Gracilinema caldarium: Spica_0639 Help Entry Spica_0639        CDS       T01573                                  Name (GenBank) Pectate disaccharide-lyase   KO K22994   pectate disaccharide-lyase [EC:4.2.2.9] Organism scd  Gracilinema caldarium Pathway scd00040   Pentose and glucuronate interconversions scd01100   Metabolic pathways Brite KEGG Orthology (KO) [BR:scd00001]  09100 Metabolism   09101 Carbohydrate metabolism    00040 Pentose and glucuronate interconversions     Spica_0639 Enzymes [BR:scd01000]  4. Lyases   4.2  Carbon-oxygen lyases    4.2.2  Acting on polysaccharides     4.2.2.9  pectate disaccharide-lyase      Spica_0639 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  Pel9A-like_beta_helix Y_Y_Y fn3_2 Motif Other DBs NCBI-ProteinID:  AEJ18793 UniProt:  F8F1E9 LinkDB All DBs Position 700545..703502 Genome browser AA seq 985 aa AA seqDB search MKRFWFVVLLLVHTIAVIIADENRLEWKDVANPRIISIQVNKDNPKNIVVNYEMDLSFNG ADRASIYMINEQGLILQTKIMGKTNRPIKSVEFTPVSSGIYKFYVEATRVGENENKRSLD AIYQYELPFQSPALKILNNKNGSVLLRWDTIPEIELYEISYRLVQESSDLRNNSKSEIIQ LNASGNSMEYLIKNLNVGSKYAFSLNLIKNSKIVLTKEVQKTVRDIQEREWYFTWFGQST KSDVNTFKMIDEDSFKFSLFSCTVNSESGQIDQKGGKFTTFHDGISFYYTKTNANTENFE LSATFIVDYINPQPDGQEGFGLLALDSLGEYGNNSSNHYTNSAGVIATKFEEVINGVKKT SKDTLGARFVTGLTRQIIESGDSGIAQNGRSASYAFSYDQSDLIKKGDSYRLTLKKDNTG YHAIYKKQYPGETDITEYILYDPKKLQVLDTNTIYVGFAVARGCNVTIQDVDFKITNVAE DPPGLVEPPEIIPLIAKVDSPSTYTEPLYPFIFNANANGRLTVKDRKGNALIKDAIIQAN QDYIKNITLLKGNNDFIVEFIPDKTFKPGDNKVMGRYDNEKKALVESYLPYYINHSVLYH YYQGDTLFVSTMGTPFGKGTKDSPLDLSTALYFVRPGQTILLAGGVYYPTSTITIERGNN GTNRQYKIFRSVNGERAIIDFSRSNAKASGFMLSGDYWIIDSIDIRNTPGDVKGLQVAGN NNIIRFVKTYQCGDTGLQISGFSTEKSDKWPKYNQIISCESYDNKDPASNNADGFAAKLT VGKGNIFKYCIAHHNIDDGWDLFSKIETGPISPVVIENCVSYKNGSLSDGSGNGDGNGFK MGGDGIAVPHILRNSIAYCNGTSGITSNSNPAIIIENCTAYANKGANINLYGKGDSIRSF IVKNSISLQGGISDVYREMPEIESRTNFLWNGAMAKNSEGQQINLDIFTTVDCTLNPEIQ KDGKINIKGLFQINKKELQGLGAQF NT seq 2958 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgaaaagattttggtttgtagtgttattattggttcatacaatagcagtaattatagct gatgaaaatagattggaatggaaagatgttgctaatccacgtattatttctatacaagta aataaagataatcccaaaaatattgttgttaattatgaaatggatttaagttttaatgga gcggatcgtgcatcgatatatatgattaatgaacaaggattaatactacaaactaaaata atgggaaaaacgaatcgtcccataaaatcagtagaatttacacctgtatctagtggtata tataaattttatgttgaagcaactcgagtaggtgagaatgagaataaacgttcgttagat gcaatttaccaatatgaactaccatttcaatcgccagcattgaaaatattaaataataag aatggaagtgttttattgcgatgggatactattccagaaatagagttatatgaaataagt tatcgactagtacaagaatcaagcgatttaagaaataatagtaaaagtgaaataatacag cttaatgcatcaggaaatagtatggagtatttaattaaaaatttaaatgttggaagtaag tatgctttttccttgaatcttattaaaaatagtaaaatagtacttacaaaagaagtccaa aaaactgtacgagatatacaagagcgagaatggtattttacttggtttggtcaatcaaca aaatcagatgtaaatacttttaaaatgattgatgaagattcctttaaatttagcctattt tcatgtactgtaaattctgaatctggtcagatagatcaaaaaggcggtaaatttacaaca tttcatgatggaatttctttttattatacaaaaacaaacgcaaatacagaaaattttgaa ttatcagcaacctttattgttgattatataaatccacaacctgatggtcaggaaggcttt ggtttgttggctttagatagtctaggggaatatggtaataatagctcaaatcattatact aattcggcaggtgttattgcaacaaaatttgaagaagttataaatggagtaaagaaaaca agtaaagatactttaggtgcccgattcgttaccggattaacgagacaaatcattgaatca ggtgattctggaattgcccaaaatggtagaagtgcttcttatgcttttagttatgatcag tcagatttgattaaaaaaggtgattcttatagacttaccttaaaaaaagataatactgga taccatgcaatatataaaaaacagtatccaggtgaaacggatataactgaatatatttta tatgatccaaagaaattacaagtactagatacaaatactatttatgttggttttgcggta gcacggggttgtaatgttactattcaggatgttgattttaaaattacaaatgtggcagaa gatcctccgggtttagttgaaccaccagaaattattccattaattgcaaaggtagattca ccttcaacttataccgaacctttatatccttttatatttaatgcaaatgcaaatggtcgt ttaacagtaaaagatagaaagggtaatgcattaataaaagatgcaataatacaagctaat caagactatattaaaaatatcacactgttaaaaggtaataatgattttattgtcgaattt atacctgataaaacatttaaaccaggtgataataaagtcatgggccgttatgataatgaa aaaaaagctctggttgaaagttacttaccctattatatcaatcattctgtcttgtatcat tattatcaaggtgataccctatttgtgagcacaatgggaacaccttttgggaaaggaaca aaggatagcccattagatctttctacagcactctatttcgtacgccctggtcaaacgata ttattagcaggtggtgtatattatcccacatcaactataacaatcgaaagaggaaataat ggtacaaatcgacaatataaaatctttcgttctgttaatggagaacgcgctataatcgat tttagtagaagtaatgcaaaggccagtggatttatgttatcaggtgattattggattatt gacagtatagatataaggaatactccaggagatgtcaaaggtttacaggtcgcaggaaat aataatattatccgatttgtaaagacctatcaatgtggtgatacgggtctacaaataagt ggtttcagtacagaaaaaagtgataaatggccgaaatataaccaaattatcagttgcgaa tcttatgataacaaggatcctgcgtctaataatgcagacggttttgctgctaaacttaca gtaggaaaaggtaatatttttaaatattgtatagctcaccataatattgatgatggatgg gacctgttttctaaaattgaaacaggtccaataagtccagtagtaatagaaaattgtgtt tcttataaaaatggctcattgtcagatggaagtggtaatggggacggtaatggttttaaa atgggtggagatggtatagctgttccgcacatacttcggaatagtatagcttattgtaat ggaacaagtggaattacgagtaattctaatccagcaattatcattgaaaactgtacagcc tatgcaaataagggtgctaatattaatttatatgggaaaggtgatagtatacgatcattt attgttaagaatagtatttcattacaaggtggtataagtgatgtttatcgtgaaatgcct gaaatagaaagtaggactaatttcctctggaatggtgctatggcgaagaatagtgaaggt caacaaattaacctagatatttttactacagtggattgtacattaaatccagagattcaa aaagatggaaaaatcaatataaaaggtttatttcagataaataaaaaagaattacaaggt ttgggcgctcaattttaa

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