Shewanella carassii: TUM17387_35360 Help Entry TUM17387_35360    CDS       T07543                                  Name (GenBank) hypothetical protein Organism scaa  Shewanella carassii SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  Cadherin_4 Big_9 K319L-like_PKD HemolysinCabind He_PIG Motif Other DBs NCBI-ProteinID:  BCV68177 LinkDB All DBs Position 4022034..4030346 Genome browser AA seq 2770 aa AA seqDB search MGVAISKQDAVVTNLVGQLKAKDENGNIRDLSIGDLIRNGEEIIFTANDTFTIEYADGTR LTEQNAQPSAQPQPDAVAADVAQFANEGVDAEIAALQAQILAGDDPTANLPATAAGAGTT GNQGDFGYVAVDRDGSELLASAGYDTSGFDQTAITTQEEILLEDLPLAGPTLSSSAATLS DANLPTGTTPSPAALTQTGNLSFSAAAGVASLTLDGIAIVSGGVFNGPVSINTEYGVLTI NAVDLINGNISYSFTLNSAVDHSSSDDFSQAFNLILTDLEGNSVGNTLTISVLDDAPSGQ DDINSVDEDSLLAISGNLLDNDVQGGDTAQVTAAGSGSNLDNAVSNQSQVSGSYGLLTLN ADGSYSYQINSAAQAVQALAQGESLTETFSYLLTDADGDTSIQTLTITITGTNDVPVIST PQPGEADGVVREAGQFDDGSIDPGTPSVSGQLSASDVDNGAVLIWSGSADSPLGSFTIDA VTGAWNYQLDNAAADGLLEGEIRTETFTVTVTDEFGASAEQLVTITIIGTNDAPILSADS SGSLTEDLDVINGMLSDSGALSFTDVDIGDSHVVSSSYNGDASWSGGALDQATQDALAQG FSADNSGWSYDIANSLVQFLAVGETITLSFTLTVTDAFGASDSQLVTLTINGTNDGPIIN PPGEGDADGTVREAGQFDDSSVDPGTPGVSGQLSASDVDNGADLTWSGSADSPLGSFSVD AATGAWNYQLDNAAVDGLLEGEIRTETFTVTVTDEYGASAEQLVTITIIGTNDAPILSAD ASGAVIEDLDVINGMLSDSGSLSFTDVDIGDSHVVSSSYNNDASWSGGALDQATQDALAA GFSADNSGWSYDIANSLVQFLAVGETVTLSFTLTVTDAFGASDSQPVTLTITGTNDAPVL SIDMSGAVTEDVDVVAGMLSDSGDLSFTDVDINDSHSVGSSYNGDVLWSGGALDQATQDA LAAGFSVDNSGWSYEIANSLVQFLAVGETITLSFDVTVDDGNGGTDTDTVTVTITGTNDA PVLTIDMSGAVTEDVDVVAGMLSDSGDLSFTDVDINDSHSVGSSYNGDVLWSGGALDQAT QDALAAGFSVDNSGWSYEIANSLVQFLAVGETITLSFDVTVDDGNGGTDTDTVTVTITGT NDAPVLTIDMSGAVTEDVDVVAGMLSDSGDLSFTDVDINDSHSVGSSYNGDVLWSGGALD QATQDALAAGFSADNSGWSYEIANSLVQFLAVGETITLSFDVTVDDGNGGTDTDTVTVTI TGTNDAPVLTIDMSGAVTEDVDVVAGMLSDSGDLSFTDVDINDSHSVGSSYNGDVLWSGG ALDQATQDALAAGFSVDNSGWSYEIANSLVQFLAVGETITLSFDVTVDDGNGGTDTDTVT VTITGTNDAPVLTIDMSGAVTEDVDVVAGMLSDSGDLSFTDVDINDSHSVGSSYNGDVLW SGGALDQATQDALAAGFSADNSGWSYDIANSLVQFLAVGETITLSFDVTVDDGNGGTDTD TVTVTITGTNDAPVLTIDMSGAVTEDIDVLAGMLSDSGDLSFTDVDINDSHSVGSSYNGD VLWSGGALDQATQDALAAGFSVDNSGWSYDIANSLVQFLAVGETITLSFDVTVDDGNGGT DTDTVTVTITGTNDAPVLTIDMSGAVTEDVDVVAGMLSDSGSLSFTDVDINDSHSVGSSY NGDVLWSGGALDQATQDALAAGFSVDNSGWSYDIANSLVQFLAVGETITLSFDVTVDDGN GGTDTDTVTVTITGTNDAPVLTIDMSGAVTEDVDVVAGMLSDSGSLSFTDVDINDSHSVG SSYNGDVLWSGGALDQATQDALAAGFSVDNSGWSYEIANSLVQFLAVGETITLSFDVTVD DGNGGTDTDTVTVTITGTNDAPVLSIDMSGAVTEDVDVVAGMLSDSGDLSFTDVDINDSH SVGSSYNGDVLWSGGALDQATQDALAAGFSVDNSGWSYDIANSLVQFLAVGETITLSFDV TVDDGNGGTDTDTVTVTITGTNDAPVLSIDMSGAVTEDVDVVAGMLSDSGDLSFTDVDIN DSHSVGSSYNGDVLWSGGALDQATQDALAAGFSVDNSGWSYDIANSLVQFLAVGETITLS FDVTVDDGNGGTDTDTVTVTITGTNDAPVLSIDMSGAVTEDVDVVAGMLSDSGDLSFTDV DINDSHSVGSSYNGDVLWSGGALDQATQDALAAGFSVDNSGWSYDIANSLVQFLAVGETI TLSFDVTVDDGNGGTDTDTVTITITGTNDPVEGEFAKEIWVPASLLQLSDPYLAGYPLNI DAPTDVDTTDGISITNLSLEFIDPGETAEIGSIWYWDDNSQMLVEYDFNNPEALSAAELS SLVYMPGDNGDIEEQLDISLTFTVNSGPDQVDGNFIIHAVPGNSLGGESVTIGDGSSPLT SGNDQDAVLSISAGFADAINLAPANGSLDLFTDYQKSPFAIPIPGDERDIDTTAGSKRET EVSVRLTINGITFIVLLADPVDNVEQTWFYDVDSGLMKASIGYDQIVQESDNSITLADYL ALNPAQAGDLWTITYFDNDGGSYQARYVQAVFTHELLPDDAITVTGTDDIDNLIFGTTQS DSLTGANQSDEIVGREGNDTIYGLEGNDQLLGGAGNDYIYGGTGADYLVGGPGSDRLDAG LDSDRDILIWDAGSADGSTDNVYNFTVGIDALDLSDILVNEENGVLDDYLDFSFVGGNTI ISVDTTGVGGGSVTIILNGVDLSAEYGTTNEAAIIQSLINDNSLLVTEAPIQASLPEPNY TYSSEEQLIP NT seq 8313 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgggcgtcgcaatcagcaagcaagacgcagttgtcaccaatttggttggacaactcaag gccaaggacgaaaatggcaatatccgcgatctgagcatcggggatctcatccgcaatggt gaagagatcatcttcaccgcgaacgataccttcactatcgaatatgccgatggtaccagg ctgacagagcaaaatgcacaacccagcgctcaacctcagccagatgccgtggccgcagat gtcgcccaattcgccaatgaaggggtcgatgccgaaatagccgcactgcaggcacaaata cttgcaggtgacgaccctaccgcaaacctgcctgctaccgcagctggtgccgggacaaca ggtaaccaaggtgatttcggttatgtcgccgtagacagggacggctctgagttattggca agtgcaggttatgacaccagtggtttcgatcaaaccgccattaccactcaagaagagata ctgcttgaggatctccccttggctggcccaacactcagcagtagcgcagccacactctca gatgccaacctgccgacaggaaccactccatcacccgccgccttgacccaaaccggtaac ttgagttttagcgctgcggccggcgtggcaagcttgaccctagatgggattgccattgtc tctggcggcgtatttaacggccctgtcagtatcaatactgaatacggtgtactcaccatc aacgccgttgacctgataaacggcaatatcagctatagctttaccctcaattctgcggtt gaccacagctcaagtgatgacttctcgcaggctttcaacctgatattgaccgatctagaa ggaaacagtgtcggtaatacccttaccatctcggtactggatgacgctccaagcggccag gatgacatcaacagcgtagatgaagactcactactagccattagcggcaatctgctcgac aacgatgttcagggcggcgataccgcacaggtaacagccgctggcagtggcagcaacctt gataatgccgtatccaatcaaagccaggtttcaggcagctacggcctgctgaccctcaat gccgatggtagttacagctatcaaattaactctgcagcgcaagccgttcaagcgctcgct cagggagaatccctgacggaaactttctcctatctgctgaccgatgccgatggcgatacc agcatccagaccttgactatcactatcacaggcaccaatgatgtgccggtgatcagcacg cctcagccgggtgaggccgatggtgttgtacgagaagccggtcagtttgatgacggcagc atagaccctggcacccctagtgtcagcggacaactgagcgccagcgatgtggataatggt gccgtgcttatttggtccggcagtgccgacagcccacttggcagcttcaccatagatgcc gtcaccggcgcctggaattatcagctcgataacgccgcagccgatggcctgctggaaggc gaaattcgcaccgagacctttacggttactgtgacggatgagtttggcgccagcgccgag caactggtcactattaccatcataggtaccaatgacgcccccattctcagcgccgatagc agcggcagtctcaccgaagatcttgatgtcatcaatggtatgctcagtgacagtggtgcc ttgagcttcaccgatgtggatattggtgacagccatgttgtcagcagtagctacaatggc gatgcaagctggagcggcggcgccctggatcaagcgacccaagatgcgctagcccaaggc tttagcgccgacaactccggctggagctatgacatcgccaacagcctggtgcagttcctc gccgtcggtgaaaccatcaccttaagcttcacactgacggtcaccgacgcctttggcgcc agtgattcacagctagtcactctgactatcaatggcaccaacgatggcccgataattaac cctcctggcgagggcgatgccgacggcactgtgcgtgaagccggtcaatttgacgatagc agcgtcgatcccggaactccgggtgtcagtggccaactcagcgccagcgatgtcgacaac ggtgcagatctgacttggtccggtagtgccgacagcccactgggcagcttcagtgttgat gccgccaccggcgcctggaattatcagctcgataacgccgccgttgatggtttactggaa ggcgaaattcgcaccgagacctttacggttactgtaacggatgagtatggcgccagcgcc gaacaactggtcactattaccatcataggtaccaatgacgcccccattctcagcgctgac gcaagtggagccgtcattgaagatctggatgtcatcaatggcatgctcagcgacagcggc agcttgagcttcaccgatgtggatattggtgacagccatgttgtcagcagcagctacaac aatgatgcaagctggagtggcggcgccctggatcaagccacccaggatgcgctggcagcc ggcttcagtgccgataactccggctggagctatgatatcgccaacagcctggtgcagttc ctcgccgtcggcgaaaccgtcaccttgagcttcacactaacagtcaccgatgcctttggc gccagtgattcacaacccgtcactttgaccatcaccggcaccaatgatgcgccggtgctg agcatcgacatgagcggcgcggtcaccgaggatgttgatgtcgtggccgggatgctcagc gacagcggcgatttaagcttcaccgatgttgatatcaacgacagccacagcgtcggcagc agctataacggcgatgtactctggagcggcggcgctctggaccaagccacccaggatgcg ctggcggccggcttcagtgtcgataactccggctggagctatgagattgccaacagcctg gtgcagttcctcgccgtcggcgaaaccatcaccttaagctttgatgtcacggtcgatgat ggcaacggcggcaccgataccgataccgtcactgtgaccatcaccggcaccaatgatgcg ccggtgctgaccatcgacatgagcggcgcggtcaccgaggatgttgatgtcgtggccggg atgctcagcgacagcggcgatttgagcttcaccgatgttgatatcaacgacagccacagt gtcggcagcagctataacggcgatgtactctggagcggcggcgctctggatcaagccacc caggatgcgctggcggccggcttcagtgtcgacaactccggctggagctatgagattgcc aacagcctggtgcagttcctcgccgtcggcgaaaccatcaccttaagctttgatgtcacg gtcgatgatggcaacggcggcaccgataccgataccgtcacagtgaccatcaccggcacc aatgatgcgccggtgctgaccatcgacatgagcggcgcagtcaccgaggatgtcgatgtc gtggccgggatgctcagcgacagcggcgatttgagcttcaccgatgttgatatcaacgac agccacagtgtcggcagcagctataacggcgatgtactctggagcggcggcgctctggat caagccacccaggatgcactggcggccggcttcagtgccgacaactcaggctggagctat gagattgccaacagcctggtgcagttcctcgccgtcggcgaaaccatcaccttaagcttt gatgtcacggtcgatgatggcaacggcggcaccgataccgataccgtcactgtgaccatc accggcaccaatgatgcgccggtgctgaccatcgacatgagcggcgcggtcaccgaggat gttgatgtcgtggccgggatgctcagcgacagcggcgatttgagcttcaccgatgttgat atcaacgacagccacagtgtcggcagcagctataacggcgatgtactctggagcggcggc gctctggatcaagccacccaggatgcgctggcggccggcttcagtgtcgacaactccggc tggagctatgagattgccaacagcctggtgcagttcctcgccgtcggcgaaaccatcacc ttaagctttgatgtcacggtcgatgatggcaacggcggcaccgataccgataccgtcaca gtgaccatcaccggcaccaatgatgcgccggtgctgaccatcgacatgagcggcgcagtc accgaggatgtcgatgtcgtggccgggatgctcagcgacagcggcgatttgagcttcacc gatgttgatatcaacgacagccacagtgtcggcagcagctataacggcgatgtactctgg agcggcggcgctctggatcaagccacccaggatgcactggcggccggcttcagtgccgac aactcaggctggagctatgatatcgccaacagcctggtgcagttcctcgccgtcggcgag accatcaccctgagctttgatgtcacggtcgatgatggcaacggcggcaccgataccgat accgtcactgtgaccatcaccggcaccaatgatgcgccggtgctgaccatcgacatgagc ggcgcagtcaccgaggatattgatgtgctggccgggatgctcagcgacagcggcgatttg agcttcaccgatgttgatatcaacgacagccacagtgtcggcagcagctataacggcgat gtactctggagcggcggcgctctggatcaagccacccaggatgcactggcggccggcttc agtgtcgataactccggctggagctatgacattgccaacagcctggtgcagttcctcgcc gtcggcgagaccatcaccctgagctttgatgtcacggtcgatgatggcaacggcggcacc gataccgataccgtcactgtgaccatcaccggcaccaatgatgcgcctgtgctgactatc gatatgagcggcgcggtcaccgaggatgtcgatgtcgtggccggaatgctcagcgacagc ggcagcttaagcttcaccgatgtcgatatcaacgacagccacagcgtcggcagcagctac aacggcgatgtactctggagcggcggcgctctggatcaagccactcaggatgcgctggca gccggcttcagtgtcgacaactccggctggagctatgacattgccaacagcctggtgcag ttcctcgccgtcggcgagaccatcaccttaagctttgatgtcacggtcgatgacggcaac ggcggcacggataccgataccgtcactgtgaccatcaccggcaccaatgatgcgcctgtg ctgactatcgatatgagcggcgcggtcaccgaggatgttgatgtcgtggccggaatgctc agcgacagcggcagcttaagcttcaccgatgtcgatatcaacgacagccacagcgtcggc agcagctacaacggcgatgtactctggagcggcggcgctctggaccaagccacccaggat gcgctggcggccggcttcagtgtcgataactcaggctggagctatgagattgccaacagc ctggtgcagttcctcgccgtcggcgagaccatcaccttaagctttgatgtcacggtcgat gacggcaacggcggcaccgataccgataccgtcactgtgaccatcaccggcaccaatgac gcgccggtgctgagcatcgacatgagcggcgcagtcaccgaggatgttgatgtcgtggcc gggatgctcagcgacagcggcgatttgagcttcaccgatgttgatatcaacgacagccac agtgtcggcagcagctataacggcgatgtactctggagcggcggcgctctggatcaagcc acccaggatgcactggcggctggcttcagtgtcgacaactccggctggagctatgacatt gccaacagcctggtgcagttcctcgccgtcggcgaaaccatcaccttaagctttgatgtc acggtcgatgatggcaacggcggcaccgataccgacaccgtcacggtgaccatcaccggc accaatgatgcgccggtgctgagcatcgacatgagcggcgcagtcaccgaggatgtcgat gtcgtggccgggatgctcagcgacagcggcgatttgagcttcaccgatgttgatatcaac gacagccacagtgtcggcagcagctataacggcgatgtactctggagcggcggcgctctg gatcaagccacccaggatgcactggcggctggcttcagtgtcgacaactccggctggagc tatgacattgccaacagcctggtgcagttcctcgccgtcggcgaaaccatcaccttaagc tttgatgtcacggtcgatgatggcaacggcggcaccgataccgacaccgtcacggtgacc atcaccggcaccaatgatgcgccggtgctgagcatcgacatgagcggcgcagtcaccgag gatgtcgatgtcgtggccgggatgctcagcgacagcggcgatttgagcttcaccgatgtt gatatcaacgacagccacagtgtcggcagcagctataacggcgatgtactctggagcggc ggcgctctggatcaagccacccaggatgcactggcggccggcttcagtgtcgacaactcc ggctggagctatgacattgccaacagcctggtgcagttcctcgccgtcggcgaaaccatc accttaagctttgatgtcacggtcgatgacggcaacggcggcactgatactgacacagtg actatcaccatcactggtaccaatgatccggttgaaggtgagtttgccaaagagatctgg gtgccagcttcattgttgcaactctcagatccttatcttgccggctatccgctgaatatt gatgcgccaactgatgtagatactactgatggcattagcatcacaaacctgagccttgag tttatcgacccaggggaaaccgccgaaataggctcaatttggtattgggatgataacagc cagatgctggtagagtatgacttcaacaatccggaggccttgtctgcagcagagttgagt agtctggtatatatgccaggggacaacggtgacatagaagagcagttggacatttcccta accttcacagtcaattcaggtccagatcaggtggatggaaacttcattatccatgctgtg cccgggaatagcttagggggcgaaagtgtcaccataggtgatggttcatctcctttaacc tcaggtaatgatcaggatgcagtcctcagtattagtgcgggatttgccgatgccattaat ttagcgccagcaaacggtagtctggatctgttcaccgattaccaaaaatccccctttgcc attccaattcccggggatgagagagatattgacacaaccgcaggcagcaagcgggaaaca gaggtatcagtcaggctaaccattaacggcataaccttcatagtgctattggcagatcct gtcgataacgtagaacagacttggttctatgatgtggattcaggcttaatgaaggccagt attggctatgatcagatagtacaagaatcggataactcaataaccctcgccgactacctg gctttgaatcccgctcaagccggcgatctgtggaccatcacttacttcgacaacgatgga ggtagctatcaagcccgttacgtacaagctgtatttacccatgaactgttgcccgatgat gccattacagtgacaggaaccgatgacatagacaatctcatattcggcaccactcaaagt gactccctcaccggagctaaccaaagtgatgaaattgtcggtcgtgaaggtaacgatacc atctatggtcttgaaggaaacgaccaactgctggggggggcaggtaatgactatatctat ggcggtacaggtgccgattatttagtcggtggccccggcagtgaccgtcttgatgccggt ctagacagtgacagagatatcttaatctgggatgccggttcagcagatggcagtacagat aacgtctacaactttaccgttggcatagatgccttggatttatcggatattttagtcaat gaggaaaacggtgtattagatgattatctggacttcagctttgtgggtggcaacaccatc ataagcgtcgacacaactggagttggcggtggcagtgttaccataattctgaatggtgta gacctttctgcagaatatggaacaacaaatgaagcagcaattattcagtctctgataaat gacaattcattgttggtcactgaggctcccatacaagcatctctacctgaacccaactat acctattcatcagaggaacaattaatcccttaa

DBGET integrated database retrieval system