Spiroplasma citri: SCITRI_001906
Help
Entry
SCITRI_001906 CDS
T04628
Symbol
polA
Name
(GenBank) DNA polymerase I
KO
K02335
DNA polymerase I [EC:
2.7.7.7
]
Organism
sck
Spiroplasma citri
Pathway
sck03030
DNA replication
sck03410
Base excision repair
sck03420
Nucleotide excision repair
sck03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sck00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
SCITRI_001906 (polA)
03410 Base excision repair
SCITRI_001906 (polA)
03420 Nucleotide excision repair
SCITRI_001906 (polA)
03440 Homologous recombination
SCITRI_001906 (polA)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
sck03032
]
SCITRI_001906 (polA)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
sck03400
]
SCITRI_001906 (polA)
Enzymes [BR:
sck01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
SCITRI_001906 (polA)
DNA replication proteins [BR:
sck03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
Other elongation factors
SCITRI_001906 (polA)
DNA repair and recombination proteins [BR:
sck03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
BER (base exicision repair)
DNA polymerase I
SCITRI_001906 (polA)
NER (nucleotide excision repair)
GGR (global genome repair) factors
SCITRI_001906 (polA)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol_A
5_3_exonuc_N
DNA_polI_exo1
5_3_exonuc
HHH_2
HHH_5
DUF7793
Tcp10_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
APE75769
UniProt:
Q14QK7
LinkDB
All DBs
Position
complement(1575451..1578060)
Genome browser
AA seq
869 aa
AA seq
DB search
MKKVLLIDGNSLLFRAFYATAYNGEMLKSLDGTPTNAVYAFTNMLNKILKANNYYSVVVA
FDKGKKNFRHDLLVDYKDGRSKTPNELIVQFPIVKEFLDSYQIPYLEQEGYEADDLLGCL
AMLAEKEDFYVDIFSSDKDLYQLITNKTNILVPRQGDSADVIDEAALIAKWGIKPLQVPD
LKGLMGDPSDNLKGVPKVGEKTAIKLIKEYHSIENLYDNIEHIKGALQQNLLNHKESALL
CKKIATIFCDINLEHFTFTSFSPNHETLMQFYLKYNMNSFVTKLFNNQDNDIQNSNIKVK
IIEEWRSEFNENNTTVYLELLDENYHTSEIIGFGIVNSKGVFYFDYIHAKHDKLWHQFLN
DNKYQKLTYHAKSLIVALARDNIFVQNIEYDMMLAGYVYNSNAKNSLDTYINLFEKKQIL
TDEFFYGKGVKKQIPADVIKLGHFIGEKASYIHKLRPKIIELLKTNQQYDLYHNIELPIA
FALARMEINGVKVDQYELTTQTLRIEKIVQELNNEINDIAQKEINPNSPKQISELLFQNF
SLPDRKKGSTAQETLEEIKNNHVIIPKILDYRKYQKLYSTYLKGMEKYIFADGKVHTIYK
QTLTNTGRLSSVEPNMQNISIRDHIQKEVRKIFVVSSPDNILLSCDYSQIELRILAHMSK
DQDLIAAFNNNEDIHTNTAMKIFNLSKDEITPNIRRSAKAVNFGIIYGISDFGLATDLNI
SVAKAKAIINNYYQQFPTIKAFIDKQVEFCKQNGYVTTIFNRKRYVSEINDRNYMQREFG
KRIAMNMPIQGSAADIIKIALKNIDQEFLKLNLKAKIIAQIHDELIFEIPQVELIQVQKI
VKILMEDSTKLDVKLIVDMKTGLSWYDLK
NT seq
2610 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaagtattgttaattgatggaaattctttgctttttagagcattttatgccaca
gcttataatggcgagatgttaaaaagtttggatggaacaccaacaaatgctgtttatgca
tttaccaatatgctaaataaaatattaaaagcaaataactactatagtgttgttgttgct
tttgataaaggaaaaaagaattttcgtcatgatttattagttgattacaaagatggtcgg
agcaaaacaccaaatgaattaattgtacaatttccaattgtaaaggaatttttagatagt
tatcaaattccatatttagagcaagaaggatatgaggctgatgatctattaggatgttta
gcaatgttggctgaaaaagaagatttttatgttgatattttttccagtgataaggattta
taccaactaattactaataaaacaaatattttagtgccacgtcaaggcgatagtgctgat
gttattgatgaagctgctttaatagcaaaatggggaattaaaccattacaagttcctgat
ttaaaagggctaatgggtgacccttccgataatttaaagggtgttccaaaagttggcgaa
aaaacagcaataaaattaattaaggaatatcattcaattgaaaatttatatgataatatt
gaacatattaagggtgctttacaacaaaatttattgaatcataaagaaagtgcattattg
tgcaaaaaaatagctactattttttgtgatattaatttagagcattttactttcacttca
ttttcaccaaatcacgaaacattaatgcaattttatttaaaatataatatgaattcattt
gtaacaaaactatttaataatcaagataatgatatccaaaactcaaatataaaagtaaaa
attattgaagaatgacgttctgaatttaatgaaaacaatactactgtgtatttagaacta
ttagatgaaaattatcacacttcggaaattattggatttggaattgttaattccaaaggc
gttttttattttgattatattcatgcaaagcatgataaactatgacatcaatttttaaat
gataataaatatcaaaagttaacttatcatgcaaaaagtttaattgttgctttagctcgt
gataatatttttgttcaaaatattgagtatgatatgatgctggctggttatgtttataat
tcaaatgcaaaaaatagtttagatacttatattaatttatttgagaaaaaacaaatttta
actgatgaatttttttatggaaaaggggttaaaaaacaaattcctgctgatgtaattaaa
ttaggtcactttattggcgaaaaagcatcatatattcataaattaagaccaaaaattatt
gagttattaaaaactaatcaacaatatgatttgtatcataatattgagttaccaattgct
tttgcattagcacgaatggaaattaatggcgttaaagttgaccaatatgaattaacaaca
caaaccttacgaattgaaaaaattgttcaagaattaaataatgaaattaatgatattgca
caaaaagaaattaatcctaattccccaaaacaaatttcagaattattatttcaaaatttt
tctttacctgatcggaaaaaaggatcaacagcacaagaaactttagaagaaataaaaaat
aaccatgtaattattccaaagatcttagattatcgaaaatatcaaaaattatattcaact
tatttaaaagggatggaaaaatatatttttgctgatgggaaagttcatacaatttataaa
caaaccttaacaaatactggcagactttcatctgtggagcctaatatgcaaaatattagt
attcgtgatcatatccaaaaagaggtacgaaaaatttttgttgtttcatcaccagataat
attttattatcttgtgattattcacaaattgaattacgaattttggcacatatgtcaaaa
gaccaagatttaattgctgcttttaataacaatgaagatattcatactaatactgcaatg
aaaatttttaatttatcaaaagatgaaattactccaaatattcgtcgtagcgcaaaagct
gttaattttggtattatttatggaattagtgactttggtttagcaactgatttaaatatt
tctgttgcaaaagcaaaagcaataatcaataattattatcagcaatttccaacaattaag
gcttttattgataaacaagttgagttttgtaaacaaaatggctatgttacaacaattttt
aatcgaaaacgttatgtttcagaaattaatgatcggaattatatgcaacgtgaatttgga
aagcgaattgcaatgaatatgccaattcaaggtagtgcggcagatattattaaaattgct
ttaaaaaatattgaccaagagtttttaaaattaaatttaaaagcaaaaattattgcacaa
attcatgatgaattaatttttgaaattccgcaagttgaattaattcaagtgcaaaaaatt
gttaaaatattaatggaagattctactaaattagatgtaaagttaatagttgatatgaaa
actggtttaagctgatatgatttaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
