Stomoxys calcitrans (stable fly): 106092610
Help
Entry
106092610 CDS
T07664
Name
(RefSeq) laminin subunit alpha-1
KO
K05637
laminin, alpha 1/2
Organism
scac
Stomoxys calcitrans (stable fly)
Pathway
scac04512
ECM-receptor interaction
scac04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
scac00001
]
09130 Environmental Information Processing
09133 Signaling molecules and interaction
04512 ECM-receptor interaction
106092610
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
106092610
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Laminin_EGF
Laminin_G_2
Laminin_G_1
Laminin_B
Laminin_G_3
Laminin_II
CENP-H
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
106092610
NCBI-ProteinID:
XP_013114965
UniProt:
A0A1I8PYT7
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2774 aa
AA seq
DB search
MCKYNVEGEACSKCREGFYDLNADNIDGCSPCWCSGLEVSCSSANLSALAFETLNDWKIT
DITLSQTTTPSLDTDTNSLSYSMFDLADVEAIYWQAPKGYLGNRLSSYGSRLSVQVKWVT
IRGDTSGKPTAGPHVIFLGKNGMKIAYGDEEFNRDTSAVINITLEETNWYHVPPQVKDIK
TRMRRTDYHGTEVSKGHFLSVLSNLKAILVRASFHTDQVETYLERVIMFTGGTELGHSTS
RVEQCSCPPGYTGFSCESCDFGYIRIYENSSDHHEVGRCKPCPCNGHSNSCDVQSGGCGN
CMHNTYGERCERCKRGFYGNPLEGTPNDCRPCACPLLVDSNNFSPSCQLKTYSVTDINPM
FGVVKNAEYICTQCPPGYTGDHCEMCDDGYYGKPTEIGSSCRPCNCDGGPCDVFTGQCIV
CEGNTEGWHCERCKLGFWGDPSVGCEPCSCFEQGSDSAVCDSTDGQCLCKPRYAGQKCDE
CDEGYALLDEQCSPCGCDEFGTIDPNTCDPDNGQCYCKPGVEGLKCKECSLGYFGLKEES
NGCTECQCSHLGSIGNTCDKRSGQCSCLPNVTGRRCDKCKSGHWNLTQNVGCHDCRCDPS
GSRGHECNPWTGQCDCKIGVGGQRCNECTDGFFGFSTDGCQRCAPCPGEGQVCDPINGRC
VCPPNSRGLGCSQCMSGTWGWQPRLGCRECQCDRVGSIGKYCHTISGQCQCREGYTGRRC
DSCAIGYFGYPECRRCNCDVDGSFVRSDGLIACDANGQCPCKSLVVGLKCDTCMQSTFGL
SALNPEGCTRCYCFGRATECEQSDWSWGHVRMSEARNLTVQYVRASHVTNTEFEYIVVVQ
MSGSQTYREDAEIQNMNGLNLIPRSTGNVTMGSYSQLYYPLYFQLPPQFYGDRTNSYGGN
LYFTLLTEGGSTPLDRKILGRYPLVQMHAHSRMILDFYEYESFEYSRNETYRVPLHESYW
KLHHNGQAVDRSTLMAALQNVRHVFIRGSCFADFTEIILQNVHMDSAIYVHGSTSMLAKG
VEKCKCPKRYDGLSCQDPGQGYYRWRNVTETISETIYIEEMIGRAAPCNCNGRSNQCNRE
TGECMNCVENSGGRHCEQCAEGFYGDPNSPYGCQACPCPETNRNFAKGCTVWQGEVNCVC
RPGYMGKLCDQCRPGFYGNPMASPNSTCKPCDCNLYGVSQEGCDAKTGQCYCQPGITGLK
CDKCMAERHHLEEKGCKICDNCTLLLMDYVQLIGHKLRRGLHNMDLTGIPAPYKKVEEYE
LLFHQEDVRYQDFNDARRLLLNYDSNALLKLDSHAENQKFQNRKALATAEKRTYAMAILV
QDATVLYQDLDSVKTDILQNIATLDNYGRGAHHLSLPSALQQARFYLDSIKQHRDSFEDI
RSASACAWHYFYKFGNASDLAFDQKGKIEMFWRDLNHSNFRISDMRLQADRTVEMQNEID
DVLEHIKNLKIYTLEDYQQIQDQQTLVEDTLKQTLMPQTSVLIELNIDRLELLSDTVDSI
TKLGTMLNVTQESNEIMHREVRKHWLPKAQKHAARLLERSNEYARQFQPTRQGARIAMLA
SSAHKNISDAIEAARLASKEAREQVYSAHHKLYPRLGLSVIERARLSLHNSQILKKQAMD
KIQDTGVLDNRLKFHENKVESIKSRILEAGIRTNNISSYIPPMQRTTARKNAVESLDSAS
TTSEEMRAVTQKTRELHEDIRKLRDKFAILEPDFEIKLGMAEENISLTKTNVRLANISLT
YVEEQAVREQNEFDVWNNTMAQQMQKLRDQITKAKHAAETIKISLQSMGPKCIRSYLPTS
YGLTTSNSIKISFALANRNGNSPLLYIQGNDDRYIALDLFKRHVRLLWNLGGATEIITHP
LEIQTRDPQYDDAWYHVEVNRTLNVGSLLVRRMNNYGALVPQTPVTGSTDVEFTRFIQTP
EDRIFLGGYPKILRTKDLQLNPGLNVVVHSVEVDNKPMGIWNFATSEGKCGGAMIGAQES
TSSSVARHFNGLGYAEVKKSRPRPYRKNLFALQMTFKTLDENALLFLAVDDKNNRSVSVT
LSRGRIMFRIDYGDESKLEINTTNKYNTGKWVKIEAAREFVPKRGTENGILRVSNDRPIT
GSPTVPIKSHMLPDLSKAVYYLGGVPPGFTSATSKAPGADNPFLGCMMDVQVNGETYDPL
EGSTHFGVESSCKEMITKAGFRGQGYIELPSQSLRKRANTGFVFRTLQADCLLMLAAYPP
EVQEDYDAKDIKGNYSISLIDGHLQVWVNSGRSLVKMKSNVSLNDGEFHVVNLLKNGRHL
ELMVDDELQESKNLMGSPTLVSMPRDAGGLYIGGSPPHEEYTPLAPTFNKLEGAIRDVVF
NNRTINFNQALSFVNVQIGRNGPAMGSVNGLSDILMKTEPMIGKSFTAAPEGCKRVGSYS
YEPNAFKFGDEPYSFAQLQTPIRNYWQKNFHISFDFRSFYPNGLIFLAPGMKEKRKHYLA
LVLKDGHLLLVVRGRRREELPLHAKLNDGEWHHVTLLCIDRKVTMSVEIGRTDQKTSAQM
KVPKKISASNVVFVGGLPENPPKIPSELLVRLEPFKGCLRKFSIANSTQDLAKPGKHLHV
GQCFPKVERGSYFPGDAYAVYKRNFHVGKYLELEMEFRTSELSGILLSISESTGFPALSL
EIFNGNVVFSCDLGDGNPFRVESLLPTKYALCDNKWHNISALYDYEQIALRIDQMPATIA
VAQQRTAGKVQTKSPLYIGGIPDIASSGSLLSRENFKGCIRNVSIRNERRDWVDMDVLHN
VLLSECLVSGNLDS
NT seq
8325 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtgcaaatataatgtggagggagaggcttgttctaaatgtcgtgagggcttttacgat
ttgaatgcagacaacattgatggttgttctccttgttggtgctcaggactagaggtctcc
tgctcaagtgccaatctatcggctttggcctttgagactttaaatgattggaaaattacc
gatatcacactctcccagacaactacaccctctttggatacggacaccaactctttaagc
tacagcatgtttgatttggcagatgttgaggccatctattggcaagcccccaaaggttat
ctgggaaatcgtctctccagctacggctcacggctatccgtacaagtgaaatgggtgacg
ataagaggcgatacttcaggcaagcctaccgctggaccccatgtcatatttctgggcaag
aatggcatgaaaattgcctatggtgatgaagagttcaacagagatacttctgcagtaatc
aatataaccttggaggaaacgaactggtatcatgtacccccacaagtgaaggatataaaa
acgagaatgcgtcgcaccgactaccatggcacagaggtgtccaaggggcattttctctct
gtgttgtcgaacttaaaggccattttggttagggcctcctttcatacagatcaagtggag
acatatttggaaagagtcataatgtttaccggtggcactgaattgggccattccacatct
cgagtggagcagtgctcttgtcctccaggctacactggcttctcttgcgagtcctgcgat
tttggttatatacgaatctatgagaattcctcagatcatcatgaagtgggtaggtgtaaa
ccatgtccttgtaatggccattcgaattcgtgtgatgtacagagtggaggatgtggaaat
tgcatgcataacacctatggcgaaagatgtgaacgctgtaaacgtggtttctatggcaat
ccgcttgaaggcacacccaatgattgtcgcccatgtgcttgccctctgttggtggatagc
aacaacttctcgcccagttgtcagctaaagacttattccgttacagacatcaacccaatg
tttggtgtggtgaaaaatgctgaatacatatgcacacaatgtccgccaggctacaccgga
gatcattgcgaaatgtgcgatgatggttattatggcaaacctaccgaaatcggatcctcc
tgccgcccttgtaattgtgatggaggaccttgcgatgttttcactggccaatgcattgtg
tgcgagggcaacactgaaggctggcactgtgaacgctgtaaactgggcttctggggtgat
ccctcggtgggctgtgaaccctgttcctgctttgagcaaggttcagatagtgctgtctgt
gacagcaccgatggccagtgtctctgcaaaccccgttatgcgggacaaaaatgcgacgaa
tgtgatgagggctatgctctgcttgatgaacaatgctctccatgtggttgtgatgaattt
ggtaccattgatcctaacacttgtgatcccgacaatggtcagtgttattgtaaacccggt
gtggagggtctcaaatgcaaggaatgcagtttaggatattttggccttaaagaagaatcc
aatggttgtacggaatgtcaatgcagtcatttgggctcaattggtaatacctgcgataaa
cgttcgggtcaatgctcttgcctgccaaatgttaccggacgccgttgtgataaatgcaaa
tcgggccattggaatttgacacaaaatgtgggatgtcatgattgtcgttgtgatccctcg
ggatcgcgtggtcatgagtgcaatccatggactggtcagtgtgattgtaagattggtgtg
ggaggtcaacgctgtaatgaatgcaccgatggtttctttggcttctccaccgatggatgc
cagaggtgtgcaccctgtccaggcgagggacaagtatgtgatcccattaatggcagatgt
gtttgtccacccaatagcagaggtttgggttgtagccaatgtatgagtggtacctggggt
tggcaaccaaggctgggctgtcgagaatgccaatgtgatcgtgtgggttccataggaaaa
tattgtcacaccatttcagggcaatgtcaatgtagagaaggctacacaggcagacgttgt
gattcatgtgccataggctattttggctatcccgagtgtcggcgctgtaactgtgatgtg
gatggttcgtttgtgagaagtgatggtcttatagcctgtgatgcgaatggccagtgccct
tgtaagagtttggtggtgggcctgaagtgtgatacctgtatgcagtccacctttggcttg
tccgccttgaaccctgagggatgtactcgctgctattgttttggccgagccaccgaatgt
gagcagagtgattggtcttggggtcatgtgcgtatgtctgaggcccgcaatttgactgtg
caatatgtcagggcttcgcatgtcaccaacacggagttcgaatacattgtggtggtgcaa
atgagtggctcgcaaacatatcgcgaagatgccgaaatacaaaatatgaatggcttgaat
ttaataccccgctccacgggcaatgtgaccatgggctcgtatagccaattgtattatccc
ctgtatttccaattgccgccacaattttatggtgatcgtaccaacagttatggtggcaac
ttgtatttcactctgctcactgagggcggctcgacgcctttggatcgtaagatattgggg
cgttatcctttagtgcaaatgcatgcccatagtagaatgatattggatttctatgagtat
gagtcgtttgagtattcgcgcaatgagacatacagagtgcctttacatgagtcctattgg
aagttgcatcataatggtcaggcggtggataggagtacactgatggcggcgttgcagaat
gtaagacatgtgtttatacgaggatcctgttttgccgattttacggagatcattttgcaa
aatgtccatatggactcggcgatttatgtccacggctccaccagcatgctggccaaaggt
gtggagaaatgtaaatgtcccaaacgctatgatggtttgtcttgccaggatcctggccag
ggctattacagatggcgcaatgtcaccgaaaccatttcggagaccatatacatagaggag
atgataggcagggccgcaccctgtaactgcaatgggcgcagtaatcaatgtaatcgagag
actggggaatgtatgaattgtgttgagaactctggtggccgccattgtgaacaatgtgcc
gagggcttttatggtgatcccaattccccctatggctgtcaggcctgtccttgtcccgag
acaaatcgtaactttgccaaaggctgcaccgtatggcagggtgaagtcaattgtgtttgt
cgtcctggttatatgggcaaactctgtgatcaatgtcgtcctggcttctatggcaatccc
atggcctcccccaatagtacctgtaagccttgtgattgcaatctctatggcgtgagtcag
gagggttgcgatgccaaaacagggcaatgttattgtcagcctggaattacaggcctaaaa
tgtgacaaatgtatggcggaacgccatcatctagaggaaaagggttgtaaaatctgcgac
aactgcactctactgctaatggactatgtgcaactgataggccacaagctgaggagaggt
ttgcacaacatggacttgactggcataccggcgccctacaagaaagtggaggaatatgag
ctgctgtttcatcaagaggatgttcgctatcaggacttcaatgatgctcgccgtttgtta
ttgaactatgacagcaatgccttgctgaaattggattctcatgctgaaaatcagaaattt
caaaatcgcaaggccttggccacagcggaaaagcgtacctatgccatggccatactggtg
caggatgccactgttttgtaccaggacttggactccgttaagacagacattctgcaaaac
atagccactttggataattatgggcgtggtgctcatcatctgagtctaccttccgccttg
cagcaggcccgtttctatttggattccattaaacagcatcgcgattcgtttgaggatata
cgctcggcctccgcttgtgcctggcattatttttataaatttggcaatgcctccgatttg
gccttcgatcagaaaggcaaaattgaaatgttttggagagatctaaatcactctaatttt
cgcatatcggatatgcgtttacaggctgatcgcactgtggaaatgcaaaacgaaatcgat
gatgttctggagcacataaagaatctcaagatttacactttggaggattatcaacaaatt
caggatcagcaaactttggtggaggacactctcaaacagactcttatgccccagacatcg
gttttaatagaattgaatatagatcgcctggagctgttaagtgataccgtggattctata
accaaactaggcaccatgttgaatgtaactcaggagagcaatgagataatgcatagagag
gtacgcaagcattggttgcccaaggcccagaaacatgctgcccgcttgctagaaagatcc
aatgaatatgctcggcaatttcagcccaccaggcagggggcacgcatagccatgttggcc
agttctgcccataaaaatatttccgatgccattgaggccgcccgtttggcctccaaggag
gctcgtgagcaagtatattctgcccatcataaattatatccccgtctggggctttcggta
atcgaaagggcccgcctctctttgcataattcacagattttaaagaaacaagccatggat
aagatacaggatacaggagttctagataatcgcttaaagttccatgagaacaaagtcgag
tccattaaatcacgcattttggaagctggcatacgcaccaacaacatctcctcctatata
ccacccatgcagcgtaccacggctcgtaaaaatgctgtagaaagtttggatagcgcctcc
actacctcagaagaaatgagagcagtaacccaaaaaactcgagagttgcatgaggacatc
agaaaattgcgcgataagttcgccatacttgaacctgattttgaaattaaactaggcatg
gctgaggagaatatttcgctgaccaagaccaatgtgcgtctggccaatatctcgctgacc
tatgtggaggagcaggcggtgagggaacaaaatgaatttgatgtatggaataataccatg
gcccagcagatgcaaaagctgcgtgatcaaataaccaaagccaagcatgcggcagagacc
attaaaatttccctacaatcgatgggtcctaaatgtatcagatcctatttgcccacttcc
tatggtctgaccacttcgaatagcataaagatcagctttgccttggccaatcgcaatggc
aactctcccctgttgtatatacaaggcaatgatgatcgttacatagccttggatttgttt
aagcgtcatgtgcgtttgctgtggaatttgggaggagctacggaaattatcacccatccc
ttggagatacagacacgagatccccaatacgatgatgcctggtatcatgtggaggttaat
cgcactctgaatgtgggcagtcttttggtgaggcgcatgaataattatggagccctggtg
cctcagaccccggtgacaggcagcacagatgtggagttcacacgctttatacaaaccccc
gaggatcgcatattcttgggtggttatcccaagattttaagaaccaaggatttgcagctc
aacccagggctaaatgtggtggtccacagtgtggaggtggataacaaacccatgggtata
tggaattttgccacaagtgagggaaaatgtggaggagccatgataggagctcaggaatca
acctcctcctcagtggcccgacatttcaatggcctaggctatgcggaagttaagaaatca
aggccaagaccgtatcgtaagaatttgtttgccttacaaatgaccttcaagacattggat
gagaatgcgttgctattcctggcagtggatgataagaataaccgctctgtttctgtaaca
cttagtcgtggtcgcattatgttccgcatagattatggcgatgaatccaagttggaaatc
aataccaccaataaatacaacaccggcaaatgggttaaaatcgaggccgccagagaattt
gtgcccaagcgtggcactgagaatggtattttgcgtgtcagcaatgatcggcccataaca
ggttcccccactgtgcctataaagagtcacatgttgccagatctctccaaggctgtctac
tatttgggaggtgtgcctccgggctttacttcagccacttctaaggctccaggggctgat
aatcccttcttgggttgcatgatggatgtgcaggttaatggtgagacttatgatcccttg
gagggttccacacatttcggggtggagtcttcttgcaaggaaatgataaccaaagctggc
ttcaggggccaaggctatatagaactgccctctcaatctctacgcaagcgtgccaatact
ggttttgttttccgcactttacaagccgattgtttgctcatgttggccgcctatcctccc
gaagtgcaagaggactatgatgccaaagatattaagggcaactattccatatctctcata
gatggtcatctgcaagtttgggttaactctggacgcagtctggttaaaatgaaatccaat
gtctcccttaatgatggagaatttcatgttgtaaatctgttgaagaatggtcgtcatctt
gaattgatggttgatgatgaactgcaagagagtaaaaatcttatgggctctcccaccttg
gttagtatgcccagagatgctggtggtctatacatagggggttcgcctccccatgaggaa
tatacacccttggctcctacctttaataagttggaaggggccatacgagatgtggtcttc
aataatcgtaccattaacttcaatcaagccttatcgtttgtcaatgtgcaaattggacgc
aatggccctgctatgggtagtgtgaatggccttagcgatattttgatgaagactgaaccc
atgattggtaaaagttttacggcagctcccgaaggatgtaaaagggtgggcagctattcc
tacgagccaaatgcctttaaatttggcgatgaaccctatagttttgctcaattgcaaact
ccaatccgtaactattggcaaaagaatttccatatttccttcgattttcgttccttctat
ccgaatggtctgatcttcctagcccccggtatgaaagagaagcggaaacattatctagct
ttagttctcaaggatggtcatcttctattggtggtgcgcggaagaagaagagaagaattg
cctttacatgccaagctaaatgatggcgaatggcatcatgtcaccttgttgtgcattgat
cgcaaagtgaccatgtctgtggagattggaagaacagatcaaaagacttcggctcagatg
aaagttcccaaaaagatttctgcttccaatgtggtgtttgttggaggtttgccagagaat
ccgccaaaaataccttcagagcttttggtacgtttggaaccatttaagggttgcctaagg
aaattttccatagccaatagtacacaagatttggctaagcctggaaaacatctgcatgtg
ggtcaatgttttcccaaagtggagaggggatcctattttccgggagatgcctatgcggtg
tataaacgtaacttccacgttggcaaatatttggaattagaaatggaatttaggacttcg
gaactctccggtatattattaagtatttcagagtctacaggatttccggctctatcacta
gagatttttaatggcaatgtggtcttctcttgtgatttgggtgatggtaatcccttccgc
gtcgaatcattattgcccaccaaatatgctttgtgtgacaataaatggcataatatatcg
gccctgtacgattatgagcaaattgccttaaggatagatcaaatgccggcaacaatagcg
gtggcgcagcaaaggacagctggaaaggtacaaacgaagtcacctttgtacataggtggg
attccagatatcgcctccagtggatccctattgtcgcgtgaaaacttcaaaggttgcata
cgtaatgtctccatacgcaatgaacgtcgagattgggtagatatggatgtactgcacaat
gtactgctgagtgagtgtctagtatcgggaaatcttgatagctga
DBGET
integrated database retrieval system