Stomoxys calcitrans (stable fly): 106086505
Help
Entry
106086505 CDS
T07664
Name
(RefSeq) nidogen
KO
K06826
nidogen (entactin)
Organism
scac
Stomoxys calcitrans (stable fly)
Pathway
scac04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
scac00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
106086505
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04990 Domain-containing proteins not elsewhere classified [BR:
scac04990
]
106086505
Domain-containing proteins not elsewhere classified [BR:
scac04990
]
EGF-like domain-containing proteins
cEGF domain-containing proteins
106086505
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
G2F
NIDO
EGF_3
Ldl_recept_b
EGF_CA
SGL
cEGF
Arylesterase
EGF_Hmr-1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
106086505
NCBI-ProteinID:
XP_013106658
UniProt:
A0A1I8NTE5
LinkDB
All DBs
Position
5:148173072..148205338
Genome browser
AA seq
1359 aa
AA seq
DB search
MLITKMKTATQLWCVSALLLLSISCTSGHILDSLHINELYTPDSGSQDSVLTLAKGDAEF
LVWHLDNPISFYSEKYDQLYINTNGILTFNIEFPEYINQPFPFEYPSIAGFYSNVDTSGG
NESTSITIFSTQDPEQLQKVSELVRYAYDEKADFEATEVIVATWKNVGYYESKTDQLNTF
QIALIVDDEDTFVQFIYPSGGLNWLQGENGPLGLPDIRAQAGFVAEDGRSFDLEGSGTEN
ARFLADKSNVGIAGVWLYRVGPLDYEENVKGPTNEETFTESPTVSQTCSEAGHRVCNKNA
VCVDKFEGYCCVCNSGFYGNGAVCIKDDLPVRVTGSLMGEINGETINDGSKLQSYVVTAE
GRSYTAVTPITTELGSNLRLALPLVTSIGWLFAKPLNNTQNGYQLTGGEFVHTSKMSFET
GEVLLINQTYEGLNYWDQLSLKIELHGQVPAIKPSLKLHMAEYTEEYEFVSENELHSLQA
HTVEIPEENRVLNFQLEQNINFERCWVNEHSKYEIVGTTYLQKISKIMLDFFERDQALRT
SILTVAGVSAASNACTDGTAVCGENMVCIPYDDTYRCDCIHGYGPQVTETGAEICVDIDE
CALGTHVCDDNALCTNNEGGFNCVCFDGYQGNGYRCLINGTVADNIEAPMGGGGHNIGTP
VYVMPGEEHTDEREQTTGQEHYMPPMQYPSTTPMSSYNPYNADDCFHCSPYADCWEGKCV
CREGFNGDGFYCASNCALDEVWEDGKCVKLSYEEPDIEPRCNFFGDCVCDDGYELMSDVQ
MCRWVGHFNGESKTDDFVPCDVEFNCHVNATCEWFPMELRHVCTCKSGYYGDGYNCAVID
ESCAVKPEICDPQAECNYNDALGRSQCQCKRGYEGDGFRCALAPECVEDLDCGQNAFCDH
DVCQCLQGYERDMSDMCVLAGSCGAVFCGANAICKFDHDQGVKYCDCMDGYEGDASIGCK
SKPMPCNVQYNCGVHASCEPTEDPAYYECQCHAGFNGDGYVCIEDQNCLNTPQLCDMNAQ
CLSTNNGLVCVCNKGFYGNGSLCMERKQHDSGFLLVSQGVVIVRVPLNGKNVRPISVASM
AIGLDKDCVEGRIYWGDISTKKIISAKYDGSDVKTFISEDVESPEGIAIDAISRRIYWTD
SVKDTIEVASLDDPSLRSILVSKNLVNPRGIAVDPYREKLYWSDWNRESPKIEMSDLDGT
GREMLMDKQGVTLPNSLVVLERSGELCFADAGTKKVECIDPYSKKLRTISNELSYPFGLV
FTQDQFYWTDWTTKKLESVDNMGLRQQSMQIPFFGSHKMYAMTSVEDTCSQMDSPCQINN
GGCSDSRLCLVNRKAPSGKSCKCTALSKLCNVPNPFNNM
NT seq
4080 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttgataacaaaaatgaaaactgccacacaattgtggtgcgtttccgctttactactt
ctaagtatttcctgtacttccggtcacattttggatagtctgcacatcaatgaattgtac
acccccgatagtggcagccaggattccgttttaacactggccaagggagatgctgaattt
cttgtttggcatttggacaatcccatcagcttttatagtgaaaaatatgatcagttatat
atcaatacgaatggcattttgacatttaatattgaatttccggaatacatcaatcaacca
tttccctttgagtacccttcaatagctggtttctattcgaatgtggatacgtcgggtggt
aatgagtcaacatcgattaccattttcagtactcaggatcctgagcaactgcaaaaggtc
agtgaactggtgcgttatgcctacgatgagaaagcagattttgaggctacggaagtaatt
gtggccacttggaaaaatgtgggctactatgaatcgaaaaccgatcaactgaatactttc
cagattgccttgattgtggacgatgaagacacctttgtgcaattcatttatccttcgggc
ggccttaactggttgcagggagaaaatggtcctttgggcttgcccgatattcgggctcaa
gctggttttgtagcagaagatggccgatcctttgatctcgaaggttcgggtactgagaat
gctcgttttcttgccgacaagtccaatgttggcattgctggtgtttggctttatcgtgtt
ggtccccttgattatgaagaaaatgtgaaaggacccaccaatgaggagacttttactgaa
tcccccaccgtctcgcaaacctgctcggaggctggacatagggtttgcaataaaaatgcc
gtttgtgttgataagttcgaaggctattgctgcgtgtgcaattcaggattctatggcaac
ggtgctgtctgcattaaggatgatttgcctgttcgtgttacaggttcgctcatgggtgaa
atcaatggagagaccatcaacgatggctctaaattacagtcttatgtggtgactgccgaa
ggtcgcagttataccgcagtcactcccataaccaccgaattgggctcgaacttacgcttg
gccttgcccttggttacctctattggttggttgtttgccaagcctttgaataacacacaa
aacggttatcaactgaccggaggtgaatttgtccatacctccaaaatgagttttgaaact
ggcgaggttttgctcatcaatcaaacgtatgagggcctcaactactgggatcagttgtcc
ttgaaaatcgaattacatggtcaagtgcctgccattaaaccctcgcttaagttacacatg
gccgagtataccgaggagtatgaatttgtctctgaaaatgaattgcattccctacaagcc
cacaccgtggagatacccgaagaaaatcgagtgttaaacttccaattggagcagaacatc
aatttcgagcgttgttgggtgaatgagcatagcaaatatgagattgttggcaccacctat
ttgcaaaagatctccaagattatgttggacttctttgagagggatcaggccttgcgtacc
agtattttgacagtggctggtgtaagtgctgcctcgaatgcctgcaccgatggcactgct
gtgtgtggtgaaaacatggtctgcataccctatgatgacacctaccgttgtgattgcatt
catggctatggacctcaggtaaccgagacaggcgctgagatctgtgtggatattgatgag
tgtgccttgggcactcatgtctgtgatgataatgccctgtgcaccaataatgagggtggt
ttcaactgtgtctgctttgatggctatcagggtaatggttatcgttgcttgatcaatggc
acagtggcagataatattgaagctcctatgggtggtggtggtcataatattggaacacct
gtatatgtaatgccaggcgaagaacataccgacgaaagggagcagaccaccggccaggag
cactatatgccacccatgcaatatccctctaccacaccgatgagttcgtataatccttat
aatgcggatgattgtttccactgttccccctacgccgattgttgggaaggcaaatgtgtg
tgtcgtgaaggatttaatggtgatggtttctattgtgccagcaattgtgccttggatgag
gtttgggaagatggcaaatgtgtaaaactgtcctatgaggagcctgacattgagccacgt
tgcaatttctttggcgactgtgtatgtgatgatggttatgagttgatgagtgatgtccaa
atgtgtcgttgggtgggtcatttcaatggtgaatcaaagactgatgattttgttccttgc
gatgttgaattcaattgccatgtcaacgccacctgtgaatggttccccatggagttgaga
catgtttgcacctgtaagtcaggctactatggtgatggttataattgtgctgttattgat
gaatcctgtgctgtgaaacccgaaatctgtgatccccaagccgaatgcaattacaatgat
gccctgggtcgttctcagtgccagtgtaaacgcggctatgagggtgatggtttccgttgt
gccttggcccccgaatgtgtggaggatttggattgtggccaaaatgctttctgtgatcat
gatgtttgccaatgcttgcagggctatgaacgtgatatgtccgatatgtgcgtattggct
ggcagctgcggggccgttttctgcggagccaatgccatttgtaaatttgaccatgatcag
ggagttaaatactgtgattgcatggatggctatgagggtgacgcttccattggttgcaag
agcaaaccaatgccttgcaatgttcagtataattgtggcgtccatgccagctgtgagccc
actgaagatcctgcctattatgagtgccagtgccatgctggctttaatggtgatggctat
gtttgtattgaggatcagaattgtttgaataccccacaactgtgtgacatgaatgcccag
tgtttgtccaccaacaatggcttggtgtgtgtgtgcaataagggcttctatggcaatggc
tcgttgtgcatggaacgtaagcaacatgattccggtttcttgttggtctcccagggtgtt
gtcattgtgcgcgttcctttgaatggtaaaaatgtgcgacccatatcagtagcctccatg
gccattggtttggataaagactgtgtggaaggtcgcatctattggggtgatatctcaacc
aagaagataatcagtgccaaatacgatggcagcgatgtaaagaccttcatttccgaagat
gtggaatcacctgaaggcattgccattgatgccatatcgagacgcatctactggactgac
tcggtaaaggataccatagaggtggccagcttggatgatcctagcctaaggtcgattttg
gttagcaagaatttggtaaatcctagaggcattgctgtggatccctacagagaaaaatta
tactggtccgattggaatcgcgaatctcccaaaattgaaatgtccgatttggatggtacc
ggtcgtgaaatgttgatggacaaacaaggcgttactttgcccaactctttggtggtcttg
gaacgctctggtgaactttgctttgctgatgccggcaccaagaaagtcgagtgcattgat
ccctattccaaaaagttgcgcaccatttccaacgaactgagctatccatttggtttggtg
tttacccaggatcaattctattggaccgattggaccaccaaaaaactcgaaagcgttgac
aacatgggcctacgtcaacagagcatgcaaattcccttctttggcagccataaaatgtat
gccatgacttcggtggaggacacctgctcacaaatggacagtccctgtcaaatcaataat
ggcggctgttcggattctcgcctctgcctggtcaatcgcaaggccccatcgggtaagagc
tgtaagtgcacagctctctcaaagttgtgcaatgttcccaatcccttcaacaacatgtaa
DBGET
integrated database retrieval system