Solitalea canadensis: Solca_1414
Help
Entry
Solca_1414 CDS
T02084
Name
(GenBank) outer membrane cobalamin receptor protein
KO
K16092
vitamin B12 transporter
Organism
scn
Solitalea canadensis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
scn00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
scn02000
]
Solca_1414
Transporters [BR:
scn02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
Solca_1414
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Phage_XkdX
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFD06499
UniProt:
H8KVJ6
LinkDB
All DBs
Position
1697133..1699061
Genome browser
AA seq
642 aa
AA seq
DB search
MKKTFTLFALTVTTSLVAYSQEKKLALDEVTVTATKFAKKQSETGKVVSVISREELERSS
GKSILDILNIQPSLNFNNANGNRGGNISTYLRGSQTGNTLILIDGIPVNDPSQITNDYDL
NLIAVDMIDHIEILKGGHSTLYGSDAVAGVINIITKKGGAKPFNINALVTAGSYKDFKES
LGISGSLSRVDYNFSVTHEYLKGFSAAKDTVKKHLSDEQKFDDDHFKLQSLNFNMGIKAT
ENLMIRPFVRYSKTNMAVDYGAFTDDRDYTGESSDLSAGFSSNLKIKSSDLFLNYNYSDV
KRSFLNDSIAGPKEYSSNDTKGLAHNVDLYGRFLLVDHLELLTGGSFRYANTNQANNSIS
QYGVYKTELNSDSAKNSLSSLYASVFLKDIKGFNLELGGRFNYHSIYGNNFTYTINPSLI
IEENTKVFVNISSAFKIPTLYQLYAPVYGNPNLNPEKVQTFEAGFQTVFADGKAKLGLNA
FKRKGKDVIAFTTKYVNYNKQDDQGMEVEGEVEVIKDLSVKASYALVYGKVTTATSSFNN
LYRMPRNSFIFNAGYKVTDNLFISTNLKVVGQRVDPYFDTNTFQSVNLTLDKYFLLDAYA
EYKFKMFKVFVDFRNITNEQYTEITGYNTRGFNLNGGLSFTL
NT seq
1929 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgaaaaaaacctttacactttttgccttaacggttacaacctcattagtagcctattca
caagagaaaaaattagctcttgatgaagttactgtaacggctacgaaatttgcgaagaag
caatcagaaacaggaaaagtagtttctgttattagccgtgaagaattagaacgaagctca
gggaaaagtattttggatatcctgaacattcagccttcattaaattttaacaatgctaac
ggaaacagaggtggcaatatttctacttatctacgtggttcgcaaactggtaatacgctt
atccttattgacggaattcccgtaaatgacccttcacaaatcaccaatgattatgatttg
aatttgattgctgtagatatgattgatcatattgaaatattaaaaggaggtcattcaaca
ttatatggttctgatgcagttgcgggagtaatcaacatcatcacaaaaaaaggcggtgct
aagccttttaatataaacgcattagttacagcaggtagttataaggattttaaagaaagt
ctgggcatatccggttctttatcccgcgtcgattataatttttcggtaactcatgaatat
ttaaaaggcttttcggcggcgaaagacacggtgaagaaacacctatcagacgaacaaaag
tttgatgatgatcatttcaaattgcaatcattaaatttcaatatgggtattaaggccact
gaaaatttgatgatcagaccatttgtgcgttatagcaaaacaaatatggctgttgactat
ggtgcttttacagatgatagagattatacaggtgaatcatcagatcttagtgcaggtttt
agcagtaatctgaaaataaagtcatcagatctgttcttgaattataattacagtgatgtt
aaacgatcatttttaaatgattcaatcgcaggccccaaagaatacagctctaatgatacc
aaaggactggcccataatgttgatctttatggaagattccttttagtagaccatttggag
ttgctaactggaggcagttttcgatacgctaacacaaatcaggcaaataatagtataagt
cagtacggtgtttataagactgaattaaatagtgattcagccaaaaattcattaagcagc
ctttatgcctcggtatttctaaaagatatcaaaggttttaaccttgagttaggggggcgt
tttaactatcacagtatttatggtaataattttacctatacaattaatccatcgttaatt
attgaagagaatacaaaagtttttgtcaacatttcttcagcatttaaaattccaacatta
taccaattatacgcaccggtatatggtaatccgaatttgaatccggaaaaagtacaaaca
tttgaagccgggtttcaaactgttttcgctgacggcaaagcgaaactaggtttaaatgca
tttaaacgtaagggtaaggatgtaatagcattcacaactaaatacgtaaattataataag
caggacgatcaaggaatggaagttgaaggtgaggttgaagtaatcaaggatttgagcgtc
aaagcttcttatgcactggtttatggcaaagtaactacggcaaccagttcttttaataac
ctttaccgaatgccaagaaactccttcatttttaatgcaggctataaggtaaccgataat
ttatttatctcgaccaatctgaaagttgttggtcaacgagtggatccatattttgatacc
aatacttttcagtcggttaatttaacattggataagtacttcttattggatgcttatgca
gaatataaattcaagatgtttaaggtatttgttgactttagaaacatcacaaacgaacaa
tacacggaaattacaggctataatacccgtggatttaatctgaatggaggtctttctttt
acgttgtaa
DBGET
integrated database retrieval system