Solitalea canadensis: Solca_2307
Help
Entry
Solca_2307 CDS
T02084
Name
(GenBank) TonB-linked outer membrane protein, SusC/RagA family
KO
K21573
TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
scn
Solitalea canadensis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
scn00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
scn02000
]
Solca_2307
Transporters [BR:
scn02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
Solca_2307
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Plug
TonB_dep_Rec_b-barrel
CarbopepD_reg_2
CarboxypepD_reg
PEGA
OMP_b-brl_3
EMC7_beta-sandw
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFD07349
UniProt:
H8KR82
LinkDB
All DBs
Position
complement(2715660..2718635)
Genome browser
AA seq
991 aa
AA seq
DB search
MRKLYLLKYGATLCMLLVSLITFAQTGTLTGRVFDDTNLPMPFAGVTIKGTKLSTGTNVD
GIFKFTGLPLGQHTVVVNSMGFEVLEKTINVTANTNITLYLKASATSLNEVVVIGYGTKK
KDDLTGAVGTLSNKEFNAGAVNSVQEAISGRIAGVTVTSISGAPGNTSTIRIRGGASLNA
SNDPLIIIDNVPVDNTPIGGSPNILSSINPNDVENVTVLKDASATAIYGSRASNGVILIT
TKKGGEKFKVTYGLTTSLATVPNKVAVYTGDEFRALVNKIYAGQQPVLSLLGTANTDWQD
AIYQNAFGQDHNVGVSGTWKKMPYRVSLGYNNTDGTLKTYNFERTTLAINANPTFLKNSL
KLNFNVKGMYNNNNFADQGAIGNAVYYDPTKPVYNGNERWRGFTTWTQDNTLNGNPVPLA
TPNPVAQLELTDNTSTVKRSIGNAQADYQFPFLKELRANLNLGYDYTISQGHNNVKDSTQ
WVNSPAVSGGRINPYEERRRNQLLDFYLNYSKEVKSIQSKIDVMGGYSWSHFYREGADSS
MNVTKTAKGEPNIYSSEYYLVSFFGRLNYTFKDKYLVTFTLRDDATSRFDADNRWGLFPS
VAVAWKINDDFFKNNKTISDLKLRVGYGTTGQQDLNNGNNYPYLAKYTISDNTSRYQFGN
SFYNTLRPDGYDANIKWESTNTANIGLDYGFLDNRITGTLDFYQKKTNDLLSIVDVPAGT
NFSARVLTNVGDMENKGVEFTLNAKILTKSALKWNVNYNISYNKNEITNLSLTGDPNYQV
LVGGIAGTTSGTIQVQKVGYPVNSYFVYEQVYDRDGKPMEDVYVDRNNDGIINSSDLYVF
KKPDATVLMGIGTNLSYKRWDFSAFGRLSLGNYNYNNVAANSTYRGFYSTLGYLSNQTMS
ASDTRFMTALKTNTSDYYIQDASYFRLDNISLGYRLPALWNNKVNLRINANVQNVFVITN
YDGLDPEISGGLDNNFYPRSRTFQLGVNCDF
NT seq
2976 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagaaaactctacttacttaagtacggtgctaccttgtgtatgttattagtttcgctg
ataacatttgcacagacaggaacactcaccggtcgtgtttttgacgacacgaatctgcca
atgccttttgccggggtaaccataaaaggcaccaaattatctacgggaaccaatgtagac
ggtatttttaaatttacaggattaccacttgggcaacacacggtagtggttaattcaatg
ggatttgaagttttagaaaaaacaatcaatgtaacggctaataccaatatcacactttat
ttaaaagcctctgcaacttcattgaatgaggtagttgttattggttatggaacaaagaaa
aaagatgaccttaccggagcggtagggacgctttctaataaagagtttaatgctggtgca
gtaaattctgttcaggaggcgatttctggacgtattgcgggtgttaccgtaacctcaatc
agtggagcacctggtaatacatcaactatccgtattcgaggtggagcttctttaaatgct
agcaatgatccgctgatcattattgataacgttccggttgataacactccgatcggaggt
tctcctaacattttatcatccataaatcctaacgatgtggaaaatgtaaccgttcttaaa
gatgcttctgctacagctatttacggttcacgagcatcaaacggtgttatcttgatcacc
actaaaaaaggtggcgaaaaatttaaagttacttacggattaacaacatcattggcaact
gttccaaataaagtggcagtttatacaggagatgaatttagagctttggttaataaaatt
tatgctggtcagcagcctgtattgtcacttttaggaactgccaataccgattggcaagat
gctatttatcaaaatgcgtttggtcaggatcataacgtaggcgtttcaggaacctggaag
aaaatgccttatcgtgtttcattaggttataataataccgatggaacgctgaaaacgtac
aattttgaaagaacaactttagcaattaatgcaaatccaacattccttaaaaactccttg
aaactcaatttcaacgtaaagggaatgtataacaataacaatttcgctgatcagggagca
attggtaatgctgtatactacgatccaacaaagcctgtatacaatggcaatgaacgttgg
agaggtttcaccacctggacgcaggataataccttgaatggcaaccctgttcctttggca
acaccaaaccctgttgcacagttagaattaacagataatacatcaactgttaaaagaagt
attggaaatgcccaagcagattaccagtttccattcttaaaggaattacgtgctaacctt
aacttaggttatgactatacgatatctcaaggtcataataacgttaaggacagtacacaa
tgggtaaattctcctgccgtttcaggaggtagaattaatccatatgaagaaagacgccgc
aatcagttattggatttctaccttaattactcaaaagaggtaaagagtatccaaagtaag
attgacgtgatgggcggttattcgtggtcgcacttttatagagaaggtgcagattcgagc
atgaacgttactaaaaccgctaagggcgagcctaatatctacagttctgagtattacctg
gtttctttcttcggccgtttaaactatacgtttaaagataaatatttggtaacctttacc
ttgcgtgatgatgcgacttctcgttttgatgcagataaccgttggggcttgttcccatca
gttgctgttgcctggaagatcaatgatgatttctttaaaaataacaaaaccatctcagac
cttaagctgcgtgttgggtacggtacaaccggacaacaagatttaaataacggcaataat
tatccttatttggctaaatacacgatcagtgataatacctcacgttaccagttcgggaat
tcattttacaacaccttacgtccggatggttatgatgcaaacattaaatgggaatctacc
aatacagccaacatcggtttagattatggattccttgataaccgcatcaccggtacttta
gatttctatcagaaaaaaacgaacgatctgctaagcattgtggatgtgccagcaggaacc
aacttctcagcccgtgtgcttaccaatgttggggacatggaaaacaaaggagttgaattc
actttaaatgcaaaaatacttacaaaatctgctttgaaatggaatgtgaattataacatt
tcttacaataagaacgaaatcaccaacctgagtttaacaggtgatccaaactatcaagta
ttggtaggaggaattgccggaaccacttccggaacaattcaggtacagaaagtaggctat
cctgttaactcctactttgtgtatgaacaagtgtacgatcgtgatggaaaacctatggaa
gatgtgtatgtagaccgtaacaatgatggtatcatcaacagcagcgatctgtatgtattc
aaaaagccggacgcaacagtattgatgggtatcggaaccaatttatcttacaaacgttgg
gatttctcagcattcggaagattaagcttgggtaactacaattacaataacgtagcggct
aacagcacctacagaggattttattcaacactgggttatttaagcaaccagactatgtcg
gcctcagatacccgtttcatgactgcattgaaaaccaatacatcagattattatatccag
gatgcctcttacttccgtttggacaatatcagcttgggttaccgcctgccagctttatgg
aataacaaagtgaacctgagaattaatgccaatgtgcagaatgtattcgtgatcactaat
tatgacggcttggatcctgagatcagtggaggtttggataataacttctacccacgttca
aggacattccaattaggtgttaactgtgatttttaa
DBGET
integrated database retrieval system