Spiroplasma cantharicola: SCANT_v1c05170
Help
Entry
SCANT_v1c05170 CDS
T04084
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K21449
trimeric autotransporter adhesin
Organism
scj
Spiroplasma cantharicola
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
scj00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
scj02000
]
SCANT_v1c05170
Transporters [BR:
scj02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
SCANT_v1c05170
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Big_2
T2SS-T3SS_pil_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ALD66423
UniProt:
A0A0M4JJM8
LinkDB
All DBs
Position
591190..593835
Genome browser
AA seq
881 aa
AA seq
DB search
MRKIFKPLAIIILIIGLIFLTFMYALPKGKDKKVQEQNFVMNHGNKDWHWIENWEQYNKD
HKNFEIYSNNTDIAHVTEKVIHDDGKFELNANSVGQTFLTLVGSTKNSNLEKKWIFPTEI
YESVEPEKINIEISNNNSSIETGNTDSSIVIKNYLSLSNLSIESTNKNIATVFNDNEIIH
ISAIAEGETKIIVNADNAINPVEINVIVNKKLFDIELSNDNINLQTEEINSSISIKNYKS
LMNVSVKSKNNNVVQVTNENEIIKVTALAEGETKIIVNADNAKSPIEINVIVNKKLFDIE
LSNNKISIENGQTNSSIIIKNYKNLENVNVDIKNSKIASVINEGEVVKVTALAEGETKII
VNADNAKNPVEINVTVTKKLFIIELSNNNISIENGQASSSIKIKNYESLNNVSVESKNIN
VAQVTNENEVIKVTALAEGETKIIVNADNAKNPVEINVIVTKKLFNIELSNNNISVEAEK
TDSTISIKNFEDLNNVSFKITNEKNINVTNENEIIKVTGLVEGETKIIVNADNAITPVEI
NVIVTKKLFNIELSNKEISIEAGQSDSITIENYNSLKNINIESKNSKIALVINESNNIKI
SAIAEGETKIIVNADNAITPVEINVIVTKKLFNIELSNDNITLESGQTNSSIRINNYDSL
VNVGIKSKNNNVAEIKNENGIIKISALAEGETKIIVNADNAKNPVEINVIVTKKLFNIEL
SNNNISIEAEQNDLITIENFENLINVSIKSNNEDIIGVVHENEKIKIEGLVEGETKIIVN
ADNAKNPVEINVTITKKLIDIKVNKTKVKIRVGSALTKIKILNYEDLENPEVKNSSSGLI
TVSVKEDTISIKALLIGDATITVNADNAREIVKIEVKARLI
NT seq
2646 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagaaaaatttttaaacctttagcaatcattatattaattatcggacttatcttttta
acatttatgtatgcattaccaaagggcaaagataagaaagtacaagagcaaaattttgtt
atgaatcatggtaataaggactgacattgaattgaaaattgagaacaatataataaagat
cataaaaattttgaaatttattcaaataatactgacattgcacatgttactgaaaaagta
attcatgatgatggaaaatttgaattaaatgcaaatagtgttggtcaaacttttctaact
ttagtaggatcaacaaaaaattcaaatttagaaaaaaaatgaatatttccaactgaaatt
tatgaatcagtagagcctgaaaaaattaatattgagatatcaaataataattcaagtatt
gaaactggtaatactgattcttcaatagtaattaaaaattatttaagtttaagtaatctt
agtatagagtctacaaataaaaatattgcaacagtatttaatgataatgaaattattcat
atatctgcaattgcagaaggtgaaacaaaaataatcgttaatgctgataacgctattaat
cctgttgaaataaatgttatagtaaataaaaaactatttgatattgaattatcaaatgat
aatatcaatctccaaactgaggaaattaattcttcaattagtatcaaaaattataaaagt
ttaatgaatgtaagtgttaaatctaaaaataataatgtagtacaagtaacaaatgaaaat
gaaattattaaagtaacagcacttgcagaaggtgaaacaaaaataattgttaacgctgat
aacgcaaaaagtcctattgaaataaatgttatagtaaataaaaaattattcgatattgaa
ttatcaaataataaaattagtattgaaaatggtcagactaactcttcaattattattaaa
aattataaaaatttagagaatgttaatgttgatataaaaaattcaaaaatagcttcagtt
attaatgaaggagaagttgttaaagtaacagcgcttgcagaaggtgaaacaaaaataatt
gttaacgctgataacgcaaaaaatcctgttgaaataaatgttacagttacaaaaaaatta
tttattattgaattatcaaacaataatattagtattgaaaatggtcaagctagttcatca
ataaaaataaaaaattatgaaagtttaaataatgttagtgtggaatctaaaaatattaat
gtggcacaagtaacaaatgaaaatgaagttattaaagtaacagcgcttgcagaaggtgaa
acaaaaataattgttaacgctgataatgcaaaaaatcctgttgaaataaatgttatagtt
acaaaaaaattatttaatattgaattatcaaacaataatataagtgttgaagcagaaaaa
actgattcaactatatcaataaaaaattttgaggatttaaataatgtttctttcaaaata
actaatgaaaaaaatattaacgttacaaatgaaaatgaaattattaaagtaacaggactt
gtagaaggtgaaacaaaaataattgttaatgctgataatgcaattactcctgttgaaata
aatgttatagttacaaaaaaattatttaacattgaattatcaaataaagaaattagtatt
gaagctggtcaatctgattcaataacaatagaaaactataatagcttaaaaaatattaat
atagaatctaaaaattcaaaaattgccttagtaattaatgaatcaaataatataaaaata
tctgcaattgcagaaggtgaaacaaaaataattgttaacgctgataatgcaattactcct
gttgaaataaatgttatagttacaaaaaaattatttaacattgaattatcaaatgataat
attactttggaaagtggtcaaactaattcatcaataagaataaataattatgatagttta
gttaatgtaggtattaaatctaaaaataataatgtcgcagaaataaaaaatgaaaatgga
attataaaaatatctgcacttgcagaaggtgaaacaaaaataattgttaacgctgataat
gcaaaaaatcctgttgaaataaatgttatagttacaaaaaaattatttaacattgaatta
tcaaacaataatataagtattgaagcagaacaaaatgatttaataacaatagaaaacttt
gaaaatttaattaatgtaagtattaaatcaaataatgaagatattattggagtagttcat
gaaaatgagaaaattaaaattgaaggacttgtagaaggtgaaacaaaaataattgttaac
gctgataatgcaaaaaatcctgttgaaataaatgttacaattacaaaaaaattaattgat
atcaaagttaataaaactaaagttaaaattagagtaggaagtgcattgacaaaaataaaa
atattaaactatgaggatttagaaaatccagaagttaaaaatagttcttcaggtttaatt
acagtatctgttaaggaagatacaatttcaattaaggcacttcttataggagatgcaact
attacagttaatgctgataatgccagagaaattgttaaaatagaagtaaaagcaagattg
atttaa
DBGET
integrated database retrieval system
