Styela clava (leathery sea squirt): 120348523
Help
Entry
120348523 CDS
T07291
Name
(RefSeq) fibrillin-2-like isoform X1
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
sclv
Styela clava (leathery sea squirt)
Pathway
sclv04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sclv00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
120348523
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
sclv00536
]
120348523
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
sclv00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
120348523
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
EGF
hEGF
TB
FXa_inhibition
EGF_3
Plasmod_Pvs28
EGF_PEAR1L
EGF_2
Cadherin
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
120348523
NCBI-ProteinID:
XP_039274602
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2889 aa
AA seq
DB search
MRGLLVLTFTCLFVGAIGQMRSRRLHVPQHWRNYGFGRPQNLVRPRRNGNIMVGPHVCKE
NGQSFCCPGWTTLVGSNKCIQAVCDPNQCGDGVCIQPKKCICQNGAIATSCGAEPRYRTG
QRCGLRCMNGGECVNNECACSGAFTGAHCSQPICGPGCQNGGRCISPNKCLCTYGFTGNR
CQTDYRVGPCFLTRANDTCMDQIEGVTCNKKICCATIGQGWGIPCEECPARAGNCSRGRM
PPHCEDINECQMIPGLCKDGECVNTDGSFRCECADGYVYNNKLHKCEDIDECLEGYCENG
ECSNTVGGFMCKCPPDYLLSSDQTYCISDKPGFCYTSIESGLCATPLPQLTRRTECCCST
VGEHEQETLGKCFAVPNSNPERCPTLGTPEFDRDCQTDTMLGIYDRPAPLVGAGLLSSLM
GHPCASNLDACGKGVCVEVLSISSGWKCQCDEGYIQDKNTKTCVDKNECGDGMSERDICG
LYGTCVNSIGSYSCHCDPGFANGEDMISCIDIDECAEAPEGLCENGRCVNNRGSFICSCD
EGYRQTATRQACEDYDECVEDNDLCEFGRCVNIIGAFRCVCNPGFVESADKRSCKDENEC
EATGMCEHGSCINRNGGFECMCDNGFEITHDGKHCVDIDECKQKPCINGECENLIGDFRC
HCHRFQQLDESGRRCLLESRVANCFRNVRNGQCNAENALTALTTRAECCCAVPGGMSAWD
DCEPCPERGSENHGVLCSGVTINNICAMHASPCDNGACINMEGNNYRCECHPGFLPTADQ
KACVDIDECSESMQCSNGQCRNTPGSFVCTCDPGFVLKGDVCEDIPECESNPCINGECVD
LPGSFECRCEEGSMLDINGLACYNVQMQQCWKSYENNTCSDNFRVLTAEACCNSIGVAWG
NKNCIPCTEIELRCQKGYMYNVATDECDDIPECSYGACDPLAECIETEGSFQCICPEHLT
LDSTRTVCLDIRVGTCFWDFEESTNECSNPTFGAVMRKSDCCCTVGQGWRHDSNACEGCP
VEGTAEFDKLCPLGKTGGTDGKLGPTVNECIRFPDLCNNGICENTVDSFICRCNIGFTLD
ETGRMCNDIDECDISIELCGEGECVNTDGSFNCICKEGYTLSSTGDFCEDDNECIAGGKC
TGGDCLNTDGSYECRCPQGRALSPDGTRCVDVDECLVMKDLCKPYGECVNMLGFFVCVCD
PGFETTEDKTICVDKDECAIENGGCSTICVNTIGSYECRCEEGFTLTFDGHTCADVDECM
DQPSRCDGGRCENIEGSFQCVCFDGFMATMDFQYCEDMDECAMNPNICMNGKCHNTRGSY
TCNCDQGYCVPQGQMICVDEDECELGKHTCDVNADCSNTDGGFECSCIDGFSGDGFDCID
EDECTNGNNTCDENAECDNTHGSYACNCDDGFHGDGFSCSDKDDCLADENLCGPHGTCLN
IQGSFECECPMGFMTTADKKACKDIDECAIEHICVNGRCHNVPGTFRCECLKGFEKDEQG
ANCTDIDECDDVANCINGECVNSIGTYECQCPEGFTPNPGGVGCVDTRTGDCFLRVEGDE
NAPICSRAIGVDVVRATCCCSYYAQAWGNPCEICPERNTSEYQTLCPGGDGFKPNPITVF
LEDIDECMELPGLCQGGKCVNVFGSFICECPEGYKLNEESRVCEDVDECTEAEAVCGPGT
CVNSVGGYSCLCPDGYKPINRGRICEDEREAFCYRYYNESSFQCTEQLPFNVTKKLCCCT
GQIGQGWNNPCEVCPIPGDGTAFKELCGVDIYEPGELICKKVPDLCLNGICVDTDTGYQC
ECPMGFRYNEAMLMCEDIDECAADENICRINAQCVNLQGSYRCSCKDGYTDRNGECVDVD
ECIEQEACSNGQCENREGGFLCICNQGFKSINDEQACEDVDECDFDPCGFGNCQNMVGSY
ICTCYNGFTLSDNGDCVDTDECVELSVCRNGLCINEDGSYSCMCDDGYKVARDGRSCIDA
NECMEDAAVCGEGSCQNMDGSFKCFCPDGYSSPDGKSCIDDDECELLDMCTNGDCVNTPG
SFTCVCPPNFALSTNKKLCIDQTKGQCYSSYDLGVCSNEMPTAVTRGSCCCTCTDSAWGE
SAGECEACPAEGTQEFENLCPEGCGFTPNGDDINECVTNNPCVNGICRNLAGGFKCECRT
GFKLDETNFVCVDEDECVERGNPCGPGTCSNRVGGFHCECEDGYYNGPMMKCLDINECLE
QTHGCKFRCVNTDGSYVCTCPDGYKLNDDERSCSDIDECSDDDLNRCEEKGMLCKNAVGS
FECLCQPGYKKVGVADQCENIDECLTLGVCAGGECIDLEGSYQCRCGEGYIYDEQGRRCI
DNREGLCYAAVHQRTCELTATTGFSVSKTSCCCNNGAGWGPDCDICPLPSSKEFVKLCPH
GPGFDERGEDIDDCIVFPGLCANGTCTNLLGSYKCICDRGFMPTENMQACIDIDECAMPN
GCAGGSRCRNTFGGYKCECPAGYQITNTMRCVDVDECTRKDHQCQFICINTIGSYHCGCP
HGFAMHNNQSCVDQDECKMDPDICGENADCENDVGGYHCVCAPGFEKTPNGDGCIGLPCD
SRPGICGPQMCMNVGESIRCVPGCNPNTRLRFHNMRCYDINDCRANPCKFGGRCVPNAEG
QYRCTGGGCGRGFAMMGGYGRGCGDINECRFQNNPCSYQCQNSYGGFKCGCPRGYFGLGG
SQCMNGMGGFQQPPVYPQQYGQLPFMGGRGAPMGRCYDCGPVGPHRQRRSTESAQMEMIS
GDDENRPPVNTSVPIIMHLSLQNLNPRQRLIQLIPAIRTLKDHTLYKIIGGNEGRMFRIH
KQDSFHFIHLNRGFEREEGKIEPGQYKIKVEAKPTIDKKTAKKASLDNPQIEKAMENTVK
FEVLFDIEK
NT seq
8670 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcggggactattagtattaacgttcacctgcctgtttgtgggcgcgatcgggcagatg
cgtagcagaagacttcatgtgcctcaacactggagaaactatggattcggcagaccccag
aacctcgttagaccaagaagaaacggaaatataatggtcggaccccacgtttgtaaagaa
aatggtcaaagtttctgttgccccggatggacgacgttagtaggatcgaacaaatgtatt
caagctgtttgtgatcccaatcaatgcggggacggtgtgtgcattcagcctaaaaaatgt
atctgtcaaaatggtgcaattgcgacatcttgtggagcagaacccagatacagaactggt
cagagatgcggacttcgttgcatgaacggtggagaatgcgtcaacaacgaatgtgcttgc
agtggcgctttcactggtgcccactgctcccagcccatctgtggaccaggatgccagaat
ggcggaagatgcatcagcccgaacaaatgtctctgcacatatggattcactggaaacaga
tgccagacagactaccgagttggaccatgcttcctcactcgtgcaaatgatacatgcatg
gaccagatcgagggcgtgacttgcaacaaaaagatctgctgcgccaccattggtcaagga
tggggaatcccctgtgaagaatgccccgcaagagctggaaactgctcacgtggaagaatg
cctccacattgtgaagatatcaacgaatgccagatgatcccaggactctgcaaggacggc
gaatgcgtcaacactgatggatcgttcagatgtgaatgtgccgatggttacgtttacaat
aacaaacttcataagtgcgaagatatcgatgaatgtcttgaaggatactgcgagaatggc
gaatgctcaaacacagtcggaggcttcatgtgcaaatgtccgcctgattatttattgtca
tctgaccaaacatactgtatatccgacaaaccaggattctgctacacttcaattgagagt
ggcttgtgcgcaacacctcttccacagctcaccagaagaactgaatgctgctgttctact
gttggagagcatgaacaagaaaccctcggaaaatgcttcgcagttccaaacagcaatcca
gaacgttgcccaactctcggaacgcctgaatttgaccgagactgccaaactgataccatg
cttggtatttatgaccgaccggcaccgcttgttggcgcggggttactgagtagtctcatg
ggtcacccatgcgcctcaaatctcgacgcgtgtggaaagggtgtttgtgttgaagtactt
tcgatctctagtggctggaaatgtcaatgtgatgaaggctacatccaagataagaacacg
aaaacctgtgttgataagaatgaatgtggtgacggaatgagtgaacgagatatctgtggc
ttatatggaacttgcgttaactctatcggaagttacagctgccattgtgatcccgggttt
gcaaacggagaagacatgataagttgcattgatattgacgaatgcgcagaggcccctgaa
ggtctctgtgagaacgggagatgcgtgaacaaccgcggaagcttcatctgcagctgtgat
gaaggctacagacaaactgccacacgtcaggcatgcgaagactacgacgaatgcgttgaa
gataacgatctatgtgaatttggaagatgcgtcaacattattggtgcattcagatgtgtg
tgcaacccaggattcgttgaatctgctgataagagaagctgcaaagatgagaacgaatgt
gaggcgacaggaatgtgtgaacatggatcttgtatcaacaggaatggtggattcgagtgt
atgtgtgataatggctttgaaatcacacacgacggtaaacactgcgtagacatcgacgaa
tgcaagcagaaaccctgcatcaacggagaatgcgagaatttgatcggtgacttcagatgc
cactgccatagattccaacaactggacgaatcaggcagacgctgtttacttgagtctcga
gtcgccaactgcttccgaaatgtaaggaatggacaatgtaatgcagaaaatgcactgaca
gcattgacaacgagagctgagtgctgttgtgcggtgccaggaggaatgagcgcctgggat
gattgcgaaccttgtccggagagaggatctgaaaaccacggagttctctgcagtggtgtc
accatcaacaatatatgtgcaatgcacgcttcaccttgtgacaacggagcctgtattaac
atggaaggaaacaactacagatgcgaatgccatcctgggtttttaccgacagctgatcag
aaagcctgcgttgacattgatgaatgcagcgaatccatgcaatgtagtaacggacaatgc
aggaatacaccaggatcatttgtctgtacttgcgatcccggtttcgttcttaaaggagac
gtttgcgaagacattcctgaatgtgaatccaacccttgcatcaacggagagtgtgttgat
cttcctggaagctttgaatgtcgatgcgaagaaggaagcatgcttgacataaatggactg
gcttgctacaacgttcaaatgcaacaatgctggaaatcatatgaaaacaatacttgctca
gataacttcagagttttgactgctgaggcttgctgtaactccattggggttgcttggggc
aacaagaattgcatcccatgtactgagattgaactccgttgccagaaaggatacatgtac
aacgttgctaccgatgaatgtgatgacatcccagaatgttcttacggggcctgcgatcca
cttgctgaatgtattgaaacagagggctccttccaatgcatctgcccagaacatctcaca
ttggattcaacaagaactgtttgtctagatattcgtgttggaacttgcttctgggatttc
gaagagagcacaaacgaatgtagcaatccaactttcggtgccgttatgcgaaagtctgat
tgttgctgcaccgtgggacaaggctggcgtcatgactccaatgcatgtgaaggatgcccg
gtagaaggaactgcagaattcgataaactttgcccgcttggcaaaaccggaggcacagac
ggaaaactcggacctacagttaatgaatgtattcgattccctgatctttgcaacaatggt
atctgtgagaacacagtggatagcttcatatgcagatgcaacattggttttaccttggat
gagacaggcaggatgtgcaatgatattgatgaatgtgatatcagcatcgaactttgcggt
gagggcgaatgcgtcaacacagacggaagcttcaactgcatctgtaaagaaggatacact
cttagttcaactggagacttctgtgaagatgacaacgaatgtattgctggaggtaaatgc
acaggaggagattgcctgaacacagatggttcatacgaatgcagatgtcctcaaggaaga
gcattgagcccagacggaacaagatgcgtcgatgttgacgaatgcttggtcatgaaagat
ctatgcaaaccatatggagaatgcgtcaacatgctcggtttctttgtctgtgtatgcgat
cctggattcgaaactactgaagataaaacaatttgcgttgacaaagatgaatgcgccatc
gaaaacggtggatgctctaccatctgtgtcaacactattggatcatatgaatgccgatgc
gaagaaggattcaccttgacttttgacggacacacttgcgctgatgttgatgaatgtatg
gaccaaccaagccgatgcgacggaggaagatgtgaaaacatcgaaggaagtttccaatgt
gtttgctttgatggattcatggctacgatggacttccaatattgcgaagatatggatgaa
tgtgcaatgaatcccaacatatgcatgaatggtaaatgccacaacacaagaggttcctac
acctgcaattgcgatcaaggatattgtgtaccacaaggacaaatgatctgtgtcgacgag
gatgaatgcgaattgggaaaacatacctgcgatgttaacgcagactgttcaaatactgat
ggcgggtttgaatgctcctgcattgatggattctccggtgatggatttgattgcatcgac
gaagatgaatgtactaatggcaacaatacttgtgatgagaatgcggagtgtgataatact
catggatcatatgcttgcaactgtgatgatggattccacggagacggcttctcttgctct
gacaaggatgattgtttagccgatgaaaacttgtgcggaccccatggtacctgcttaaac
attcaaggaagcttcgagtgtgaatgcccaatgggattcatgacaaccgctgacaagaaa
gcatgcaaagacattgatgaatgcgcaatcgaacacatctgcgtcaacggccgatgtcac
aacgttccaggaacattcagatgtgaatgcctcaaaggtttcgagaaagacgaacaagga
gcaaactgcactgatattgacgaatgtgatgacgttgccaattgtatcaacggtgaatgt
gtcaactcaatcggaacctatgaatgtcaatgtccagaaggattcacccccaaccctggc
ggtgtcggatgtgttgataccagaactggcgactgtttcctgagagtggaaggcgatgaa
aacgctcccatctgttctcgtgctattggagttgatgttgtccgtgcgacatgctgttgt
tcttactacgcacaagcctggggaaatccatgtgaaatctgtcctgagagaaatacttcc
gagtatcaaacactctgtccaggaggagacggattcaaaccaaacccgatcacagtattc
ttggaagacattgatgaatgtatggagcttccaggtttatgtcaaggcggaaaatgcgtc
aacgtttttggatcttttatctgcgaatgtccagagggctacaaactcaacgaagagagc
agagtttgcgaagatgttgatgaatgcacggaggcagaagctgtctgcggaccaggaact
tgtgtcaactctgttggcggatacagttgcttatgtcctgatggatacaaaccaatcaat
agaggaagaatctgtgaagacgaaagagaagcattctgctacagatattacaacgaatct
tcattccaatgtaccgaacaactcccattcaatgtgacaaagaaattgtgttgttgcacc
ggacagatcggacaaggatggaataatccatgcgaggtttgccccattcccggagatggc
actgccttcaaagagctgtgtggcgttgatatctacgaacctggtgaacttatctgcaag
aaagttccagatctctgcttgaatggaatctgtgtcgacaccgataccggataccagtgt
gaatgtccgatgggattcagatacaacgaagcaatgctcatgtgtgaagatattgacgaa
tgtgctgctgatgaaaacatctgcagaatcaatgcacaatgtgtcaacctgcaagggtca
tacaggtgcagctgtaaagatggttacactgacaggaatggagaatgtgtcgatgttgat
gaatgtatcgagcaagaagcctgttccaacggtcaatgcgagaacagggaaggcggattc
ctttgcatttgcaaccaaggtttcaagagcatcaacgatgaacaagcatgcgaggatgtc
gacgagtgtgactttgatccatgtggtttcggaaattgtcagaatatggttggaagttac
atctgtacatgctataacggtttcaccctgagtgacaacggagactgtgttgatactgat
gaatgtgttgaactatctgtctgtcgtaacggactttgcatcaacgaagatggttcgtac
tcgtgcatgtgcgatgatggttacaaggtagcccgcgacggaagatcgtgtatcgatgct
aacgaatgcatggaggatgcggctgtatgcggtgaaggctcctgccaaaatatggacggt
tccttcaaatgtttctgtccagatggatactctagccctgatggaaaatcttgcattgat
gacgatgaatgtgaattgttggatatgtgcacaaatggcgattgtgtcaacacgccagga
agcttcacatgcgtttgcccgcccaactttgctctcagcaccaacaagaaactttgcata
gatcaaaccaaaggccaatgctacagttcatacgaccttggcgtgtgttcaaacgagatg
ccaactgcagttactcgcggttcctgctgctgtacatgcactgactcagcctggggtgaa
tctgctggtgaatgcgaggcctgccctgctgaaggaacacaagagttcgaaaacctttgc
cctgaaggttgtggattcacaccaaatggagacgacatcaacgagtgcgtgacgaacaat
ccatgcgtgaacggaatctgcagaaatttggcgggaggattcaaatgcgaatgcagaact
ggattcaaacttgacgaaacgaactttgtctgtgttgacgaagacgaatgtgttgagcga
ggtaacccatgcggacctggaacatgttcaaacagagttggtggattccattgtgaatgt
gaggacggatactacaatggacctatgatgaaatgccttgatatcaatgaatgtcttgaa
cagacccacggatgtaaattcagatgcgtcaatacagatggaagctacgtatgtacttgt
cctgatggatacaaattgaatgatgatgagcgatcatgtagcgacattgatgaatgttcc
gatgatgacctaaacagatgtgaagagaaaggaatgctctgcaagaacgctgttggaagt
ttcgaatgtctttgccaaccaggatacaagaaagttggagtggcagaccaatgcgagaac
attgatgaatgtttgactctcggagtttgtgcaggaggcgaatgcatcgatttggaagga
agctatcagtgcagatgtggtgaaggctacatatacgacgaacaaggacgacgttgcatt
gacaatcgtgagggactctgctatgccgctgtccaccaacgtacatgcgaactcactgct
actactggcttctccgtttcaaagacaagctgctgttgtaacaacggtgcaggatgggga
cctgactgtgatatctgcccgcttccaagttcaaaggaattcgtgaaactttgcccacac
ggacctggattcgacgagagaggagaagacatcgatgattgtattgtattccctggactt
tgcgccaacggcacatgcaccaatctcctaggatcatacaaatgtatctgcgacagaggt
ttcatgccaactgagaacatgcaagcttgtattgacattgacgaatgcgccatgccaaac
ggatgtgctggaggatctcgatgcagaaacacatttggtggatacaaatgcgaatgccca
gctggttaccagatcaccaacactatgagatgcgttgacgtcgacgaatgcaccaggaaa
gatcatcaatgtcaattcatctgcatcaacactatcggaagctaccactgcggatgccca
cacggattcgctatgcataacaaccaatcatgcgttgaccaagatgaatgcaagatggat
ccagatatctgtggtgagaacgctgattgtgagaatgatgtcggtggataccattgcgta
tgcgcaccaggatttgagaagactccaaatggagatggatgcattggtctaccatgtgat
tcccgacctggtatctgcggacctcaaatgtgcatgaacgttggcgagtccatcagatgt
gtgccaggatgcaatcccaacacaaggctcaggtttcacaacatgagatgttacgatatc
aacgactgcagagcaaacccttgcaaatttggaggccgatgtgttcctaatgctgaagga
caatacagatgcactggcggtggatgcggaaggggcttcgcaatgatgggaggatacggt
agaggatgcggagacatcaatgaatgcagattccagaacaatccttgctcttatcaatgt
cagaattcatatggtggattcaaatgtggatgcccgagaggatacttcggtctcggtgga
agtcaatgtatgaacggtatgggtggtttccaacaaccgccagtctaccctcagcaatac
ggtcaactaccattcatgggaggacgtggagcacccatgggaagatgctacgactgcgga
ccggttggaccgcacagacaacgaagatctactgagtcagcacaaatggaaatgataagc
ggggatgatgagaaccgtccaccagttaatacatctgttccaatcattatgcatctcagc
ctacaaaacctgaacccacgtcaacgattgatccaacttatcccagctatccggacattg
aaggatcacacattgtacaaaatcatcggaggaaacgaaggcagaatgttcagaattcac
aagcaagacagcttccacttcatccatcttaaccgtggtttcgagagagaggaaggaaag
atcgaaccaggccaatacaagatcaaggttgaagccaaaccaaccattgataagaagaca
gcaaagaaagccagccttgacaacccccagatagagaaagcaatggagaataccgtcaag
ttcgaggttcttttcgatatcgaaaagtag
DBGET
integrated database retrieval system