Solitalea canadensis: Solca_0942
Help
Entry
Solca_0942 CDS
T02084
Name
(GenBank) RIP metalloprotease RseP
KO
K11749
regulator of sigma E protease [EC:3.4.24.-]
Organism
scn
Solitalea canadensis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
scn00001
]
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01002 Peptidases and inhibitors [BR:
scn01002
]
Solca_0942
Peptidases and inhibitors [BR:
scn01002
]
Metallo peptidases
Family M50: S2P protease family
Solca_0942
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Peptidase_M50
PDZ_6
PDZ_2
PDZ
PDZ_Tricorn
PLEKHS1_C
Peptidase_M50B
GRASP55_65
Glyco_hydro_59
TP0546_4th
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFD06056
UniProt:
H8KV56
LinkDB
All DBs
Position
1107454..1108776
Genome browser
AA seq
440 aa
AA seq
DB search
MSGLIMAAQLLAGLSILIVLHELGHYLAARAFGIKVEKFYLFFDAWGVKLFSFKKGDTEY
GIGWLPLGGYVKIAGMIDESMDVEAMKQPAQPWEFRSKPAWQRLIVMLGGVFVNVVVGVF
IFWMLTFKFGESYLPNSEVKYGIEARELGKEIGLKTGDKITGVNGKSLERFDDLYSPNVL
FGNVNLNVNREGKDTLIHVPSDFIEKISDEGKTAFVVPRLTFEVGEVQSGSNADKAGLKT
GDKIVAVDSLKVTYFDELRTALDTNKNKKIKIKVDRNNTEVYLTANVEKDGTIGFSPKTV
GMNFKTDQFSFAQALPVGAEKAKQTLVDQAKGFGKIFKGDVDPRKAVQGPIGMAKIYGGT
FQWEKFWTLTGLISLVLAFMNLLPIPALDGGHAVFLIIEMIKGKPLSDKFMERAQVVGFV
ILIGLMIFAFGNDISKFFLK
NT seq
1323 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtggtttaattatggcggcccaattgttggccggactttcgattttgattgtttta
cacgagttggggcattaccttgctgcacgagcattcggcatcaaggtagaaaagttctac
ttgttttttgatgcttggggcgttaagctgttcagcttcaaaaaaggtgataccgaatac
ggaatcggatggttaccgcttggcggatatgtgaaaattgccggaatgattgatgagtct
atggatgtggaagcaatgaagcaacctgctcaaccatgggaattccgctcaaaaccagct
tggcaacgcttaattgtaatgttgggtggtgtatttgtaaacgttgtggtgggtgttttc
atcttttggatgttaacttttaagttcggagaaagctacttgcctaattctgaagtgaag
tatggtattgaagcccgtgaactaggaaaggaaatcggattaaaaacaggtgacaaaatt
acaggtgttaatggaaaatcacttgagcgttttgatgatttgtatagtcctaatgttcta
tttggtaatgtaaatctgaacgttaaccgcgaaggtaaggatacgttgattcatgttccc
tctgatttcattgaaaaaatatctgatgaaggcaaaacagcatttgtagttcctcgtcta
acatttgaagtaggagaagtacaaagtggaagtaatgccgataaagctggtttgaaaacc
ggtgataaaatagtggctgttgattcattgaaagtaacctactttgatgaattaaggacg
gcattagacactaataagaacaaaaaaattaaaattaaagttgacagaaataacactgaa
gtatatttaactgccaatgttgagaaggacggaactattggtttttcccctaaaacagtt
ggaatgaactttaaaaccgatcagtttagtttcgcgcaggcattaccagttggtgctgaa
aaagctaaacaaacattggttgatcaggcaaaaggttttgggaaaatattcaagggtgac
gtagacccacgtaaagcggttcagggacctattggaatggcgaaaatctatggtggtact
ttccaatgggagaaattctggacgctaaccgggttgatttccttagtgttggcatttatg
aacttgctgccaattcctgcattggatggtggtcacgctgtattcctgatcattgaaatg
attaaaggcaagccactaagcgataagtttatggagcgtgctcaagtggtaggtttcgta
atcttaatcggattgatgatctttgcatttggtaatgatatttctaaattctttttaaaa
taa
DBGET
integrated database retrieval system
