Sphingobacterium cellulitidis: ACF3OC_14240
Help
Entry
ACF3OC_14240 CDS
T11786
Name
(GenBank) efflux RND transporter permease subunit
Organism
scel Sphingobacterium cellulitidis
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
SecD_SecF_C
DUF6594
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XID70977
LinkDB
All DBs
Position
complement(3224817..3227894)
Genome browser
AA seq
1025 aa
AA seq
DB search
MSLIRYPIKNYQFTMIMVLMIMVVAITSMMTMPRAEDPDMKGVSFPVLVVHPGTSPKDME
QLVVKPLEARFYELDNIKDIKTTINNSVAFFFIEFEYGQNYDDKYQELVRELNASRSELP
DNIYSMEVLKIDPTNVSVIQAALISENASQSSMKKYADKLKQELEKVKALKAVEISGLPD
QQVRIDLKQAKLAELGIPMNRIIQAVQSENQNIPAGSVNAGSLSFSVKSSGNYQSIEDIQ
NTIISSAQGRNILLKDVADVYPSFGINNHITRLNGFHCILINAAQKEGMNISDTQKEYKK
VLDEFKAGLPENIDLVLNFDQANNVNKRLGGLAVDFGIAIFLVLFTLLPLGTRASLVVMI
AIPLSLGIGLIAMNSFGYSLNQLSIVGFVVALGLVVDDSIVVVENIERWMREGYSKIEAA
IKGTEQIALAVLGCTVTLVIAFMPLVFMPEMAGEFIRSMPIAVISSVIGSMFIALLVVPF
LSSKLLKPHEHEGGNAILRGMQKVIHKSYGVFLDKALKHPGRTAIIALAIFLGSLALIPI
VGFSLFPASEKPQFMIHINSALQSNIQTTDSITKAIEKELKQIPEVKYYTSNVGKGNPRV
YYNMQQAREDVSYADIFVQLHDDIKSKDKIALIEQLRAKWTPYLGAKVEVRDFEQGVPII
SPVEVRILGENLDTLQSLAFKVEDLLRNTEGSEYVNNPIKNNKTDIKVKINREKAMALGV
PTSSIDQTIRVALSGYSVGTYTDPNSDDNDYDIMVTVPRNGEPNIETLEGIFVDNVAGTS
IPLSQLASLEFEESPSNIYHKNKIRTVSVNSFVKKGYGNDEVINSVIDQMDKFPFPEGYS
YEMGGEVESREMAFGGFGTIILITVFMFIAVLILEFKTFKSTLIVLSVIPLGVVGAVLAL
LVTGNTLSFVATIGIVALAGIEVKNTILLVDFTNQLRREGMALNEAIEKAGEIRFLPIIL
TTLTAIGGLLPIAWSSNPLISPLATVMIGGLISSTLLSRIVTPVIYKLIPPKIEEEENST
QIETK
NT seq
3078 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagcttaataagatatcctattaagaattaccaatttacgatgatcatggttttgatg
atcatggtggtggccatcacttcgatgatgaccatgcctagagctgaagaccctgatatg
aaaggagtatcctttccggtgttggtagtgcatcctgggacaagtccgaaggatatggaa
caattggtggtgaaacctttggaagctagattctatgaactagacaatatcaaggatata
aaaactaccatcaataatagtgttgcctttttctttattgaatttgaatatggtcaaaac
tatgatgataaatatcaggagttagtacgtgaattgaatgcttcgcgttcggagcttcct
gataatatctacagtatggaggttttgaaaatcgaccctacgaatgtgagtgttatccag
gcggctttaatttctgagaatgcttcacaaagtagcatgaagaaatatgcggataagctg
aagcaagagttggaaaaggtgaaggccttgaaagcggtggagatttccggtcttccggac
cagcaggttcgcatagatttaaaacaggcaaagctggcggaattgggtatcccgatgaac
agaattattcaagctgttcagagtgagaatcagaatattcctgcgggtagcgtaaatgct
ggtagcttatccttcagtgtgaaaagttcggggaactatcagagtattgaggatattcag
aatacgataatatccagtgctcagggacgaaatatcttattaaaagacgtagctgatgtt
tatccatcctttggaataaacaaccatatcacccgactaaatggctttcattgcattttg
atcaatgctgctcaaaaggagggaatgaatatctccgatacccagaaggagtataaaaag
gttctggacgaatttaaagctggacttccagaaaatattgacttggtattgaattttgac
caggctaataatgtcaataagcgtcttgggggcttggctgtagattttggaattgcgatt
ttcttggtgctatttaccttattgccattaggaacgcgagcttccttggttgttatgata
gccattccattatccttggggataggtttgattgccatgaattcatttggttattcgttg
aatcaattgagtattgtaggatttgtggtggcattaggactggtggtggatgatagtatt
gtggtcgttgagaatattgagcgttggatgcgcgaaggttacagtaagatcgaagcggct
atcaaaggaacagagcaaatagcattggcggtattgggatgtacggtgactttagtaatt
gcctttatgcctttggtatttatgccggagatggccggtgagtttatccgcagcatgccg
attgcggtaatttcatcggttataggttcgatgtttattgccttattggttgttccattc
ttatcgagtaaacttttgaagccacatgagcatgaaggtggaaatgcgattttgagaggg
atgcagaaggtgatccataagtcttatggtgtatttttggataaagccttaaaacatccg
ggccgtacggcaatcattgcgttggcgatatttttagggtctttggcattgattccaatc
gtaggatttagtttatttccagcttctgagaagccacaattcatgatccatatcaattct
gcacttcaatcgaatattcaaaccactgatagtattactaaggcgattgaaaaggagttg
aagcaaattccggaggtgaaatactatacatccaatgtaggaaaaggaaatccaagggtg
tattacaatatgcaacaggcacgtgaagatgtttcctatgcggatatctttgttcagttg
catgatgatattaagtccaaggataagattgctttaattgagcagttgcgagccaaatgg
acaccttatttaggagcgaaggttgaagttcgagattttgaacagggagttcctattatt
tctccggttgaggttagaattcttggtgaaaacctggataccttacaatcactagcattt
aaggttgaggatttattgagaaatacggaaggttcggaatatgtgaataatcctatcaag
aacaataagaccgatatcaaggttaagatcaatcgtgagaaagcaatggctttgggtgtt
ccgacctcttctattgaccaaacgattcgagttgccttatctggttatagcgtaggaacc
tatactgatcctaattcggatgacaatgattatgatatcatggtcactgttccgcgcaat
ggtgaaccgaatattgaaacattagaaggcatatttgttgataatgtagctgggacttca
attccattatctcagttagcaagtttggaatttgaggagtctccgtcgaatatctatcat
aagaataaaatcagaacggtttcggtgaattcatttgtgaaaaagggttatggaaatgat
gaagtcatcaattcagttatcgatcaaatggataaattcccattccctgaaggatactcc
tatgaaatggggggtgaggttgaaagtagggagatggcttttggtggatttgggactatt
attttgattaccgtctttatgtttattgcggtgttgatcttggagttcaaaacctttaag
agcaccttgattgtgttatctgttattccgttgggagtagtgggtgctgtgttggcattg
ttagtgactggaaacaccttatcctttgttgcaacgattggtattgttgcgctagcaggt
attgaggttaagaatacaattctgttggtggattttaccaatcaattaagacgtgagggg
atggctttaaatgaggctattgagaaggcaggagagattcggttccttccaatcatacta
acgaccttaacggctattggagggttattaccgatcgcttggtcatctaatccattgata
tctccattggcgaccgtcatgattggaggattgattagttcaacattattatcacgaatt
gttacaccggtgatttataaattaattcctccaaaaatagaagaagaggaaaattcaaca
caaatagaaacgaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
