Styela clava (leathery sea squirt): 120345481
Help
Entry
120345481 CDS
T07291
Name
(RefSeq) glycine-rich cell wall structural protein 1.8-like isoform X1
KO
K13098
RNA-binding protein FUS
Organism
sclv
Styela clava (leathery sea squirt)
Pathway
sclv03015
mRNA surveillance pathway
sclv03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sclv00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
120345481
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
120345481
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
sclv03041
]
120345481
Spliceosome [BR:
sclv03041
]
Complex A
Other components
Complex A specific factors
120345481
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
120345481
NCBI-ProteinID:
XP_039270877
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
571 aa
AA seq
DB search
MASSNSQYGSSGGYGQPSYGASGGQGYGQSNYSQSGGGTQGYGQQGYGSAGGQQSGGAGG
VTSAQGYGSSYQQQGGYGSYGSNNQSGGQGYGQQPTGAAPAAAAASASGSSSYGGQKNNS
GYQQGGASGQQSGQQQGGGYGGQQQQSGYSGQQGGYGGPQQGGYGGQQQGGYGGQQQGGY
GGGHRGGQQQSQQSYGSGGNSGGSGSYGQSGGGSRNQSYGQRDSGSGGGSQSYGQQGGGG
GGGYRNDQSGGGNYGGDQGPNNYNQSQQGPMGQYGNKNQGYQDRGYGSGGGGGRGYDSRG
GGRGSRFDQGGGRDGGGRGRGGGDRDRDSSGYGGRGGSRSSDYGNESRGRGGGGGQSDYK
PRGGGAGGGYQPRSEEAGPESDTVFVSGLPDGADKMKIAEYFGQIGIVKKDRRTGEPKIY
VYMDKETGAPKGECTVTYDDPPSAKAAINWFNGKDWLGGTLSVSFAQQRQGGFGAGRGFG
GGGGGGGGGRGRGGGGFRGRGGDRRGGFGDRGGGGRYGGGDRYGDRGGRGDSGYGGGRGG
GYGDRGGRGRGGDRGGGKWRGPPRGGRSDPY
NT seq
1716 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcgtcttctaattctcaatatggatcctccggtggatatggacagccatcttatggt
gcatctggtggacagggatatggacaatctaattactctcaaagcgggggtggcactcaa
ggttatggtcagcagggctatggatcagctggtgggcaacaaagcggaggcgcaggcgga
gtgactagtgcccaaggatatggttcaagctatcagcaacagggtggttatggcagctat
ggatcgaacaaccaatctggaggccagggttatggacaacagccgactggagctgcacct
gctgctgctgctgcttctgctagtggtagtagtagttatggtggtcagaaaaacaatagc
ggctaccaacaaggtggagccagtggacagcaatctggacaacagcaaggtggtggatat
ggtggtcagcaacaacagagtggttacagtggacagcaaggtggttatggtggaccacaa
caaggtggttatggtggtcagcagcaaggtggctatggtggacagcagcaaggaggatat
gggggaggccatcgtggtggacaacagcagtctcagcaatcgtatggatctggtggaaat
tcaggtggcagtgggagctacggccagtctggcggaggtagcagaaatcaatcatatggc
caacgggacagtggctctgggggaggttcacagtcttatggtcagcaaggtggtggggga
ggaggcggctacagaaatgatcagtctggtggtggaaactacggtggagaccagggtccc
aataactataatcaaagtcaacaggggcccatggggcaatatggaaataagaaccagggt
tatcaagatagagggtatggttctggtggcggaggtggtagaggatatgacagtaggggg
ggtggacgaggaagcagatttgatcaaggtggtggaagagatggtggtggtcgtggtaga
ggtggtggtgatcgtgacagagatagcagtggatatggtggtcgaggtggctcgcgttct
tcagattatggaaatgaatcacgtggacgaggaggtggcggcggacaaagtgactacaaa
cctcgtggtggaggtgccggaggtggatatcaaccaagatcggaggaagctggtcctgaa
agtgacacagtttttgtatctggccttccagatggtgctgacaagatgaagattgcagaa
tattttggccaaattggcatcgtaaagaaagacagacggactggagagcccaaaatctat
gtttatatggacaaagaaacaggagctccgaagggtgaatgtactgtcacatatgatgat
ccaccatcagccaaggcagccataaactggttcaatggcaaagactggttgggtggcact
ctcagtgttagcttcgcacaacaaagacaaggtggatttggtgccggaagaggtttcgga
ggtggaggtggaggcggaggcggaggaagaggcagaggaggtggtggcttcagaggtcga
ggtggagacagaagagggggttttggagatcgaggaggaggtgggcgatatggaggcgga
gacagatatggggatagaggtggaagaggcgacagtggctatggaggtggacgaggtggt
gggtacggtgacagaggtggaagaggacgaggtggtgataggggcggtggaaaatggaga
ggaccaccacgagggggaagatcagacccatattga
DBGET
integrated database retrieval system
