Scyliorhinus canicula (smaller spotted catshark): 119957524
Help
Entry
119957524 CDS
T11175
Name
(RefSeq) mucin-2-like isoform X1
Organism
scau Scyliorhinus canicula (smaller spotted catshark)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Extensin_1
Astacin
MAM
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
119957524
NCBI-ProteinID:
XP_038641585
LinkDB
All DBs
Position
26:complement(1461944..1489812)
Genome browser
AA seq
2183 aa
AA seq
DB search
MGGRVWQFLFLTLALALRAVRQTEVKKQVSSLRLDTVQTKTTLTAEDAIVRINQRIFRYE
KPWRSFLIEGDIIKPLWKNAVVSETKIWQKSPDGVVRIPYEISQKYDEETRSSISRGFKD
FEKFTCVRFAPHSDEEDFISIQPIHGCYSSVGRIGGMQLISLNHQCLKKGKGVVEHEIMH
SLGFWHEHARSDRDKFIKIEWKNVWPGYEHNFLKQNTNNLKTKYDYGSILHYSRTAFSKN
REPTLRPLMDTDTVLGQRIRLSELDLVKVNRLYNCTTHLKDKANVVKRLQMLNEDGSLHE
LGRAKEAGRLKFLLGIYPETVKVRVDTSAQLIWSLSGNGSTGNHTTTTTHGYRECFRQGT
CSPTSWPTKSGAAFIRNASVIAAVKAPEASGDQVELSVVAQDQSQKAETLFPTRTELPFA
QSVSTNLKTTHPLLHIMSPALTRRTLTQPPAPCPKGCTRRMSKEPILHQQSQNLFGQIEL
LPVTPHFLKSGNQTHGSVLFSADSLTTRRQGPRPITWSDEADTHTQAANIVQQSSSASGF
PPVLINAIYPKRFAILCQSCKRRHERLPIWPVFKTQLTGHLEIMTPANQLKVPTVQSTIP
GTGTTITPGILRTDVGESPRVQIDMASQKKAPTVTLHTKRLSSHLKIGCLARWNKALKVC
DPLVTTRTAPTHTHLTPTSPTEMLLQSMSLVKSLLASAALVNARVEPLRSTDILLGPVHP
TENVLKSTPLADTQLSSIPLVGTLLVPTDPEGTLLAPTDPEGTLLAPTHPEGTLLAPTDP
EGTLLAPTDPEGTLLAPTHPEGTLLAPTHPEGTLLAPTHPEDTLLAPTDPAEMLLASTGP
ANTLLTSTPHADNLLASTPPAQMLPDSTLPGQTLLASTPPENSLLASTAHADSPLSSVES
LLAPTVIEDTPRAYTPPADTPPADTPQAYTPPADTPWAYTPPADTPRAYTPPADTPQAYT
PPADTPQAFTPPADTPPADTPQAFTPPADTPRASTPPADTPQAFTPPADTPQASTPPADT
PRAYTPPADTPPADTPQASTPPADTPQAYTPPADTPEASTPPADTPQAFTPPADTPQAST
PPADTPRAYTPPADTPPADTPQASTPPADTPQAYTPPADTPEASTPPADTPQAFTPPADT
PRAFSPPADTPQAFTPPADTARAYTPPADTPRAYTPPADTPWAFTPPADTPRAYTPPADT
PRAYTPPADTPPADTPWASTPPADTPRAYTPPADTPPADTPWAYTPPADTPRAYTPPADT
PRAYTPPVDTPQAYTPPADTPQAYTPPADTPPADTPWASTPPADTPPADTPWAYTPPADT
PRAYTPPADTPQAYTPPADTPQAFTPPADTPQASTPPADTPRAYTPPADTPQASTPPADT
PRAFSPPANTPQASTPPADTPRAFSPPADTSQAYTPPADTPRAYTPPVDTPRAYTPPADT
PRAYTPPADPPWASTPPADTPQAYTPPADTPRAYTPPADTPRAYTPPADTHRAYTPPTDT
PRASSPPADTPQASTPPADTPPADTPQAYTPPADTPRASTPPADTPWAFSPPADNPQAYT
PPADTPPADTPWASTPPADTPRAYTPPADTPQAYTPPADTPRAYTPPADTPQAYTPPADT
PRAYTPPADTPRAYTPPADTPQASTPPADTPRAYTPPADTPQAYTPPADTPPADTPRAYT
PPADTTQASTPPADTPRAFSPPADTPRAFSPPADTLRASTLPTGTPRAYTPPADTPRAYT
PPADTPRASSPPADTHRAYTPPADTPRAYTPPADTPWAFSPPADTPQAFTPPADTPQAST
PRADTPRASTPPADIPQASTPRADTPWAPTPPADTPQASTPPVDTPRASTTPADTPQAST
PPADTLVVTAAPADTPQASTTPADTPWATTPPVDTPPADTPWASTPPADTPPAAPLRALT
HPAETLLPAEALLSSTHIADTLLTSSSSAIINAGDPQSIISPFTVTRWYSPVVTNTLYDS
KLLSPSRSVLPADLTVEQLCDFEHGLCDWGQSTTDDFDWMLHHRQTSSRGTGPKWDHTRG
QCKGRGGHYLYLEASYPRQSGEHAALVSPVLRGQKCLTFWFNMFGSHMGSLNVFQKSENA
PHWHKLWSVSGNKGRKWLNAEIDLFPHGETYQVIIEGVLGPNYQSDAAIDDVQIHRSSCT
SGWERRNPSCNWGRKKRNKSHLG
NT seq
6552 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggcggaagagtgtggcaattcctatttctcaccttggcacttgcactgagagcagtc
agacagaccgaggttaagaaacaagtcagcagccttcgtctggatactgttcaaaccaag
actacccttacagcagaggatgcaattgtcaggattaaccagcgtatctttcgatatgaa
aagccctggaggagcttcctcatcgaaggggacattatcaaacctctgtggaagaatgct
gtagtgtctgaaaccaagatatggcagaaatcgccagatggggtggtgagaattccatac
gaaatatctcagaagtacgatgaggagaccaggagctccatcagccgaggtttcaaggac
tttgagaagttcacctgtgtacggtttgcccctcacagtgatgaggaggacttcatttcc
attcagcccatccacgggtgttactcgtccgtgggccgcattggagggatgcagctaatc
tcactcaatcaccagtgcctgaagaaggggaagggggttgttgaacatgagatcatgcac
tcacttggcttctggcacgagcatgcaaggagtgatcgagacaaattcatcaaaattgag
tggaagaacgtgtggcctggctatgaacataatttcttgaagcaaaacaccaacaatctc
aagaccaaatatgattatggctccatcttgcactacagtaggactgcattttccaagaac
agagagccaaccctgagaccgctgatggatacggatactgtgctcggccaacgcattcgc
ctgagtgagctggacttggtgaaggttaatcggctctacaactgcaccacccacctcaaa
gataaggcgaatgtggtgaaacgtcttcaaatgctgaatgaagatggttccttgcacgaa
cttggaagagccaaagaagcagggagattaaaatttctcttgggtatctatcctgaaaca
gtgaaagtgagagttgacacatcagcgcagctgatttggagtttgagtgggaatgggtcc
acaggaaaccacaccacgaccactacccatggatatcgtgaatgctttcgacaaggtacg
tgctcacccacttcttggccaactaagtcgggagctgcgttcatccgcaatgcctcggtc
atagctgcggtgaaggctcctgaagcttctggggaccaggtggagttgtctgttgtggca
caggaccaaagtcaaaaagctgagacactgtttcccactcgcactgagctgccttttgct
cagagtgtgagcacaaacctgaaaaccactcacccccttctgcacatcatgtctcctgca
ctgaccaggcggactctgactcaaccacctgcaccttgccccaagggatgcaccaggcgc
atgagcaaggaaccaattctgcaccagcaaagccaaaatttatttgggcagattgaactg
ttgcctgtaactccccatttccttaaatccggcaaccagactcacgggtcagtgctgttt
tcggctgactcattgaccactcgacgccaggggcctcggccaatcacttggagcgatgaa
gcagacacgcacacacaagcagccaatattgtacaacaatcttcgtcagcgtctgggttt
ccgcccgttctgatcaatgctatttatccaaaacgatttgccattctctgccaaagttgt
aaacggagacatgaaagattgcccatttggccagtcttcaagacacaactaactggacac
ttggaaataatgactccagccaatcaattgaaggtgccaactgtgcagtcgacgattcca
ggaactggaaccacaataacacctggaattcttcgtacagatgttggggaaagtccccgt
gtgcagatcgatatggcctcacagaagaaggcaccaaccgtgaccttgcacacaaagaga
ctgtcttctcacctgaaaattggttgtttagcaagatggaacaaggcattgaaagtgtgt
gaccctctggtgacaaccaggactgccccaacacatactcacctgacgcccacttcccct
acggagatgctgttgcagtccatgtcccttgtgaagtcgctgttggcctccgctgccctt
gtaaatgcccgagtagagccccttcgctctacggacatcctgctggggcccgtacaccca
acggagaacgtgctgaaatccactccccttgcggatacccagctgtcctctatacccctt
gtgggcaccctgcttgtccccactgaccctgagggcactctgcttgcccccactgaccct
gagggcaccctgcttgcccccactcaccctgagggcaccctgcttgcccccactgacccg
gagggcaccctgcttgcccccactgaccctgagggcaccctgcttgcccccactcaccct
gagggcaccctgcttgcccccactcaccctgagggcaccctgcttgcccccactcaccct
gaggacaccctgcttgcccccactgaccctgcagaaatgctactggcctccactggtcct
gccaacaccttgctcacctctactccccatgcagacaacctgctggcttcaactccccca
gcacagatgctgccggacagcactctccctgggcagactctgctagcctccactccccca
gagaactccctgctggcctccacagcccatgcggacagtccgctatcatcggtggagtcg
ctgttggcacccactgtcattgaggacactccccgggcctacactccccctgctgacact
ccccctgcggacactccccaggcctacactccccctgcggacactccctgggcctacact
ccccctgcggacactccccgggcctacactccccctgctgacactccccaggcctacact
ccccctgctgacactccccaggccttcactccccctgcggacactccccctgcggacact
ccccaggccttcactccccctgcggacactccccgggcctccactccccctgcagacact
ccccaggccttcactccccctgcggacactccccaggcctccacaccccctgcggacact
cctcgggcctacactccccctgcggacactccccctgcggacactccccaggcctccaca
ccccctgcggacactccccaggcttacactccccctgcggatactcccgaggcctccact
ccccctgcggacactccccaggccttcactccccctgcggacactccccaggcctccaca
ccccctgcggacactcctcgggcctacactccccctgcggacactccccctgcggacact
ccccaggcctccacaccccctgcggacactccccaggcttacactccccctgcggatact
cccgaggcctccactccccctgcggacactccccaggccttcactccacctgcggacact
ccccgggccttcagtccccctgcggacactccccaggccttcactccccctgcggacact
gcccgggcctacactccccctgctgacactccccgggcctacactccccctgcggacact
ccctgggccttcactccccctgcggacactccccgggcctacactccccctgcggacact
ccccgggcctacactccccctgctgacactccccctgcggacactccctgggcctccact
ccccctgcggatactccccgggcctacactccccctgctgacactccccctgcggacact
ccctgggcctacactccccctgcggacactccccgggcctacactccccctgcggacact
ccccgggcctacactccccctgtggacactccccaggcctacactccccctgcggacact
ccccaggcctacactccccctgctgacactccccctgcggacactccctgggcctccact
ccccctgctgacactccccctgcggacactccctgggcctacactccccctgcggacact
ccccgggcctacactccccctgcggacactccccaggcctacactccccctgcggacact
ccccaggccttcactccccctgcggatactccccaggcctccacaccccctgcggacact
cctcgggcctacactccccctgcggacactccccaggcctccactccccctgcggacact
ccccgggccttcagtccccctgcgaacactccccaggcctccactccccctgcggacact
ccccgggccttcagtccccctgcggacacttcccaggcctacactccccctgcggacact
ccccgggcctacactccccctgtggacactccccgagcctacactccccctgcggacact
ccccgggcctacactccccctgcggaccctccctgggcttctactccccctgcggacact
ccccaggcctacactccccctgcggacactccccgggcctacactccccctgcggacact
ccccgggcctacactccccctgcggacactcatcgggcctacactccccctacggacact
ccccgggcctcctctccccctgcggacactccccaggcctccactccccctgcggacact
ccccctgcggatactccccaggcctacactccccctgcggacactccccgggcctccact
ccccctgcggacactccctgggccttcagtccccctgcggacaatccccaggcctacact
ccccctgcagacactccccctgcggacactccctgggcctccactccccctgcggacact
ccccgggcctacactccccctgcggacactccccaggcctacactccccctgctgacact
ccccgggcctacactccccctgcggacactccccaggcctacactccccctgcggacact
ccccgggcctacactccccctgcggacactccccgggcctacactccccctgcggacact
ccccaggcctccactccccctgcggacactccccgggcctacactccccctgcggacact
ccccaggcctacactccccctgcggacactccccctgcggacactccccgggcctacact
ccccctgcggacacaacccaggcctccactccccctgcggacactccccgggccttcagt
ccccctgcggacactccccgggccttcagtccccctgcggacactctccgggcctccact
ctccctacgggcactccccgggcctacactccccctgcggacactccccgggcctacact
ccccctgcggacactccccgggcctcctctccccctgcggacactcaccgggcctacact
ccccctgcggacactccccgggcctacactccccctgcggacactccctgggccttcagt
ccccctgcggacactccccaggccttcactccccctgcggacactccccaggcctctact
ccccgtgcggacactccccgggcctccactccccctgctgatattccccaggcctctact
ccccgtgcggacactccctgggcccccactccccctgcggacactccccaggcctctact
ccccctgtggacactccccgggcctccactacccctgcggacactccccaagcctctact
ccccctgcggacacgctggtggtcaccgctgcccctgcggacactccccaagcctccact
acccctgctgacactccctgggccaccactccccctgtggacactccccctgcggacact
ccctgggcctccactccccctgcggacactccccctgcggcccccctgcgggccttgact
caccctgcagagacgctgctgccggcggaggccttgctatcgtcgactcacattgctgac
accctgttgacatcctcctcctctgcaatcatcaatgctggagacccccagtctattatt
tcaccatttactgtgaccagatggtacagtcctgtagttaccaacaccttgtatgattcg
aagctgctttctcccagtcgctcagtgttgcctgctgaccttactgtggaacagctctgt
gactttgaacacggtctatgtgactggggacaatccacaacagatgactttgactggatg
cttcatcaccgccaaacttcctcaaggggaactggaccaaaatgggaccacacgagaggc
cagtgcaaaggccgaggaggtcactacctgtatctagaagcttcgtatcctcggcagagt
ggggagcacgcagcactcgtcagccctgtattgagaggacagaagtgcctgacattctgg
ttcaacatgtttgggagccacatgggttccttaaacgtattccagaaatccgagaatgct
cctcactggcacaagctgtggtctgtctctggaaacaaaggccggaagtggctaaacgct
gagattgatctcttccctcatggggagacctaccaagtgattattgagggcgtactggga
ccaaactatcagagcgatgctgcaattgatgacgtgcagatccacagaagtagctgtacc
tcaggatgggagcgccgtaacccatcctgcaactggggtcggaagaaaaggaacaaatct
cacttgggttag
DBGET
integrated database retrieval system
