KEGG   Solitalea canadensis: Solca_3516
Entry
Solca_3516        CDS       T02084                                 
Name
(GenBank) outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)protein
  KO
K03286  OmpA-OmpF porin, OOP family
Organism
scn  Solitalea canadensis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:scn00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:scn02000]
    Solca_3516
Transporters [BR:scn02000]
 Other transporters
  Pores ion channels [TC:1]
   Solca_3516
SSDB
Motif
Pfam: DUF937 OmpA DUF748 BatA
Other DBs
NCBI-ProteinID: AFD08521
UniProt: H8KSH0
LinkDB
Position
complement(4145183..4146466)
AA seq 427 aa
MANIIDTLKGFVTPDLVSQASSTLGESSGSITGAFGAAFPSILAGLLNKSSDSSSMSGIF
DLIKGSAASSNILSNPSDLLSGLGTSGTAGGGLIDQGKRLLFSLFGDKTADLSTLIGGAS
GVKSSSAASILTLAAPLIMSFLGKKASDEGWGLSGLTNFLSSQKDNIVSAAPSGLGSLLG
LGSLTNLGSSISSGVRDTVNTAKTAYSTPPPTGSSNWLRNLLLAAVALLAIFFLWRSCNK
KPDTATVPTVDTVVDTAEQMVDTAAAKVSDAMAKLGNFFKKKLPNGVELNIPEFGIENKL
IAFIEDKSKPVDKTTWFSFDRLTFETGSATLKPESQEQLNNIAEILKAYSAVELKIGGYT
DNVGDAKANQKLSSDRADNVKAELVKLGIDAKRLSAEGYGDKFPVATNETEEGKAQNRRI
DLRVTKK
NT seq 1284 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggccaatattattgataccctaaaagggtttgtaacgcctgaccttgtctctcaggct
tcttctacattaggtgaatcatcaggtagtataacaggagctttcggtgctgcatttcca
agtattctggcaggtttacttaataaatcttctgattcatcatcgatgagtggaatcttt
gatctaataaaagggtcagccgcatcaagtaatattctttcaaacccttcagatctgttg
tctggcctgggtaccagtggaactgcaggaggtgggttgattgatcaaggtaaacgttta
cttttttcattatttggtgacaaaactgctgatttgtcaactcttataggaggagcatca
ggggttaaaagttcttctgctgcttcaatattgactttagctgctcctttaataatgagt
ttccttggaaaaaaagcgagtgatgagggttggggactgagcggattaactaattttttg
tcgagtcagaaagataatattgtaagtgcagctccttccggattaggtagcctgttaggt
ttgggtagcttaactaatcttggatcatcaatcagtagtggagttcgggataccgttaat
acagccaaaactgcctactcaactcctccacctactggaagttccaattggctacgtaat
ctattgttagcagctgttgccttactggcaatattctttttgtggagaagttgtaataaa
aaaccggatacagcaacagttcccactgttgataccgtggtcgatactgcagagcaaatg
gtagatacagcagctgcaaaagtatctgatgctatggctaagctgggtaatttctttaag
aaaaaattacctaatggcgttgaattgaatattccggagtttggaattgaaaataaactg
attgcttttattgaagataaaagcaagccggtagataaaaccacctggttttcttttgat
cgtttaacttttgaaacaggtagcgctacgcttaaaccagaatcccaagaacaattaaac
aatatcgcagagatactaaaagcttattcggcagttgaacttaaaattgggggctataca
gacaacgtaggcgatgctaaggcaaatcagaagttatcttctgatagggctgacaatgtt
aaagcagagcttgtaaaactaggcatagatgcaaaaagattgtcggctgaaggttatggt
gataaattccctgtggcaactaatgaaacagaggaaggcaaggctcagaacagacgtatc
gatctacgagttactaagaagtag

DBGET integrated database retrieval system