Staphylococcus caprae: DWB96_10900
Help
Entry
DWB96_10900 CDS
T06252
Name
(GenBank) AraC family transcriptional regulator
Organism
scar
Staphylococcus caprae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HTH_AraC
HTH_18
HTH_5
MarR
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QDW94712
LinkDB
All DBs
Position
complement(2256667..2258736)
Genome browser
AA seq
689 aa
AA seq
DB search
MHLQQFRKHRTLTNELYIVNNMDVFGINSNGTTLEIYISSDWFTELGYNFFDYHYTAELI
KSTNEVKYLMAELALNFLDDNTDKEHELINKIVETLAKEASIDKKIAEDQYIYAFYGDLK
EELDYIYNHMSERLTLKDISNQLYVSKSNLSSQFHILMGMGFKKYVDTLKISKSIEMLLT
TDKTISQISDKLGFSNASTYSKQFKNYLSVTPNEYRTMKKYDKYNGCSDDSIPDHRKAPL
RKLIRSVTPNNVSDAYDKIKIDASPHTEASTFYSVIQINTVEEIKVLFLEGLYKRIGFKD
SNIIFYFMPHLYEYSNDLTENEKNYISQTIIENELHVAFHIEEIERVNELKESFMWGLNQ
FSDKSSVIDKDYEVQFIFNLKEKEIRDIYRDILKMQNMPLKYKVGLDISCMVDDPTQFKA
LESQIKRLKFDYLYIDNAQLTSPYLMGSNGGLFLKNILQLQHLNVNLEQFDFDKENLIFL
NLVNHQLLNNEEIDLSNSAPLLYQSVAKLKESFSGYGLNLFSHPNLFNAVHLFDENGFKT
TLGLIFNDLSWMINQNKCEKRFYNIVENEDRYLLYLFDWRVIESESKGDNFNDIEVDISF
EDPQLADEYICVMAKIDNESGNINHIISQELRSKYDWSTKFLIKVEDNFKPYVEIFEHDF
KDKSLKVNLKYNAVYLIKIYKKDNRLKKA
NT seq
2070 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaccttcaacaatttagaaaacatagaaccttaacgaacgaattatatatcgttaat
aatatggatgtatttggtattaatagtaatggtacaacactagaaatatatatttctagc
gattggtttacagagttaggatacaatttctttgattatcattatactgctgaactgatt
aaatctacgaatgaagttaaatatctaatggctgaacttgcattaaattttcttgatgat
aatactgataaagagcatgaacttattaataaaattgttgaaacacttgcgaaagaggca
agtatcgataaaaaaatagccgaagatcaatacatatatgcattttatggagacttaaaa
gaagaattagattatatatataaccatatgagtgaaagattgactttaaaagatatatca
aatcaattatatgtatccaagtctaatttatcctctcaatttcatatattaatggggatg
ggtttcaaaaaatatgttgatactttaaaaattagtaaatcgatagagatgttattgact
acagataaaacgattagtcaaatcagcgacaaattaggttttagtaatgcttcaacctat
tcaaaacagtttaaaaattatttaagtgttacacctaacgaatatcgaacgatgaagaaa
tatgataaatacaatggctgttctgatgattcaatacctgatcatcgtaaagcgccgcta
agaaaacttattcgttctgtcacacctaataacgtttctgatgcttacgataaaattaaa
attgatgcctcccctcatacagaggcatcaactttttattcagtgattcaaattaatact
gtcgaggaaatcaaagttctcttcttagagggtttatataaaagaattggcttcaaagat
tctaatattatcttttactttatgcctcatttatacgaatatagcaatgatttaacagaa
aacgaaaaaaattatatcagtcagaccattatcgagaatgaattacatgtcgcatttcat
attgaagaaattgaacgtgtcaatgaactaaaagagagtttcatgtgggggctaaatcaa
ttcagtgacaaatcctctgtgatagataaagattatgaagttcaattcatttttaattta
aaagaaaaagaaatacgcgatatttatagagatatcttaaaaatgcaaaacatgccgttg
aaatacaaagtaggattagatatcagttgtatggttgatgatcctactcaatttaaagca
ttagaatctcaaattaagagattaaagtttgattatctttatatagataatgcgcagtta
acttctccttatttgatgggaagcaacgggggtctgttcctaaagaatatactccaattg
caacacttgaatgttaatttagaacagtttgattttgacaaagagaatcttatttttcta
aatttagtgaaccaccaattattaaataatgaagaaattgatttaagtaatagtgctcca
cttttatatcaatctgttgctaaattgaaagaaagcttttctggttatggattaaactta
ttttctcaccccaatctatttaacgcagttcatttatttgatgaaaatggctttaaaaca
acattaggacttatatttaatgatttaagttggatgattaatcaaaataagtgtgaaaaa
cgtttctataatattgtagagaatgaagacagatatttgctttatctatttgattggcgc
gtgattgaaagtgaatcaaaaggagacaatttcaatgatatagaagttgatattagtttt
gaggatccacaattagcagatgaatacatttgtgtaatggctaaaattgataatgaaagt
ggtaatatcaatcacattatttctcaagaattgcgaagcaaatacgactggtctactaag
tttctaattaaagttgaagataattttaaaccgtatgttgagatttttgagcatgatttt
aaggataagtctttaaaagtgaatttaaaatataacgctgtttatctcataaagatttat
aaaaaagataacagattaaaaaaggcgtga
DBGET
integrated database retrieval system
