Solitalea canadensis: Solca_2138
Help
Entry
Solca_2138 CDS
T02084
Name
(GenBank) RHS repeat-associated core domain protein
Organism
scn
Solitalea canadensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SpvB
TcdB_toxin_midN
RHS_repeat
NAGLU_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFD07191
UniProt:
H8KU79
LinkDB
All DBs
Position
complement(2505022..2514597)
Genome browser
AA seq
3191 aa
AA seq
DB search
MTNISFRKITALLVLTAGIINNAYCSEIIDKNGPSKKYYLSKKQEGQIGVSEKIPIDNPA
DNVFHINIDKSLRGNENVWLIYELEGVEDHNAVSRSVNDQLAVGGYLVKKRNGWVKQRER
INAAWLKSGDNVIRFTVPSGAKHHYQVRNLQFEIDHTNSAIGQSLVIDQNAGHTYYNNMA
YIKGFITGNDNKAQIFIDGEKARLYKGEFEGVVKRSGISQRVKVEAVYPNGQRLVKNVEF
LNSENADYTYDLSGAISATKKLILPHQDASVSLNGASLTLVNGSLKSAQSISITSLRDVD
IPALDPGMVNVTKNHVGYRFLPHKTQFLKEAQLRIAFDEEKIPDGYTAKDVKTYFFDESS
HHWIALPLDSVMEESGEVISGTTHFTDMINAVIKVPESPEVNAYNSNSIKDIKSANPTAA
VNLIEPPQANSMGNASIGYSINIPSGRNGMQPQVGISYNSGNGNGWLGLGWGLGTPFIGI
DTRWGVPRYDAGKETETYLFNGEQLTPVAHRGELQDRTTGDKRFYPRVESSFSKVIRHGN
SPANYWWEVTDKNGTTYFYGGDPDNGVDENATLSDANNNKAHWCLKETRDLNGNFVRYQY
RKVEDVGVEGGTVPGYQIYIEKISYTGHNTEEGKYAVLFKRDRELQNWKKRVDVNIMANL
GFKQVTADLLKKIEVQFEGKNIRSYELNYKQGEFFKTLLDSISEFDAAGKFFNSHKFEYY
NDITTGGNLKPFKTVENWTTNNDKINANFINPIKNIDPLKDFGDEASALSGTKSTDIGAG
LAVTVGFDANVASKSTSVGGNLGYSESTSEGLLSMIDINGDGLPDKVFTTNDGMFYRPNL
SGPDGTAVFGDKISIQGINKFHKEKSKTISGGIEAHGPGAVIFAGVGASKTTSTTTVYFT
EANGDQLTDVVINGTVYFNRLNTTSGHPEFNPTSNGTPSPINQDGNVATDIYEVDPAELD
SAINQNPLHDVVRTWKAPFDGQVVVKAPVQLIKSNDADRNETPADGVRVAIQLKGTELWN
ATIGPDDYSWHQPSGVNNLAVQKGDRIYFRVGSIANGSYDQVNWSPQIEYLNQDISLKDA
NNKPVYSFSSKDDFVLSSSQEVATPIKGQVKIEGSFSKPKTSDSVLVQIIKKVNNGIEVP
VWSKMYSWETEVNEPIVADLAVENNESYSFKVHSSTNIDWSNIKWNPVMYYTASADPAIP
VTGTSGESLIKFYPVPDYSIYADVISITKPWVVNANVNSISVIPQLSLPPSSLYNGSITF
SVKKKDTLVAKQRLNVVNGQIGNPQTLNINTSTNDTLYFEYHTTSFELAKVLDHKAVVVQ
AGTTLNVATGLHAYLDTVKNGNIIFGPLFRGWGHFAYNGNRDRATSAINESELKLSEVLL
NTEPVDVGSIGDGNELENKNTYDPAKDNFIMLVAMGEKKHWEGYDKQTFITADIISSSRL
GDDDISPAQAVPGNGSGARAINKIAKSTNYSFSVGAGGGFVSGSYGKSYGGMKVLTDFVD
MNGDRYPDIVTERKIQYTNALGGLSSTYIDHGKKENHKTTTESDGVSLSGSFVTSKGTSS
PSNAKKITFSVGTGNNSAGLSANYGKGKNEADFTWMDINGDGLPDRVKQGGMVELNLGYS
FAPEEPWGYSQIQKGDSKSYGGGLGFSIWNGSISGGISLSRSDNYNRIGLQDVNGDNLVD
IVLEGNPMKVRLNTGSGFGEEINWLGASQINKSSAANEAANVAFTFGIYFPIVNIKICFN
PSVNAGKGMTRDLEKLSDVDGDGYPDYVKSTKDNELFVSRSTIGRTNLLKGVKRPLGASF
AIDYKRIGNTYEMPNDVWALSQVEVKDGFTGDGADRMLTTFDYKNGYYDRFERDFYGFKK
VIVNTHDTQKRDEEYIVVEQTFNNDNFYEKGLQLTEVMQDGQGHKYLEKENQYSVTDRST
GTVLSSDAKKNFVNSAFPSLKETVQKFYEGQTDPGKSTRSTYAYDQLGNVTNFTDFGDEG
DQDDISSVITYHSVEDKYIMSSPKSIVVSGSSAVYRKRESSINEKGNVSQVKQFLENGEA
AAFDMEYDAYGNLSKVTRPTNAKGQRLSFNYIYDNTVHTYNTKVSNSYGYNSEASYDFRF
GQVISSKDMNGHLISSEFDNLGRIIKVTGPYEKASPAGYTIKFEYHPEAAVPWALTKHYD
PSNPRNDLESVIFVDGLGRVLQTKKDAAIYQGENKADKEQVVVSGRVKFDPFGRIYESRY
PVIENLGTLGKFNFSEDNIAPTLSTYDIMGRTLTTTLPDGAVNKTEYGFGNDRNSVKQFS
IKITDANGKQTEQFTDIKGRNTSIKNYTTDKDIWTSFAYNAIDELIASTDDEGHTTQSVY
DWFGRRTGRKHPDAGINIYTYDLVGNLIQLQTANLKKDNAHINYDYDFERLTNVNYPQNP
ENNVRYVYGAVDASDNRVGRIVLQEDVSGAQEFFYDALGEVVKNVHTIVIPQHAEQTYIT
EWKYDTWGRLTSMIYPDGEEVAYNYNVGGLLNSLNGKKKGSQYNYVKQLGYDKFEQRLFL
AYGNGTKTTYTYEPDRRRLKVMNAKTAKGRTFMDNVYGYDKVNNILSLKNNAPVPAANLM
GGSSEYAYDYDDMYQLKEATGLFKGSNSQHRYSLTMDYNTVGGITKKVQKHERSGGSSGN
AWTEQKKTTYASDYTYGESQPHTPVHIGRQTYSYDANGNQTGWEDDKSGQRRKIFWDEEN
RVRAVMDNGATYHYVYDASGERVLKGQSQGQTAFVNGERKAGSGQMGNYTVYVNPYIVLK
SGGYTKHYYIEGQRILSKLGGGWDNKGKGPLKAGGDSLNYTNKKQAMEQGIVKNLKFLGM
DGQILTAGKSGKIPPGQINGTGNATESFQYYFHPDHLGSTSYISDAAGEIYQHLEYFAFG
ETFVEEHSNTNRVPYLFNGKELDEETGLYYYGSRYMDPKTSLWLSIDRYTEKYPGFSGYS
YCLNNPVIVTDPTGDTTHLVVYGAGYLNYTTAGGGHDVGKGFQLNAEALKKKIESSPTFD
PARDAVILVYAPSSSRFISAVNKKYKSGKIGSLTVFSHGYGFSDNNGTNTGGVSLGGEKP
NERRSDGTTTSQADADAQKNNYDLREINGNNVMRFDKSNFEKSAVATFYGCWIGGDQSWS
DAQIRSFSFGQKLADNMGITVKALTSSGLFKTNSSGKVIYDGTMIRAIDAKSQKTRLSTF
RPYSVPSIIRK
NT seq
9576 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacgaatatttctttcaggaaaattactgctcttttagttttaactgcgggcattatc
aataatgcttattgttcagaaataatagacaaaaacggcccttctaaaaaatactatctt
tcaaaaaaacaggaaggacagattggggtatctgagaaaattccaatcgataatccggca
gataacgtatttcatattaatatcgataagtccttacgcggcaatgaaaatgtttggcta
atctatgaattagaaggagtggaagaccacaatgctgtatctcgtagtgtaaatgatcag
ttagctgttggggggtatctggttaaaaagagaaacggttgggtaaaacaacgtgaaaga
ataaatgccgcctggctaaaatcaggagacaatgttattcgcttcactgtaccttcagga
gcaaaacatcattatcaggttcgcaatcttcagttcgaaatagatcacactaatagtgct
attggtcaatctttggtgatcgatcaaaacgctggccatacttattataataatatggcc
tacattaaaggctttattacaggtaatgataataaggctcaaatctttattgacggagaa
aaggcacgactatacaaaggagaatttgaaggagttgttaaacgttccggtatttcacaa
cgggttaaagtagaagccgtatatccgaatgggcaaagattagtgaagaacgttgaattt
ctaaattcggaaaacgctgattacacttatgatttgtcgggagcaattagcgccactaaa
aaactcattcttccccatcaggatgccagtgtttcgttaaatggagcaagtttgacatta
gttaatggttcacttaaaagtgctcaatctatatctattacctcattaagagatgtcgat
attccggctcttgacccgggaatggtaaatgtgaccaaaaatcatgtcggttatcgtttc
cttccacataaaacgcagttcctgaaagaagctcaattacgtattgcttttgatgaggaa
aagataccagacggttataccgcaaaagatgtaaagacctatttctttgatgagagttcg
catcattggattgcattaccattggattcagtaatggaagaaagtggcgaagtaatttcc
ggtaccacgcattttactgacatgatcaatgcggtgattaaggtgcccgaatctcccgaa
gtaaatgcttacaactctaattccattaaagacattaaatcagcaaatccaacggctgca
gttaatcttatagagcctccacaggccaatagtatgggtaacgcatcaattggttatagc
attaatattccatctggcagaaatggtatgcaaccacaggtgggcatttcttataacagc
ggaaatggtaatggatggttgggtttaggatggggattaggcacaccttttattggaatt
gatacacgttggggtgtaccacgctatgatgcaggaaaagaaacagaaacctatttgttt
aatggagaacagttgactccggttgctcatcggggcgaattgcaagaccgaacgacgggt
gataaacgattttatccaagggtggagagctcttttagtaaggttattcgtcatggaaat
agccctgcaaactattggtgggaagtaacagataagaacgggacaacatatttctatggt
ggtgaccctgataatggggtagatgaaaatgctaccttaagtgatgctaataacaataaa
gcccattggtgtttaaaagaaacacgtgatttgaatgggaattttgtccgttatcaatat
cgaaaagttgaagatgttggcgttgagggtggaacggtaccaggttatcagatttacatt
gaaaagatttcctacacaggacataacacggaagaaggcaaatatgctgtactgtttaag
agagaccgggaattgcaaaactggaaaaaacgtgtggatgtaaacatcatggccaatctt
ggttttaagcaagttacagccgatttgttaaagaaaattgaagtacagtttgagggaaag
aatatccggagttacgagttgaactataaacaaggagagtttttcaaaaccttgctcgat
agtataagtgagtttgatgccgccggtaaattctttaatagtcacaagttcgaatattat
aatgatataactacgggaggtaatttaaagccttttaaaaccgtagaaaactggacaact
aataatgataagattaatgccaattttataaatccaataaaaaacattgatccgttaaaa
gattttggagatgaggcttcggctttaagtggtacaaagtctacagacataggtgccggt
cttgctgttacggttggttttgatgcgaatgttgcttcaaagagtacctctgttggaggt
aatctgggttattcggaatcaacaagtgaagggcttttatccatgattgatataaatgga
gacggattgcctgataaagttttcacaactaatgacggaatgttttatcgtccaaattta
tcaggacctgatggtactgctgtttttggagataagatttcaattcagggtattaataag
tttcataaagagaagagtaagacaattagcggaggtattgaagctcatggtcccggagcg
gttatttttgcaggtgtaggtgctagcaaaactacctctactacaacggtttatttcact
gaagccaatggcgatcaattaacggatgtggtgattaacggaacagtttatttcaataga
cttaataccacttccggccatccggagtttaatccgacaagtaatggaactccaagtcct
attaaccaggacggcaatgtggctactgatatttatgaagtagatcccgctgaacttgat
tctgcaattaatcaaaaccctttgcatgatgttgttcgtacgtggaaggctccttttgat
ggtcaggtagtggttaaggctcctgttcaattaattaagagtaatgatgcggatcgaaat
gagactcccgcagatggtgtgagggtagctattcagctgaaaggaaccgaattatggaac
gcaaccatcggtccggatgactattcatggcatcagccatcaggagtaaataatttagct
gttcaaaaaggggacaggatttattttagagtaggttcaatagccaatggttcttatgat
caggtgaattggagtccacagatcgagtacttaaatcaggatatcagcttaaaagatgct
aataataaaccggtttatagcttttcaagtaaggatgattttgtactgagttctagtcag
gaagtggcaacaccaataaaaggacaggttaaaattgaaggaagttttagtaaacctaaa
acctctgattcagttttggtgcagattataaagaaagttaacaatggtattgaagtacct
gtatggtctaaaatgtactcttgggaaacagaagtaaatgagccgattgttgctgattta
gctgttgagaataatgaaagttattcatttaaagtacactcttcaacaaatattgactgg
agtaatataaaatggaacccggtgatgtattatactgcatcagctgatcctgcaatacca
gttacaggaacctcaggagaatcgctcattaagttttatcctgtacctgattattccatt
tatgctgatgtgatttcaattacgaagccttgggtggtaaatgcaaatgttaactccatt
agtgtaatccctcagctttcgttaccgccttcatcactttacaatggttcaatcaccttt
tccgtaaagaagaaagatacgctggttgctaaacaaagactcaatgtagttaatggtcag
attggtaatccccaaacattaaacattaatacatctacaaatgataccttatattttgaa
taccacacaactagttttgaattagctaaagtgctggatcataaggctgttgtagttcag
gcaggaacgacactgaatgtagcaaccggattacatgcttatctggatacagttaaaaat
ggaaatataatttttggccctttatttagaggatggggacattttgcctataacggtaat
cgcgaccgggcaacaagtgccatcaatgaaagtgagctaaaattaagcgaagtgctttta
aataccgaacctgtagatgttggttctataggagatggtaatgaattggagaataagaat
acttatgatcctgcaaaagacaattttattatgttagttgccatgggtgaaaaaaaacac
tgggagggatatgataagcaaacgtttataactgctgatattattagtagttctcgattg
ggagatgatgatataagtccggcacaggctgttccaggaaatggcagtggtgcaagagca
ataaataaaattgcaaaaagtactaattattcattctctgttggtgccggaggaggcttt
gttagtggtagctatggcaaatcttatggaggaatgaaggtgcttactgattttgtagat
atgaatggcgatcgctatccggatattgttacggagagaaaaattcagtataccaatgct
ttaggaggactatcatcgacctatattgaccacggtaaaaaagaaaatcataaaactacc
actgagtcggatggtgtttctttatcaggctcatttgttacttccaagggaacttcatct
ccttcaaatgccaaaaaaatcacatttagtgttggtacgggcaataattcagcaggttta
agtgccaactatggaaagggaaaaaatgaagctgattttacatggatggatattaacgga
gatggtttgccagatagggttaagcaaggtggaatggttgaattaaatctgggatacagt
tttgctccggaagagccttgggggtacagtcaaatacagaaaggtgatagtaaaagttat
ggcggcggacttggattcagtatttggaatggtagtatttcaggagggatcagtttatca
agatcggataactataacagaatcgggctgcaggatgtgaatggtgataacctggttgat
attgtcttagaaggaaacccaatgaaagtaagattaaataccggaagtgggtttggagaa
gaaataaattggttgggggcatcgcaaataaacaaaagctcggccgctaatgaagctgcg
aatgttgcttttaccttcggtatttattttcctatagttaatattaagatttgttttaac
ccaagtgtgaatgcaggtaaaggtatgaccagggatttggagaaactttctgatgtagac
ggtgacgggtatccggattatgtaaaatctacaaaggataatgaattgtttgtatcacga
tcaactataggtcgaaccaatctattaaaaggtgttaaacgtccattgggggcatctttt
gccatcgactacaagcgtattggtaatacttatgagatgccaaatgatgtatgggcttta
agtcaggttgaagttaaggatggttttacaggggacggagcagatcggatgctaacgact
tttgattacaaaaatggttactacgatcgctttgagagagatttttatggctttaaaaaa
gtaattgtaaatacgcatgatactcaaaagcgcgatgaagaatatatagttgttgagcaa
acttttaataatgataatttttatgaaaagggactgcaactgacagaggtgatgcaagac
ggacaaggccataaatatctagaaaaagagaatcaatattcagtaaccgaccgatcaact
ggaactgtcttatcctcagatgcgaaaaaaaactttgttaacagtgcttttccatcgtta
aaggaaaccgtacaaaagttttatgaaggacaaacagatccgggaaaaagcaccagaagc
acttatgcttatgatcagctagggaacgttaccaattttactgactttggagatgaaggc
gatcaggatgatatttcatcagttatcacttatcattcagttgaagataaatacataatg
tcatcgcctaagtcaattgtggttagtggcagtagcgcagtatatcgcaagcgcgaatct
tctatcaatgaaaaggggaatgttagccaagtaaaacaattccttgaaaatggggaagcc
gctgcttttgatatggaatacgatgcttatggtaatcttagcaaggtaacccgaccgaca
aatgcaaaaggacaaagactatcgtttaactacatttacgataatacggttcatacctac
aatacaaaggtgagtaattcctatgggtataattctgaggccagttatgactttcgtttc
ggccaagtcataagtagcaaggatatgaatggtcacctgatttcttcggaatttgataac
ctgggcaggattattaaagtaaccggtccttatgaaaaagcttcgcccgctggttatacg
attaaattcgaataccatccggaggcagctgttccttgggcattaacaaaacattacgac
ccttcaaatccgaggaatgatttggaatcagtcatttttgtggatggtttggggcgtgtt
ttacaaacgaagaaagatgctgccatttatcaaggggaaaataaagctgataaagaacaa
gtggtcgtttcaggaagagtgaagtttgatccttttggcagaatttatgaatctcgttat
cctgtaattgaaaatttaggtaccctcggtaagtttaatttttccgaagataatatcgct
cctacattaagtacttatgatattatggggcgtacactcacgactacattaccggatggt
gcagttaataaaactgaatatggtttcggaaatgatcggaatagtgtaaagcaatttagt
attaaaattactgacgcaaatgggaaacaaactgagcaatttacagatataaaaggtaga
aatacctctataaaaaattatacaacagataaagatatctggacaagttttgcctataac
gcaattgacgaactgattgcatcaactgatgatgaaggacatactactcagtccgtttat
gattggtttggcagacgcaccggccgtaaacatcctgatgcaggcataaacatttatacc
tatgacctggttggaaatctgattcagttacaaacagctaacttgaaaaaggataatgct
cacatcaattatgattatgattttgaacgtttaacaaacgttaattatcctcaaaatcct
gaaaataatgtaaggtatgtttatggagctgtagatgcatctgataatcgtgtaggacgc
atcgttttacaggaagatgtttcaggagcacaagagtttttctatgatgcgctaggagag
gtggtgaagaatgttcacactattgtgatcccacaacatgctgagcaaacctacattaca
gaatggaaatatgacacttggggacgattaacttcaatgatttatccggatggagaagag
gttgcctataattacaatgttggtggcctgcttaatagtctgaatggcaagaaaaaaggc
agtcagtataactatgttaagcagctgggatacgataagtttgaacagcgtttattcctg
gcttatggcaatggaactaaaacaacttatacctatgaaccagatcgtagaagactaaaa
gtgatgaatgccaaaacggccaaaggaagaacttttatggataatgtttatggttatgat
aaagtaaataatattctgagcctgaaaaataacgcgcctgtgcctgctgcaaatctgatg
ggtgggtcttcagaatatgcttatgattatgatgatatgtaccaacttaaagaagctact
ggcttatttaagggcagtaatagtcagcatcgttattcactaactatggattataataca
gtaggtggaattaccaaaaaagttcaaaagcatgaacgaagtggtggtagttccggaaat
gcgtggacagagcagaaaaaaactacctatgctagtgattatacttatggagaaagtcag
ccgcatacgcctgtgcatataggtcggcaaacctatagttatgatgcaaatggtaatcag
actggttgggaggatgataagagcggacaacgtcggaagatattctgggatgaagagaac
cgtgtaagagcagtgatggataatggtgctacttatcattatgtgtatgatgcctcgggt
gagcgcgtattgaaaggacagagccaaggacaaacagcttttgtaaatggtgaaagaaaa
gccggctcgggtcaaatgggtaattatacagtttatgtaaacccatatattgtgctaaaa
agtggtggttataccaagcattattacattgagggtcaacgcattttgagtaagctaggt
ggtggttgggataataaagggaaaggtcctttaaaggcaggaggagattcacttaactat
acgaataagaagcaggcaatggagcagggtattgtgaaaaaccttaaatttttgggtatg
gacggtcagattttaacagctggcaaaagtggtaaaattcctcctggccaaattaacggc
accggaaacgcaaccgaatcttttcaatattatttccatcctgatcatttaggaagtact
tcttacatttcagatgctgccggagaaatatatcagcatttagaatattttgctttcgga
gaaacttttgtagaagaacatagtaatactaacagggtaccttatttatttaatggaaaa
gagttagatgaagaaaccggactgtattattatgggtcgaggtatatggatccaaaaact
tctttatggttgtcaattgacaggtatacagaaaaatatcccggttttagtggttattct
tattgtttgaataacccagtgatagttactgacccaacgggtgatactacacatttggtg
gtgtatggagcggggtatctaaactatacaactgcaggtggaggccatgatgttggtaaa
ggatttcaattgaacgcggaagcgcttaaaaagaaaattgaaagtagtccaacttttgat
ccggccagggatgcagttattcttgtttatgctccatcttcttcaagatttatcagtgct
gtaaataaaaaatacaaatcgggtaaaattggtagtctcactgtatttagtcatggatat
ggatttagtgataacaatggaaccaacacgggaggagtgagcttgggtggagaaaaacca
aatgaacgacgttcagatggaacaactacaagtcaggcggatgcagatgcgcagaaaaac
aattatgatttaagagagatcaacggtaataatgtgatgagatttgataaatcaaacttt
gaaaaatcggccgtggctactttttacggatgctggataggaggagaccaatcttggagt
gatgcacagattcggagtttttcatttggtcaaaaactcgcagacaatatgggaattacc
gtaaaggcattaacaagtagtggactctttaaaactaacagtagtggtaaagttatctat
gacggtacgatgattagagctattgatgcaaaatcgcaaaaaacgagactttctacattc
cgtccatattcagtaccttcaatcattagaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
