Solitalea canadensis: Solca_0394
Help
Entry
Solca_0394 CDS
T02084
Name
(GenBank) TonB-dependent siderophore receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
scn
Solitalea canadensis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
scn00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
scn02000
]
Solca_0394
Transporters [BR:
scn02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
Solca_0394
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
CarboxypepD_reg
CarbopepD_reg_2
fn3_3
EMC7_beta-sandw
TTR_TEN1-4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFD05534
UniProt:
H8KP12
LinkDB
All DBs
Position
complement(492493..494916)
Genome browser
AA seq
807 aa
AA seq
DB search
MTLKLYNSSKSFAILSFLILCITVFSANGQSKNGSITGTVKTSDGSPAAAVSVSLKEVNR
GSITNDAGLFTIKGVKEGSYTLLISYVGLEPQSKTVLVTAGQSSVVDFTLIETSGKLAEV
VVTGTKSVNKKPVSVGKIDITPMDLPQSVAVINSTVIAEQQVNKLSDAIKNVNGVSLGTT
RGTTSETFFARGYNLGANNIMKNGARSNSGVIPEASALESIEVLKGSSALLYGNVTAGAV
INMVTKQPKFNFGGEVSMRTGSYDFYKPTLDVYGPISKKVAFRVIGTYENSKSFRHSVES
KRIYVNPSILYKISDKTDLLVQGDYLDADLTPDFGLGSLADTALATSIDRSSFFNTPWAY
NKAKQATANATLNHQFNEKWKLNAQVAYQNFDRNYFSTERIQAKSNGDWARNLTRTKTNE
NYYTTQLNLNGSVKTGKVEHKLLLGADAEKYMNNTYGFKKFPTAYDQINILDPSKYSWRT
DMPSTSDSIRNAIPTNRFGIFVQDLISISEKIKVLAGLRWSYIDSPVPTIYNLTNGTDAK
NTTIKYKSDKAFSPRLGVVYQPSKNTSVFASYSNNFVPNTSGTDIYQGSLDPSTIDQYEV
GIKNDFLQGRLSVNLTAYKIINNNLVQTARYDKEGKENFDTNLKEFSGQTTSDGIELDIN
GTITKGLNFLAGYSYTYMRYTKTPDTKGSYVEGERLVSVPSHTANGTVFYTFSNSTLKGL
KVGVSGFYTGERNAGWNNTKGQTQKNRLIPVSGFTTFDLSLGYTFKKFSVLGKVSNITDE
LNYYVHENYSVNPIAPRQFMATVAYKF
NT seq
2424 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgactcttaagctctacaactcttctaaatcatttgcaatccttagttttttgatacta
tgtataaccgttttttcagcaaatggtcaatcaaaaaatggttcaataaccggaactgta
aaaacaagtgatggtagtcctgcagctgcggtaagtgtaagcttaaaggaagttaacaga
ggctccattacaaatgatgctggtttatttacaatcaaaggtgtaaaagaaggctcgtac
acccttcttatcagttatgtaggcttagaaccacaatcaaaaactgtattagtaactgct
ggtcaatcatcagttgtcgactttactttaattgaaacatcaggtaaacttgctgaagta
gttgtaacaggtactaaaagcgttaacaaaaaacccgttagtgtaggcaaaattgatatt
actccaatggacctaccacaaagtgtagccgttatcaatagcactgtaattgctgaacaa
caggtaaataagttaagtgatgccatcaaaaacgttaatggtgtatcattaggtactaca
cgcggtactacatccgaaaccttttttgcacgcggttataatcttggagccaacaatatc
atgaaaaacggcgctcgctctaactctggcgttattcctgaggcaagtgcgcttgagagt
attgaggttttaaaaggaagttcggctttattatacggtaatgtaactgctggggcagtt
attaatatggtaaccaaacagcctaaatttaactttggtggtgaggtttcaatgcgcaca
ggcagttatgatttttacaaacctacacttgatgtttacggaccaatcagcaaaaaagta
gctttccgtgttattggcacttatgagaactcaaaaagtttcagacattctgttgagtct
aaacgtatctatgttaacccttctattctgtacaaaatcagtgataaaactgacttatta
gttcagggggattatttagatgctgatttaactcctgattttggtttgggttcattagct
gatacagctttagcaacttcaattgatcgatcgagtttctttaatactccatgggcgtac
aacaaagcaaaacaagctactgctaatgcaacattaaatcatcagtttaatgaaaaatgg
aaactaaacgctcaggttgcttatcagaattttgatcgtaattatttctcaactgaacgt
attcaagcaaaaagcaatggagactgggccagaaatttgacaaggactaaaactaatgag
aattattatacaacgcaacttaacttaaatggttctgttaaaaccggaaaagtagagcac
aagttattgcttggagctgatgcagaaaaatacatgaacaatacatacgggttcaaaaag
tttcctacagcatatgaccagatcaacatccttgatccttcaaagtacagctggcgtaca
gatatgccatcaaccagtgattctataagaaatgccatacctactaatcgctttggaatc
tttgttcaggatttaataagcatttctgaaaaaattaaagttttagcaggcttaagatgg
tcatacatcgactctcctgtgccaactatctataatttaacaaatggaacagatgcaaaa
aacaccacaattaagtacaaatctgataaagcgttttctcctcgtcttggtgtagtttat
caaccatctaagaacacatctgtatttgctagctattcaaataactttgtaccaaatact
tcaggaacggatatttaccaaggaagtttagatccttcaacaattgaccagtatgaagtt
gggataaaaaatgatttcttacagggccgtctttcagttaatctgactgcttacaagatt
atcaacaataatctcgttcaaactgcaagatatgataaagaaggaaaagaaaactttgat
actaaccttaaagagttctccggacaaactacaagtgatggtattgaattagacattaac
ggtactattacaaaaggcttaaatttcttagcgggctacagttatacttatatgcgttac
actaaaactcctgatactaagggtagttatgttgaaggcgaacgtttagtaagcgttcct
tctcatactgcgaacggaaccgtattttatacgttctcaaattctactttaaaaggttta
aaagtaggagtatcgggtttttatacgggagaacgtaatgcaggctggaataatacaaag
ggacaaactcaaaaaaatcgtttaatcccagtaagtggctttacgacatttgatctttca
ttaggttatacatttaaaaaattctctgttttaggtaaggtttcaaacattactgatgaa
ttgaactactatgttcatgagaattacagcgtgaatcctattgcgcctcgtcaatttatg
gctactgtagcttataaattttaa
DBGET
integrated database retrieval system
