Spiroplasma citri: SCITRI_00702
Help
Entry
SCITRI_00702 CDS
T04628
Symbol
oppA
Name
(GenBank) oligopeptide ABC transporter substrate-binding protein
KO
K15580
oligopeptide transport system substrate-binding protein
Organism
sck
Spiroplasma citri
Pathway
sck02010
ABC transporters
sck02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sck00001
]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
SCITRI_00702 (oppA)
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
SCITRI_00702 (oppA)
09160 Human Diseases
09175 Drug resistance: antimicrobial
01501 beta-Lactam resistance
SCITRI_00702 (oppA)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
sck02000
]
SCITRI_00702 (oppA)
Transporters [BR:
sck02000
]
ABC transporters, prokaryotic type
Peptide and nickel transporters
Oligopeptide transporter
SCITRI_00702 (oppA)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SBP_bac_5
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
APE74598
LinkDB
All DBs
Position
618899..621073
Genome browser
AA seq
724 aa
AA seq
DB search
MFKKKLAFFASFTVITTVTPLVVSCEISLDQLANRLITDNVFRSIFKFPLTSWSSASTFL
GEDNKILADVLGTLVATDKYNRSFGDLAEQKDKTSKYVGIPNADQSEWKYKISPQAKWFD
YQGNFQRQVKASDMINTAKFVLFPKNSSATSGLWRTFISGAQEIWEYFQSGNYQPDYYND
PIWKKLGMTINDSDDEITIKLTKSAEYFDTLMTYLAFAPLPEKALRQGYNYGTNYKNIWY
SGAYLVEKYSSTSQILLRKNPAYRHAKLTYIDKLNYTYLANNDVSREHVLFESGDVNDFL
VEPTDSNGWKKYVGSNPANPIFSGASSIINPNPTTYTIINNYANSDVLNSNPTRAKQALN
ASKALQYDKIRKYLSTQLDRSKFVKYYSEALDDSPTSKFLRNVYTARYFVYNGNVDYASY
VEEAYANNFLNGNVMAASQLLKDGSDALYRNKDLLENDDNILDDIRNWLQTNIGSSRVEF
RFLMNGAWTLTINKFLLNMIDSFNAENDVIKIIPDITVDATEYLTRRKKADWDMQAGGWS
PDYADPYTYLHTFSLGGDLQYYFGTSRIFSDLKLTNNRAPDYATIKDQLNNPYWNLLKNT
TAIEDFYNVFKNYTNQVAASDEITDPTRLADRYRSFAEVEFNAIYTNFMFIPVYVPNGSY
QIRISYVTPRTQVTIGYGSSKYKHWGMVLNPYLLTTQERQIIEKRYQHQLAIIQTDYAAF
REDY
NT seq
2175 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttcaaaaagaaattggcgttttttgctagttttaccgtaataaccacagtaacacca
ttagtggtttcgtgtgaaattagtttagaccaattagcaaatcgtttaattaccgataat
gtttttcgctctatttttaaatttcccttaacatcttggtcaagtgcatcaacatttcta
ggtgaagataataaaattttagctgatgttcttggaacattagtagcaactgataaatat
aatcgtagttttggtgatcttgctgaacaaaaggataaaacatcaaaatatgttggaatt
cctaatgctgatcaaagtgaatgaaaatataaaatttcacctcaagcaaaatgatttgat
tatcaagggaattttcagcgacaagttaaagctagtgatatgattaatactgctaaattt
gttttatttccaaaaaactcatcggcaacatcaggattatggcgaacttttattagtggt
gcacaagaaatttgagagtattttcaatcaggtaattatcaaccagattattataatgat
ccaatttgaaaaaaattaggaatgacaattaatgatagtgatgatgaaattaccattaaa
ttaacaaagtcagcagaatattttgatactttaatgacttatttagcttttgcgccatta
ccagaaaaggcattacgacaaggttataattatgggactaattataaaaatatttggtat
tcaggggcatatttagttgaaaaatatagttcaacttcacaaattttattacgaaaaaac
cctgcttatcgacatgcaaaattaacatacattgataaattaaattatacttatttagca
aataacgatgtttcgcgtgaacatgttttatttgaatcaggtgacgtcaatgattttcta
gttgaaccaacagatagtaacggttgaaagaaatatgttggttctaatcctgctaatcca
attttcagtggtgcatcaagtattattaatcctaatccaacaacatatacgattattaat
aattatgcgaatagtgatgttttaaattcaaatccaactcgtgctaaacaagcattaaat
gcaagtaaggcattacaatatgataaaattcgaaaatatttatcaacccaattagaccgt
agtaaatttgttaaatattattctgaagctctagatgattcaccaacttccaagttttta
cgaaatgtttatacagcacgttattttgtttataatgggaatgttgattatgcgtcatat
gttgaagaagcatatgcaaataattttttaaatggtaatgtgatggctgctagtcaattg
ttaaaagatggtagtgatgctttatatcgtaacaaagatttattagaaaatgatgataat
attttagatgatattcgtaattgattacaaacaaatattggttcttcacgagttgaattt
cgttttttaatgaatggtgcatgaacattaacaattaataagtttttattaaatatgatt
gactcatttaacgctgaaaatgatgtgattaaaattattccagatattactgttgatgcc
acagaatatttaacacgtcgtaaaaaagcagattgagatatgcaagcaggaggatggtcc
cctgattatgcagacccgtatacttatttacataccttttccttaggtggtgatttacaa
tattattttggaacttcacggatttttagtgacttaaaattaacaaataatcgtgctcca
gattatgcaacaattaaggatcaattgaataatccatattgaaatcttttaaaaaataca
acagcaattgaagatttttataatgtttttaaaaattatactaaccaagtagcagcaagt
gatgaaattactgatccaactcgtttagctgatcgttatcgaagttttgctgaagttgaa
tttaatgccatttatactaattttatgtttattccagtttatgttccaaatggttcatat
caaattcgaatttcatatgtaacaccacgaacacaagttacaattggatatggtagttca
aaatataaacattgaggaatggttttaaatccttatttactaactacgcaagaacgtcaa
attattgaaaaacgttaccaacatcaattagcaattattcaaactgattatgccgccttt
agggaggattattaa
DBGET
integrated database retrieval system