Spiroplasma cantharicola: SCANT_v1c07380
Help
Entry
SCANT_v1c07380 CDS
T04084
Symbol
polC
Name
(GenBank) DNA polymerase III subunit alpha (PolC)
KO
K03763
DNA polymerase III subunit alpha, Gram-positive type [EC:
2.7.7.7
]
Organism
scj
Spiroplasma cantharicola
Pathway
scj03030
DNA replication
scj03430
Mismatch repair
scj03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
scj00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
SCANT_v1c07380 (polC)
03430 Mismatch repair
SCANT_v1c07380 (polC)
03440 Homologous recombination
SCANT_v1c07380 (polC)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
scj03032
]
SCANT_v1c07380 (polC)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
scj03400
]
SCANT_v1c07380 (polC)
Enzymes [BR:
scj01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
SCANT_v1c07380 (polC)
DNA replication proteins [BR:
scj03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
DNA polymerase III holoenzyme
SCANT_v1c07380 (polC)
DNA repair and recombination proteins [BR:
scj03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
DNA polymerase III holoenzyme
SCANT_v1c07380 (polC)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol3_alpha
RNase_T
DNA_pol3_finger
PHP
HHH_6
tRNA_anti-codon
DNA_pol3_a_NI
RNase_H_2
PHP_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ALD66644
UniProt:
A0A0M3SJF5
LinkDB
All DBs
Position
complement(869538..873989)
Genome browser
AA seq
1483 aa
AA seq
DB search
MHKQVKDMFESLNIFLSEEEESYFSEAHFYQEAEFSQSANKLRVFIKLKDFLPIHLLHKI
ESIMLTNTLVSTKLNFWVDSELYSKELIWNHIEYVKEQKAEVKTGTIKILTPSNVDYSKE
HRMVFFNVSNETEKSLLEEHKEYYKNKLLKYGFRNLDLKIRVKENLETDVLESIREKYEK
ASHYIANTQKSNTDINSYTSPSRQKYKSNNDILNIATYESIVDLEEDAQNVTIHGQVISK
NVRKSKAGRNVYNIAITDGTSSVMCIFFQRNNEPTFFDEITEETKNSLIGFENQIINKGD
WVSFNGNFNYSSFDKSYIFYISKYKKIESKTVYRKDESKVKRVELHTHTKMSVMDGVSSA
KDYIDCAKRFGWKAIAITDHLNVQTFPDAYYSLLSANKGVSEEEKLKLIYGSELVMLNDD
SWIIKNPTGKKLREAKFVVFDLETTGLSPEFDEIIEFGANVYDYAKGTSKKYDILIKPKK
PLKKFTTDLTGITTEMLEDKNSIEVEFKNIMEIIEDGILIAHNANFDFNFLQSFAKKLGY
GELKNTIIDTLALGRLLQPRLKNHRLGTVAKAYQILYDEKIAHRADYDAEVLTNMYEHMW
TEAKKITSIDVDSDWNKFNKSKYENENFKRSRGYHINVLVKNQQGLKDLYKLISYSHTES
FLGSPKVFQSKILEIKSKNNILVGSGCVNGLVFENARTGTFKMLEESIDFFDYIEIQPLS
VYKKLIQTEDLTMDELKTIILKIIEVAKKLNKTIVATSDAHYVDPELKKIRDIYINTKGL
GGAYHPLYDFKQRVKDNPDQHLRTTKEMLEEFNWLENSELINEIVIENPNKIADLIDANI
VPIKTGSYPPNIENVDKLLTDECYKNAKSLYGELLPEIVKERLEKELLSIIKHGFAVVYW
ISHLLVKKSNDDGYLVGSRGSVGSSFVATASLITEVNPLKPHYRCIECKYSDFETPEEIK
CGYDLPEKLCPKCNTKLLGDGHDIPFETFLGFDGDKVPDIDLNFSGEYQPIAHNFTKEIF
GENNVFRAGTISTVAEKTAYGFTLGYFEKQSQNIDLIRKAEIERLASLSTGVKRTTGQHP
GGIIILPKEYEIEDFTPVNYPADDNESDWKTTHFDFHSIHDNLLKMDILGHVDPTALRML
YDLTGFDPIKVPTDDKAVYSLFSELSALKIDADSILGETTGAIGLPEFGTQFVRNMLKET
KPQNFADLVQISGLSHGTDVYVGNAQSLIKEGVANISQVIGCRDDIMVYLMSKGLDSSSS
FNIMESVRKGKGLSKEWINLMKENNVPEWYINSCLKIKYMFPKAHATAYVLMAYRVAWYK
IYYPEEYYAVWFSTRADFFDLETVLKGKDAVVKTIEDIKYRQNNKLPVTAKENALITIYE
VILEMFARGIEISNIDFNISEGEKFVITKNNDGKKILVPSFNVIDSLGVAVANSIVNARK
ERQITSVNDLKMRTQVTQTQIEIFNKLKVTDKLKDDEQLSFDF
NT seq
4452 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcataaacaagttaaagatatgtttgagagcttaaatatttttttaagcgaagaagaa
gaatcatattttagtgaagcccatttttatcaagaagctgagtttagtcaaagtgcaaat
aaattaagagtctttattaaacttaaagattttttacctattcatttattacataaaatt
gaaagtattatgttaacaaatactttagtttctacaaaattaaatttttgagtagacagt
gaattatattcaaaagaattaatttgaaatcatattgagtatgttaaagagcaaaaagca
gaagttaaaactggaacaattaaaattttgacaccttcaaatgttgactattcaaaagaa
cacagaatggtattctttaatgtatctaatgaaactgaaaaatctcttttagaagaacat
aaagagtattataaaaataaattattaaaatatggttttagaaatcttgacttaaagatt
agagttaaggaaaatttagaaactgatgttttagaatcaattagagaaaaatatgaaaag
gcttcacattatattgcaaatactcaaaaaagtaatactgatattaattcttatacatca
ccttcaagacaaaaatataaatcaaataatgatattttaaatatagcaacttatgaatca
atagttgatcttgaagaagacgcacaaaatgtaacaattcatgggcaagtaatttccaaa
aatgtaagaaaatcaaaagcaggaagaaatgtttataatattgcaattacagatggaact
tcatctgtaatgtgtatttttttccaaagaaataacgaaccaactttttttgatgagata
acagaagaaacaaaaaattctttaattggttttgaaaaccaaattataaataaaggtgat
tgagtttcatttaatggtaattttaattattcatcttttgataagagttatattttttat
attagcaaatataaaaagattgaatccaaaacagtttatcgaaaagatgaatcaaaagtt
aaaagagtcgaacttcatacacatacaaaaatgtcagtaatggatggagtaagtagtgct
aaagattatattgattgtgcaaaaagatttggttgaaaagcaattgcaataacagatcat
ttaaatgttcaaacttttcctgatgcatattattctttattaagcgctaataagggtgta
agtgaagaagaaaaacttaaattaatttatggtagtgaacttgtgatgttaaatgatgac
tcatgaattataaaaaacccaactggtaaaaaattaagagaggccaaatttgttgtcttt
gacttagaaacaactggtttatcacctgagtttgatgaaataattgaatttggagctaat
gtttatgattatgctaaaggtacttcaaaaaaatatgatattttaattaaacctaaaaag
ccattaaaaaaatttacaactgatttaactggtatcacaactgaaatgttagaagataaa
aattcaattgaagtggaatttaaaaatataatggaaattatagaagatggaattttaata
gctcacaatgctaatttcgactttaacttcttacaaagttttgctaaaaaacttggttat
ggtgaattaaagaacacaattattgatacactagcattaggaagacttttacaaccaaga
ttaaaaaatcatcgactaggaactgttgcaaaagcatatcaaattctttatgatgaaaaa
atagctcaccgtgccgattacgatgcagaagttttaactaatatgtacgaacatatgtga
actgaggctaaaaaaataacttcaattgatgttgacagcgattgaaataagtttaataaa
agtaaatatgaaaatgaaaactttaaaaggtcaagaggatatcacattaatgttttagta
aaaaatcaacaaggtttaaaggatttatataaattaatttcttattctcatacagaaagt
tttttaggatcgccaaaagtttttcaatctaagattttagaaattaaaagtaaaaataat
attttagttggaagtggttgtgttaatggtttagtatttgaaaatgcaagaacaggtacc
tttaaaatgttggaagagtctatagatttttttgactatattgaaattcaaccactaagt
gtttataaaaaattaattcaaacagaagatttaacaatggatgaattaaaaactattatt
cttaaaattattgaagttgcaaaaaaattaaataaaacaattgttgcaacaagtgatgca
cattatgttgatccagaacttaaaaaaattagagatatttatattaatacaaaaggatta
ggtggagcatatcatcctctttatgactttaaacaaagagttaaagataatccagatcaa
catttgagaacaacaaaagaaatgttagaagaatttaattgattagaaaatagtgaatta
attaatgaaattgttattgaaaatccaaataaaattgcagatttaattgatgccaatata
gttccaattaaaactggatcttatcctccaaatattgaaaatgttgataaacttttaaca
gatgaatgttataaaaatgcaaaatcactttatggagaactattaccagaaattgtaaaa
gagagattggaaaaagaattactttcaattattaaacatggttttgctgttgtttattga
attagtcatttacttgttaaaaaatcaaatgatgatggttatttagtgggaagtcgtggc
tctgtgggaagttcatttgttgcaactgcatcactgattacagaagttaacccattaaaa
ccacactatagatgtattgaatgtaaatattcagattttgaaacaccagaagaaattaaa
tgtggttatgatttaccagaaaaattatgtccaaaatgtaatacaaaattattaggtgat
ggccatgatattccttttgaaacttttttgggttttgatggagataaagttccagatatt
gatttaaatttttctggagagtatcaaccaattgcacataacttcacaaaagaaattttt
ggagagaataatgtttttagagctgggacaatttctactgttgcagaaaaaacagcctat
ggttttacacttggttattttgaaaagcaaagtcagaatattgatttaattagaaaggct
gaaattgaacgtcttgcttcactttctactggagttaaaagaacaacaggacaacatcca
ggtggaattattattttacctaaagaatatgagattgaagattttactccagtaaattat
ccagctgatgataatgaaagtgattgaaaaacgactcattttgactttcactcaattcac
gataatttattaaaaatggatattttaggtcacgttgatccaactgcattaagaatgctt
tatgatttaacaggatttgatccaattaaagttccaacagatgataaagccgtttattct
ttattttcagaattatcagcattaaaaattgatgctgattcaattcttggtgaaactact
ggagcaattggacttcctgaatttggaactcaatttgttagaaatatgttaaaagaaaca
aaaccccaaaattttgcagacttagtacaaatttcagggttaagtcatggaacagatgtt
tatgttggaaatgctcaatctttaattaaagaaggtgtagcaaatatttcacaagtaatt
ggttgtcgtgatgatattatggtttacttaatgtcaaaaggtttagactcatcatcttca
tttaatattatggaaagtgttagaaaaggtaaaggtctttcaaaagaatgaattaatctt
atgaaagaaaataatgttcctgaatgatacattaatagttgcttaaaaataaaatatatg
tttccaaaagctcacgcaactgcttatgtgttaatggcatatcgtgtagcttgatataaa
atatattatcctgaagaatactatgctgtttgattttctacaagagcagatttctttgat
ttggaaactgtactaaaaggaaaagatgcagtagttaaaactattgaagatattaaatat
cgacaaaacaataaattacctgtaactgcaaaggaaaatgctttaataacaatttatgaa
gttattttagaaatgtttgcaagagggattgaaatctcaaatattgattttaatatttca
gagggagagaaatttgttattacaaaaaataatgatggaaaaaaaatattagtaccatca
tttaatgtaattgattctttaggtgttgctgtggctaattcaattgttaatgccagaaaa
gaaagacaaattacaagtgttaatgatttaaaaatgagaacccaggtaacccaaactcaa
attgaaatatttaataaattaaaagttacagataaattaaaagatgatgaacaactttca
tttgatttctaa
DBGET
integrated database retrieval system
