Sporomusa carbonis: SCACP_01600
Help
Entry
SCACP_01600 CDS
T10996
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
scao Sporomusa carbonis
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Glyco_hydro_77
Alpha-amylase
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XEQ91365
LinkDB
All DBs
Position
203693..207268
Genome browser
AA seq
1191 aa
AA seq
DB search
MNQYWILHDSHNVDFRSPFGAASCHSEITLKLLIATPHHYGVPPLDAVLLRTWQDGTGET
MIDMRLAQDHGGQKLYEAVITAPDSPGVIWYYFVVRQGGQTFYYGNNAEETGGVGHIYDS
PPPSYQISTYIPGATTPKWFKNAIVYQIFVDRFYNGLPDGKILNPRPGSLIHADWYDTPV
YTRDMDTGAILAYDFFGGNLAGVIAKLPYLEELGITAIYLNPVFAAPSNHKYDTADYKTI
DPMFGDNALFAELCTKAKERGIAVILDGVFSHTGSDSIYFNQNGTYDSVGACQSRESPYY
SWYKFIDYPVSYESWWGIGTLPNVNEDDPSYQNFIIDAPDSVLKQWLGLGAKGWRLDVAD
ELPETFLKNFYKTLKQEDPEAILIGEVWEDASRKVAYGNLRQYFNGTELDAVMNYPFRKI
ILDFMLGWRDADAVHRALFSLYENYPKENFYANLNIIGSHDVPRILTLLGEAPPEESHSK
LNAFKHRLTSEQRALGLARLKLVVLWQMTFPGAPCIYYGDEVGVEGYSDPLNRRPYPWGR
EDRDLLAWYKKLTGLRRQYPVLRTGEWLPLIAAGDVYGYVRRIRSGKDVFGDLEADNTAA
VIINRSTTAEAHISIDTNAWFADQDYVIDMLTGEKIMLPEQGNLELKIPALSGKLLLAHV
EPPATERQRSSGILLHPTSLPSPFGIGDLGPEAYRFVDFLVAGEQRVWQFLPLNPVGFGE
SPYQCLSAFAGNPLLISPEKLAEDGWLTQAELPLAAFANYDNYTIDFPRVKLWKEKSLRL
AFDRFKYRGDTGAYRNFKEQAEAWLADYTLFIALKKHFRGMPWNQWDSDIRWREPEAIDY
YRQVLEEEIEYQNFLQFIFWQQWQELKVYANHRGISLFGDLPLFVAHDSADVWANPELFE
LDAAGSPAKVAGVPPDYFSATGQLWGNPLYKWEAMAQDDYCWWRHRLEVLLNLVDFIRID
HFRGFDAYWEIPAGEQTAVNGRWVTGPGAKLFTVLEKYLGKLPLVAEDLGIITPGVNRLK
HRFAYPGMKVLQFSFGDGWTAPDFPHNTGYNTIAYTGTHDNDTLLGWYQKLDSAEPHVKR
VILEHLQRLKLGDDMSDTGVCEQLIRLAYLSRANTVIVPLQDVLGLGSEARMNTPGTVGG
NWNWRLKPGMLTPEIAGRLAGWTRLGGRAGRLGQTAPSQDKHQDANGGFSK
NT seq
3576 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgaatcaatactggatattgcacgactcccacaatgtcgactttcgcagcccttttggg
gctgcttcttgtcatagcgaaataacgctaaaactgctgattgcaaccccgcatcattat
ggcgtgccgccccttgatgccgtacttttaagaacctggcaggacggcacgggcgagacc
atgatagatatgcggctggcgcaggatcatggcgggcaaaaactgtacgaggcggtcatt
accgcccccgacagtccgggggttatttggtactattttgttgtcagacagggcggccaa
acgttctactatggcaacaatgccgaggaaacaggcggcgtgggacatatctatgactct
ccgccgccgtcatatcagataagcacctatattccgggggcgactacgcccaaatggttt
aagaatgccatcgtctatcagatatttgttgacagattttataacggtctgccggacgga
aaaattttaaatccccgtccgggcagcctaattcacgcggactggtatgacacacctgtt
tacacccgcgacatggacactggtgcgatactagcttatgactttttcggcggtaatttg
gcaggcgttattgccaagctgccttaccttgaggaacttggcataacggccatttatctt
aaccccgtatttgccgcgccttccaaccacaaatatgacacggccgactacaaaaccatt
gaccccatgtttggcgataatgcattgtttgccgaactgtgcaccaaggccaaagagcgt
ggtatagcggtaattcttgacggggtgttcagccataccggcagtgacagcatttatttt
aaccaaaatgggacttatgacagtgtcggagcgtgccagtcccgggaatctccctattat
tcttggtacaaatttatcgactatcctgtcagctacgagtcctggtggggtattggcaca
ttgcctaatgtcaacgaagacgacccttcataccagaactttattattgatgcgccggac
agtgtgcttaaacagtggcttgggctgggagccaaaggctggcggctggatgtcgccgac
gaactgccggaaacttttttaaaaaatttttataaaacactcaaacaagaagacccggaa
gctattttaatcggtgaggtatgggaagacgcctcacgcaaagttgcctacggcaatctc
cggcagtattttaacggtaccgagcttgatgctgtcatgaattaccccttccgaaaaatt
atcctcgatttcatgctgggctggcgtgatgccgacgccgttcaccgtgcgttgttcagt
ctgtatgaaaactatccgaaagaaaatttttatgccaacttaaatattattggcagccat
gatgtgccgcgcattttgacgctcttgggcgaagcgccgccggaagagtcgcacagcaaa
cttaatgcgtttaagcatcggttgacatctgagcagcgggcgcttggtttggcccggctc
aagcttgttgtgctctggcagatgactttcccgggcgctccctgcatctattacggggat
gaagtcggcgttgaaggctacagcgacccgttaaaccggcgaccgtatccgtggggacgg
gaagaccgcgatctgctggcatggtataagaaattgacaggtttgcgccggcaatatccg
gtgctgaggacaggcgagtggctgccacttattgctgccggtgatgtgtacggttatgtg
cgccgtatccggagcgggaaagatgtttttggcgatttggaagccgataatactgcggcc
gttattatcaatcgcagcactacggccgaggctcacataagtattgataccaacgcttgg
tttgccgaccaggactatgttattgacatgctgaccggtgaaaaaattatgctgccggaa
cagggaaaccttgaacttaagataccggcgctctccggcaaactgttgcttgcccatgtt
gagccgcctgcaaccgaacggcagcgttcgagcggcattcttttgcaccctacctcgctg
ccttcgccgtttggcatcggcgatttggggccggaagcctaccggtttgttgattttctt
gtagccggcgagcagcgggtgtggcagtttttgccgttaaatcctgtgggctttggcgaa
tcgccgtatcagtgcttgtccgcgtttgccggcaatccgctattaatttctccggaaaag
ctggcggaagacgggtggctgacccaagccgaactgccgctggcggcctttgctaattac
gataactatactattgatttccccagggtaaaactatggaaggaaaaatccttgcgactg
gctttcgaccgattcaaataccggggtgatactggcgcataccggaatttcaaggaacaa
gcagaagcgtggctggcagactatacattgtttattgctctaaaaaagcacttccggggc
atgccctggaatcaatgggacagtgatatcagatggcgcgaacctgaggctatcgactat
tatcgccaggtgcttgaggaggaaattgaataccagaactttttgcagtttatattctgg
cagcagtggcaggaactgaaggtttacgccaaccaccggggtattagcctgtttggtgat
ttaccgctgtttgtcgcccatgacagcgctgatgtatgggccaatcccgaactgttcgag
cttgatgccgccggtagcccggccaaagtggccggtgtgccgcctgactatttcagcgct
accggccaactgtggggcaacccgttatataagtgggaggcgatggcacaggacgactac
tgctggtggcgccaccgcctggaagtgttgctcaacctggttgactttattcgcatcgac
catttccgtggttttgacgcctattgggagataccggccggggagcagacagccgttaat
ggccgctgggtaaccggtccgggggcaaagctgtttaccgtgctggaaaagtatctgggc
aaactgccgctggtggctgaagatctgggcataattactcctggtgttaaccggttgaaa
caccggtttgcttatcctggcatgaaggtgttgcagtttagcttcggtgacggctggaca
gcgcccgactttccccataataccggctataataccatcgcttacaccggcacgcatgac
aacgacacgctcttaggctggtatcaaaagctggacagcgccgagccgcatgtaaagcgc
gttatccttgaacatttacagcgacttaagctgggtgacgatatgagtgacaccggtgta
tgcgagcagctcatcaggctggcctacctcagccgggccaatactgttattgtgccgctc
caggatgtgttggggttaggcagtgaggccaggatgaacacaccaggcacagttggcggt
aactggaactggcggctgaagccaggcatgcttaccccggaaatagccggacgtctggca
ggatggacccggcttggcgggcgcgcaggccgccttgggcaaacggcaccatcacaggat
aaacaccaggatgccaatgggggatttagcaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
