Scyliorhinus canicula (smaller spotted catshark): 119958121
Help
Entry
119958121 CDS
T11175
Name
(RefSeq) collagen alpha-1(II) chain isoform X1
KO
K19719
collagen type II alpha
Organism
scau Scyliorhinus canicula (smaller spotted catshark)
Pathway
scau04510
Focal adhesion
scau04512
ECM-receptor interaction
scau04518
Integrin signaling
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
scau00001
]
09130 Environmental Information Processing
09133 Signaling molecules and interaction
04512 ECM-receptor interaction
119958121
04518 Integrin signaling
119958121
09140 Cellular Processes
09144 Cellular community - eukaryotes
04510 Focal adhesion
119958121
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
scau00536
]
119958121
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
scau00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
119958121
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
COLFI
VWC
VWC2L_2nd
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
119958121
NCBI-ProteinID:
XP_038642300
LinkDB
All DBs
Position
X:complement(8352281..8477027)
Genome browser
AA seq
1492 aa
AA seq
DB search
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4479 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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gaatttggtgttgacattggcgcagtctgcttcttgtaa
DBGET
integrated database retrieval system
