Solitalea canadensis: Solca_0223
Help
Entry
Solca_0223 CDS
T02084
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
scn
Solitalea canadensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TamB
Mucin_bdg
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFD05368
UniProt:
H8KNV7
LinkDB
All DBs
Position
complement(274149..278627)
Genome browser
AA seq
1492 aa
AA seq
DB search
MLYFAGQTKWFQTKAAQFGADYLSKELKTKVQIKGLYIKFIKSVVIEGLYIEDLKKDTLL
YSGYLEVDLNKFNLKNRKIAVADLKLSDTYFAYKELKDKKSTNLSFIINYFSGAPDTTTK
PPSKPFELSVNNIDIKNLTFIYKDESDTSKTEGMNYADIRAYGVNIQANDVNMDGDVILA
NLKNLSAQEKCGFVLNKLAGRVKYTPKEIEINNLKLITPHSNISKYLAFRYNRIGDFKHF
VRKVYMDADFKRSHLDFKDITYFAPAIKDYTLKVNLDGTVKGTVTNLQTKNITFSAGDKT
LIKGNIAIKGLPHINDTDMDLEFAQLVTNSDDINKILASIDQKDVALPEILKQVGNVDFK
GTFKGRYNNFKIKGILISDAGSALTDLAMDFRDMKKPLYKGFVNTTDLDIGKLSGVKSLG
KTTLSANVDGQGFDFKTMKDDLNAKITYFDYNGYRYQNIDINGSLALKKFNGSFNINDKN
LIIDFDGKFNLNQNPSYNFTADIKQADFRALKLMKDTLAISTYISSNFTGTTIDNVLGKL
LLEGTKLTTKQGSFDLDSIQVISEMRGDTAKRLLLRSDMLNAGFEGDYTLTRLEGAVKSM
LSAYLPSFKWKQTKAHVPQNFKFGIYLKDLTPITSIFIPDLKIPEKGLFIGNFNSEKNQM
TINGSIKKLKYQNFEVDNLILDQGNSNESLFLNLALGTFAMDSLRFNDVGMSNYLRNDKV
NSNLKLVDPKGTNALDLNAELLFTPDSTIFSVLPSELTLNSERWKIDDKFRILFAEDGYH
VEDFTLHNKDQRLTVEGMISKTDNEPLTVNLRNLDLNILNPFLKSQGIRLSGYVTGNAST
IAVLKAPKVSSDMIVHELGLNNNILGDAEISSRWYSETNEVNFSMNVMQDDVTKISVSGS
AQPTKKEDNIFADVEMNETSLVIFQPFLTGLVSDLSGKTSMNLLVRGSIAKPKINGTLSF
NNAGVRVDYLNTRYTINDKLGVENSRITFENFNLRDVKNHTATANGYMDLSDLNSVKLNL
RLNANRFQALNTTIKDNEIYYGTAYATGNFLFQGPLNDMLIDINATTNEGTQFFLPISDE
SSVGSDELVTFVSRDTLANLKKKEDSELKLRLNFDLTVNPTAEVSILLGENSGGTMTGKG
NGNLQLRINTLGDFQMFGLYNLTEGKYDMSIPGIKKTFKISDGSTVRFNGDPYDARMNVN
AIYETRSSLTNLYSDARITETSEEKMNQRITVNTLINVSGSLSEMTYDFKIAFPQNESLY
ENTFASYFSSEGNVQKQAFGLLSTGSFTSENQNFGQGAIAGSLVDLASSKLSSLLNEAIG
AQNFDVNANVNASGQTEFGGNVRLLNQRLIINGQFTSRDKNITGNSNYNTNNSSALSSDI
DVEYLIFPDGNLRLKAYNHSNTTNSNDLVYDSDYKQGVGILYRKDFDSWKEFFENSRKKQ
RLAEIRRQQRLEERKKQQEEKERLEREKQELEKAKAKENIKDNADDSERVEF
NT seq
4479 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctgtattttgccggtcagaccaagtggtttcaaacaaaagccgctcagtttggtgcc
gattatctctctaaagaacttaaaacaaaggttcagatcaaaggtttgtacatcaagttt
attaagtctgtcgttattgaaggcttatacattgaggacctgaaaaaagacaccttgctt
tattccggctatcttgaagttgaccttaacaagttcaatctgaaaaacagaaaaatagct
gtagctgacctaaaattgagcgatacctatttcgcttacaaggagttaaaggataaaaaa
tcaacaaatttaagctttatcatcaattacttcagcggcgctccggacactactaccaaa
cctccttcaaagcctttcgaattatctgttaacaacatagatattaagaacctgacattc
atctataaagatgaaagcgatacatccaaaactgaggggatgaattatgctgacatccgt
gcatatggtgtaaatattcaggccaatgatgtaaacatggatggagatgttattcttgcc
aacctcaaaaatcttagtgcgcaagagaaatgcggctttgtacttaacaaactggccggc
cgtgtaaagtatacccctaaagaaattgaaattaataacttaaaactgatcactcctcat
agtaatatcagtaagtacttagcttttaggtataatcgtattggcgatttcaaacatttt
gttcgcaaggtttacatggatgccgactttaagcgctcacatctagactttaaggatatc
acctattttgctccggccattaaagattacacccttaaagttaacctcgacggaactgta
aaaggaacagtaaccaacctacaaactaaaaacataacctttagtgcaggcgataaaaca
cttatcaaaggaaatatcgctatcaaaggattgccccatattaatgacacggatatggat
cttgagtttgcacaattagtgaccaatagtgatgatatcaataagattctagcaagcata
gaccagaaggatgttgctttaccagaaattctgaagcaggttggaaatgttgatttcaag
ggaacattcaaaggtcgttataacaatttcaagattaaaggcattttgataagtgatgca
ggttctgcattaactgaccttgcaatggatttcagagacatgaaaaaaccattgtacaaa
gggtttgtaaataccaccgacctggatattggtaaacttagcggtgttaaatcattaggc
aaaacaaccctttctgccaatgttgacggacaaggttttgacttcaaaacaatgaaggat
gatctgaatgccaagattacctattttgattataatggttaccgctaccaaaacattgat
atcaacggaagtttggctcttaagaaatttaacggctcatttaacatcaacgataaaaat
cttataatcgattttgacggtaaattcaatttaaaccaaaatccatcttacaactttaca
gctgatattaagcaggctgattttcgtgcgctaaagctaatgaaagacacgctggctatt
tcaacttatatcagtagcaactttaccggaaccactattgataatgtactgggtaagttg
ttattagaaggcactaaattaaccaccaaacaaggttcatttgatttagacagtatccag
gtgatctcggagatgaggggagacaccgctaaaagactcttacttagatcagatatgctg
aatgcaggctttgagggagattataccttaacccgtttggaaggtgcagtaaaaagtatg
ctttctgcttatttaccttcattcaaatggaaacaaacaaaagctcacgttccacagaac
tttaaattcggtatctatctaaaggaccttactcctattacttccatctttattcctgac
ctgaagattccggagaaagggttattcattggtaacttcaatagtgagaagaatcaaatg
actattaatggttctatcaaaaaattgaagtaccagaactttgaggtcgacaacttgatt
cttgaccagggtaatagtaatgagtcattattcctgaaccttgcattgggaacatttgca
atggacagcttaaggttcaacgatgtgggtatgtcgaactacctgagaaatgacaaggta
aattccaacctaaaactagtagatcctaaaggcaccaacgcacttgacttaaatgcggaa
ttattgttcactcctgattccaccatctttagtgtacttccttcagagttaactcttaac
agtgaaagatggaaaattgacgataagttcaggattctatttgctgaggacggttatcac
gttgaagattttaccctgcataataaagaccaacgattaacagttgaggggatgatctct
aaaacagataatgaacctcttactgttaatctccgcaatcttgaccttaatattttaaat
ccgtttctaaaaagccagggcataaggctcagcggttacgtaaccggaaatgcaagtacg
attgctgttttaaaagcgccgaaagtgagttctgacatgatcgttcatgaacttggtctt
aacaataatattttgggtgatgccgaaatttcttctcgatggtacagtgaaaccaatgag
gtaaacttctcaatgaatgtgatgcaggatgacgttaccaaaatcagtgtttctggatct
gctcaaccgacaaaaaaagaagacaacatctttgccgatgtagagatgaacgaaaccagt
ctggttattttccaacccttcttaacaggtttggtttccgatcttagtggcaaaacctcc
atgaatttactggttcgcggtagcattgctaaaccaaaaatcaacggtaccttatctttt
aacaatgcaggagtaagagttgattacttaaatacccgctatacaattaatgataaattg
ggtgtagagaatagtcggattacatttgaaaatttcaacttaagagatgttaaaaaccac
acagctacagccaatggttacatggacctttctgaccttaacagtgttaagttaaactta
cgtctgaatgccaatcggttccaggcattgaacaccactataaaggataacgaaatttac
tacggaacggcgtacgcaaccgggaatttccttttccaaggcccgttgaacgatatgctt
atcgatattaatgcaacaactaatgaaggcacacagttcttccttccaatttctgatgag
agtagcgttggtagcgacgagttagtaacctttgttagtcgtgatacactggcaaacctt
aaaaagaaggaagactcagagttaaaacttcgtctgaatttcgaccttaccgttaaccct
accgcagaagtttcaattttattaggagaaaactcgggtggaacaatgacaggtaaggga
aatggtaaccttcagcttagaataaataccttgggagatttccagatgtttgggctatat
aaccttacagaaggtaaatatgacatgagcattccgggaattaaaaagacattcaaaatt
tctgacggaagtacggttcgttttaacggagacccttacgatgcgcgaatgaatgttaat
gcgatttatgaaacccgttcgagtttgacaaacctgtattcggatgcccgtataacggaa
acttctgaagaaaaaatgaatcagcggatcactgttaatacacttatcaacgtttcggga
agcttgagcgagatgacctacgactttaagattgcgttccctcaaaacgagtcgttgtac
gaaaatacatttgcttcttatttcagcagtgagggtaatgttcagaaacaagcattcgga
ctattatctaccggaagttttacatctgaaaaccaaaacttcggacagggtgctatcgcg
ggttcattagttgatttggcatcttccaaactatcgtcattattaaatgaggcgatcggc
gcacaaaactttgatgtgaatgccaacgtaaacgcgagcgggcaaaccgaattcggagga
aatgttcgtttgttaaatcaacgcttgatcatcaacggccaatttacatcacgagataag
aacattaccggtaacagtaattataataccaataacagttcggccctgagtagcgatatc
gatgtagagtatttaatattccctgatggaaatcttcgtttgaaagcctataatcactca
aatactaccaacagtaatgacttggtttacgattctgattataaacaaggcgttggtatt
ctgtacaggaaagactttgacagctggaaagagtttttcgaaaactcccgtaagaaacaa
cgactagctgaaatcagaagacaacaacgattggaagaacggaaaaaacagcaggaagaa
aaagaaaggctagagcgcgagaaacaagaactcgaaaaagcaaaagccaaagaaaatata
aaagacaacgctgacgacagtgagcgggttgaattctaa
DBGET
integrated database retrieval system