Spiroplasma cantharicola: SCANT_v1c03770
Help
Entry
SCANT_v1c03770 CDS
T04084
Symbol
secDF
Name
(GenBank) bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF
KO
K12257
SecD/SecF fusion protein
Organism
scj
Spiroplasma cantharicola
Pathway
scj02024
Quorum sensing
scj03060
Protein export
scj03070
Bacterial secretion system
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
scj00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03060 Protein export
SCANT_v1c03770 (secDF)
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
03070 Bacterial secretion system
SCANT_v1c03770 (secDF)
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
SCANT_v1c03770 (secDF)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02044 Secretion system [BR:
scj02044
]
SCANT_v1c03770 (secDF)
Secretion system [BR:
scj02044
]
Sec (secretion) system
Prokaryotic Sec-SRP core components
SCANT_v1c03770 (secDF)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SecD_SecF_C
Intein_splicing
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ALD66287
UniProt:
A0A0M4K154
LinkDB
All DBs
Position
437451..441233
Genome browser
AA seq
1260 aa
AA seq
DB search
MVNLNNKEKNISKKPKKPIVKSFAILIIICSLVLGIVFSNLKFSENIKLGSDFKGYYSAL
VSVGNLNEDESINGQPNGDSNEGAKALNERLNPMGNNQIIIEKAGKNFLKVLSPVDAYQN
ETIFKNQIQKNGGIVLLDSTENKYTDLQISAEESNKIERKGINDYFTGATSTFINESNSK
NPAISYSLNGDNFKSLFPKAEEGGAGETREEGTLPLFILLDADGFYNDIRNYFNLIKGNK
KDRIEEFFKVIVDPLRTFYDATNTSTKVKEVLYDLFYGQWTEKTSSGINTTYRGSLMARR
NGSNDSLRDANSFLEVVDSFNYLAETSKYVYDSNAVTKDFETGGRYSQNVQLWNSSNTLT
EKYKVNEIFSLINPVLLNFVRTNQILFNETYANNLATNYFLFNGNVTESNSQNSNGYIDG
EKLITKVDSEAKARIGASLFNASGKGFVFTVNSVATIDGKVTKIMLISSLVFILIIVLCL
VIFMGFFYRLLGLFSMIITLSIIGLTLLSLSWFNLAVGPETIICSFILVGLNIEIFSSLF
ENMKESYYLKQRGLKTSFNISIKETVGIALDLVVALLVPAMCMFWISSNAIISMAIMLAM
GSFFTVLFTIVVGVILFKLVINSQLIANKSYLFALNTDFASQGKFFINYKIRKIESKIAK
LNSNTKTIDKELISKLENNLKSLNEKLKEINLKDIEKNNKKQELSKAKLNKKIDLITQKI
AKLNSEKDAKKIQALNFKVNELIFVRDDNTQNILEEEGQIITSTNEKLKIKTIERNIKNG
TKFVSLFGVILLAVSLAFGLLFGLRFDNTFGGRTDYTLWGDNTSTLYLQIKEERFEDTSN
GSADKLEKIFNFKEDLIQKHEDFISNNSGEREAIKLDETRTVSEFLNFAFEDSFYINYLA
QNFSNNKSYKSKSYSVSYGDKFIFNDSSSITDINQNWITVTVFTQDLKQSAIIKKMFNNL
GVDKNSNSTSGNGFITKAIKPATMLWSIKEIAISVLTIIGALVIYILIRFKWTYYIAMIV
SIVLAPLVVVAAITALQIPLGNVAIIAIVGSIFFTIISLFIIFGKARTLIASKDEKSLIN
FFKQEIEIIYDTKSVKKKMNDELFNLKNEMRLNIKTNNLPKEEKKKLKLEFKEIKHNKKI
EFKKVKKANKIKINRVAKQNNYLSEVLVKTFKFGLVRCLLLISLYTILGVVLAASMSSIW
SFGTSMIIGTVISSVFVLFISLPLWVVFEQIRIRNQLARKRFINGLYVSNEEQIIEGIND
NT seq
3783 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtggttaacttgaataacaaggaaaaaaatataagcaaaaaacctaagaaaccaattgta
aaaagttttgctatattaataattatttgttctttggtattagggattgttttctctaat
ttaaaattctcagaaaatattaagttgggttcagactttaaaggttattactcagctctt
gtttcagttgggaatttaaatgaagatgaatcaattaatggtcaaccaaatggtgattca
aatgaaggtgctaaagctttaaatgaacgtttaaatccaatgggaaataatcaaataata
atagaaaaagctggtaaaaacttcttaaaagttttatcacctgttgatgcttatcaaaat
gaaacaatttttaaaaaccaaattcaaaaaaatggtggaattgttttattagattctact
gaaaataagtatactgacttacaaatttcagctgaagaaagcaacaaaattgaaagaaaa
ggaattaatgattactttactggagcaacatcaacttttattaatgaatcaaattcaaaa
aaccctgcaatttcatactcattaaatggtgataattttaaatcattattcccaaaagct
gaagagggtggagcaggtgaaactcgtgaagaaggtactttacctttattcattctttta
gacgctgatggtttttataatgatataagaaactattttaatttaattaaagggaacaaa
aaagatagaattgaagaattttttaaagttatagttgatcctttaagaacattttatgac
gcaacaaatacttctacaaaagttaaagaagttttatatgacttattttatggtcaatga
actgaaaaaactagttctggaattaatactacttatagagggtctttaatggctagaaga
aatggttcaaatgattctctaagagatgcaaattcttttttagaagttgttgactcattt
aattatttggcagaaacatcaaaatatgtttatgattcaaatgctgtaacaaaagatttt
gaaactggtggaagatattcacaaaatgtacaattatgaaattcttcaaatacattaaca
gaaaaatataaagttaatgaaatattttctttaattaatcctgtacttttaaattttgta
agaacaaatcaaatactttttaatgaaacttatgcaaataacttagcaactaattatttc
ttatttaatggaaatgttactgaatcaaactcacaaaattctaatggatatatcgatgga
gagaaattaataactaaagttgattctgaagcgaaagctagaattggagcttcattattc
aatgcttctggtaaaggttttgtctttacagttaactctgttgcaactattgatggaaaa
gtaactaaaataatgttaatctcatcactagtatttatattaattattgttttatgtcta
gttatctttatgggattcttctacagattacttggtttattttcaatgataattacatta
tcaattataggcttgactttattgtcactatcatgatttaacttagcagtgggaccagaa
acaattatttgttcatttattttagtagggttaaatattgagattttctcttcattattt
gaaaatatgaaggaaagttattatttaaaacaaaggggattaaaaactagttttaatatt
tctattaaagaaactgtgggaattgctttagatcttgttgttgctctattagttccagca
atgtgtatgttctgaatttcgtcaaatgcaattatttcaatggcaataatgttagcaatg
gggtcattctttacagttttatttacaatagtagtaggtgtaattctatttaaattagta
attaattctcagttaattgcaaataaatcatatttatttgctttaaacacagattttgct
tctcaaggtaaattctttattaattataaaattagaaaaatagaatctaaaattgctaaa
ttaaactcaaatactaaaacaattgataaagaattaatttcaaaacttgagaataatttg
aaatctttaaatgaaaagttaaaagaaattaatcttaaagatattgaaaaaaataataaa
aagcaagaactatctaaagctaaattaaataaaaaaattgatttaattacacaaaaaata
gctaaattaaattctgaaaaagatgcaaaaaaaattcaagcattgaattttaaagtgaat
gaattaatctttgtaagagatgataatactcaaaatattcttgaagaagaagggcaaatt
attacttcaacaaatgaaaaattaaaaattaaaacaattgaaagaaacataaaaaatgga
actaaatttgtttcattattcggagtaattctactagcagtatcacttgcttttggatta
ttatttggtttacgctttgataatacatttggaggaagaactgattatactttatgaggt
gataatacttcaacactttatttacaaattaaagaagaacgttttgaagatacaagtaat
ggtagtgcagataagttagaaaagatctttaattttaaagaagatttaattcaaaaacat
gaggactttataagtaataacagtggtgaacgtgaagcaattaaattagatgaaacaaga
acagtaagtgaatttttaaactttgcatttgaagatagtttctatattaattatttggct
caaaatttctcaaataataaatcatataaaagtaaaagttattcagtttcttacggagat
aaatttatatttaatgattcttcttcaattacagatataaatcaaaattgaatcacagtt
acagtgtttacacaagatttaaaacaatcagcaattattaaaaaaatgtttaataactta
ggtgttgataaaaattcaaattcaacttcaggtaatggatttataacaaaagctattaaa
cctgcaacaatgctttggtcaattaaagaaatagcaatttctgtattaacaattattggt
gcattagttatttatattcttattagatttaaatgaacatattatatagcaatgatagtt
tcaatagttttagcaccattagtagtagtagcagcaattactgcattacaaataccttta
ggaaatgtagcaattattgcaatagttggttcaatattctttacaattatttctttattc
ataatttttggtaaagcaagaactttaattgcttcaaaagatgaaaaatcattaattaac
ttctttaaacaagaaattgaaattatttatgatacaaaatcagttaagaaaaaaatgaat
gatgagctatttaatcttaaaaatgaaatgagattaaatattaaaactaataatctgcca
aaagaagaaaagaaaaaattaaaattagaatttaaagaaattaaacataataaaaaaata
gaatttaaaaaagttaaaaaagctaataaaataaaaataaatagagttgcaaaacaaaat
aactatttatctgaagttttagtaaaaacatttaaatttggattagtaagatgtttatta
ttaatttctttatatacaattcttggagttgtattagctgcgtctatgtcaagtatctga
tcatttggaacttcaatgattattggaactgttatttcaagtgtgtttgtattatttata
tcattaccgctatgagtagtgtttgagcaaataagaataagaaatcaattagcaagaaaa
cgtttcataaatggtttatatgtttcaaatgaagaacaaatcatagaaggaataaatgat
taa
DBGET
integrated database retrieval system
