Solitalea canadensis: Solca_3419
Help
Entry
Solca_3419 CDS
T02084
Name
(GenBank) TonB-linked outer membrane protein, SusC/RagA family
KO
K21573
TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
scn
Solitalea canadensis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
scn00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
scn02000
]
Solca_3419
Transporters [BR:
scn02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
Solca_3419
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CarbopepD_reg_2
CarboxypepD_reg
Plug
STN
FecR_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFD08426
UniProt:
H8KX97
LinkDB
All DBs
Position
complement(4027129..4030671)
Genome browser
AA seq
1180 aa
AA seq
DB search
MVAFATIMGWLCVLVFNPKQFKYMKKTFTKLIWETMRLSVIVVSIVMMTFGVLKAEKSWG
QMLKDRKVSINIESGSLESAIRRIETTSKIGFAYDYDLLKNIKVAPHRFFNESLDQILDA
LLSSNGLTFSVKNNTILIVKAPKENNKVTGFIKGRVVENSSDGTPIPGVTVRIDGSSMAS
STDADGNYKLSLSPGKYRLVFSFVGFDTRVVDNVVVEDGKVREINISMKPSIAYLQEAVV
VGYGVQEKRNLTGAIGTYKPLEEVGKVPMTIDNALIGKIAGVQVAPSSGIPGSASAIIIR
GVSTLNKNGNTPLVVVDGVPVYSIDRNNNTTDFSGAKAPQFTFGGTGVNENYKNGAESSF
ENNPLASINPDDIESIEVLKDAYATAIYGSRGAAGVILITTKKGKSGKMKVDFSLSSSVS
DPVKTPSMMDGDQYAEFYTSYLKAKNPASTVVFPKGISTNWLDQVTRIALGTNAALAISG
GSDNMIYSISGGFDNQQSYIVNNDFSRYQGRVNLEGNLSKSIKIGTNIGMSYVDNNALNT
QRIYRNAVLRAPNTPIMDGQGKYVWRYGSNPQGVNEDTNPVAWANTGKNSRIDTRVLGNI
YADIKFASWVTWHTDFGVDWIDGKAYSREADKISTREGMAVSTTNNNRRWVISNELRINK
VLNYKHAFNATLGQSFESSVEGINSVVGEGFQSDDILSINAATTKKVTNSLDQKWALVSY
FGRLNYQFNNRYLAGVTYRLDGSSKFGKNHRYVGFPSFSLGWIPSEETFMKDVNWIDQLK
FRGSLGFTGNDGGTGYYGNQGTYKPSSYSATYGTLSPLEVTSPNNPNLEWETTTMIDVGM
DLTLLRSRVTLGVDYYKKDTRNSIVSSPLPSFMGFSNQQQNLADLTNKGWELTVNSQNIQ
GKKFGWFTTFNISRNSNTINKLHAIDPEQNARDIELNGGRYWMPGASATSFYMYEWGGVN
SETGNPAWIDKDGNKGDKPIPVAYTTNPNSQRKVLGDALPKFFGGLGNTFIYKGFELNAF
LSFSYGNKLFNGAKASMMNYTEGTMTGINAVNLSTDMLAYWKNAGDQTEIPSLVNPSNNV
GGFGSSTDYTQGRYTSRFLEDASYIKLRSLTLAYTLKKKWASNLYRVKVFVEGNNLFTIT
KYTGLDPEVSAFGSSALNTGYDELTLPPMRTFRLGLQVGL
NT seq
3543 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggttgctttcgcaactataatgggatggctttgtgttttagtgttcaacccaaaacag
ttcaaatatatgaagaaaacgtttacaaagctaatctgggaaactatgaggctcagtgta
attgtagtaagcattgttatgatgaccttcggagtgctcaaagctgaaaaaagctggggc
caaatgctgaaggatcgaaaagtaagtattaacattgaaagtggatctctcgaatctgct
atcaggcgtatcgaaactacgagtaagatcgggtttgcatacgattacgatttgttaaaa
aatattaaagtagcgccgcaccgcttctttaatgagtcattagatcagattttagatgcc
cttttatcctcaaacggtttaactttttcagtaaagaacaataccattctgattgtcaaa
gcaccgaaggaaaataataaagtaacaggttttattaagggccgagttgtagaaaattct
tcagatggcacaccaattcctggagtaaccgtgcgtattgatggttcttcaatggcttcc
tcaacagatgccgatggtaactataaattgagtttatctcctggtaagtatcgtttagta
ttttcatttgttggtttcgatacccgtgtagttgataatgtggtagtagaagatggcaaa
gttcgcgagataaacatcagtatgaaaccttctattgcttacctgcaagaagcagtggtt
gtaggttacggtgttcaagaaaagcgtaatcttacaggtgctattggtacctataaacct
ctggaagaggttggtaaagtgccaatgacaatcgataatgcacttattggtaaaatcgcc
ggtgttcaggttgctccatcgtcaggtatacccggaagcgcttctgcaattattattcgc
ggtgtaagtacgttgaataaaaatggcaatactccattggtagttgttgatggagttccg
gtttacagcatcgaccgtaataataataccaccgattttagtggcgcaaaagctcctcaa
tttacgtttggaggcacgggtgtaaatgaaaattataaaaatggtgcagaaagctctttt
gagaataatcctttggcaagtattaacccggacgatattgaatccattgaggtattgaaa
gatgcttatgcaacggccatttatggttctcgtggcgcggcaggtgtaattttaattact
actaaaaaaggtaagagcggtaaaatgaaagttgatttctctttatcatcttcagttagt
gatcctgtaaaaacaccttcaatgatggatggtgatcaatacgccgagttttataccagt
tatttaaaggctaagaatccggcttcgacagttgtttttccgaaaggaataagtaccaac
tggctggatcaagttacccgtatagcattaggaactaacgctgccctggcaatatcaggt
ggttctgataatatgatctactctattagcggtggttttgacaaccaacaaagttatatc
gttaataatgattttagccgatatcaaggtcgcgtgaatttggagggtaatctttcaaaa
agcataaagatcggtaccaatatagggatgtcttatgttgataataatgcattaaacaca
caacgtatttatcgtaatgctgtattgcgggctccaaatacaccaattatggatggacaa
ggtaaatatgtatggcgttacggcagtaaccctcaaggtgttaatgaggatactaatcct
gtggcctgggccaatacaggcaaaaatagtcgtatcgatacacgtgtgcttggaaatatt
tatgcggatatcaaatttgcatcttgggttacctggcataccgattttggtgtagactgg
atcgatggaaaggcttattctcgtgaagctgataaaattagcactcgtgaaggaatggcg
gtttcgacgacaaataataatcgtcgctgggtaattagtaatgagttacgcattaataaa
gtgcttaactacaaacatgcatttaatgctacacttggacaatcattcgaatcatctgtt
gaaggtataaatagtgtagtaggagaaggttttcagagtgatgatattttaagtataaat
gccgcgacaaccaaaaaagtaaccaattcattagatcaaaaatgggcattggtatcgtat
ttcggtcgtttgaattatcaattcaataatcgttacctggcgggagtaacttatcgtttg
gatggctcctctaaatttggaaagaatcatcgttatgtaggtttcccctctttctcttta
ggatggatacctagtgaagaaactttcatgaaagatgttaactggattgatcaacttaag
ttccgtggtagtttaggatttaccggaaatgatggcggaacaggatattacggtaaccag
ggaacttataaacctagttcatatagtgcaacttacggaaccttaagcccactggaagta
acctctccgaataacccgaatctggaatgggaaactactactatgattgacgtaggtatg
gatctgaccttgcttcgttcacgagttactttaggtgttgattattataaaaaggatact
cgtaactctattgttagttcacctttgccaagctttatgggcttcagcaatcaacaacaa
aatctggctgatcttaccaataaaggttgggagttgacagtaaattctcaaaacattcaa
ggcaagaaattcggatggtttaccacattcaatatttcaagaaacagcaataccattaat
aaactgcatgctattgatccggagcaaaatgctcgagatatagaacttaacggtggtcgt
tactggatgccaggcgcctcagctacttcgttctatatgtatgaatggggtggtgtaaac
agcgaaacaggtaatccggcttggatcgataaggatgggaacaaaggtgataaaccaata
ccagttgcttatacaaccaatcctaatagccaacgcaaggtattaggagacgctttgcca
aaattctttggcggattgggtaatacattcatctacaaaggatttgagttaaatgcattt
ctgtctttctcttatggaaataaactattcaacggtgcaaaagcttccatgatgaattac
acagaaggaacaatgacaggaataaatgctgttaatctttcaacagacatgttagcttat
tggaaaaatgcaggagatcaaactgaaatcccatcattggtaaatccttcaaataatgta
ggtggttttggtagttcaactgattatacacaaggacgttacacttcacgattcctggag
gatgcttcttatataaaattacgcagcttaacacttgcttatacacttaagaaaaagtgg
gcttcaaatctgtatcgtgttaaagtatttgttgaaggaaataatttattcaccattact
aaatacaccggattagatccggaagtaagtgcattcggatcatcagcgcttaatacaggt
tacgatgagttaaccttgcctccaatgcgcactttcagattaggattacaagttgggctt
taa
DBGET
integrated database retrieval system
