Scyliorhinus canicula (smaller spotted catshark): 119979502
Help
Entry
119979502 CDS
T11175
Name
(RefSeq) multiple epidermal growth factor-like domains protein 6 isoform X1
KO
K24333
multiple epidermal growth factor-like domains protein 6
Organism
scau Scyliorhinus canicula (smaller spotted catshark)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
scau00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04990 Domain-containing proteins not elsewhere classified [BR:
scau04990
]
119979502
Domain-containing proteins not elsewhere classified [BR:
scau04990
]
Laminin domain-containing proteins
Laminin EGF-like domain-containing proteins
119979502
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_laminin
FXa_inhibition
cEGF
EGF_CA
hEGF
EGF_2
EGF_Teneurin
JAG1-like_EGF2
EGF_DL_JAG
EGF
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
119979502
NCBI-ProteinID:
XP_038677741
LinkDB
All DBs
Position
16:129132807..129584290
Genome browser
AA seq
1582 aa
AA seq
DB search
MDRVSASVCILFLSLTSAINSGILQSHMPNVCAEKEVMMIGHRQPCVQAFTRMVKVWKQG
CGGQKWCVGHERRTAYYTAYRQLYSMDFQVAYKCCPGWIQLNNEAGCLYPICSYGVCFNG
GKCIEGTSQLCHCPEGFQGPRCQYDVNECGNDNGGCEGQCCNTIGNFYCKCHEGLKLKAD
GKTCEDVDECQVHNGGCQHKCINTQESHYCECKSGFRLHTDGRTCIGVHSCSIGNGGCEH
DCVQLSIAHYQCRCRHNYQLKEDAKHCELKDPCTDKNGGCMHKCHNYHGVAKCECHPGYR
LANDVKGCEDIDECVIGLADCSHGCLNARGSFSCVCNAGYELGANGKQCYRIEMEIVNSC
ESNNGGCSHHCRHTSSGPLCSCNQGFHLDADQKTCIDVDECDAGAGCCLQDCFNTPGGYE
CGCHAGYRLSLDGCTCDDVDECIAENDICEHTCHNTAGSFQCFCNIGHKLEEDRKSCAPL
DDPVEALNGRPGFGRHYPEVTFYHGEELTQLFDDENEEGGEEEARGEFTLSQSFVCWDGT
FGHDCSLICEDCKNGGLCNEARDGCICPEGWTGILCNQTCPEGTFGKNCSFLCKCKNGAK
CDPLTGKCRCPSGVSGEMCEDGCPKGLYGKTCTKKCNCANNGRCHRTYGACLCDPGLYGR
FCHLSCPKWTHGPGCSKECRCEQRNTLQCDRKDGSCTCKPGYHGDTCQKACDHGFYGVGC
NAKCSCSVGVSCDHVTGACAILCPEGYHGRNCSQECASSRFGVNCLQTCNCGGAPCDKVT
GGCSCPLGKMGPGCKKECQEGHWGLACKGTCPICENNGTCNKKTGQCTCPSGFMGTLCQN
MCSTGQYGPGCQMRCACENEGHCHPVTGRCTCSPGWTGHNCRRACDAGRWGPDCVNICDC
RNSDGSCNSITGQCICEAGFTAQRCDEKCPEGNYGAGCRYRCQCENGAACDHVSGACNCT
SGWLGTFCERACPDGFYGMECRQMCDCYNGGHCNHVTGSCACLPGWIGLSCNQSCQGQSF
GENCSQSCHCKNGARCDHVTGQCSCAPGWMGATCQRACSAGFYGTGCLQRCICRNGGTCD
HVTGHCTCPEGWAGVACELECAPGKYGLACQQLCDCLNGGLCDRQSGHCTCRPGWIGDKC
EISCPKGAYGEHCEEHCNCEHRSLCDHVTGSCQCTKGWRGRQCEKACWPGFYGDNCVQRC
NCSPNTPCNHVTGECGCPPGFMGNGCEQICLPGTYGQNCNQVCQCSAQNEQCHPVSGKCV
CAPGYHGDSCKLSCPDGRYGSNCAQPCRCLNRGQCETVTGTCVCPPGYVGADCNQTCPAG
YYGMDCAVTCSCGEGAKCDHVTGRCICPPGRTGFQCQHVCPKGRFGEGCRYSCTCRNGGS
CNRVNGSCSCGLGWTGPRCEQECPFGKFGANCQLDCACHNNGTCSRVTGYCQCARGYYGH
NCEHVCPPGFHGPNCQRLCDCKNGECDPVTGQCVCSTGYHGDHCEKGCEEGQYGEQCQQQ
CDCEGGAPCEHETGQCLCPPGKTGSRCDIDCRANRYGPNCSLSCRCSNNARCDSRNGHCT
CLYDWSGPTCEEGGPPKPPHHL
NT seq
4749 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaccgagtgtctgcaagtgtctgcatcttgttcctcagtctgacctctgctatcaac
tcaggaatactgcagagtcacatgcccaatgtttgtgcggagaaggaggtgatgatgatt
ggccacaggcagccgtgtgtccaggccttcactcggatggttaaagtgtggaaacaaggg
tgtggagggcagaagtggtgcgtgggacatgagaggaggacagcatactacacagcgtac
agacaactttacagtatggactttcaggttgcctacaagtgttgccctggatggatacag
ctcaacaacgaagctggatgcctgtaccctatttgtagttatggagtgtgctttaatggt
ggcaagtgcattgaggggacgtcacagctgtgtcactgcccagagggattccaaggacct
cgttgtcagtacgatgtgaatgaatgtggaaacgacaatggtggatgtgaaggtcaatgc
tgtaacaccatcggcaacttctactgcaagtgtcatgagggcttgaagctgaaggctgat
gggaaaacctgcgaagatgtggatgagtgccaagtccataatggaggttgtcagcacaag
tgcataaatacccaggaatcacattactgcgagtgtaaatcaggcttccgacttcacact
gatgggcgaacctgtattggtgtccactcatgctcaattggtaatggaggctgtgagcat
gattgtgttcaactgtcgatagcacactaccaatgtaggtgtcgacacaactatcagctg
aaggaagatgcaaagcactgtgaattgaaggatccatgtacagataagaatggcggctgc
atgcacaagtgccacaactaccatggagttgccaagtgtgagtgtcacccaggatacaga
ttggcaaatgatgtcaaaggatgcgaagatattgatgagtgcgtgattggattagccgat
tgttcacatggatgcctcaatgctcgtggatcattttcctgtgtctgtaacgcaggctat
gagctgggtgccaatgggaagcagtgctaccgaattgagatggaaatcgtcaacagttgt
gaatcaaacaacgggggctgctcccatcactgtcgccacacatccagtggtccgctatgt
agctgcaatcaaggctttcacctggatgctgatcagaagacgtgtatagatgtggatgag
tgtgacgccggtgctggctgctgtctacaggactgtttcaacactcctggtggatatgag
tgtggttgtcatgcaggctatcggctcagtctggatggttgcacatgtgatgatgttgat
gaatgcatcgcagaaaatgacatctgcgagcacacctgccacaacacagctggatccttc
cagtgtttctgcaatatcggacacaagctggaggaagatcggaagagctgtgcacctctg
gacgacccagtagaggcgctgaatggccggcctggttttggaaggcactatcccgaggtg
acattctaccatggcgaggaactaacccaattgtttgatgacgagaatgaagaaggcggg
gaagaggaagcacgaggggaatttaccctgtcgcaaagttttgtgtgctgggatggtacc
tttggacatgactgcagcttgatctgtgaggactgtaagaatggtggcctttgcaatgag
gctcgagatggatgtatttgcccagaaggctggactgggatcttgtgtaaccagacttgc
ccggagggaacatttggcaaaaactgcagcttcctgtgcaagtgtaagaacggtgcaaag
tgtgacccgctgactgggaaatgtcgctgcccttcgggagtcagtggtgagatgtgcgag
gacggctgccccaaggggttgtacgggaagacctgcaccaagaaatgcaattgtgccaac
aatgggcgctgccatcgcacctatggtgcctgtctctgtgatccaggtctctacgggcgc
ttctgccatctgtcgtgtccaaagtggacacatgggcctggctgttcgaaggaatgtcgt
tgtgaacagcgcaacacgctgcaatgtgaccgcaaagatggaagctgcacttgcaaaccc
ggttaccacggtgacacttgccagaaagcttgtgatcacggtttttatggagttggatgc
aacgccaagtgtagctgctcagttggtgtgtcatgtgaccatgtgactggagcgtgtgcc
attttatgtcctgagggatatcacggaaggaactgtagtcaagaatgtgccagcagcagg
tttggcgtgaactgtctgcagacgtgtaactgcggaggagctccatgtgacaaagtgaca
ggaggatgcagctgccctctgggtaaaatgggccctggctgcaagaaagagtgccaagag
ggtcactggggcctcgcctgcaaggggacttgccccatctgtgaaaataatgggacctgt
aataagaagactggacaatgtacctgtccatcaggattcatggggacattatgtcagaac
atgtgctccacgggtcagtatggcccaggttgtcagatgcgatgtgcttgtgagaatgaa
ggtcattgccatccagtgacagggcgttgcacgtgttctccaggatggactggccataac
tgcaggagagcctgtgatgccggccgctggggtccagactgtgtgaacatctgtgattgc
aggaacagtgatgggagctgcaatagtatcacaggacagtgcatctgtgaggcaggtttt
actgctcagcgctgtgatgagaagtgccctgaaggtaattacggagcaggctgccgctac
aggtgtcagtgtgagaatggagctgcttgtgaccacgtgagtggagcgtgtaattgtacc
tcaggctggcttggaacgttctgtgaacgagcttgcccagatgggttttatggcatggaa
tgtcgtcagatgtgtgattgctacaacggtggacactgtaatcatgtgacgggatcctgc
gcatgccttccaggctggattggactgagctgcaatcagtcgtgccaggggcaatcattc
ggggagaactgcagccagtcttgtcattgcaaaaatggtgcccgctgtgatcatgtgacc
gggcagtgcagctgcgctcctggctggatgggagccacatgccagagagcatgttcggct
ggtttctatggcaccgggtgcttgcaaagatgcatctgtcgaaatggtggaacatgtgat
cacgtgactggtcactgcacatgcccagaagggtgggcgggagtggcatgcgagctggag
tgtgccccaggaaagtatgggctcgcctgccaacaactgtgtgactgcctaaacgggggg
ctgtgcgatcggcagagtggtcactgtacctgccggccaggatggataggtgacaaatgt
gaaatttcttgccccaagggtgcctacggagagcattgtgaggaacattgcaactgtgag
catagatccttgtgtgatcatgtgacgggaagctgccaatgcactaagggatggagaggg
agacagtgtgagaaagcatgctggcctggtttctatggcgacaattgtgtgcagcggtgt
aactgttcccccaacactccctgcaaccatgtgacaggtgaatgtggctgccctccaggc
tttatgggcaatggatgcgagcaaatctgtctgcctggtacttatggacagaactgtaac
caggtatgccagtgttctgctcagaacgagcaatgtcacccagtcagcgggaaatgtgtc
tgcgcgcctggttaccacggagacagctgtaaactgagctgtccagatgggaggtatgga
tccaactgcgcccaaccatgccgctgtttgaacagaggccagtgtgagacagtgactggg
acatgtgtctgtccacctgggtatgtcggagccgactgcaatcagacctgtcccgctggt
tactatggtatggactgtgccgtgacctgttcctgtggggaaggtgcgaagtgtgaccac
gtgactggaagatgcatttgcccaccgggcaggactggttttcaatgtcagcatgtgtgc
cctaaaggcaggtttggtgaaggatgccgttatagctgcacgtgcaggaatggaggatca
tgcaacagggtcaacggctcctgttcctgtgggctgggctggacggggccccggtgtgaa
caagagtgcccctttgggaaattcggtgcaaactgccagctggactgtgcctgccataat
aatgggacctgcagccgtgtgaccgggtactgccagtgtgcgcgagggtactatgggcac
aactgtgagcacgtctgcccacctggatttcacggaccaaactgtcagcgtttgtgtgac
tgcaaaaatggagaatgtgaccctgtgactggacagtgcgtgtgttcaactggttaccat
ggagaccactgtgaaaaaggatgcgaggagggacaatacggggagcaatgccagcagcag
tgtgactgtgagggaggtgcaccctgtgaacacgagacaggacagtgcctctgtccccca
gggaaaactggcagtaggtgtgatattgattgccgagccaatcgctatggccccaattgc
tccttgagctgcagatgttccaataatgctcgctgtgactctcggaatggacactgtacc
tgcctgtatgattggtctgggcctacctgcgaggaaggagggcctcccaaaccaccgcac
cacctgtga
DBGET
integrated database retrieval system
