Solitalea canadensis: Solca_3029
Help
Entry
Solca_3029 CDS
T02084
Name
(GenBank) protein of unknown function DUF11
KO
K21449
trimeric autotransporter adhesin
Organism
scn
Solitalea canadensis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
scn00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
scn02000
]
Solca_3029
Transporters [BR:
scn02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
Solca_3029
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
CHU_C
CarboxypepD_reg
CLIPPER
NOMO1-like_2nd
DUF7619
CarbopepD_reg_2
Chlam_OMP6
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFD08048
UniProt:
H8KSE0
LinkDB
All DBs
Position
complement(3560770..3567594)
Genome browser
AA seq
2274 aa
AA seq
DB search
MIAHLLKNCNCLKRFQLRKRLFRFLPLLMLLLFATNQKTLAQGDLNIQGKMSSSVDDQYF
HFNWWGFARYDTDGKVWCDNVDSENSHILKTWSGTSPGWAGFDSGSLSSASAGAGNGAIQ
LGPSMPYTIVFKYETGSNSTGCNLHWGYSSFSGTTAKIKAPVNLLASFQTSPNYSVKLTW
NKGTSIDNNNIQYLIKRNGTEIARASGGSVEFVDTGILPGMGYSYTVQTIVGPNAPGDWI
RDVSDAVSTTISSQSFQLTATQTDVGRIKLTWPTLSSIKGLERIAIFRDGEVITELTKTT
KTYNDPDVMPGMYYSYRLGLIEDEDPNTPAIDVNNWTSNIAKGRSLPKGKISGYVKGKTN
GGVPGVEITVTSKTNLSDKETAQTYSYTTTSGADGYYEISNIFFAASAEYIVKPKMPGYD
KPRFDPDSLIRKLDIDNFNQSQVNFSDTASFAISGKVYFSSLIDSNGVSIKLPLKDAEIW
VDGKNTQTKTSPDGSYSTTIINGGVYTVEAKFKNHTIKAVGEIVSSKRVSVYSLVNGVDF
EDLTTDTLNIHVAASCDAFIGEYALVKLTSAVAGVTPTGDKLIYGKPIKISSKAFSRGTT
FGQKEPGITSLILPATQFNVQVVEVRELNGINSNKLEYFTREYNVQSADLGKRDTIDGKA
VIRQADFIYHKDLEVLLNNGNDIFSEKKKFRPTGQDKFLVAQNDKYPVNIKIRETYEYDG
VQYNCALDTGTVYIYDAISDSTDRQELKMDSGFVKYFVKVGQPVLEAPYEKSIQFVGKVG
GRQTSVIVKAVVEGERPRRETFVTKTPEIPFFVLHDPPGDKSFSKISKGTTISTTSTTQY
GGGAGGGAYADVKTGKGVVLPIIGKIGAAIQIQSEVEAGADKNSGTTTNRTITFTEDFST
SGEETLVGNEGDLYVGASLNMTYALTDKLYYNESKQDMDRDTSLAVNNDGFNTTFLYTEK
HIKNTLLAQLSTLYSISKSDYDVAYQKVKSGDNSISNEVLEKMNQQQLEYKANIDAWKSA
LVKNEANRKNAKDRKLPDGVKGVVGGNISFSSGAIYDNTISIDADTTTFDEVSVYLNGYV
KVGISMHGGEANETNAGGLVTFRFNHSKNKENSTTTSTTTSYHLEDNDIGDFFSVGLAED
QVYGTPVFKTVSGSSSCPHENNTQFRHLPAMQIAGVSEQRNVPSDKPAKFEILISNRSES
DETVEYAIKLDPLSNLDGAKVLVGGQDVTNKAATYYIPTGKSFKLPVEVYRGPLTSTYEN
LTLVIFSTCDNTLDDISEFDTLAKPKVKFNAYFQNRCSDVDLFVPGDNWVVNQSNNNQLF
VAFSKYDASESSPLTTVGLQYRKINTDYENGLWQTVITVPKANLKDKYYDYTFDVSGLPD
GNYELRAIAICQGVDVNYSPVYKGKIDRKSAVAFGVPSPKNGILTVADIIGITFNKDIVY
ADISNPVKVTLKRKDNGQLIPATFLSDGKNFEIRTIPANAINDYENVELIATIKNLTDVI
GNKVADSISWSFVVNLSPVYWSPANITINAIENQQTSFGAKLINKSGTPQNFSLIKYPEW
LRPTIKSSKIVAQGQENIDFELNKNLNTGTYADTVIALIDGKRQFLYVKVNVSKTPPVWT
VNPSAFKYNMAVTAQFSLNQTDTLTSKDIRDKIGVFVGNECRGIAPIEYDSDANKYIAYI
TAYSNTAGEELTIRFWDAYPGVEYQGKELLSFVANGTIGNLTNPIILHPEGVIQTIPLKK
GWTWISLNVENSDMSLKKILSSLKPTEGDIIKTLSNNNTYSQYSSKLGWVGTFDKINLYN
SYMIYVAKPDTLRVLGNFMTQPANVVLNKGWNWTGYPMAINMELGTYLKNFNPSDGLKVV
SQEEFAQYNAVTKTWSGSLKYLRPGKGYKIYSGTDTFTIPVIPYAPNPGEDQGNIQTAPV
YNPAAPTIINNNNTTVTSTVYQNTSVNTVNYENNMSVTSVINQGGQIINNTNNRYETYVY
VENKLVNIVNQVVLPDGKSVGFIPVNGDKTDDGKTVEIKVYDKVEKKEYTAKVEEPLKQQ
GDQITGNIDHPVILVLEGNADLKVENIVESSEVNKGENFNYIIRIKNVGKDLAVNAILKD
TLDASINYISSSFANTSFNDVENVMEIQLAKLEAEAEQEIILVLKANKIGDTYLGKGNIV
VNNDVNLSNNSLKPQSLRVIDNRSNSAKLLIPSLFTPNGDGINDLFEIVGVNEFYASNTL
IIFNKAYNQIFKKDNYQNDWTGDNLPMGSYGYILKVKGKDGVEQVFKGYITIVY
NT seq
6825 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattgcacatttacttaaaaattgtaattgccttaaacggtttcaattaaggaagcga
ctatttcgttttcttcctttacttatgttactgcttttcgcaacaaatcagaaaacatta
gctcaaggtgacctgaatattcagggtaaaatgtcgagctctgtagatgatcaatatttt
cacttcaactggtggggctttgcgcgttacgataccgacggtaaggtgtggtgtgataat
gtagatagtgagaacagtcacattttgaaaacttggtctggaacgtctcccggatgggcc
ggttttgatagtggttcattaagttctgcttctgccggagccggaaacggggctatacaa
ttaggcccaagtatgccgtatacaatcgttttcaaatacgaaaccggaagtaactctacc
ggttgtaatttgcattgggggtattcatctttttcgggaacaaccgctaaaatcaaagcg
ccagtcaacctgttagcttcctttcaaacttcaccaaattattccgttaaactgacttgg
aataaaggtacgtctatcgataacaataacatccaatacctcattaagcgtaatggaacc
gagattgccagagcgagtggtggatctgttgagtttgttgacaccgggattttgccaggg
atgggttattcttatacggttcaaacaattgttggtcctaatgctcccggagattggatt
agagatgtttcagatgctgtttctacaacaatctcttcccaatcatttcagttaacggca
acccaaacagatgttggtagaataaagttaacatggccaacgctaagtagtattaaggga
ttagagcgcattgctatttttagggatggtgaagtaataactgagcttactaaaacaaca
aaaacttataatgatccggatgttatgccaggcatgtattattcctatcgcttgggttta
attgaggatgaagatcctaatacaccagcaattgatgttaacaactggacatccaatatt
gccaaggggagaagtttacccaaagggaaaataagcggttatgttaaaggaaagactaat
ggtggtgtaccaggagtagaaattacagtaacctctaaaaccaacttgtctgataaagaa
acagctcaaacctattcttatacaacaacatcaggggctgatggctattatgaaattagc
aatatcttttttgcagcatctgctgaatatattgtaaaacctaaaatgcctggttacgat
aagcctcggtttgatccggacagcctaattcgtaaactagatattgataactttaatcaa
agccaggtaaatttctctgacacagcttcctttgcaattagtggaaaggtttatttttcg
agtttgatagattcaaatggagtaagtattaaacttccattgaaggatgcagaaatatgg
gtagatggtaaaaatacgcaaacaaaaaccagtcctgatggtagctatagcactacaatt
ataaatggaggtgtttatacagttgaagcaaagtttaagaatcatactataaaagcagtt
ggagaaatagtaagcagtaaaagagtaagcgtttatagtttggttaatggagttgacttt
gaagatttaacaacagataccttaaatatacatgtagcagcaagttgtgatgcctttatt
ggtgagtatgcgttggtaaagttgacttccgcagttgctggtgtaacacctacaggagat
aagctgatttatggaaaacccattaagattagttcaaaagccttttcgagaggaactaca
ttcggccaaaaggaaccgggcataacctctttaattttacctgcaacccagtttaatgtt
caggtagtagaggtaagggagctcaatgggattaatagcaataagcttgaatattttaca
cgtgagtacaatgtacaaagtgcagatttaggaaaaagagataccattgatggaaaagca
gtaattagacaagctgattttatttatcataaagaccttgaggttctattaaataacggt
aatgacatcttctctgagaaaaagaaattcaggccaactggtcaggataaatttttagtg
gctcaaaatgataagtacccggtaaacattaaaataagagaaacttatgagtatgatggc
gttcaatacaattgtgcacttgataccggtaccgtatatatttatgatgctatttctgat
agtactgatcgccaggagttaaaaatggattctgggtttgtaaagtactttgtcaaagtc
ggacaacctgtattagaagctccttatgaaaaatcaattcaatttgtaggtaaggttgga
ggccgacaaacaagtgttattgtaaaagctgttgttgaaggtgaaagaccccgacgagaa
acttttgttacaaaaactcctgaaataccattctttgtattacatgatcctccgggagat
aaatccttttcaaaaatatctaaagggacaaccatttcaaccacaagcactactcagtat
ggcggtggagcagggggaggagcttatgctgatgtaaaaactggtaaaggggtggtgtta
cctattattggtaaaataggagcagctatacagatacagagtgaagtagaagcgggggcc
gacaaaaactcaggcactactactaatagaacaattacgtttacggaagatttctctact
tcaggagaggaaacattggttggcaatgaaggtgatttatatgtgggtgcctctcttaat
atgacttatgctttaacggataagttatactacaatgaatccaaacaagatatggataga
gatacctcattagctgtaaataatgatggtttcaataccactttcttatacaccgagaaa
catattaaaaatactttactggcacaactgagtacgctttatagtatttcaaaatcagat
tatgatgtagcttaccagaaagtgaaaagtggagacaacagtattagtaatgaagtgttg
gagaaaatgaaccaacagcagttggagtataaagctaatattgatgcctggaagtccgcc
ttagtaaaaaatgaagcaaacagaaaaaatgctaaggatcgaaaactgcctgatggggtg
aagggtgttgttggaggtaatatttcttttagttctggtgcgatctatgataatacgata
agcattgatgctgatactacaacgtttgatgaagtttcagtttaccttaatggatatgtt
aaagtaggtatttcaatgcatggaggtgaggcaaatgaaactaatgccggagggttagtc
acttttaggtttaaccatagcaagaataaggaaaacagtactaccaccagcaccacaacc
agttatcatttagaagataatgatataggtgatttcttctcagtaggattagcagaggat
caggtttatggaacccctgtttttaaaaccgtttcgggctcttcaagctgtcctcatgaa
aataatacgcagttcaggcatttacctgcaatgcaaattgccggtgtgagtgaacagcga
aatgttccttctgataaacctgcgaaatttgaaattctaatttctaacagaagcgaaagt
gatgaaactgttgagtatgccattaaattagatccattatctaatctggatggagcaaaa
gttttagtgggtggtcaggatgtaaccaataaggcagctacttattatattccaacaggc
aaaagctttaaacttcctgttgaggtgtatagaggtccgttaacaagcacttatgaaaat
ctaacattggtaattttctcaacttgtgataacaccttagatgatatttcagaatttgat
acactagctaaaccaaaagttaaatttaacgcctatttccaaaatagatgcagtgatgtt
gatctctttgtgcctggagataattgggtggtaaatcagtcaaacaataatcaattattt
gttgcctttagtaagtatgatgcctcagaatcatcgccacttaccaccgtgggtttgcag
taccgcaaaataaatactgattatgaaaatggattatggcaaactgttattactgttcct
aaagctaatttaaaagacaagtattatgattatacattcgatgttagcggattgccggat
ggtaattatgagctaagagcaatcgctatttgccagggtgtggatgtaaattattcacca
gtgtataagggcaaaatagatcgaaagtcggccgtagcatttggtgtaccaagtccgaag
aatggaatattaacggtagccgatattatcggaataacctttaataaagatatcgtgtat
gcagatatttcaaatccggtgaaggtcacactgaagcgtaaagataatggtcagcttatt
cctgctacttttttaagtgacggtaaaaactttgagatcaggactattcccgccaatgca
attaacgattatgaaaatgttgaactgattgcaaccattaagaatttaaccgatgtaata
ggaaataaagtggcagacagcataagctggagctttgtagtcaatttaagtcctgtttat
tggtcgcccgctaacattacaatcaatgcaatagaaaaccagcaaactagttttggagct
aagttgataaacaaatcgggcacaccccaaaacttttcattaattaaataccccgaatgg
ctgcgtccaacaattaaatcaagcaaaattgtggcacagggtcaggaaaacatcgacttt
gagttgaacaaaaatcttaataccggaacttatgcagatacagttattgcattaattgat
ggtaaaagacagttcctgtatgtaaaagtaaatgtttcgaaaactccccctgtctggacg
gtgaatccttccgcgttcaaatacaatatggccgtgactgcccagtttagtcttaatcaa
actgatacgcttacttcaaaagacattagagacaaaataggtgttttcgtaggaaatgaa
tgtagaggcatcgcacctatagaatatgatagcgatgcaaataaatacatcgcgtatatt
actgcttattcgaatacagcaggagaggagctaactattcgtttttgggatgcttaccca
ggagttgagtatcaaggcaaggaactactttcctttgtggccaatggtacaataggtaat
ttaacaaaccccatcattctacatccggaaggcgtaattcaaacaattcctttaaagaaa
ggttggacctggatttcattaaatgtggagaactcggatatgagtttgaaaaagatttta
agctcattgaagcccacagaaggtgatattattaaaacactcagcaataataatacatac
agtcagtattcatcaaaattaggttgggttggaacgttcgataaaatcaacttatataat
agttatatgatttatgtagctaaacctgatacattacgagtgctgggtaatttcatgact
caaccggccaacgtggtattaaataaaggttggaactggacaggatatcctatggctata
aatatggaattgggtacatacttgaaaaattttaacccatcagacggattaaaggtagtt
agtcaggaggaatttgctcaatataatgcggtaaccaaaacatggtcgggtagtttgaaa
tatttacgaccaggcaaagggtacaagatttacagtggaaccgacacctttactattcca
gttattccatatgctccaaatccaggcgaagatcaaggaaatatccagacggccccagtt
tataatccagcagcgccaacgatcatcaataataacaatacaacagttaccagtacagtt
tatcaaaatacatcggtaaatacggttaattatgaaaataacatgtcggttacctcggtg
ataaatcaaggtggacagattataaacaacaccaacaaccgctatgaaacttatgtatat
gtagaaaataaactggtaaatattgtaaaccaagttgtgctgccggatggaaaatcggtt
ggatttattccggtgaatggtgataaaacagatgatggcaaaacagtggaaattaaggtt
tatgataaagtggaaaagaaagagtacacagccaaagtagaagaacctctaaaacagcaa
ggagatcaaatcaccggaaatattgaccatcctgtaatattagtattagaaggaaatgca
gatttgaaggtggaaaatatagttgaatcttcggaagtaaataagggtgaaaactttaac
tacatcattaggattaaaaatgtaggtaaagatctagctgttaatgcaatcttgaaagat
acacttgacgcaagcattaattacatatcgtcttcatttgctaatacctcttttaacgat
gtcgagaatgttatggagattcaactggcaaaattagaagcagaggctgaacaggagatc
attctagtgttgaaggcgaacaagataggtgatacatacctcggtaaaggaaatatagtt
gttaataatgatgtaaaccttagtaataactcactgaaacctcaatcactaagggtgatt
gataaccgatcaaatagtgctaagctattgataccttctttgtttactccaaatggagat
ggcataaatgatctgtttgaaattgttggagtgaatgagttttatgcatctaatacctta
atcatttttaataaagcctataaccagatttttaagaaggataattatcagaatgattgg
actggcgataatttaccaatgggttcatatggctacattcttaaggttaaaggcaaggat
ggagttgaacaggtatttaagggatatataacaattgtttattaa
DBGET
integrated database retrieval system