Stomoxys calcitrans (stable fly): 106087253 Help Entry 106087253         CDS       T07664                                  Name (RefSeq) collagen alpha-5(IV) chain   KO K06237   collagen type IV alpha Organism scac  Stomoxys calcitrans (stable fly) Pathway scac04512   ECM-receptor interaction scac04820   Cytoskeleton in muscle cells Brite KEGG Orthology (KO) [BR:scac00001]  09130 Environmental Information Processing   09133 Signaling molecules and interaction    04512 ECM-receptor interaction     106087253  09140 Cellular Processes   09142 Cell motility    04820 Cytoskeleton in muscle cells     106087253  09180 Brite Hierarchies   09183 Protein families: signaling and cellular processes    04147 Exosome [BR:scac04147]     106087253    00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:scac00536]     106087253 Exosome [BR:scac04147]  Exosomal proteins   Exosomal proteins of other cancer cells    106087253 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:scac00536]  Heparan sulfate / Heparin   Extracellular matrix molecules    106087253 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGFIT Motif Pfam:  Collagen C4 Motif Other DBs NCBI-GeneID:  106087253 NCBI-ProteinID:  XP_013107689 UniProt:  A0A1I8PJA6 LinkDB All DBs Position Unknown AA seq 1814 aa AA seqDB search MLLLPRDLLGLLGGNAAPKWHHQLLKTAVLIVCITTIIGPFTADAKERDEPCNGVVCDCK GLKGRPGAIGLPGFQGYEGPPGDFGPVGPAGRPGEWGDPGEYGEQGEKGHRGDAGESGLP GTPGLRGPPGEDGPQGPRGIDGCDGQTGQQGAPGVPGRHGTRGEIGKPGPPGPTGDAGEG GINSKGTKGSRGDRGPDGHDGQHGYPGMKGYKGDTGFPGADGAKGEMGPKGYKGEMAEGA NFTLTLQGEQGSKGEPGDAEEGEWKPQEVSKGYRGDAGFKGEKGFHGEQGETGDTGRAGL PGARGDTGESGERGKPGKTGDPGFPGDKGMKGAPGYNGQDGEDGLPGERGEDGYDGIPGV QGYAGEPGSYDPLLDESLPGPIGPQGDLGPPGPPGLPGVPGPEGRRGPRGNTGPPGDPGY DGLPGRRGASIRGDDGDYGLMGQPGPMGPPGNAGPIGRVGQRGADGRSVQGPKGYAGQPG LPGVPGYRGDRGDIGLPGEKGAAGLGVNVVGPPGADGLPGLRGQPGSDGFPGYRGMPGDK GIRGDDCGICPAGPRGSKGIHGDAGFPGIHGARGLHGLPGERGPKGPQGKPGFVGFKGQA GPDGIPGETGPVGQPGRPGTILKTGSSRQAETGDQGDHGERGAQGESGDRGYDGRSGMHG LRGETGMRGDYGDPGRPGRDGAPGRIGRDGTNGRDDNTPKVYLVGQKGYDGRKGQRGEPG AKGVKGEKGAPNPGQVFDNKGERGDPGYPGEQGLQGPKGERGSDGIDGGRGEMGLSGRVI AGVIGAKGYPGVTGEVGLHGAAGNPGTNGAPGVDGVTGAKGMRGEPGPYILAGEMGPDGP PGVPGMGGDEGPRGNPGPTGRPGVKGIRGGKGDAGPDGLQGLAGNKGMRGDMQAGFPGLA GEPGRNGRIAPHGRKGQKGETGVPGVRGVFGAKGDIGRTGNRGEHGDRGYPGAPGSIGPQ GFVGIPGEQGDRGELGEDGRHGDMGPRGSIGAMGPKGQMGDVGPFGRRGNDGMHGRKGIQ GDQGFPGRMGPKGLASRSGIKGETGEAGYMGPRGYDGIPGEKGMQGLPGDEAYGEDGLPG RKGETGVPGINGMNGLPGLKGIRGDYGLMGRMGEFGDRGNQGMPGYPGINGKVGFAGAVG PMGPMGLMGERGEMGEMGYAGYVGVVGDRGDNGEPGAFGPPGERGDDGFPGRPGMILTGY AQRGDKGEPGIRGEQGPVGEMGPDGSVGFPGRKGERGDFGLAGLPGTDGYPGVNGERGDK GYTGPPGLTPHYAEPGDEGDMGYDGLPGRPGRMGQKGAPGDMGAYGINGMKGEMGMSVMG PKGMSGDIGYPGPNGRNGLHGMAGLKGERGDFGPPGMRGEPGYAIPGLRGDHGDVGPQGA PGFDGRKGEMGMHGRPGRTGPVGQRGPRGPTGDVGYDGRNGLDGLKGIVGEPGTTFPFHM ARKGERGEPGFDGLKGQMGDIGPDGEMGFRGAIGQRGYQGERGLIGLTGQDGPKGEMGMM GPPGLTGYTGIMGPKGPTGEPAPPPPRPKSRGYIFARHSQSFVAPHCPPNTNLMWEGYSL AGSIGNARAVAQDLGRAGSCMRRFSTMPYMTCDGSVCNYGQTNDDSMWLATDEPMNFAMI PIQANVIQKYISRCAVCETSTRVIALHSQSMEIPNCPSGWEEMWTGYSYYMTTTDNTGGL GQNLVSPGSCLEEFRAQPIIECHGQGKCNLYDPVTSFWLAVIEEHEMWQMPVAQTLKKDQ TSKISRCSVCRRRNDSFISRTPTFDSSAHEFRRGYEPVIAAPAPPRRTPSTNRRPSGYGR VNRNRYPRADTTAP NT seq 5445 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgctgttattgcccagagaccttttgggtctcttgggtggaaatgccgcccccaagtgg catcatcaactgctgaaaacagcggtgttgattgtttgtataaccacaataattggccca tttactgctgacgctaaggaacgcgacgaaccctgtaatggtgtggtatgtgattgcaaa ggcttgaagggccgtcctggtgctattggcttgcctggatttcaaggctatgaaggacct ccaggtgattttggtcctgtgggcccagcgggacgccctggcgaatggggtgatcccggt gagtatggtgaacagggtgaaaagggtcatcggggtgatgctggagaatctggccttcct ggaacacctggcttgcgtggtcctcctggcgaggatggtccccaaggcccgcgtggcatt gacggttgcgatggtcagacaggccaacagggtgctcctggtgtacctggtcgtcatggt actcgcggtgaaatcggcaaacctggcccaccaggtccaaccggtgacgctggtgagggt ggcataaattccaaaggcaccaagggtagccgtggtgatcgcggcccggacggccatgat ggacaacatggctatcctggcatgaaaggttataaaggtgataccggcttcccaggtgcg gatggtgccaagggtgaaatgggtcccaaaggttacaagggtgaaatggccgaaggtgcc aattttactctgacattacaaggagagcagggcagcaagggcgaaccgggtgatgccgag gaaggcgaatggaaacctcaagaagtttcgaagggttataggggtgatgctggattcaaa ggcgaaaaaggttttcatggcgaacaaggtgaaacgggtgatacgggccgtgcaggtttg cctggtgctcgtggtgatacaggtgaatctggcgaacgtggcaagccaggcaaaaccggt gatcccggtttcccaggtgataaaggaatgaaaggtgctcctggctacaatggacaagat ggtgaagacggccttcctggcgaacgcggtgaagatggctacgatggcattcctggtgtg caaggttatgctggggaacctggttcatacgatccacttcttgacgaatcattgcctggc ccgattggaccccagggtgatctgggtcctcccggacctcccggtttgcccggtgttcct ggcccggagggtcgcagaggtcctcgtggcaatactggacctcctggtgatcccggttat gacggcttgcctggtcgtcgtggtgccagtattagaggtgatgatggtgactatggctta atgggacaacccggtccaatgggtccacccggcaatgccgggcccataggtcgcgttggg caacgtggtgccgatggcaggagtgtacaaggtcccaagggttatgctggacaacctgga ttacctggcgttcccggttatcggggtgatcgaggtgatattggcctgcctggtgaaaag ggtgccgccggtcttggtgttaatgttgtaggccctcctggtgctgatggtttgcctggt cttcgaggacaacctggtagcgatggttttccgggctatcgtggcatgcctggtgataaa ggtattcgcggtgatgactgcggcatttgtccagctggacctaggggaagtaaaggtatt catggcgatgctggtttccctggcattcatggcgcaagaggattacacggtctacctggt gagagaggccctaaaggtccccaaggcaaaccaggatttgtaggtttcaagggtcaagcc ggtccagatggtattccaggtgagactggtcccgttggtcagccaggtcgacctggtaca atattaaaaaccggcagctcacgtcaagctgaaactggcgatcaaggtgatcacggcgaa cgtggtgctcaaggagaatcaggcgatcgtggctacgatggccgttccggcatgcatggc ttgagaggtgagactggtatgcgtggagattatggtgatcccggaagacctggtagagat ggcgctcccggacggattggtagagacggcacgaatggtcgagatgacaatacaccgaaa gtatacctggttggccagaaaggctacgatggtcgcaagggacaacgtggtgagcccggc gcaaagggtgttaaaggtgaaaaaggtgcaccaaatcctggacaagtattcgacaacaag ggcgaacgtggcgatcctggctatccaggcgaacaaggtcttcaaggtccaaaaggtgaa cgcggctctgatggcattgatggtggtcgtggtgaaatgggtttgtctggaagggtcatc gctggagttattggcgccaagggctaccccggtgtgacaggcgaagttggccttcatggt gcagctggaaatccaggtacgaatggagctcctggtgttgatggcgtgacgggtgccaag ggtatgcgtggtgagcctggtccttatatcttggctggtgaaatgggtccggacggtcct ccaggcgttccaggcatgggaggcgatgaaggtcccagaggcaatcccggtccaaccggc agacccggtgttaaaggtatccgaggcggaaagggcgatgctggtcccgatggtcttcaa ggtttggctggcaataagggtatgcgaggcgatatgcaagcaggatttccaggtttggct ggagaacccggtcgaaatggacgcattgctccccacggccgcaagggacaaaaaggtgaa actggcgtacccggcgttcgaggtgtctttggtgccaagggcgacatcggccgaactggc aatcgaggtgagcacggcgaccgcggatatccaggtgccccaggttcgattggaccacaa ggatttgttggcatacccggagagcaaggtgatcgtggcgaattgggagaggatggacga cacggtgatatgggaccaagaggctcaatcggagctatgggacctaaaggtcaaatgggt gatgtgggtccgtttggtcgtcgaggcaatgatggtatgcatggacgcaaaggaattcaa ggtgatcagggcttccctggacgaatgggtcctaaaggtctggcctctcgcagcggcata aagggcgaaactggtgaagcgggctacatgggaccacgcggttatgatggcatccctggt gaaaagggtatgcaaggtttacccggcgacgaagcttatggtgaagatggtttgcccggc aggaaaggagaaactggtgtacccggaatcaacggcatgaatggtttacccggtctgaag ggtatccgtggcgactatggtctgatgggtcgaatgggagaatttggtgatcgtggcaat caaggcatgcctggttatcctggaatcaatggaaaagtaggatttgcaggagctgtagga ccaatgggccccatgggtctaatgggtgaacgaggcgaaatgggtgaaatgggctatgcc ggctatgttggagttgttggcgaccgcggtgacaatggagaacctggtgctttcggacct ccaggtgaacgtggtgacgatggtttccccggccgacctggtatgatattaaccggttat gctcagagaggtgacaagggagaacctggcataagaggagaacaaggcccagtgggtgaa atgggccctgatgggtctgttggtttcccaggacgtaaaggcgaacgtggtgactttggt ttggctggccttcccggcacagacggatatcctggcgtcaatggggaacgtggtgacaaa ggttatactggtcctcccggcttgacacctcattatgctgaacctggcgatgaaggtgat atgggctatgatggattacctggtcgcccaggccgcatgggccaaaagggtgcccctgga gatatgggagcatatggcataaatggcatgaaaggtgaaatgggcatgagcgtaatggga cccaagggtatgtctggcgacattggttatcctggtccaaatggtcgcaatggattgcac ggtatggctggactgaagggtgaacgtggagatttcggtccacctggtatgcgcggtgaa ccgggttatgccattcccggcttaagaggtgatcatggcgatgttggtccccaaggtgct cctggcttcgatggtcgtaaaggtgaaatgggcatgcatggcaggcccggccgaacaggt ccagttggtcaacgtggtcctcgcggtcctacgggtgatgtcggttatgatggacgcaac ggtttagatggccttaaaggcattgttggtgagcctggcacaacattccccttccacatg gcacgtaaaggagaacgcggcgaacctggctttgatggattaaagggtcaaatgggtgac attggtccagatggtgaaatgggcttccgcggcgcaatcggccagagaggttaccaaggc gaacgtggtctcattggtcttacaggccaggatggacctaaaggtgagatgggcatgatg ggtcctcccggtttgaccggttacactggcattatgggtccaaaaggtcccacaggcgaa ccagcaccaccaccaccacgccccaagagtcgtggctacattttcgcacgtcactcgcaa tcgttcgtagcaccccactgtccgcccaacaccaatttgatgtgggaaggctattcactg gccggcagcattggcaatgcccgtgcagttgcccaagatttgggccgtgccggttcctgt atgagacgtttcagcactatgccctacatgacgtgcgatggtagtgtctgcaattatggc caaactaatgacgacagcatgtggctggcaactgatgaacctatgaatttcgccatgatt ccaatacaagctaatgtaattcagaaatacatttcacgttgcgccgtttgcgaaacctcc acaagagtcattgctctgcacagtcaaagtatggagattcccaattgtcccagtggatgg gaggaaatgtggaccggttacagttattacatgacaactaccgacaacactggtggtttg ggtcaaaatctggtttcgcccggttcctgcttggaagaattccgtgcccaaccaattatt gaatgtcatggtcaaggtaaatgcaacttgtacgatccggtcacttcattctggttggct gtaatcgaagaacatgaaatgtggcagatgccggtggcacagaccctcaagaaggatcag accagcaagattagcagatgttctgtttgtcgtcgtcgcaatgattctttcatctcacgc accccaacgtttgattcatcggcccatgaatttagacgtggctatgagcccgtgatagct gctccagcgccaccaagacgaacaccatcaaccaacagacgaccctctggctatgggcgc gtcaatcgcaaccgctatccaagagccgataccacagctccctag

DBGET integrated database retrieval system