Spiroplasma clarkii: SCLARK_00739
Help
Entry
SCLARK_00739 CDS
T05330
Name
(GenBank) ABC transporter ATP-binding protein/permease
KO
K06147
ATP-binding cassette, subfamily B, bacterial
Organism
scla
Spiroplasma clarkii
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
scla00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
scla02000
]
SCLARK_00739
Transporters [BR:
scla02000
]
ABC transporters, eukaryotic type
ABCB (MDR/TAP) subfamily
ABCB-BAC subgroup
SCLARK_00739
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_tran
ABC_membrane
SMC_N
AAA_7
AAA_22
Zeta_toxin
RsgA_GTPase
AAA_23
AAA_15
AAA_29
DUF87
AAA
AAA_5
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ARU91386
LinkDB
All DBs
Position
607170..608660
Genome browser
AA seq
496 aa
AA seq
DB search
MNKKNWDFLRVKCLDNLVDVDLSFYSKNQIGNIMTKIVGDSQGVADSLNEFSINFIYILI
MFTTVNIVTFSIDPLIAGICLGIFFGLLIISWIVFLAYQKALITSIDFKQQMDTNNTDKL
MNIRLIKSSGTELQEIENVKDANKQYQKKISCTIRIRITMQLFSNFLSWILPGITTILVI
VLYKDQTPQFISSRAIAFISTMSIMAGAVFLLPIILRALSACLNCNTRLTFIYTQKSIIK
FLEKPTKITGIKTITFADLEFIYPESPTKQVLPKTNLVFENGKSYAFVGETGSGKSTIAK
LLLRFYDPSQGSVRVNDIDLKEIDLPNYLQYVGYVEQEPQILYGTVIDNIRYGNFEATDE
EVIAAAEKAQIHNFVLTLADKYDTILGERGFMLSGGQKQRLVIARMFLKNPQLLILDEAT
SALDNIVEKEVQAQLDQLVIGRTTIVIAHRLSTIKNCDQIIVLGPNAQGIIQTGTFNELK
DQPGHFKKLYDAGLMG
NT seq
1491 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaacaagaaaaattgagattttttaagagttaaatgtttagataaccttgtggatgtt
gacttaagtttttattcaaaaaaccaaattggtaatattatgaccaaaattgttggggat
tcacaaggagttgcagacagtttaaatgaattttcaatcaactttatttacattttgatt
atgtttaccacagtaaacattgtaactttttcaattgatcctttaattgcaggtatttgt
ttaggaatcttttttggattattaatcatttcttgaattgtttttttagcttatcaaaag
gctttaatcacttcaattgattttaaacaacaaatggatactaataatactgataaattg
atgaatattcgtttaatcaaatcatcaggaactgaattacaagaaattgaaaatgttaaa
gatgcaaacaaacaatatcagaaaaaaattagttgcacaattagaattagaattactatg
caactattttcaaactttttgagttgaattttaccaggaattactacaattttagtaatt
gttttgtacaaagatcaaactccccaatttatttcatcacgagcaattgcctttatttca
acaatgtcaatcatggctggagcggtttttttactaccaattattttaagagctttatct
gcttgtttaaactgtaatactcgtttgacattcatctatactcaaaaatcaattattaaa
tttttagaaaaaccaaccaaaattacagggattaaaacaattacctttgcagatcttgag
tttatttaccctgaatcaccaactaaacaagtgttaccaaaaactaacttagtttttgaa
aatgggaaaagctatgcttttgttggtgaaactggtagcggtaaatcaacaattgctaag
ttattgttgaggttttatgatccaagtcaaggtagtgttagagttaatgacattgattta
aaagaaattgatttaccaaattacttacaatatgtgggttatgttgaacaagagccccaa
attttatatggcacagtgattgataatattcgttatggtaattttgaagcaactgatgaa
gaggtaattgcagcagcagaaaaagcccaaattcacaattttgttttaacattagcagat
aaatatgacacaattttgggagaaagaggttttatgttaagtggggggcaaaaacaaaga
cttgtaattgcccgaatgtttttaaaaaatccccaattattgatcttagatgaagctaca
agtgctctagacaacattgttgagaaggaagtacaagcccaattagatcaattagtgatt
gggagaaccacaattgtgattgcacaccgattaagtaccatcaaaaattgtgatcaaatc
attgttttgggcccaaatgcccaaggaattattcaaactgggacttttaatgaactaaaa
gatcaaccaggacactttaaaaaactgtatgatgcaggattaatgggatag
DBGET
integrated database retrieval system
