Spiroplasma citri: SCITRI_00557
Help
Entry
SCITRI_00557 CDS
T04628
Symbol
rmgs1
Name
(GenBank) Recombination factor protein RarA
KO
K07478
putative ATPase
Organism
sck
Spiroplasma citri
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sck00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09192 Unclassified: genetic information processing
99976 Replication and repair
SCITRI_00557 (rmgs1)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MgsA_C
AAA_assoc_2
AAA
RuvB_N
AAA_5
AAA_16
DUF815
DNA_pol3_delta2
nSTAND3
AAA_18
Sigma54_activ_2
AAA_22
Sigma54_activat
NPHP3_N
RsgA_GTPase
RNA_helicase
RCF1-5-like_lid
TIP49
NB-ARC
VapE-like_dom
AAA_7
MMR_HSR1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
APE74456
UniProt:
A0AAJ4EIQ9
LinkDB
All DBs
Position
492359..493594
Genome browser
AA seq
411 aa
AA seq
DB search
MFEPLAFVLRPTTITDIIGQSHLINEQNGVISRMLKYNYASSLIFYGDPGVGKSSIARAL
ANDLQLEYAIFNAGINKKQDLEKIIKQAANFERFIIIVEEVHRMNKDRQDILLQYLENGH
LIMFACTTENPYFVINPALRSRANIIKLERITVDEMLTGLQKIITKKKLPLTITNDALLL
ICQLASGDLRIAINILELCLNLYPTEEITVTIINNLATSANLINFAEGDEHHDLKSALQK
SIRGSDVNAALYYFARLLASGDHEALLRRMLIIAYEDIGLANPAIAVHVKTAIDSFRQIG
LPEGRIPLGLAIVEMCLSEKSNSAYLATDQAYEDVLKGNLYPIPHHLRDTSYASAKKLGN
GRGYQYPHDFPNDYVAQQYLPKEMRGTVYYQPKLHSVYEKRINELYGRFTK
NT seq
1236 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttgaaccattagcatttgtcttacgaccaactacaataactgatatcattgggcaa
agccaccttattaatgaacaaaatggtgttatttcacgaatgttgaaatataattatgca
agttcattaattttttatggtgatccgggcgttgggaaaagtagtattgctcgagcatta
gccaatgatttacaacttgagtatgcaatttttaatgctggaattaataaaaaacaagat
ttagagaagattattaagcaagcagcaaattttgaacgatttattattattgtagaagaa
gtacaccggatgaataaagatcggcaagatattttattacagtatttagaaaatggacac
ctaattatgtttgcttgcacaacagaaaatccatattttgtgattaatccagctttacgg
tcacgagctaatattattaaattagaacgaattactgttgatgaaatgctaactggttta
cagaaaataattacaaagaaaaaattgccactaacaattactaatgatgctttactatta
atttgtcaattagcaagtggtgatttaagaattgcaattaatatattagaattatgttta
aatttatatcccacagaagaaattactgtgacaattattaataatcttgctacatcggct
aatttaattaattttgcagagggtgatgaacatcatgatttaaaatcagccttgcaaaag
tcaattcggggtagtgatgttaatgctgctttatattattttgcacgcttattagcaagt
ggtgatcacgaagcattattacgccgaatgttgattatcgcttatgaagatattggttta
gctaatccagcaattgcggttcatgttaaaacagcgattgatagttttcgtcaaattgga
ttaccagaggggcgaattccattaggattagcaattgttgaaatgtgtttaagtgaaaaa
tcaaatagtgcttatttagcaacagatcaagcttatgaagatgttttaaaaggtaacctt
tatccaattcctcatcatttacgtgatacgagttatgcttccgcaaagaaattaggaaat
ggtcgtggttatcaatatccacatgattttccaaatgattatgttgcgcaacaatacctt
ccgaaggaaatgcggggcacggtttattatcaaccgaaattacatagtgtatatgaaaaa
cgaattaatgaattatatggacggtttacaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
