Spiroplasma citri: SCITRI_00511
Help
Entry
SCITRI_00511 CDS
T04628
Symbol
valS
Name
(GenBank) valyl-tRNA synthetase
KO
K01873
valyl-tRNA synthetase [EC:
6.1.1.9
]
Organism
sck
Spiroplasma citri
Pathway
sck00970
Aminoacyl-tRNA biosynthesis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sck00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
00970 Aminoacyl-tRNA biosynthesis
SCITRI_00511 (valS)
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01007 Amino acid related enzymes [BR:
sck01007
]
SCITRI_00511 (valS)
09182 Protein families: genetic information processing
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
sck03016
]
SCITRI_00511 (valS)
Enzymes [BR:
sck01000
]
6. Ligases
6.1 Forming carbon-oxygen bonds
6.1.1 Ligases forming aminoacyl-tRNA and related compounds
6.1.1.9 valine---tRNA ligase
SCITRI_00511 (valS)
Amino acid related enzymes [BR:
sck01007
]
Aminoacyl-tRNA synthetase
Class I (U)
SCITRI_00511 (valS)
Transfer RNA biogenesis [BR:
sck03016
]
Eukaryotic type
Aminoacyl-tRNA synthetases (AARSs)
Other AARSs
SCITRI_00511 (valS)
Prokaryotic type
SCITRI_00511 (valS)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
tRNA-synt_1
Anticodon_1
tRNA-synt_1g
tRNA-synt_1_2
tRNA-synt_1e
Val_tRNA-synt_C
tRNA-synt_1f
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
APE74414
UniProt:
Q14P39
LinkDB
All DBs
Position
450034..452700
Genome browser
AA seq
888 aa
AA seq
DB search
MRKELTKKYDHILVETGKYQFWKKKGYFTADVKSKQPSFSIVIPPPNVTGKLHLGHAWDT
TLQDLIIRYKKLLGFDTLYLPGMDHAGIATQAKVEERLCVTKNILRHDLGREKFIEQVWA
WKEEYAEIIREQWAKLGLALDYSREQFTLNNNLSAAVQKVFIDLYQKGLIYRGKRIISWD
PVQKTALSNIEVIYQEQQGKMYYFKYFLENSTSEFLTIATTRPETMFADQCVVVNPNDNR
YRKYWNKKVVNPANGELLPIICDDYVEQDFETGAMKCTPAHDANDFEIALRHHLAMPICM
NLDGTMNELAGKYHNQDRFTARQNLVHDLNQQKLIVEIKVHSHQVGFSERSGAIVEPYLS
DQWFVKMEYFAEKIIKFQSSTNKIQFYPPRFNITLINWMKNVQDWCISRQLWWGHQIPAW
YYKDDSTKIHVGLTPPDNSKNWIQDADVLDTWFSSALWPMTSLGWNWDKKLFQHYFPTNV
LVTGYDIIFFWVSRMMFESLEFTKEKPFNDVLIHGLIRDEEGRKMSKSLGNGVDPMDVIK
EYGADTLRYFLVTNSAPGQDLRFSLEKVNSAWNFINKLWNAARYVEMNLTNNFKPLVNFE
IEIKNLLLNHQENAIDQWILSELAKTITKVQTNMEKYEFVLVGKDLYDFVWNKLCSWYIE
LTKVNLQSNNATIKMVSTQTLFYVLKQILIMLHPFIPFVTEEIYQKLNLKESIMLEVYPK
INFNYNVDYLNLVTEIVAAIRELRSNYQIKKEHIIEIWFDQASSKNNITTNVISLINEFI
LKMVNSKVMGVLHQKDQNQKYVTIPLTNVILEVGLNDIVDETIEHQKINAELTRLEQELK
RSKNILNNPNFLAKANAEKIKLEEEKYAQYLEQYQQLKGKITNDNSNN
NT seq
2667 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagaaaagaattaacaaagaaatatgatcatatcttggtcgaaacaggaaaatatcaa
ttttggaagaaaaaaggttattttaccgcggatgttaaaagtaaacaaccaagttttagt
attgttattccacccccaaatgtgacagggaaattgcatttaggtcatgcatgagataca
acattgcaagacttgattattcgttataaaaaattactaggatttgatactttatattta
ccaggaatggatcatgcgggaattgctacccaggcaaaagtagaagaacgtttatgtgta
acaaaaaatattttacgacatgatttagggcgagaaaagtttattgaacaagtttgagca
tgaaaggaagagtatgctgaaattattcgtgagcaatgagctaaattaggtttagcatta
gattattcacgcgaacaatttacgttaaataataatttatcagcggcagtgcaaaaagtt
tttattgatttataccaaaaaggattaatttatcgtggtaaacgaattatttcatgagat
cccgtgcaaaaaaccgctttatcaaatattgaagttatttatcaagaacaacaaggcaaa
atgtattactttaaatattttttagagaatagcacaagtgagtttttgaccattgcaaca
acgcgtccagaaacaatgtttgctgatcaatgtgttgttgttaatccaaatgataatcgt
taccgcaaatattgaaataaaaaggtagtaaatcccgcaaacggtgaattacttcctatt
atttgtgatgattatgttgaacaagattttgaaacgggagcaatgaaatgtacaccagca
catgatgctaatgattttgaaattgctttgcgtcatcatttagcgatgccaatttgtatg
aacttagatggaacaatgaacgaattagctgggaaatatcataaccaagatcgttttact
gctcgtcaaaatttagtgcatgatttaaatcaacaaaagttaattgttgaaattaaagtt
cattctcaccaagttggtttttcagaacgaagtggtgctattgttgaaccatatttgtca
gaccaatgattcgttaaaatggaatattttgctgaaaaaattattaaatttcaatcatca
acaaataaaattcaattttatccacctcgctttaatataacattaattaattgaatgaaa
aatgttcaagattgatgtatttcacggcaactatgatggggacatcaaattccagcatga
tattataaagatgattcaacaaaaattcatgtcggtttaactccaccagataatagtaaa
aattgaattcaagatgcagatgttttagatacttgattttcatcagcattatggccaatg
acaagtttagggtgaaattgagataaaaaattatttcaacactattttccaactaatgtt
ttggtaactggttatgatattattttcttttgagtttcaagaatgatgtttgaatcatta
gaatttacgaaggaaaaaccatttaatgatgttttaattcatggtttaattcgggatgaa
gaaggacgaaaaatgagtaagtcattagggaatggggttgacccgatggatgttattaaa
gaatatggtgcagatacattacgttattttttagttacaaatagtgccccaggacaagat
ttacgtttttcgttagaaaaagttaatagtgcttgaaattttattaataagttatgaaat
gctgctcgttatgttgaaatgaatttaacaaataattttaaaccattggttaattttgaa
atagaaattaaaaacttattattaaaccatcaagaaaatgctattgaccaatgaatttta
tcagaattagcaaaaacaattactaaagtacaaactaatatggaaaaatatgaatttgtt
ttagttggaaaagatttgtatgattttgtatgaaataagctttgctcatgatatattgaa
ttaacaaaagttaatttgcaaagtaataatgcaacaattaaaatggtatcaactcaaaca
ttgttttatgttttaaaacaaattttaattatgttacatccatttattccatttgtaacg
gaagaaatttatcaaaaattaaatttaaaagaatcaattatgttagaagtttatccaaaa
attaattttaattataatgttgattatttaaatttagtaacagaaattgttgctgcaatc
cgcgaattgcgaagcaattatcaaattaaaaaagaacatattattgaaatttgatttgat
caagcaagtagtaagaataacattactacaaatgttatttcattaattaatgaatttatt
ttaaaaatggttaatagtaaagttatgggtgtgcttcaccaaaaagatcaaaaccaaaaa
tatgtaacaattccattaacgaatgttattttagaagttggattgaatgatattgttgat
gaaacaattgagcaccaaaaaatcaatgcggaattaactcgcctagaacaagagctaaaa
cgaagcaaaaacattttaaataatccaaattttttagcaaaggcaaatgctgaaaagatt
aaacttgaagaagaaaaatatgcccaatatttagaacaatatcaacaattaaaaggaaaa
ataacaaatgacaattccaacaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
