Spiroplasma cantharicola: SCANT_v1c00870
Help
Entry
SCANT_v1c00870 CDS
T04084
Name
(GenBank) ribose/galactose ABC transporter permease
KO
K23535
general nucleoside transport system permease protein
Organism
scj
Spiroplasma cantharicola
Pathway
scj02010
ABC transporters
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
scj00001
]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
SCANT_v1c00870
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
scj02000
]
SCANT_v1c00870
Transporters [BR:
scj02000
]
ABC transporters, prokaryotic type
Saccharide, polyol, and lipid transporters
General nucleoside transporter
SCANT_v1c00870
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
BPD_transp_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ALD65997
UniProt:
A0A0M4JRJ2
LinkDB
All DBs
Position
91077..92780
Genome browser
AA seq
567 aa
AA seq
DB search
MFKVKLWTLKVKTEAFVKSPGFLEKLGFVKSSVISIVLGLLVGVLFIFSNGENGFAFLGT
AFVRALSTNVDRTLVYFGVYILIGLGLALGFKLKIFNMGGSGQILSGLLMSYLIMSSIGN
DTKNAFLIFIMFIISGMLISVLCGAMKVYLNVHEVASSILLNWIFWYLLKWYMTVSGTPA
ASPSLNESMAMLGNSLWALCVMLALISVVVVYIIFTFTTTGYKVKVIGNSPTAAKYAGIK
SQYYILMVMAIQGALISMAGFFYYFLIQGSVTFNKDLVPQLGFDGIPIALVAFNNILGIV
PIAFFWAIVKEGAAVAITTPNFNNLQPEVADLIFGIIIYCSTLYVIFIKLNLWTKIKEKL
YLEKDIITKNQIGVYKLEIKSIKKLIKEIPHLEDLVAIKEEIKKTSRNDKQKIKDLSYQY
NELKTFHHRKHLKNIEAIKQLIHDAIENGYRNYRLNSINGLWINFNNQKIGKQFVALDII
IEKISDYDKNEKSIISQECKELIENTKKEISVLKESYLASKLEAKNFLKDLKNEYKKNLK
ENQDTEKIKKEYFERLVEVKDKYDRLH
NT seq
1704 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttaaagttaagttatgaactctaaaagttaaaacagaagcatttgtaaagtcccct
ggttttttagaaaaattaggttttgtaaaatcttctgtaatatcaattgtacttggtctt
ttagttggggttctattcatattcagtaacggagaaaatggatttgctttcttaggaact
gcatttgttagagctttatcaacaaatgttgatagaacattagtttattttggagtatac
attttaattggattaggattagctctcggatttaaattaaaaatatttaatatgggtggt
tcgggacaaattctttcaggtttattaatgtcttatttaataatgagttcgataggtaat
gatacaaaaaacgcttttctgatttttataatgtttataatttcaggaatgttaatatct
gtactttgtggagcaatgaaagtttatttaaatgttcatgaagtggcttcatcaatatta
ctgaattgaatattttgatatttattaaaatgatatatgactgtatcaggaacaccagca
gcgtcaccttcattaaatgaatcaatggctatgttaggtaattcactttgagcgttatgc
gttatgttagcattaatatctgttgtagtagtatatattatatttacatttactacaact
ggatataaagttaaagtaattggtaattcaccaacagctgcaaaatatgcaggtattaag
agtcaatattacattctaatggttatggcaatacaaggagctttaattagtatggctggt
ttcttttattactttttaattcaaggaagtgtaacttttaataaggacttagttcctcaa
cttggttttgatggaattcctattgcactagttgcctttaataatattttgggtattgtg
ccaattgcgttcttttgagcaattgttaaagagggtgctgctgttgcaattacaacacct
aactttaataatttacaaccagaagttgctgacttaatctttggaattataatttattgt
tcaacactttatgtaatatttattaaattaaatttatgaactaaaataaaagaaaaatta
tatcttgaaaaagatataattacaaaaaatcaaattggagtttataaattagaaattaaa
agtatcaaaaaattaattaaagaaattccccatttagaggatttagtagcaattaaagaa
gaaattaaaaaaacttcaagaaatgacaaacaaaaaataaaagatttatcttatcaatat
aatgaattaaaaacttttcatcatagaaaacatttaaaaaatattgaagcaataaaacaa
ttaattcatgatgcaattgaaaatgggtatagaaattatcgattaaattctattaatgga
ttatgaattaacttcaataatcagaaaattggaaaacaatttgtagctttagacataata
attgagaaaataagtgattatgataaaaatgaaaaatcaatcatttctcaagaatgtaaa
gagttgattgaaaatacaaaaaaagaaataagtgttttaaaagaaagttatcttgcttca
aaattagaagcaaaaaatttcttaaaagatttaaaaaatgaatacaaaaaaaacttaaaa
gaaaatcaggatactgaaaaaattaaaaaagaatattttgaaagattagtggaggtgaaa
gataaatatgacagacttcattag
DBGET
integrated database retrieval system
