Spiroplasma cantharicola: SCANT_v1c01990
Help
Entry
SCANT_v1c01990 CDS
T04084
Name
(GenBank) ABC transporter ATP-binding protein/permease
KO
K06147
ATP-binding cassette, subfamily B, bacterial
Organism
scj
Spiroplasma cantharicola
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
scj00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
scj02000
]
SCANT_v1c01990
Transporters [BR:
scj02000
]
ABC transporters, eukaryotic type
ABCB (MDR/TAP) subfamily
ABCB-BAC subgroup
SCANT_v1c01990
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_tran
ABC_membrane
SMC_N
RsgA_GTPase
AAA_22
ABC_ATPase
PspB
AAA_7
nSTAND3
AAA_15
DUF87
AAA_29
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ALD66109
UniProt:
A0A0M4JS34
LinkDB
All DBs
Position
243868..245676
Genome browser
AA seq
602 aa
AA seq
DB search
MKKKKFISDKAFSKKKFIDSFKMIGECIKRNPATFTGYIVFTIIDAIFYSSMTIVVSQMT
KNIINNGEQANQFLWFSMSWVSWAYVGLGLLILIVIFDYLTNIYSAYFSKKVEIYLRVKA
LKKLVEVDISYYSKNQLGLIMSRVINDSQGAGDSFNDFLLNLLFTTVSFIAMMVFMFILD
VNLALIVLMIFIVLVIIIWVLFIYYRRAIIESVDVKQSIDADITDRLINIRAIKANAAEN
RETKRNMRLHDKYDRKLSKVIWLQSLLSFFSYTFAWSLPIITIIAAIGLYKNSMDPSELS
HLLVAFTSATNNILYSLLTLPMWMRGLTKLSNCIMRLNYIYDTNSLLNFVDQPEKVGDIE
KITFDRVTFNYPESPTKKILPEINLTFEKNKSYAFVGETGVGKSTIAKLLLRFYDVTTGQ
ILINGKNIKLLNPNDYLDKVGYVEQEPQILYGTVMENLKYPFFDKTDEQAIEAAKKAKIH
NYIKKLPMGYDTILGERGFMLSGGQKQRLVIARIFLKDPQLLILDEATSALDNVIEKEIQ
SELDKLMIGRTTVVIAHRLSTIKNVNEIIVLDKNGVSQRGTFNELKEKEGRFKKLYTLGL
MK
NT seq
1809 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaaaagaaatttataagtgataaagcattttcaaaaaagaaatttatagactct
ttcaaaatgattggtgagtgtataaaaagaaatcctgctacttttacaggatatatagtt
tttacaattattgatgcaattttttattcatcaatgacaattgttgttagtcaaatgaca
aaaaatattattaacaatggtgaacaagcaaatcaatttttatgattttcaatgagttga
gttagctgagcatatgttggtttaggactattaatattaattgtaatttttgattatctg
acaaatatttattctgcatatttttctaaaaaagttgaaatttatttaagagtaaaagct
ttaaaaaaacttgttgaagttgatattagttactattcaaaaaaccaattaggtttaatt
atgtcaagagtaattaatgacagtcaaggggcaggagattcattcaatgatttcttgtta
aatttattatttacaactgttagttttatagcaatgatggtatttatgtttatcttagac
gttaatcttgctttgattgtcttaatgatttttattgttttagtaataataatttgagtt
ttatttatttattatcgaagagcaattatcgaatcagttgatgttaaacaatcaattgat
gcagatattactgacagattaattaacattagagcaattaaagcaaatgcagcagaaaat
agagaaactaaaagaaacatgagattgcatgataaatatgatagaaaattaagtaaagta
atttgacttcaatctttattatcatttttctcttatacttttgcttggtctctaccaatt
attacaataattgctgcaattggactttataaaaactctatggatccaagcgagttatca
catttgcttgtagcttttacatcagctactaataatattttgtattctttattaacatta
ccaatgtgaatgagaggacttacaaaactgtctaattgtattatgagattaaattacatt
tatgatacaaattcattgttaaattttgtagatcaacctgaaaaagtaggagatattgaa
aaaataacttttgatagagttacatttaattatccagaatcaccaacaaaaaaaatattg
cctgaaataaatttaacttttgaaaaaaacaaaagttatgcttttgtaggcgaaacaggt
gttggtaagtcaactattgctaaattattattaagattttatgatgttactacaggtcaa
atattaattaatggtaaaaatattaagctattaaacccaaatgattatctagataaagta
ggttatgttgagcaagaacctcaaattctttatggaactgtgatggaaaacctgaagtat
cctttctttgacaagactgatgaacaagcaattgaggctgcaaaaaaagcaaaaatccac
aattacataaaaaaactaccaatgggttatgatacaattttaggagaacgaggttttatg
ttaagcggagggcaaaaacagcgtttagtaattgcaagaatctttttaaaagatcctcaa
ttgctaattctcgatgaagcaacaagtgcacttgataacgtgattgaaaaggaaattcaa
tcagaattagataaattaatgattggtagaacaactgttgttattgcacataggttaagt
acaataaaaaatgtaaatgaaattattgtacttgataaaaatggtgtttctcagagagga
acatttaacgaacttaaagaaaaagaaggtcgttttaaaaaattatatacattaggtctt
atgaaatag
DBGET
integrated database retrieval system
