Spiroplasma citri: SCITRI_00398
Help
Entry
SCITRI_00398 CDS
T04628
Symbol
smc
Name
(GenBank) chromosome condensation and segregation SMC ATPase
KO
K03529
chromosome segregation protein
Organism
sck
Spiroplasma citri
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sck00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
sck03036
]
SCITRI_00398 (smc)
Chromosome and associated proteins [BR:
sck03036
]
Prokaryotic type
Chromosome partitioning proteins
Condensin-like complex
SCITRI_00398 (smc)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SMC_N
SMC_hinge
AAA_23
AAA_21
AAA_15
AAA_29
ABC_tran
SbcC_Walker_B
PRK
Sfi1_C
SlyX
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
APE74303
UniProt:
A0AAJ4EIC6
LinkDB
All DBs
Position
335470..338436
Genome browser
AA seq
988 aa
AA seq
DB search
MLFLKKLEAFGFKSFADPLTVNFDHEMIGIVGPNGSGKSNINDAIRWCLGEQSIKSLRGN
NSEDVIFNGSETKQALNMAEVKLIFDNTNRIFAMDYDEIEIIRRVFRGTGENEYFINKQR
VRLKDIQDFAIDSGLTKSSLAIISQGNINAFAEAKPLERRALFEEAAGVAKYKRRKLEAL
KKLDRSNENLARLKDILNEIERKLPSLKRQSEKAIKYTTLKDKLNQIELAVLVKDITFFN
DKLLELRLQQKEIISTKQDADRKLKNNEIEYNELTKENFNLDSKINVLTKEFQSLVSEIS
DLKVHKIELDNKEAALKMSNNDITITNMVNDYNELTVNLQNEREKLTTLETQQQEYRAQR
EAFNTKQAVLNEKLGAINKTIIRLESELERSQHNLENQDNLHEGVKNIINNKTVLPGIMG
LVQDIINVDEKYEQAIVTALSGRLQDILVKNVDSAKRAISYLKQNRAGRATFIPLDVISP
RYLNSDEAFVIKSVQGYLGLGNSLVKVKKEFRIAVDYLLSRYLICTDFDSAQEIGKLTKY
RYNIVTLDGEIVRPQGAVTGGSRRTRMTIVNPEKELRVLNEKLAMRTEEHHHVLKQLNIL
RRQLDEINEVIAENQASIGAGKRQIEIIMYDQTKLQNEYQLLTAKNIDETKIVENKAVLN
IVDQIKQKELLKTKIEQQLNVARSLKDKQSLAINELNNQIAEKRYYISALQEQISKMNTD
VSIINVKIQQNLTRLTEEYQMTYDHAKTLELKVIDNEDLIRDEIKQLRSDLAQIGNVNLE
AIEEYKEEDARFQFMNNEYNDANDSIKNLLKSIDEMDSIMKEKFDKTIKEVNENLPSTFE
VLFGGGSARIIYTEPENLLETGVDIKVSPPGKNITNLNLLSGGEKSLVALSVLFAILKVR
PIPLVILDEAEAPLDPANVERFAKYIRSFVETTQFIVVTHRVGTMEHCDVLYGATMQQKG
VTKIVGIKLQQAAEMIKEFENKLENKKA
NT seq
2967 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgttatttttaaaaaaattagaggcatttggttttaaatcatttgctgatccattaaca
gttaattttgatcatgaaatgataggaattgtcggaccaaatgggagcggaaaatccaat
attaatgatgcaattcgttgatgtttaggagaacaatcaattaaatcacttcgtggaaat
aatagtgaagatgtcatttttaatggttcagaaacaaaacaagcattaaatatggccgag
gttaaactaatttttgataatacaaaccggatttttgcaatggactatgacgaaattgaa
attattcgtcgtgtttttcgaggaactggtgaaaatgaatattttattaataaacaacga
gttcgtttaaaagacattcaggattttgcgattgatagtggcttaacaaaatcatcatta
gcaattatttcgcaaggaaacattaatgcttttgcagaagcaaaaccattagaacgacgt
gctttatttgaagaagctgctggagttgcaaagtataaacgccgcaaattggaagcttta
aaaaaactagaccgttcaaatgaaaatttagcgcgtttaaaagatattttgaatgaaatt
gaacgaaaattaccaagtttaaaacgtcaaagtgaaaaagcaatcaaatatacaacattg
aaagacaaattaaatcaaattgaattagcggttttagtaaaagatattactttttttaat
gacaaattattagaattacgtttgcagcagaaagaaattattagtacgaaacaagatgct
gatcgaaaattaaaaaacaatgaaattgaatataatgaattaaccaaagaaaattttaat
ttggatagcaaaattaatgtcttaactaaagaatttcaaagtttagtttcagaaattagt
gatttgaaagtacataaaattgaattagataacaaagaagcagccttaaaaatgtctaat
aatgatattactattactaatatggttaatgattataatgagttaactgttaatttacaa
aatgaacgggaaaaattgacaacattagaaacacagcaacaagaatatcgtgcgcaacgt
gaagcttttaatacaaagcaagctgtgttaaatgaaaaattaggagcaattaataaaacc
attattcgcttagaaagtgaattagaacgttctcaacataatcttgaaaatcaagataat
ttacatgaaggggttaaaaatattattaacaataagaccgttctgcctggaattatggga
ttagttcaagatattattaatgttgatgaaaaatatgagcaagcgattgtaactgcttta
agtgggcgtttacaagatattttagttaaaaatgttgatagtgcaaaacgagcaatttca
tatttaaaacaaaaccgtgctggacgagcaacatttattccgttagatgtaatttcgccc
cgttatcttaacagtgatgaagcatttgtgattaaatcagtgcaaggatatttaggatta
ggaaatagtttagttaaagtaaaaaaagagtttcgaattgcagttgattacttgttaagc
cggtatttaatttgtactgattttgatagtgcgcaggaaattggaaaattaacaaagtat
cgctataacattgttaccttagatggagaaatagttcgcccgcagggagctgttacaggg
ggttcacgtcgaacacgaatgacaattgttaatccagaaaaggaattaagagttcttaat
gaaaaattagcaatgcgaactgaagaacatcatcatgtattaaaacaattaaatatactt
cgacgccaattagatgaaattaatgaagttattgctgaaaatcaagcttcaattggagca
ggaaaacgacaaattgaaattattatgtatgaccaaacgaaattgcaaaatgaatatcag
ttactaacagcaaaaaatattgatgaaacaaaaatagttgaaaataaagcagtacttaat
attgtggatcaaattaaacaaaaagaacttttaaaaacaaaaattgaacaacaattaaat
gttgcacgcagtttgaaagataaacagtcattagcaattaatgaacttaataatcaaatt
gctgaaaaacgatattatatttcagctttacaagaacaaattagcaaaatgaatactgat
gtatcaattattaatgttaagattcaacaaaatctaacaagactaacagaagaatatcaa
atgacatatgatcatgctaaaacgttggaattaaaggtaattgataatgaagatttaatt
cgtgatgaaattaagcaattacgaagtgatttagctcaaattggaaatgttaatttagaa
gcaattgaagaatataaagaagaagatgctcgttttcaatttatgaataatgaatataac
gatgcaaatgattcaattaaaaatttattaaagtcaattgatgagatggatagtattatg
aaagaaaaatttgataaaacaattaaggaggttaatgagaatttaccatccacctttgaa
gtattatttggtggtggttcagcacgaatcatttatactgagccagaaaatttattagaa
acaggggttgatattaaagtatcgccaccagggaaaaatattactaacttaaatttatta
tctggaggagaaaaatcattggttgctctatcagttctttttgcgattttaaaagtacga
ccaattccattagtaattttagatgaagcagaagcaccattagatccagctaatgttgaa
cgatttgctaagtatattcgtagttttgttgaaaccactcaatttattgttgttacccat
cgagttgggacaatggaacattgtgatgtattatatggggcaacaatgcaacaaaaaggt
gtcacaaaaattgttggaattaaattacaacaagcggcagaaatgattaaagaatttgaa
aataaacttgaaaataaaaaagcataa
DBGET
integrated database retrieval system
