Spiroplasma cantharicola: SCANT_v1c03280
Help
Entry
SCANT_v1c03280 CDS
T04084
Symbol
rarA
Name
(GenBank) recombination factor protein RarA
KO
K07478
putative ATPase
Organism
scj
Spiroplasma cantharicola
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
scj00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09192 Unclassified: genetic information processing
99976 Replication and repair
SCANT_v1c03280 (rarA)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MgsA_C
AAA_assoc_2
AAA
RuvB_N
DNA_pol3_delta2
AAA_14
AAA_5
Sigma54_activ_2
nSTAND3
TIP49
AAA_22
Sigma54_activat
ResIII
RNA_helicase
IstB_IS21
AAA_3
Mg_chelatase
Resolvase
RCF1-5-like_lid
AAA_2
NB-ARC
NPHP3_N
ATPase_2
SLFN-g3_helicase
AAA_18
DEAD
AAA_7
VapE-like_dom
AAA_25
AAA_24
AAA_17
AAA_11
Viral_helicase1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ALD66238
UniProt:
A0A0M3SJ70
LinkDB
All DBs
Position
374840..376090
Genome browser
AA seq
416 aa
AA seq
DB search
MNKPLSFLLRPDTLKNIIGQSHLINNKYGLISKMVEKKFITNLIFYGPPGVGKTSMAISI
ANDLKAKYDFFNASNDKKEKLQKLIESSNHDEQLILIVDEIHRMNRNIQDYLLEFIESKK
VVVFLTTTENPYFVINPAIRSRCTILKLKEITIEEMKEGLKRVLKNNRITLDIEENAFEN
LCELSNGDLRVAINSIELMIELYSNIKINNEIIEAIFEQAVTKGTGEGDEYHDLKSALQK
SIRGSDVDAALHYWARLMQIGDYEVLMRRMIIMAYEDIGLANPTIPIRVYQACQTFRQIG
MPEGRIILGLAIIEMALSEKSNSSYLALEKALEDVKNGLAPPIPPYLRDNHYRNAHKLGH
GIGYKYAHDYENDWVQQQYLPDEIKDINYFTFKPHSSYEKKLMEIYIKFTKGNKIK
NT seq
1251 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataaacctttaagttttttattaagaccagatacattaaaaaatattattggtcaa
tcacatttaattaataataaatatggcctaatatctaaaatggttgaaaaaaaatttatt
actaatttaattttttatggtcccccaggtgttggtaaaacttcaatggcgatttcaatt
gcaaatgatcttaaagcaaaatatgatttttttaatgcctcaaatgacaaaaaagaaaaa
cttcaaaaattaattgaatcatcaaatcacgatgaacaattaatattaattgttgatgaa
attcatagaatgaatagaaatattcaagattatttattggaatttatagaatccaaaaaa
gttgtagtttttttaactacaacagaaaacccttattttgtaattaatcctgctattaga
agtagatgtacaattttaaaattaaaagaaattactattgaagaaatgaaggagggacta
aaaagagttctaaaaaataataggattactttagatattgaagagaatgcatttgaaaat
ctttgtgaactttcaaatggagatttaagagttgctattaattcaattgaattaatgata
gaactatattcaaatattaaaattaataatgaaattattgaagcaatatttgaacaagct
gttactaagggaacaggagaaggtgatgaatatcatgatctcaaatcagctttacaaaaa
tcaattagaggaagcgatgttgatgcggctttacactattgagcaagattgatgcaaata
ggagattatgaagttttaatgagaagaatgatcattatggcatatgaagatattggtttg
gcaaatcccactattcctataagagtctatcaggcttgtcaaacttttagacaaattggt
atgccagaaggaagaatcattttaggtttggcaataattgaaatggctttaagtgagaaa
tcaaattcttcttatttagctttggaaaaagccttagaagatgttaaaaatggattggca
ccaccaattccaccatatcttagagataatcattatcgtaacgctcataaattaggtcat
ggaattggttataagtatgctcacgattatgaaaatgactgagttcaacaacaatatctt
cctgatgaaattaaagatattaattactttacatttaaaccacatagtagttatgaaaaa
aaattaatggaaatatacataaaatttacaaagggaaataagataaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
