Siniperca chuatsi (mandarin fish): 122868736
Help
Entry
122868736 CDS
T08948
Symbol
notch3
Name
(RefSeq) neurogenic locus notch homolog protein 3
KO
K20995
Notch 3
Organism
schu
Siniperca chuatsi (mandarin fish)
Pathway
schu04330
Notch signaling pathway
schu04371
Apelin signaling pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
schu00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04330 Notch signaling pathway
122868736 (notch3)
04371 Apelin signaling pathway
122868736 (notch3)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF
hEGF
EGF_TEN
EGF_CA
EGF_2
Ank_2
Ank
Notch
NODP
NOD
EGF_3
Ank_3
Ank_4
Ank_5
EGF_Teneurin
EGF_DL_JAG
cEGF
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
122868736
NCBI-ProteinID:
XP_044036921
LinkDB
All DBs
Position
LG21:9798606..9828491
Genome browser
AA seq
2475 aa
AA seq
DB search
MEGNIPWIILSFLLFMHICEGFLCLDKYRPCENGGTCLDSPSLCICRPGYIGPLCQHLDP
CHRSPCLNGAACKSQVVNGIPQYTCVCQRGFRGQDCSLIDACATSPCANGARCANWNNHY
NCSCPPGFQGKNCRNDIDECRKPGVCLNGGLCINTHGSFRCQCQPGYSGRTCEVSTLPCA
PSQCLNGGTCRQTSDHSYECACLPGFEGHNCENNVDDCPGHKCMNGGICVDGVNTYNCQC
PPEWTGQYCAEDVNECLMQPNACHNGGTCFNTIGGHTCVCVNGWTGDDCSENIDDCAIAV
CFNGATCHDRVASFFCECPVGKTGLLCHLDDACVSNPCNEGAVCDTNPLNGRAICTCPAG
FVGGACNQDMDECSIGANPCEHFGKCVNTEGSFQCQCGRGYAGPRCEIDINECLSMPCQN
DATCLDRIGEFTCICMPGYMGTYCEIDVDDCESNPCVNDGICRDMVNGFTCTCQPGFTGT
MCQIDIDECASTPCQNGAKCYDRPNGFECRCAEGYEGTLCESNINNCQPDPCHHGTCIDG
IASYTCNCDAGYTGYRCENQLNECHSNPCQNGGKCVDLVNKYICQCQHGTSGTNCEINFD
DCASNPCDYGICKDGINRYDCVCKPGFTGPKCNVEIDECASSPCRNGGTCVDEENGFHCQ
CPEGFKPPYCYSQVDECGSSPCVHGSCRDDINGYRCDCEPGWVGKNCDLDRNDCLPSPCQ
NAGTCIDQLNGFTCKCRQGFRGNLCQVNINECSSSPCLNKGSCVDGVASFTCLCELPYSG
PTCAEVLTPCSPNPCANHAICTHTPDYLGYQCNCQPGWQGQLCNIDVNECISNPCKNRGT
CTNTLGGFLCSCRAGYTGMTCETDVNDCAPNPCLSGGSCTDGVNTFHCSCLPGFSGPRCA
LEINECQSSPCKNGGKCTDYVNSYTCTCRPGFTGIHCETNIPDCTESSCFNGGTCTDKIN
GYSCTCRSGFTGSHCQYEVNECDSQPCLNGGICQDALESFRCSCPKGYTGNRCQTPVDWC
RRSSPCQNGGRCRQKDASFICDCTNGWSGRYCDIPRVSCETAARQRGLQTDELCHHSGHC
VNTGNTHYCKCPADYTGSYCESQVDHCEDKPCRNGATCRGYVGGYQCDCMPGYTGQNCEI
EINECQSHPCQNGGTCIDLVGHYICSCPPGTLGVLCEINEDDCAPPLRLRSAPPKCLNNG
TCVDRVGGYRCNCPPGFTGERCEGDINECLSDPCSPSNSLDCIQLPNDYQCVCKPDFTGR
RCQSRFSVCESQPCQNGGACSVASSALGYTCTCQLGYTGPNCERSMSCRELSCYNGGSCA
FTTRGARCTCLPGYGGPQCQHHSNEGCSSQPCRNGGLCTEETSFPFFHCQCPSGWTGKRC
EQSSRSPELPAPSCPLADCHGKANDGICDKECNTFPCRWDGGDCSLAVNPWARCADPRCW
RVFNNSQCDESCNNADCLYDNFDCRNKEKICNPIYETYCIDHYADGRCDQGCNTEECGWD
GLDCAGKVPEDLADGVLVLVVLLPPEELLRTSTAFLQKLSAILHTTLRFRLDHNGEAMIR
PYTRQKSHFKRELQPQQEVIGSIVYLEIDNRLCSQGSEDCFPTADSAAEYLGALSAVEML
RFPYPIKEVRGEKIVSEPDLVKLVLVGIASLFLLVILVVGMLIARRKREHSTLWFPEGFF
LKKEPREHKNRREPVGQDALGMKHMPKTVEESLLGDHSDQWMDSDCPEAKRLKVEEPSML
SDSEDAVDSRQWTQHHLAAADIRVPPTMALTPPQGEFESDCMDVNVRGPDGFTPLMLASF
CGGGLEPEVAEEEENEECSANIISDLIYQGASLAAQTDRTGETALHLAARYARADAAKRL
LDAGADANAQDNTGRTPLHAAVAADAQGVFQILIRNRATDLDSRMYDGSTALILAARLAV
EGMVEELITCHADVNAVDELGKSALHWAAAVNNVDATVALLKNSANKDMQDLKEETPLFL
AAREGSCEAVRVLLAHFANREITDHMDRLPRDIAQERMHHDIVQLLDEYNTVRSPQGHGG
VGHHLTGGHTLSPVMCPPSAFLPSLKNTPQGKKNRRPGAKGSSLGGQHAVSLKESVKARN
KKLTLDMQSALLESSVTLSPVDSLDSPHGGASNAGYITNPTSPVAMQSPGLFHSSMSVPN
TPMVHSSMLEGGGPFAVSLAQLNDLGAGGMSLQGRVSMASDVNHGYVLSSGQMGLNMGMV
SPVSVPFDWHNRMPPSSQCGQQVVNLVQSSQAGMHPQSPAMQQQNMLMHQQQLYRNSMLQ
PTPITSTPTISPVKLPSIAEQQQQQQQQQQQQQQLISHTITNQQSMARMGTSTPPTPQTS
QPPPAFFQPQQMPQQPSQPQPPAQPPQAATAAAQPTQALPSQPSMSTAGTEDYPTPPSQH
SYSSALDATPKHYLHLPSEHPYLTPSPESPEPWSSPSPHCVSDWSDSTPSPAVAGPAQTQ
ITQIPEANGKMQVFA
NT seq
7428 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaagggaatattccatggattattttgtcatttttattgtttatgcatatttgtgaa
gggttcctttgcttggataaatacagaccatgtgaaaatggagggacatgcttagattca
ccctctctatgcatatgtcgtcccggatacattggtcctctctgtcagcacctggatccc
tgtcatcgatcgccatgtctgaacggagcagcttgcaagagccaggtggtcaatggtatc
ccacaatacacctgtgtgtgccagagagggttcagaggccaagactgctccctcattgat
gcctgtgccacaagtccctgtgccaatggggcccgttgtgccaattggaataaccactac
aactgttcctgcccacctggcttccagggaaagaactgccgcaatgacattgacgagtgc
cgcaagccaggcgtgtgcctcaatggtggcctctgcattaacacccatgggtccttccgc
tgccagtgccaacctggatacagcgggcgcacatgtgaggtgtccacccttccctgtgcc
ccatctcagtgccttaatgggggcacctgtcgacagaccagcgaccattcctacgagtgt
gcttgcctaccagggtttgagggacacaactgtgagaataatgtggatgactgtccaggt
cacaagtgtatgaatggaggaatatgtgtggatggagtcaacacctacaattgccagtgc
ccaccagaatggacagggcaatactgtgctgaggatgtcaacgagtgtctcatgcaacca
aacgcttgccataatgggggtacttgcttcaacaccatcggtggtcatacctgtgtctgc
gttaatggttggactggagatgactgcagtgagaacattgatgactgtgccatagccgtt
tgcttcaatggtgccacctgccatgaccgtgtagcatccttcttctgtgagtgcccagtt
ggaaagacaggtttgctgtgccaccttgatgatgcatgtgtgagtaatccctgcaatgag
ggggcagtgtgtgacaccaacccccttaatggccgtgccatttgcacctgtcctgctggc
tttgtaggaggtgcctgcaaccaggacatggatgagtgttcaattggtgccaacccgtgt
gagcattttgggaaatgtgtgaacacagagggctccttccaatgtcagtgtggtcggggc
tatgccggcccgcgttgtgagattgacatcaacgaatgtctgtccatgccctgccaaaat
gatgccacttgcctggaccgcatcggagagttcacctgcatctgcatgccaggctacatg
gggacttattgtgagattgacgtagatgactgtgagagcaacccctgtgtgaatgatggc
atctgtcgggacatggtcaatggcttcacatgcacctgccagccagggtttactggcacc
atgtgtcagatcgacatagatgagtgcgccagcacgccctgccagaatggagcaaaatgc
tacgaccggcctaatgggttcgagtgccgctgtgctgaaggttatgaagggacactctgt
gagagtaatatcaacaactgtcagcctgacccatgtcaccatggtacttgcatagatggc
attgccagctacacctgtaactgtgatgctggctacacaggctatcgctgtgagaaccag
ctcaatgagtgccacagcaacccttgtcagaatgggggcaagtgtgtggacctggtcaat
aagtacatctgccagtgccaacatggaacctcaggcacaaactgtgagataaactttgat
gattgtgccagtaacccatgtgattatggcatctgcaaagatggcatcaaccgctatgac
tgtgtttgcaaacctggcttcactggtcccaagtgtaatgtggagatagatgagtgtgca
tcaagcccctgtaggaatgggggaacatgtgtggatgaggagaatggatttcactgccag
tgtcctgagggctttaagccgccttattgttactcccaggtggacgagtgtggcagcagc
ccatgtgtccatggctcatgccgggatgacatcaatggttaccgctgtgactgtgagcct
ggatgggtggggaagaactgtgacctggacaggaatgactgtttgccgagtccctgccag
aatgctggcacgtgtatcgaccagctcaatggctttacctgcaagtgtcgccaaggcttc
agaggtaacctctgccaggtgaacatcaacgaatgttcatccagtccctgtctgaacaag
ggctcttgtgtggacggtgtggcaagtttcacctgtctgtgtgagcttccttacagtgga
cccacttgtgctgaggtcctcaccccttgctcccctaacccctgtgccaatcatgccatc
tgtacacacacaccagactacttgggctatcaatgtaactgccagccagggtggcaaggt
cagttatgtaacattgatgtgaatgaatgcatctcaaacccctgcaagaaccgtgggaca
tgcactaacacacttggaggcttcctgtgctcctgcagagctggatatacagggatgacc
tgtgaaacagacgtcaatgactgtgctccaaatccgtgcctaagtggaggttcctgcaca
gatggtgtgaataccttccactgtagttgcctaccaggcttcagtgggccccgctgtgct
ttagagatcaatgaatgccagagttccccctgcaaaaatggaggcaaatgcacagactat
gttaactcctacacctgcacctgtaggcctggctttactggcatccactgcgaaaccaac
atccctgattgcactgaaagttcttgcttcaatggagggacgtgcacagataaaatcaac
ggctattcctgtacctgccgctcaggcttcactggctcccactgccagtacgaggtcaac
gagtgtgactcccagccctgcctcaatggaggcatctgtcaagatgccctggagtccttc
cgttgctcctgccccaaaggctacactggcaaccgctgccagactccagtcgattggtgc
agacgctcatctccctgccaaaatggaggacgctgtcgccaaaaggatgcttccttcatc
tgtgattgtactaatggctggtctggacgttactgtgacatccctagggtctcctgtgag
acagctgctcgccagagagggctccagacagatgagctatgccaccacagtggtcactgt
gtcaacactgggaatacccactattgtaaatgtcctgctgactacactggaagctattgc
gaaagccaagtggaccactgtgaagacaaaccctgccgcaatggcgccacctgcaggggc
tatgtgggagggtaccagtgtgactgtatgccaggctatactggacagaactgcgagata
gagatcaatgagtgccagtctcatccttgccagaatggaggcacttgcattgatctggtg
ggacattacatctgctcctgtccccctggcacactgggtgttctctgtgagatcaatgaa
gatgactgtgctccacccctgaggctgcgcagcgctcctcctaagtgccttaacaatggc
acctgtgtggacagagtgggtggataccgctgcaattgtccccctggatttacaggagaa
agatgtgagggagacataaatgagtgtctctctgacccctgcagtccctccaacagtctt
gactgcatccagttgcccaatgactaccaatgtgtctgcaagcctgacttcacaggtcgg
aggtgtcagagcaggttcagtgtgtgtgagtctcagccttgtcagaatggaggagcctgt
tctgtagccagctctgcactgggatacacctgcacatgtcagcttggttatactgggcca
aattgtgaaagaagtatgtcctgtcgggagctgtcctgctacaatggaggtagctgtgca
tttactacaaggggggcgcgttgcacctgcctgccaggttatggcgggccccagtgtcag
catcacagtaatgaaggctgctcttcccagccctgccggaatggagggttgtgcactgaa
gagaccagcttcccattcttccattgccagtgtcccagtggctggacaggtaaacgttgt
gagcagagcagcagatcccctgagctcccagcaccctcatgccccctagcagactgtcat
ggcaaagccaatgatggtatttgtgacaaggaatgcaacacgttcccttgtcggtgggac
ggtggcgactgttctctagcagtgaacccctgggctcgttgtgcagaccctcgctgctgg
cgtgtcttcaacaacagccagtgtgatgagtcctgcaacaacgctgactgtctgtatgac
aactttgactgcagaaacaaggagaaaatttgcaatccaatatatgaaacctactgtatt
gaccactatgctgatggacggtgtgaccagggctgcaacacagaggagtgtggctgggat
ggcttggactgcgcagggaaggttccagaagatcttgctgatggtgtcttggttttggta
gtcctactgccgccagaggagcttctccgcaccagcacagcttttctgcagaaattaagt
gctatcctacacactacactgcgcttccggctggaccacaatggagaagccatgatccgc
ccctacacccgccaaaagtcacacttcaagcgggagctgcagcctcaacaggaggtcatt
ggctccatagtgtacctggaaatagacaaccgtctgtgctctcaggggtctgaggactgt
ttccctacagctgacagtgctgcagagtacctgggagctctgtcagctgtagaaatgctc
cgcttcccttaccctatcaaagaagtccgtggtgaaaagattgtttccgaacctgatttg
gtcaagctggtactggtggggatagcttctcttttccttttggtcatccttgtggttggc
atgttgattgctcgtagaaagagagaacacagtaccctttggttccctgagggtttcttc
ctcaaaaaggaacccagggaacacaagaaccgcagggaacccgtgggccaggatgctctt
ggaatgaagcacatgccaaaaactgtggaggaatctctccttggagatcacagtgatcag
tggatggactcagactgcccagaggcaaaaaggctcaaggttgaggagccgagtatgctc
tcagacagtgaagatgcagtggacagcaggcagtggacacagcatcaccttgcagctgca
gacatacgtgtgcctcccaccatggccctcaccccacctcaaggagagtttgaaagcgac
tgcatggatgttaatgtccgaggcccagatggttttacacctctgatgctggcatcattc
tgtggaggcggtttagagcctgaggtagcagaggaggaagagaatgaggaatgttcagcc
aacatcatctctgacctaatctaccagggcgcatcccttgctgcccaaacagaccgcact
ggtgagacggcgctccacctggctgcccgctacgcccgtgctgatgctgctaaaaggctg
ctggatgccggggcagatgccaatgctcaggacaacacaggacgtacaccgctacatgct
gcagtggctgcagatgcacagggtgtcttccagattctgatccgaaacagggctacagat
ctcgactcccgtatgtatgatggttccactgcgctgatcctggcagcacggttggcagta
gagggcatggtagaggaactcatcacttgtcatgctgatgtcaatgcagttgatgaattg
ggtaaatctgctttgcactgggctgctgccgttaacaatgtggatgccactgttgccctg
ctgaagaatagtgcaaacaaagatatgcaagatctcaaggaggagacccctctgttcctt
gcagcccgtgagggcagctgtgaggctgtgagggtgctgctggctcactttgcaaacaga
gagatcacagaccatatggacaggttgccaagggacattgctcaggagcgtatgcaccac
gacattgtgcagcttcttgatgagtacaacacagtaaggagtccacagggccatggaggg
gttggacaccacctcactgggggacacactctgtctcctgtcatgtgccctcccagcgcc
ttcctacctagtctgaagaataccccacagggcaagaagaaccgtcggcctggggccaag
ggttctagcctgggaggccaacatgctgtcagtctgaaggagtcagtcaaggcccgcaat
aagaagctgaccttggacatgcagagtgccttactggagagctcagttaccctgtcccca
gtcgactcactggactcaccccacgggggagctagcaatgctggctacatcaccaacccc
acttcccccgtggccatgcagtcaccagggctcttccactcctccatgtctgtcccaaat
accccaatggtacatagtagtatgttggaaggaggtggcccctttgctgtgtctctagcc
caactcaatgatctgggagcaggaggaatgtccttgcagggacgtgtctccatggcttct
gatgttaaccatggatatgtgctgagttcaggccagatgggtctcaacatgggcatggtc
agtcctgtcagtgtgccctttgactggcacaaccggatgcccccctcctcccagtgtggt
cagcaggtggtgaatcttgtgcagagtagccaggcaggcatgcacccccagagcccagcc
atgcagcagcagaacatgctgatgcaccaacagcagttataccgtaattccatgctacag
cccacacctattacttccacacccactatcagcccagtcaagctgccctccattgctgag
cagcagcagcagcaacaacaacagcagcagcagcagcagcagctcatcagccacaccatt
accaaccagcagagcatggcccgcatgggcacctccaccccaccgacaccccagacctcc
cagcccccaccagccttcttccagccgcagcagatgcctcagcaaccttctcagccacag
cctcctgctcagcccccacaagcagccacggcagcagcccagcccactcaggctctgccc
tcccagcctagtatgagcactgcaggaacggaggattacccaacccctccctcccagcac
agctactcatccgcactagatgccacgcccaagcattaccttcatttgcccagtgagcac
ccttaccttaccccctccccagagtctccagagccctggtccagcccttctcctcactgc
gtctctgattggtcagattccacacccagcccagcagttgctggccctgcccagacccaa
attactcaaatcccagaggccaatggcaagatgcaggtgtttgcgtga
DBGET
integrated database retrieval system
