Spiroplasma citri: SCITRI_00157
Help
Entry
SCITRI_00157 CDS
T04628
Name
(GenBank) putative ribonuclease R
KO
K12573
ribonuclease R [EC:
3.1.13.1
]
Organism
sck
Spiroplasma citri
Pathway
sck03018
RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sck00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03018 RNA degradation
SCITRI_00157
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
sck03019
]
SCITRI_00157
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
sck03016
]
SCITRI_00157
Enzymes [BR:
sck01000
]
3. Hydrolases
3.1 Acting on ester bonds
3.1.13 Exoribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
3.1.13.1 exoribonuclease II
SCITRI_00157
Messenger RNA biogenesis [BR:
sck03019
]
Prokaryotic type
Bacterial mRNA degradation factors
RNA degradosome components
Ribonucreases
SCITRI_00157
Transfer RNA biogenesis [BR:
sck03016
]
Prokaryotic type
tRNA degradation factors
SCITRI_00157
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNB
OB_RNB
CSD2
OB_RNR_1st
FACT-Spt16_Nlob
TFIIE_beta
Tobravirus_2B
CSD
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
APE74071
LinkDB
All DBs
Position
137235..138509
Genome browser
AA seq
424 aa
AA seq
DB search
MHEQIVAILKKQTKPIDTIELAQLLNINKIDDNKMLLKALVELENDNIIGVTQQHRFYYF
DPKIYLRGLISINKKGFGFIKINENQEEYYVKQDDLNNALDQDQVLFILKKQKNDNNSKK
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KEAFERGCSVYLIDRVVPMLPEKLSNGICSLNPFEPRLTLICEMEIDQQGHVVNSSIYEA
VIISKARLTYDEVNKLFCQEKKSYFSRNCSDVVFSATVISNFSLKKRTWWGCWFWFRWTK
VYCW
NT seq
1275 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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DBGET
integrated database retrieval system
