Spiroplasma citri: SCITRI_00361
Help
Entry
SCITRI_00361 CDS
T04628
Symbol
uvrD
Name
(GenBank) putative ATP-dependent DNA helicase
KO
K03657
ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA [EC:
5.6.2.4
]
Organism
sck
Spiroplasma citri
Pathway
sck03420
Nucleotide excision repair
sck03430
Mismatch repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sck00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03420 Nucleotide excision repair
SCITRI_00361 (uvrD)
03430 Mismatch repair
SCITRI_00361 (uvrD)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
sck03400
]
SCITRI_00361 (uvrD)
Enzymes [BR:
sck01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.4 DNA 3'-5' helicase
SCITRI_00361 (uvrD)
DNA repair and recombination proteins [BR:
sck03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
GGR (global genome repair) factors
SCITRI_00361 (uvrD)
MMR (mismatch excision repair)
Other MMR factors
SCITRI_00361 (uvrD)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
UvrD-helicase
UvrD_C
AAA_19
UvrD_C_2
Viral_helicase1
AAA_12
AAA_11
AAA_30
PcrA_UvrD_tudor
Ku_PK_bind
RasGEF_N
CarD_TRCF_RID
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
APE74270
UniProt:
A0AAJ4JY07
LinkDB
All DBs
Position
306611..308803
Genome browser
AA seq
730 aa
AA seq
DB search
MFNEFIENLNPNQREAVLAITGPVRIIAGAGSGKTRIITNKIAYLIKYANLQPWRICAVT
FTNKATNEMKTRIVDMIGNSGQRCLIATYHALCVRILREDIIHLNYDRQFNIIDMADQDS
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ADSQAIKKVE
NT seq
2193 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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gcagatagtcaagcaattaaaaaagtagaataa
DBGET
integrated database retrieval system
