Solitalea canadensis: Solca_0050 Help Entry Solca_0050        CDS       T02084                                  Name (GenBank) VCBS repeat-containing protein Organism scn  Solitalea canadensis Pathway scn02024   Quorum sensing Brite KEGG Orthology (KO) [BR:scn00001]  09140 Cellular Processes   09145 Cellular community - prokaryotes    02024 Quorum sensing     Solca_0050 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  Big_9 Cadherin_4 Cadherin_5 CshA_repeat CHU_C Cadherin_3 Big_13 FlgD_ig Motif Other DBs NCBI-ProteinID:  AFD05208 UniProt:  H8KSR4 LinkDB All DBs Position 56769..66110 Genome browser AA seq 3113 aa AA seqDB search MNKLYKYFKRRAIIAVTSLFALLPTLIHAEGSKDLHPYSLTSTGYRALLASSTIAPSNYR SIVNQGRMFVYAKAGEKIYLGSSAQGMGAGTIKLTAPNGTLYNTSNSTTIGRISDRFQEL KGPSQLTAGGYNAFVQTVLAAEEGIWIIDFIAPVDVDPSPTSVASHSLKAAEDSNPAVPS WSSTNQSSTKPFIIAWDVTVANGTTAIPGRLFMNVFTASMGGASNEYRGKLKVLTNDGFQ FDVEGNGMTPYLFAFFSNNKGLRNLTTKDPVYKSANNTDIKNSDAAATLYDFHTPTALDD AANITHKLFYNTPDASMPAFAKITGSVVDVWLNPVLNIAKASNVKLTGIEGSPYMGTPPL NGGLIKFDATRNSNFRIEIDVNNDGDANDAVDRIIFGSAVAGSNSIVWDGKNGQGVAVAN GTDIRISIVLFSGEVHFPLIDAENNPNGIKITRTNTGDNSKIIYWNDLALGGLDKSAEPG VDSNTGAHSWNSSFGDVRTIDTWAYKYDVPAVSPVTKIVLKQADLEVVSVTRTGGTSTCA NVNVTYTVVARNNGPDHTTGAKFFFTVPAELTGLTAGTPTFTGTGAFTASNPTDSTYEAT LDLNNGSSFSITFSGTVSARPASGTLTVKASMLRQPDVTDPDATDPSADVPTDPDAECNY GTVGCNNIKTSDYTILATPNAGTDQAVSCQSTFSLTAAGSGQTWSFVSGPATASIGASSG AVTGMTKKGTYRFKLANGSCDDLVDIVRNNCAPTSANITKTILEDRPYTFANTDFSFTDV DGDLLSSIRIDASPGIGTLKLNGINVTVGQIIPLADISKLVYTPVTDGNGSPYTTFTFSV NDGTVFSTASLTVTINVTPVNDAPVAINDAYSVNEDAVLTIAAKGVLTNDTDVENNTLTV VLVSGPAHGTLTLNADGSFTYTPTANFSGSDSFTYKANDGSSDSNVATVVITVNSVNDAP VANNDAKTTNEDVAVNGTVTATDVDGDALTFTKGSNPTNGSVVVNADGTYTYTPNTNFNG TDSFTVKASDGKGGESTATVTITVTPVNDSPVANNDAKTTNEDVAVSGTVPATDVDGDAL TFTKGSNPTNGTVTVNPDGAYTYTPNTNFNGTDSFTVKASDGKGGESTATVTITVTPVND APVAVNDAYSVNEDAVLTIAAKGVLTNDTDVENNTLTAVLVSGPTHGTLTLNADGSFTYT PTANYSGSDSFTYKANDGSSDSNVATVTLTVTPVNDAPVAVNDVYSVNEDVVLTIAAKGV LTNDTDVENNTLTAVLVSGPAHGTLTLNADGSFTYTPTANFNGIDSFTYKANDGSSDSNV ATVVITVNSVNDAPVANNDAKATNEDVAVNGTVTATDVDGDALTFTKGSNPTNGSVVVNA DGTYTYTPNTNFNGTDSFTVKASDGKGGESTATVTITVTPVNDSPVANNDAKTTSEDVAV SGTVTATDVDGDALTFTKGSNPTNGTVTVNPDGAYTYTPNTNFNGTDSFTVKASDGKGGE STATVTITVTPVNDAPVAVNDAYSVNEDAVLTIAAKGVLTNDTDVENNTLTAVLVSGPTH GTLTLNADGSFTYTPTANYSGSDSFTYKANDGSSDSNVATVTLTVTPVNDAPVAVNDVYS VNEDVVLTIAAKGVLTNDTDVENNTLTAVLVSGPAHGTLTLNADGSFTYTPTANFNGIDS FTYKANDGSSDSNVATVAITVNSVNDAPVANNDAKTTSEDVAVSGTVTATDVDGDALTFT KGSNPTNGTVTVNPDGAYTYTPNTNFNGTDSFTVKASDGKGGESTATVTITVTPVNDAPV AVNDAYSVNEDAVLTIAAKGVLTNDTDVENDALTAVLVAGPTHGTLTLNADGSFTYTPTA NFSGSDSFTYKANDGSSDSNVATVAITVNSVNDAPVANNDAKTTNEDVAVNGTVTATDVD GDALTFTKGSNPTNGSVVVNADGTYTYTPSANFNGTDSFTVKASDGKGGESTATMTITVT PVNDAPVANNDAKTTNEDVTVNGTVTATDVDGDALTFTKGSNPTNGSVVVNADGTYTYTP NANFNGTDSFTVKASDGKGGESTATVTITVTPVNDAPVAVNDSYSVNEDVVLTIAAKGVL TNDTDVENNTLTAVLVSGPTHGTLTLNADGSFTYTPTANFSGSDSFTYKANDGSSDSNVA TVAITVNSVNDAPVANNDAKTTNEDVAVNGTVTATDVDGDALTFTKGSNPTNGSVVVNAD GTYTYMPNANFNGTDSFTVKASDGKGGESTATVTITVTPVKDAPVANNDAKTTSEDVAVN GTVTATDVDGDTLTFTKGSNPTNGTVTVNADGTYTYTPNANFNGTDSFTVKASDGKGGES TATVTITVTPVNDAPIVTTNPVTTEENKLVSGKVTSTDVDGDTLIAEKGTDPTNGTVVVN PDGTYTYTPKPGFNGKDSFEIVVKDGKGGETKVVVDVTVTPVNDAPVASNDSKTTNEDTP VNGKVAATDPDGDTLIFTKGNNPSNGTVVVNPDGTYTYTPNTDFNGKDSFEIVIKDGKGG ETTVVIEVTVNPVNDAPVASNDSKTTNEDTPVNGKVTATDAEGDALTFTKGSNPTNGSVV VNIDGTYTYTPNADFNGKDSFDFIIKDGKGGETKVVIDVTVTPVNDAPIVTVDPVSTDEN KPVTGKVTAKDADGDAPTAEKGTDPTNGTVVVNPDGTYTYTPKPGFNGKDSFEIVVKDGK GGETKVIVDVTVSPVNDAPVASNDNKTTNEDTPVSGKITATDADGDAMTFIKGSNPSNGT VVVNADGTYTYTPNADFNGTDSFTVKVSDGKGGETTATITITVKAVNDAPVVTAGPVTTT ENTPVSGKVTSTDADGDPLTAEKGTDPANGTVVVNPDGTYTYTPKPGFNGKDSFEIVVKD GKGGETKVVVDVTVDPANNTADLMIEKRIVKSTSDLKVGDWVQYEIVVTSKGPAKATNVK VADKLMTLLGKPEDVKSDIGNVTYSDAAHGIDWVIGIMDANTKATLTFKSQIVKAGKLTN SATVSSDVKDDNTVNNTGTTPVDVVDNKPVFVPNAFTPNGDGKNERFTIPGIEQYPGSTL HIFNRWGNEVFYSGSYDNEWVGQGLSEGTYFYILTINKLEGKTIQKGWVLLKR NT seq 9342 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgaataaactctacaagtattttaagcgaagggcaattatagcagtgacctcactgttt gcattgcttccaactttgatacatgccgaagggagtaaggacttacatccatacagccta acctctacggggtatcgggcattgcttgcaagttctacgattgcaccttcgaattataga agtattgttaatcagggacgaatgtttgtgtatgccaaagccggcgagaaaatctacctc ggctcaagtgcgcaaggtatgggagccggaactataaagttaaccgcccctaacgggaca ttatacaatacttcgaattcaacgacaataggtcgtattagcgatcgctttcaggaatta aaaggtccttctcaattaacagcgggaggctataatgcatttgttcaaaccgtattagcg gcagaagaaggtatttggattatagactttattgcacctgttgatgtagacccctcacca acttctgtagcgagccatagtttaaaagcagctgaagattctaatccggctgttccctct tggtcctcgaccaaccaatcgagtaccaaaccatttattattgcttgggatgttacagta gcaaacggaactacagctattcccggacgattatttatgaatgtatttactgcttctatg gggggagcaagtaatgaatacagaggtaaattaaaagtattaacgaatgatgggtttcag tttgatgtggaaggaaacggaatgacgccttatttatttgcattcttctcaaataataaa ggcttacgtaatctgactactaaagaccctgtttataaaagtgccaataacactgatatt aagaatagtgatgcggccgctactctgtatgattttcatactcctacagcattagacgat gccgcaaatattactcacaagcttttttacaatacacccgatgcatcgatgcctgccttt gcaaaaattacgggcagtgtcgttgatgtttggttaaatccggttcttaatatagctaaa gcaagtaatgtaaaacttacaggtattgagggttctccctacatgggaacaccacctctg aatggaggcttaattaagtttgatgcaacacgtaacagtaacttcaggatagaaattgat gtcaataatgatggagacgcaaatgacgctgtagaccggattatttttggttctgctgtt gcagggagcaatagtatcgtttgggatggaaaaaatggtcaaggcgttgccgttgccaat ggtacagatattcgcataagtattgttctcttttcaggagaagtacactttcctttgatt gatgctgaaaacaatccaaacggtattaagattacgagaactaatacaggtgacaacagt aagatcatctattggaatgaccttgcattaggtggtttggataaaagtgctgaacccgga gtggatagtaatactggggcacatagttggaacagtagttttggtgatgtaaggacgatt gatacttgggcatataaatacgatgtaccagccgtttctccggttacaaagattgtttta aaacaggccgatttagaagtagtaagtgttactagaaccggtggtacatcaacatgtgca aacgttaatgtaacctatacagttgttgcaagaaacaatggtccggatcatacaacaggg gccaaatttttctttacagtcccggcagagctaactggcttaactgcaggaactccaaca tttacaggaaccggagcattcacagcttcaaatcctaccgactcaacttacgaggcaact cttgatctgaataatggaagttcatttagcatcactttttccggaacagtaagtgctcga ccggctagcggcacattaacggtaaaagcaagtatgttgcgtcaaccggatgttaccgac cctgatgcaacggacccaagtgcggatgttccaaccgatcctgacgccgaatgtaattat ggtacggttggttgtaataacattaaaactagtgattataccattttagctactccgaat gcaggaaccgatcaagcggtatcttgtcaatctacattttcattaactgcagcgggaagt ggtcaaacatggtcatttgtttcaggtccggcaactgcttcaatcggagcatcgagtggg gcagtaacaggaatgactaagaaaggtacctatcgattcaaattagctaatggttcatgt gatgatctggtagatattgtacgtaataattgcgctccaacatctgctaatattaccaag acgattttagaagatagaccatatacttttgccaatacagatttcagttttacagatgtt gatggagacctattgtcttcgatccgcattgatgcttcacctggtattggtacattgaaa ctaaatggtattaatgttactgtagggcaaattatcccgttagcagatatttccaaattg gtttacacaccagttacagatggaaacggtagcccctacactacgtttacattcagcgta aatgacgggactgtatttagtactgcctcattaactgtaactatcaatgtaacacccgta aatgatgcacccgtagcaataaacgatgcttattcagttaatgaagatgccgttttaacc attgccgctaaaggagtgttaacgaatgataccgatgttgagaataataccttaacagtc gtgttggtttcaggtccagctcatggaaccttaaccttaaatgcagacggttcatttacc tataccccaactgctaactttagtggaagcgacagctttacctataaagccaatgatggc agctcggatagtaatgtagcaacagttgtaatcactgttaactcagttaacgatgcaccg gtagccaataacgatgctaaaaccaccaacgaagatgtggctgttaacggaacggttacc gcaacagatgtggacggcgatgcattgacctttaccaaaggttctaacccaactaatgga tcggtagttgtaaacgctgacggaacttatacttataccccaaacacgaactttaacgga accgatagtttcacggtaaaagcaagtgatggtaagggtggcgagtctacagccacagta accattacggttactccggtaaatgacagtccagttgccaataacgatgctaaaaccacc aacgaagatgtagccgtaagtggaacggttcccgctacagatgtggatggtgatgcatta acctttaccaaaggttctaacccaaccaacggaacagtaacggtaaatccggacggagcc tatacttataccccaaacacgaactttaacggaaccgatagtttcacggtaaaagcaagt gatggaaaaggtggcgagtcaactgccacagtaaccattacggttactccggtaaatgat gcacccgtagcagtaaacgatgcttactcagttaatgaagatgctgttttaaccattgcc gctaaaggcgtgttaacgaatgataccgatgttgagaataataccttaacagccgtgttg gtttcaggtccgactcatggaaccttaaccttaaatgcagacggttcatttacctatact ccaacagctaattatagcggaagtgatagctttacgtataaggctaatgatggtagctca gatagtaatgttgctacggttacacttactgtaacaccggtgaatgatgcaccagtagca gtaaacgatgtttactctgttaatgaagatgtggtattgaccattgcagccaaaggcgtg ttaacgaatgataccgatgtggaaaataataccttaacagccgtgttggtttctggtccg gctcacggaaccttaaccttaaatgcagacggttcatttacctataccccaactgctaac tttaacggaatcgacagctttacctataaagccaatgatggcagctcggatagtaatgta gcaacagttgtaatcactgttaactcagttaacgatgcaccggtagccaataacgatgct aaagccactaatgaagatgtagccgttaacggaacagttactgcaacagacgtggatggt gatgccttaacctttaccaaaggttctaacccaactaatggatcggtagttgtaaatgct gacggaacttatacttataccccaaacacgaactttaacggaaccgatagtttcacggta aaagcaagtgatggtaagggtggcgagtctacagccacagtaaccattacggttactccg gtaaatgacagtccagttgccaataacgatgcaaaaaccactagtgaagatgtagccgta agtggaacggttaccgctacagatgtggatggtgatgcattaacctttaccaaaggttct aacccaaccaacggaacagtaacggtaaatccggacggagcctatacttataccccaaac acgaactttaacggaaccgatagtttcacggtaaaagcaagtgatggaaaaggtggcgag tcaactgccacagtaaccattacggttactccggtaaatgatgcacccgtagcagtaaac gatgcttactcagttaatgaagatgctgttttaaccattgccgctaaaggcgtgttaacg aatgataccgatgttgagaataataccttaacagccgtgttggtttcaggtccgactcat ggaaccttaaccttaaatgcagacggttcatttacctatactccaacagctaattatagc ggaagtgatagctttacgtataaggctaatgatggtagctcagatagtaatgttgctacg gttacacttactgtaacaccggtgaatgatgcaccagtagcagtaaacgatgtttactct gttaatgaagatgtggtattgaccattgcagccaaaggcgtgttaacgaatgataccgat gtggaaaataataccttaacagccgtgttggtttctggtccggctcacggaaccttaacc ttaaatgcagacggttcatttacctataccccaactgctaactttaacggaatcgacagc tttacctataaagccaatgatggcagctcggatagtaatgtagcaacagttgcaatcact gttaattcagttaacgatgcaccagttgccaataacgatgcaaaaaccactagtgaagat gtagccgtaagtggaacggttaccgctacagatgtggatggtgatgcattaacctttacc aaaggttctaacccaaccaacggaacagtaacggtaaatccggacggagcctatacttat accccaaacacgaactttaacggaaccgatagtttcacggtaaaagcaagtgatggaaaa ggtggcgagtcaactgccacagtaaccattacggttactccggtaaatgatgcacccgta gcagtaaacgatgcttactcagttaatgaagatgctgttttaaccattgccgctaaaggc gtgttaacgaatgataccgatgtagaaaatgatgccttgacagcagttttggttgcaggt ccgactcacggaaccttaaccttaaatgcagacggttcatttacctatacaccaactgct aactttagtggaagcgacagctttacctataaagccaatgatggcagctcggatagtaat gtagcaacagttgcaattactgttaattcagttaacgatgcaccagtagccaataacgat gctaaaaccaccaacgaagatgtagctgttaacggaaccgttaccgcaacagacgtggat ggtgatgcattgacctttaccaaaggttctaacccaactaatggatcggtagttgtaaat gctgacggaacctatacttatacgccaagcgcgaactttaacggaaccgatagtttcacg gtaaaagctagcgatggaaaaggtggcgagtctacagccacaatgaccattacggttact ccggtgaacgatgcaccagtagccaataatgatgctaaaaccaccaacgaagatgtaact gttaacggaaccgttacagcaacagatgtggacggtgatgcattaacctttaccaaaggt tctaacccaaccaacggatcggtagttgtaaacgctgacggaacttatacttatacgcca aacgcaaacttcaacggaaccgatagtttcacggtaaaagcaagcgacggaaaaggtggt gagtcaactgccacagtaaccattacggttactccggtaaatgatgcgccggttgcagtt aatgacagctattcagttaatgaagatgtggtattgaccattgcagccaaaggcgtgtta acgaatgataccgatgtagaaaataataccttaacagccgtgttggtttctggtccgact cacggaaccttaaccttaaatgcagacggttcatttacctatacaccaactgctaacttt agtggaagcgacagctttacctataaagccaatgatggcagctcggatagtaatgtagca acagttgcaattactgttaattcagttaacgatgcaccggtagccaataacgatgctaaa accaccaacgaagatgtagctgttaacggaacggttaccgcaacagacgtggatggtgat gccttaacctttaccaagggttctaacccaactaatggatcggtagttgtaaatgctgac ggaacctatacttatatgccaaacgcaaacttcaacggaaccgatagtttcacggtaaaa gccagcgacggaaaaggtggtgagtcaactgccacagtaaccattacggttactccggtg aaagatgcaccagtagccaataacgatgccaaaaccaccagtgaagatgtggctgttaac ggaacggttaccgcaacagatgtggacggtgatacattaacctttaccaaaggttctaac ccaaccaatggaacagttactgtaaacgcggacggaacctacacttatacgccaaacgca aacttcaacggaaccgatagtttcacggtaaaagcaagcgacggaaaaggtggtgagtcg actgccacggtaaccattacggttactccggtaaatgatgcacctatagttactacaaat cctgtaacaacagaggagaataaactagtaagcggtaaagtaacttcaacagatgttgac ggagatactttaatagcagaaaaaggtactgatccaactaatggtacagtagtagtaaat cctgacggaacttacacttacactccgaagccaggctttaacggcaaagattcttttgaa atcgttgtgaaagatggtaagggaggagaaaccaaagttgttgttgacgtaacagtaact cctgtaaacgatgctcctgtggctagtaatgatagtaaaaccactaacgaggatactcct gtaaatggaaaagttgctgcaacggatcctgatggagataccttgatcttcacaaaaggc aataatccttcaaacggaactgtagtagtaaatcctgacggaacttatacttacacccct aatactgatttcaatggtaaagattcatttgagatcgtaattaaggacggaaaaggtggt gaaactacggttgtaattgaagtaactgttaatccggtgaatgatgctcctgtagcaagc aatgacagcaaaaccactaatgaggatactcctgtaaacggcaaggttactgcaactgat gctgaaggagatgcattaacctttacaaaaggctctaatcctactaacggaagtgtcgtt gtaaacattgacggaacttatacttatacacctaatgcagatttcaatggaaaggattca tttgacttcattattaaagatggtaaaggtggggaaaccaaggtagtaattgatgttaca gttactccggtgaatgatgcgcctatagttaccgttgatcctgtatcaacagatgagaat aaacctgtaactggtaaagtaactgctaaggatgctgatggcgatgcgcctacagctgaa aaaggtaccgatcctacaaacggaacagtggttgtaaatcctgatgggacttatacctac accccgaaaccgggctttaatggcaaagattcatttgagattgttgttaaagatggtaaa ggtggtgaaactaaggttattgttgatgtaactgttagtcctgtaaatgatgctccggtt gcaagtaatgataacaaaaccactaatgaggacactccggtaagcggaaaaattactgct acggatgctgatggtgatgcaatgacctttatcaaaggttcaaatccatcaaacggaacg gtggtagtaaatgctgatggtacttacacttacactccaaatgctgactttaatggaaca gatagtttcactgtgaaagtaagcgatggaaaaggtggtgaaactacagcaacaattacg atcactgttaaagcagtaaacgatgctcctgtagtaactgcaggtcctgttacaacaacc gaaaatacacctgtaagtggtaaagtaacttctacagatgcagatggggatccattaaca gcagagaagggaactgaccctgctaatggaacggttgtagtaaatcctgacggaacttac acttacactccgaaacctggctttaatggaaaggattcatttgaaatcgtagttaaagac ggtaaaggtggagaaaccaaagttgttgtcgacgtaacagttgatcctgcaaataacacc gctgatttaatgattgaaaagagaattgttaagtcaacaagcgacttgaaagtgggtgac tgggtgcagtatgaaattgtagtaaccagtaaaggtcctgcaaaagcaacgaatgtaaaa gtagccgataaactgatgactctcctaggtaaacctgaagatgttaagtcagacataggt aacgttacttattcagatgctgctcatggcattgattgggtaattggtataatggatgca aatacaaaagcgaccctgacattcaaatcgcaaattgttaaggcaggtaaattaactaac tcggcgactgtttcatctgatgttaaagatgataataccgtaaataatacaggtacaact cctgtagatgtggtggataataaaccggtgtttgttcctaatgcatttactccgaatggt gatggtaaaaatgaacgcttcactattcctggaattgagcaatatcctggaagtacgctc catattttcaatcgttggggtaatgaggtgttttactctggtagttacgacaatgaatgg gtcggacaaggtttaagtgaaggaacttatttctatatcctgacgatcaataaacttgaa ggtaagaccattcaaaaaggctgggtcttattaaaacgctaa

DBGET integrated database retrieval system