Spirobacillus cienkowskii: Spiro2_000230
Help
Entry
Spiro2_000230 CDS
T11298
Name
(GenBank) Phytoene desaturase
Organism
scik Spirobacillus cienkowskii
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Amino_oxidase
NAD_binding_8
DAO
FAD_binding_2
FAD_oxidored
Pyr_redox
Pyr_redox_2
HI0933_like
Thi4
GIDA
Lycopene_cycl
FAD_binding_3
Pyr_redox_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WWW13344
LinkDB
All DBs
Position
278516..280057
Genome browser
AA seq
513 aa
AA seq
DB search
MKKFDVVVVGAGFGGLSCALTLQSMGLKVALVEALDKIGGRAYVECKQDFKFDRGPTIIT
APFLIDDIFSMSGANRADYCEFIPVDPFYKVIFDDGTSISHYNSEEKFYNEILNVSADDL
QGVKNFFLHAEKIFQKGFIELGDKNFSGLISMLGVAPQLLKLHAIRPVYSMVSKYVKNEK
IKQFLSFHPLLIGGSPFRASAVYSLINKLERAYGVYHAVGGMHKLAEAFRKRFEELGGEV
FLSSPVSAVDKLPSGLFEIQTPNQVFYSERIVANADMHRFVKTVLRGDAYPKKLSKKLEK
ADLSMSAFLLYLGTNKQWPNMCQHSIILGPRYKELIHDIFIKKIEFEDFSLYLHIPTRSD
ASLAPQGGEVIYALVPVANLNSNTNWDEYKLTMAERVKSFLEERFMPGLRSSIVVESVFT
PKDFDLTLRSHLGNAFGLEPWILQSAGFRPSNVSSEVDGLYFVGANTQPGAGLPGVILSS
RITCRLLANDMGSIKMPSLLSKLPTAFNYVNNN
NT seq
1542 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaatttgatgttgtagttgttggcgcaggatttggaggattatcgtgcgcatta
actctacaaagcatgggtttaaaagtcgcgttggtcgaggctctagataaaattggcggt
cgtgcttatgttgaatgcaagcaagattttaaatttgatcgcggaccgacaattattact
gctccatttttaattgatgatatcttttcgatgtcaggtgcgaatagagccgattattgt
gagtttatacctgttgatccattttataaagtgatttttgatgatggtaccagtatttcg
cattataactcagaagaaaaattttataatgaaattcttaatgttagtgcagatgatttg
cagggtgtgaaaaatttttttttgcatgcagaaaaaatttttcaaaagggatttattgag
ttaggtgataaaaatttttctggattgataagtatgttgggtgtggctccacaattgcta
aagttgcacgccattcgtcctgtgtattctatggtatccaaatatgtaaaaaacgaaaaa
ataaaacagtttttaagttttcaccctttgctaattggtggcagtccttttcgtgcatct
gctgtgtacagtttgattaataaattggaaagagcctatggcgtatatcatgctgtcgga
ggaatgcacaaacttgcagaagcatttcgcaaacgttttgaagagctaggcggagaagta
tttttatcatcgccagtttctgctgtcgataaattgccttctgggttatttgaaatacaa
actcctaatcaagttttttattctgagagaatagttgcaaatgcagatatgcatcgtttt
gtgaaaactgtgttgaggggtgatgcctatcccaaaaaattgtcaaaaaaattagagaaa
gcagatcttagtatgtctgcattcttattgtatttaggcacaaataaacaatggccaaat
atgtgtcaacattcaataatacttggaccaagatataaagaactgattcatgatattttt
attaaaaaaattgaatttgaagattttagtctttaccttcatatcccaactcgctctgat
gcgtctttagctccacaaggaggggaagttatttatgcgttggtgccagtagcaaatctt
aatagtaataccaattgggatgagtacaaattgacaatggcagagcgcgtaaaatctttt
ttagaagagcgttttatgcctgggttaagatcttcaattgtagttgaaagtgtatttact
cctaaagattttgatttaactttaagaagtcatttaggcaatgcttttggtttagagcct
tggattttgcaaagcgcagggtttaggccgtcaaacgtatcgtcagaagtagatggtctt
tattttgttggtgccaacactcagccaggagctggcttaccaggcgttattttaagttca
cgaatcacttgtagactacttgccaatgatatgggttctataaaaatgccttctttgtta
agtaaacttcctacggcatttaattatgttaataacaattag
DBGET
integrated database retrieval system