Spiroplasma citri: SCITRI_00785
Help
Entry
SCITRI_00785 CDS
T04628
Symbol
secDF
Name
(GenBank) bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF
KO
K12257
SecD/SecF fusion protein
Organism
sck
Spiroplasma citri
Pathway
sck02024
Quorum sensing
sck03060
Protein export
sck03070
Bacterial secretion system
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sck00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03060 Protein export
SCITRI_00785 (secDF)
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
03070 Bacterial secretion system
SCITRI_00785 (secDF)
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
SCITRI_00785 (secDF)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02044 Secretion system [BR:
sck02044
]
SCITRI_00785 (secDF)
Secretion system [BR:
sck02044
]
Sec (secretion) system
Prokaryotic Sec-SRP core components
SCITRI_00785 (secDF)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SecD_SecF_C
MMPL
HMG_box
Ccdc124
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
APE74678
UniProt:
Q14MF7
LinkDB
All DBs
Position
688330..691506
Genome browser
AA seq
1058 aa
AA seq
DB search
MGKKEQVKIIKEPKNKKAISRLIIRIGTLIVLIIAMIVGAFFSADSFRYSYRTGIVYSGG
YQAQIDVFDKRDPNYSPDTPNGDSKKGLELLRNKLDPLSNQNLYLQTLGRNSVDVIVGKD
MFKSYSELSKTIQRLGALYLTDSKGKDLLISDNNGTKERTPLSDVISGSVTGVDQARRPI
ITLEIKNQQKWDSIINSLKPSEGGRQAQPLYIWTDIGQMIDDLRHDTDNLQAIATLFSVD
IRSKVSSTDWTNIYHIFDMEYYDNGTAQIQPGNLLDLALRYPISQVKEWMEDSRFRFTTL
PTNRLLIDPNDKAATTNAYIDPLRPYLQTIIEYNSALTEAYKKYVINWNSIKIGTGAVEN
SNQITTSTETEARQISNLINGGLSGLEFTIRGYREIPPVVSANVFKISMIILGVLVLAIF
IVLLVYYRLFGLIAILTLLFTIISTLYFSSLLKVEISPESIAALIIAFGLSLEGNLLFFS
RYKRERYENNIPFEPAMKIANKQTIAVFVDALVVLIILGLSLFWTGTNNIKSFATILLVG
LIIAIIMVFAVARLMYWIVIKLHWQEKYHWLDVSRFSLWTWLVKKQSRTLAMDVKKVDSS
ATDPPPKTELNVTANGETELAASTQAENKKPKQIKHGKWTFYNITKWTPIVGIILLIIAL
AIGFAGKANIANSIKPGINITINEDLWGTDGSKQVPDEVAIAKLKNQIEEYQQITHHNFS
FNIYVIKRQDSGNSNRILVVSTNITKGTFERDLLSSIASFYGASPSDASLSLQQTDPVME
GYILKIAAISLAIALACIFVYTLFRLDWGQFVGMVLAAIFTLVVTIAIAIITQLLITFEM
SIAFLTIFGFAIAFETMVMVRAKQNKKTINIREYETFFAYMSEHRAQIKRLRRAHKVYYQ
EELKKLAIKNPDLKLKALKKQYREQLHRVQLAAKDIKSKNHKIIREIRKEFRVYNYEHNF
LQKVANVTIKQMLQHCLTLGIMFTILLITLAAFSGTWFGFNVVILIGLIIGMFVTLFVAI
PIWVALEKYRALNKIRVKNYLDSQRVEVDEQVVVGIND
NT seq
3177 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgggaaagaaagaacaagttaaaataattaaagagccaaaaaataaaaaagcaataagt
cggttaattattcgaataggaacattaattgttttgattattgctatgattgttggtgcg
tttttttccgcggatagttttcgttattcatatcgaacaggaattgtttattcaggagga
taccaagctcaaattgatgtttttgacaaaagagaccctaattattcacctgatacccca
aatggagatagcaaaaaaggtttagaattattacgaaataaattagatcctttatcaaac
caaaatttatatttacaaacattagggcgtaattcggttgatgtaattgttggaaaagat
atgtttaaatcttatagtgaattaagtaaaacaattcaacgattaggagcactttactta
actgatagtaagggaaaagatttattaattagtgataataatggcacaaaagaacgaaca
ccattaagcgatgttatttctggttcagtaacaggagttgaccaagcacgtcgaccaatt
attacattagaaattaaaaatcaacaaaagtgagatagcattattaatagtctaaagcca
tcagaaggtggaaggcaagcacaaccactatatatttgaactgatattggtcaaatgatt
gatgatttacgacatgatactgataatctgcaagcaattgcaactttgtttagtgttgat
attcgtagtaaagtttcttcaactgattgaacaaatatttatcatatttttgatatggaa
tattatgacaatggtacagcacaaattcaacctgggaatttgttagacttagcattaagg
tatccaatttcgcaagttaaagaatgaatggaagatagtcgttttcggtttacaacattg
ccgacaaatcgcttattaattgatccaaacgataaagctgcaacaacaaatgcgtatatt
gatccattacgaccatatttacaaacaattattgaatataatagtgctttgacagaagca
tataaaaaatatgttattaattgaaattcaattaaaattggaactggtgctgtcgaaaat
tcaaatcaaattacaacatcaacagagactgaagctcgtcaaattagtaacttgattaat
gggggattaagtggtttagaatttactattcgtggttatcgtgaaatcccacctgttgtt
tcagcaaatgtgtttaaaatctcaatgattattttaggtgttctagttttagccattttt
attgtattattagtttattatcgtttatttggtttaattgccatattaaccttattgttt
acaattatttcaaccttgtatttttcatctttattaaaggttgaaatttcaccagaaagt
attgcagcattaattattgcttttggattatcgttagaaggaaacttgcttttcttttca
cggtacaaacgtgagcggtatgaaaataatatcccatttgagccagcaatgaagattgcc
aataaacaaacaattgctgtttttgtggatgctttagttgttttaatcatattagggtta
tcactattttgaacaggaactaataatattaaatcatttgccacaattttattagttggt
ttaattattgcaattattatggtttttgccgtagcgcggttaatgtattgaattgtcatt
aagttacattgacaagaaaaatatcattgattagatgtttcacgattttcattatgaact
tgattggttaaaaaacaatcaagaaccctagctatggatgttaagaaggtggattcttca
gcgactgatcctccacctaagaccgaattaaacgttactgctaatggtgaaacagaatta
gctgcttcaacccaagcagaaaataaaaaacctaaacaaataaaacatggaaaatgaacc
ttttataatattacaaaatgaaccccaattgtaggaataattttattaataattgcttta
gcaatcggttttgctggaaaagcaaatattgctaattcaattaaaccgggaattaatatt
acaattaatgaagatttatgaggaacagatgggtctaagcaagttccagatgaagttgca
attgccaagttaaaaaatcaaattgaagagtatcaacaaataacacatcataattttagt
ttcaatatttatgttattaaacgacaagatagtggaaacagtaatcgtattttagttgtt
agtacgaatattaccaagggaacttttgaacgtgatttgttatcaagcattgcttcattc
tatggtgctagccctagtgatgcatcattatcattacaacaaactgacccagttatggaa
ggctatatcttaaaaattgcggccattagccttgcaattgctttagcatgtatttttgtt
tatacattattccgattagattgaggacagtttgttggaatggtgttagctgcgatcttt
acgttggttgttactattgctattgcaattattacgcagttgttaattacctttgaaatg
tcaattgctttcttaacaatttttggttttgcaattgcctttgaaacaatggtgatggtg
cgagcaaaacaaaataaaaaaacaattaatatccgtgagtatgaaacattctttgcctat
atgtcagaacatcgtgctcaaattaaacgtttacgtcgtgcacataaggtttattatcaa
gaggaattaaaaaaattagcaataaaaaatccagatttaaaattaaaagcgctgaaaaaa
caataccgggaacaattacatcgggtacaattagcagcaaaagatattaaaagtaaaaat
cataaaataattcgagaaattcgaaaagagtttcgagtttataattatgaacataacttt
ttacaaaaagttgctaatgttacgattaaacaaatgttacaacattgtttaacattagga
attatgtttacaattttattaattactttggcagctttttcaggaacatgatttggcttt
aatgttgttattttaattggtttaattattggtatgtttgtgacattatttgttgcaatc
ccaatttgagtagcattagaaaaatatcgtgccttaaataaaatccgtgttaaaaattac
ttagattcacaacgtgttgaagttgacgaacaagttgttgttgggattaatgattaa
DBGET
integrated database retrieval system