Spiroplasma citri: SCITRI_00546
Help
Entry
SCITRI_00546 CDS
T04628
Symbol
virD4
Name
(GenBank) type IV secretion system protein VirD4
Organism
sck
Spiroplasma citri
Pathway
sck03070
Bacterial secretion system
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sck00001
]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
03070 Bacterial secretion system
SCITRI_00546 (virD4)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
T4SS-DNA_transf
TraG-D_C
TrwB_AAD_bind
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
APE74445
UniProt:
Q14P05
LinkDB
All DBs
Position
479761..481926
Genome browser
AA seq
721 aa
AA seq
DB search
MHKSKRFSKHQKDSLIAACVFFPIANIFGTIIISFFKVWKMPGFTFSKFFPYLWKFMSEN
ITFVLICILVISLLFWLIACFIIFVAAKHFEKTYVKKTETSEYGGAKWIVNELDKKGSIK
EFNKLYPVHNLHDVKNKAGWVVRFLRKNSKINFNVRGNTHAICLGTTNSGKSQKIVMPSA
IYNSCLPERYKPCLIFTDPKGELYDVLSKLLQKNGYEVLVLNLRDPKNSSSWNPLAISYK
YYYDSVTIAKELKYFIVKNQKHLEKYVCYYHDEFNCAECFRNIVNKKIAIFRNQWFFDLK
EAQEFVEATRNELKSLAIEEINDLVLTIWPLTGGENDHFASMAASIAKTIILGLLEILDD
NPATLPLEKFNFPLINMLCSDRKKMKAWFASLPSTSLAKIIGANALATGEKELGSIFSTL
DRGLQIYQDLGIQSIVCNNEIDLFKFTEKPKALFLIIPDEKTNRHIFASLIISQLYKANV
AIVTERKSKRLPRDIQFYLDEFGNMPTIPNFQSFVTVARSRGIFFLIIVQDLDQVYQKYG
KENGTVIISNCNLNIYIQTNNFDTAKTYSDMLGTETVEILSHSRSRSLQTKRIMIDPVQR
RKEGMELIKPSDLMKLKNPYGIIFSSKENPGLVYMDSAWKYSKVFGLGKLKNTKIIKPFN
FLNNHYFDLFSYVTSGQVEMMKNEIEEKIATILKIPLAERTPEQIKLLEKCKNIGINVNE
S
NT seq
2166 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcataaaagtaaaagattttcaaaacaccaaaaagatagtttaatcgccgcgtgtgtt
ttttttccgattgctaatatctttggtaccattattatttcatttttcaaagtatgaaaa
atgccaggttttacttttagtaaattttttccttatttatgaaaatttatgtctgaaaat
atcacttttgtcttgatttgcattttagttatttcactccttttttgattaattgcttgt
tttataatatttgttgctgcaaaacattttgaaaaaacatatgttaaaaaaacagaaaca
tcagaatatggaggagcaaaatgaattgtaaatgaactagacaagaaaggaagtattaag
gaatttaataaattatatcctgttcataatttacatgatgttaaaaataaagcaggatga
gtagtaagatttttgagaaaaaacagtaaaattaattttaatgttcgtggtaatacacat
gcaatatgtttaggaacaactaatagtgggaaatcacaaaaaattgtaatgccttctgct
atttataatagttgtttaccagaaagatataaaccatgtctaatttttactgatcctaaa
ggagaattatatgatgttttatcaaaactattacaaaaaaatggttatgaagtactagtt
ttaaatttacgtgaccctaaaaattcgtcttcttggaacccactggcaatttcttacaag
tattattatgattcagttactattgcaaaagagttaaaatattttatagttaaaaatcaa
aaacatttggaaaaatatgtttgttattatcatgatgaatttaattgtgcagaatgtttt
agaaacattgttaataaaaaaattgcaatttttcgcaatcaatgattttttgatttaaaa
gaagcacaagaatttgttgaagcaactagaaatgaattaaaatcattagcaattgaagaa
attaacgatttagttttaacaatttgacctttaactggtggggaaaatgaccattttgca
agtatggctgctagtattgcaaaaacaattattttaggattattagaaatattagatgat
aatccagcgacattgccattagaaaaatttaattttccattaattaatatgctttgtagt
gaccgtaaaaaaatgaaagcctgatttgctagcttaccatcaacatcattagcaaaaatt
atcggggctaatgcattagcaaccggagaaaaagaattaggttcaatattttcaacttta
gatcgtggattacaaatatatcaagatcttggtattcaatctattgtatgtaataatgaa
attgatttatttaagtttactgaaaaaccaaaagctttatttttaattattccggatgaa
aaaactaatcgtcatatttttgcttcgttaattatttctcagttatataaagcaaatgta
gcaattgtaacagaacgaaaaagtaaacgtttaccacgagatattcaattttatttagat
gagtttggaaatatgccaacaatccctaatttccaatcctttgttacggttgctcggagc
aggggaatttttttcctaataattgttcaagatttagatcaagtttatcaaaaatatggg
aaagaaaatggaacagttattatttcaaactgtaatttaaatatttatattcaaactaat
aattttgatactgcaaaaacatattcagatatgttaggaactgaaacagttgaaatttta
tctcattcacgttcacgtagcttgcaaacaaaacgaattatgattgatcctgttcaaaga
agaaaagaaggaatggaattaattaaacctagtgatttaatgaaattaaaaaatccttat
ggaattatatttagttcaaaagaaaatccgggtctagtttatatggactcagcatgaaaa
tatagtaaagtatttggcttaggtaaacttaaaaatacaaaaataattaaaccgtttaat
tttcttaataatcattattttgatttattttcatatgtcacatcaggtcaagttgaaatg
atgaaaaatgaaattgaagaaaaaattgcaactattttaaaaattcctcttgcagaacga
acacctgaacaaattaaattgttagaaaaatgtaaaaatattggaattaatgttaatgaa
agttaa
DBGET
integrated database retrieval system
