Spiroplasma citri: SCITRI_00625
Help
Entry
SCITRI_00625 CDS
T04628
Name
(GenBank) putative ABC-type transport system permease protein
KO
K02004
putative ABC transport system permease protein
Organism
sck
Spiroplasma citri
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sck00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
sck02000
]
SCITRI_00625
Transporters [BR:
sck02000
]
ABC transporters, prokaryotic type
ABC-2 type and other transporters
Putative ABC transporter
SCITRI_00625
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
FtsX
Ctr
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
APE74521
LinkDB
All DBs
Position
554377..558465
Genome browser
AA seq
1362 aa
AA seq
DB search
MEKMTGFKLLFKNNFKNTVKNKIQFIGLVVLVFLTSFIFTIIAVSKQRVENNYSSFISEQ
LSNQHDFVVSFANSTYVKNSNREPDQFEKITDSGIRQNAILEFVKEQLKNRDEHFIYNRV
EARTFTLGNNKVIKAVTLNLHQEIDKFIVANGMPLSVYTKYLLSINQETMHWIYLTPEFA
RKNNIKINDIIRLQPDRYGTTIKVADSELKDVDLTPYEKEDINKWLPKSPYANENWFRVV
GFGQSADYVTPIIDAVHPFPNMKNEGIAYLDPRLFGLVEDTAGNKYPVTKLDLTKQILIP
KSQLEREVYYVGKFQQTKVEQMRNNYSQTINNYLNTNQGKHIGLHGYYVKTLSTGLPIAT
FRTDNRYEFAKRITYFTSTLNAFISCSYILITILLIISFFVLILVVHRQIDATGPQNGLL
RALGYRRRVLTFSYISYPLMIALIGGIVGYGMGISGQFTVKYLFGSYFNLPYGNFVFAPL
ALVTCVLFIFALLTCVTMISGTIIMVSRTPLQLIRKEKTVSYGRFKKIVYKMFAIRKTFD
ARFQAVQLSNSIGKMVGVSLTMIISTIMITMSTTIPIILQNNIRYSYEGDNYKTLVEYNS
PIYNLPTSFLRTYDPSKKPWDSKKSLLINTNMTTDVNQYLTDFETGQINSENFAPTYQAD
DMRSLLYRNISKEFLQSNKLTSTNPDLSKAICSTTWGDYNDFGLNLLTKSTIEKYLRTTE
TAREHIDMLEKSRLFYWKYRETVGLNIKRADYFDSRGNLNLNDKLGKNIFTQSDYKRDFG
EGNPTITLANNYFRPALEQPLSVSFYDVLDSATGNEFNTRLKKPMYDLYNWIYAYFVENV
NQCFIQGVYSRSPQTVRLKMQQAFNQNNGNFNLTFGVIPFNPLTDDRGTMINAELNSIEF
KIYGINHTFKNQALTNKNNANLNEKLFTASNNIVLNETLAKRLNFTVGDQISPRLIRKAL
VASEQDATSDQILQAWDASDITGNNTQAQGRVGKLMFNGDNKYKNKVLKDGNNEYVLESK
IDALDPNFTKPSILNDKIVNRSYRVSNETKNESFTVVGITNQYGSPRAWINENRAQQLLG
YDKTRNYLLQLFLNEWTNSFIKNNDKLAPSKRKSLELLEKFIKEHSSTPVDKLWDEFVKY
WKAHQSAVNCIAVFENEYPIFNYKISNSSKIDDIETGLGTSQLFGDYSFYGLNAGIRSEI
SYPPYANSTFSSLMPIAEAQAILGNISKAVNGIIFFIIGISFVLSFMIIILTSNIVIAEN
QTIIATMKVLGYRNRYITKLVIGMYIPIIVIMTIAGFGFGWLFLIISNMILIRIGIVLPL
FMNIMIPIIAIGSGLLLYFIAYLISWFNMNRINPLIAIMNAD
NT seq
4089 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtggaaaaaatgacaggttttaagttattatttaaaaacaattttaaaaacacagttaaa
aataaaattcaatttattggtttagttgttttggtatttttaactagttttatttttaca
attattgcagtttctaaacaacgagtagaaaataattatagtagttttatttctgaacaa
ttaagtaatcaacatgattttgttgttagttttgctaattccacttatgttaaaaattca
aatagggaaccggatcagtttgaaaaaattacagatagtgggattcgtcaaaatgcaatt
ttagaatttgttaaagaacaattaaagaatagagatgaacattttatttataaccgtgtt
gaagcgcgaacatttacattggggaataataaagttattaaagcagtaacattaaatctt
catcaagaaattgataaatttattgtggctaatggaatgccattaagtgtttatacgaaa
tatttattatcaattaaccaagaaacaatgcattggatttatttaacccctgagtttgct
cgcaaaaataatattaaaattaatgatattattcgattacaacccgataggtatggaaca
acaattaaagttgctgatagtgaattaaaagatgttgatttaactccatatgaaaaagaa
gatattaataaatgattgccgaaatcaccatatgcaaatgaaaattggttccgagtagtt
ggatttggacaatcagcggattatgttacgccaattattgatgcagtacatccatttccg
aatatgaaaaatgaaggaattgcatatttagatccacgattgtttggattagttgaagat
acagctggtaataaatatccagtaacaaaattagatttaacaaaacaaattttaattcca
aaaagtcaattagagcgagaagtttattatgttggaaaatttcaacagacaaaagttgaa
caaatgcgaaataattatagtcaaacaatcaataattatttaaatactaatcagggcaaa
catattggtttacatggatattacgtcaaaacattgtcaactggtttaccaattgctact
tttcggacagataatcgttatgaatttgcgaaaagaattacatattttacatcaacatta
aatgcttttattagttgttcttatattttaattacgattttattaattatttcgttcttt
gtgttaattctagttgttcaccggcaaattgatgcaactggaccacaaaatggattatta
cgagcattgggatatcgacgccgtgtgttaacctttagttatatttcctatccattaatg
attgcattaattggtgggatagttggttatggaatggggattagtggccaatttactgtt
aaatatttatttggttcatattttaatttaccatatggaaattttgtatttgcaccatta
gcattagtaacttgtgttttatttattttcgctttgttaacttgtgtcacaatgattagt
ggaacaattataatggtttcaagaacaccattacaattaattcgtaaagaaaaaacagtt
tcatatggtcgttttaaaaaaattgtttataaaatgtttgcaattcgtaaaacatttgat
gcacgatttcaagcagtacaattatctaattcaattggaaaaatggttggggtatcttta
acgatgattattagtaccattatgattacgatgtcaacaacaattccaattatcttacag
aataatattcgttattcatatgaaggagataattataaaactttagttgaatataatagt
ccgatttataatttaccaacaagttttttacgaacatatgatccaagtaaaaagccatga
gatagtaaaaaaagtcttttgattaatacaaatatgacaacagatgttaatcaatatctt
actgactttgaaacagggcaaattaattccgaaaattttgctccgacatatcaagcagat
gatatgcgatcgttattatatcgtaatatttccaaagaatttttacaaagtaataaatta
acttcaactaatccggatttatcaaaagcaatttgtagcacaacatgaggtgactacaat
gattttggtttaaatcttttaacaaaatcaaccattgagaaatatttacgaacaacagaa
acagcacgggaacatattgatatgttagaaaaatctcgattattttattgaaaatatcgg
gaaactgttggattaaacattaaacgtgcagattattttgattcacgagggaatttaaat
ttaaatgataagttagggaaaaatatttttacccagagtgattataaacgagattttgga
gaaggaaatccaacgattacattagcaaataattattttcgtccagcattagagcaacca
ttgtctgtatctttttatgatgttttagattcagcaacaggaaatgaatttaatacacgt
ttaaaaaaaccaatgtatgatttatataattgaatttatgcttactttgtggaaaatgtt
aatcaatgttttattcaaggagtatattcacgttctccacaaactgtccgattaaaaatg
caacaagcatttaatcaaaacaatggtaattttaatttaacctttggagtaattccgttt
aatccattaacagatgatcgggggacaatgattaatgctgaattaaatagtattgagttt
aaaatttacggaattaatcacacatttaaaaatcaagcattaactaataaaaataatgcg
aatttaaatgaaaaattatttacagcaagtaataatattgttttaaatgaaacattagct
aaacgattaaattttacagttggagatcaaattagtccgcgactgattcgcaaagcgtta
gttgctagtgaacaagatgctacttcggatcaaattttacaagcttgagatgcaagcgat
ataacaggtaataatactcaagcacaagggcgagttggtaaattaatgtttaatggggat
aataaatataaaaataaggttttaaaagatggaaataatgaatatgttttagaaagtaaa
attgatgcacttgaccctaattttacaaaaccatcaattttaaacgataaaattgttaat
agaagttatcgggtaagtaatgaaacgaagaacgaatcctttaccgttgttggtattact
aatcaatatggttcaccacgagcttgaattaatgaaaatagggcacaacaattactagga
tatgataaaacccgaaattatttattacaattatttttaaacgaatgaacaaattcattt
attaaaaacaatgataaattagcaccatctaaacgaaaaagtttagaattattagaaaaa
tttattaaagagcattcaagtacacctgttgataagttatgggatgagtttgttaaatat
tgaaaagcacatcaaagtgcagttaattgtattgctgtatttgaaaatgaatatccaatt
tttaattataaaatttctaatagttccaaaattgatgatattgaaaccggattaggaaca
agtcagttatttggtgactatagtttttatggtttaaatgctggtattagaagtgaaatt
tcctatccaccatatgcaaatagtacttttagtagtttaatgccaattgctgaagctcaa
gcaattttaggaaatatttcaaaagccgttaatggtattattttctttattattggtatt
tcttttgtattaagttttatgattattattttaacaagcaatattgttattgcggaaaat
caaacaattattgcaacaatgaaagtattaggatatcgaaatcgttatattacaaaatta
gttattggaatgtatattcctattattgtaataatgacaattgccggctttggttttggg
tgattatttttaattatttctaacatgatattaattcgaattggaatagttttaccactg
tttatgaatattatgattccaattattgcaattggcagtggtttattattatactttatt
gcatatttaattagttgatttaatatgaatcggattaatccattgatcgcaattatgaat
gcggattaa
DBGET
integrated database retrieval system
