Snodgrassella communis: PYG29_07965
Help
Entry
PYG29_07965 CDS
T09364
Name
(GenBank) ligand-gated channel protein
KO
K16089
outer membrane receptor for ferrienterochelin and colicins
Organism
scom
Snodgrassella communis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
scom00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
scom02000
]
PYG29_07965
Transporters [BR:
scom02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
PYG29_07965
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
OMP_b-brl_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WMY91363
LinkDB
All DBs
Position
complement(1747850..1749829)
Genome browser
AA seq
659 aa
AA seq
DB search
MCKPVHYSFSLVLLSTLISPLYAAEAKLEDVVVTASGFKQKAKKAAASITVINAKELETK
EYHDVTDALQDVPGVVVTGGGSSKDISIRGMSSAYTMLLVDGKRVNSRGVRPNSDGPGIE
QGWMPPISAIQRIEVIRGPASALYGSDAMGGVINIITKKTAADWTASIKADATIQQHSDS
GNTLQSSVYVSGPLIEDRLGIRVSGGYSHRDEDKFVGGYKEQRMRNGDFMLSWTPDDNNT
VDLEVSRSLQNRNGKVGKTIDTAPRRGKKPTDDYTLYDRNQYSVTHRGYYENIDTQSYLQ
REENNNPSRDMHEKNTIFNTQTQFSLNKHTLSVGGRWQREELNDSGNQLTINGRRLSHLE
RDSWAIFGQDEWRIVPTFALTGAMRLDHDENYGSELTPKLYGVWTPNKQWTIKGGYSRGY
KAPALRAASDGWGQVTGGGYSNGIIVGNSNLKPEKSDNFEIGLNWDNNRNLSAGLTTYYT
KFKNKITEVRTCQGKAGSNACSWRNEYFDFISQRENVDKAVLRGVEATFGWKITPKIDWS
ANYTYTHSEQKSGQFSGKPLNEMPKNMFNTTLSWNANEKFSSWARWNFRSRTSDYLSRTS
MAIGKPSYGFVDTGLVFKPKKDVIVSGGIYNIFDKRVDQKDYGRTLDGRRYNISAQVNF
NT seq
1980 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtgcaaaccggttcattattctttttcgctggtgttactttccacgttaatatctcct
ttatatgccgcagaagctaaattggaagatgtggtagtaactgcttctggttttaaacag
aaagccaaaaaggcagctgcctcaattactgtgattaatgccaaggagctggaaacaaaa
gagtatcatgatgtgactgatgctttgcaggatgtgcccggggtagtggtgacgggtggt
ggtagttcaaaagatatcagtatccgaggtatgtctagtgcgtacacaatgctgttggtt
gatggtaaacgggtgaactcgcgcggcgttcgtcctaattccgatggtcctggtattgaa
cagggctggatgccaccgatttctgcgatacaacgtattgaggtgattcgtggtccggct
tcggctttgtatggctctgatgctatgggcggggtaattaatattattaccaagaaaacg
gcagcagactggactgcttcaattaaggcggatgcaactatacagcagcacagtgatagt
ggaaatacgttgcaaagcagtgtttatgtctcaggccctttaattgaagaccggttgggt
atccgtgtgagtggaggatattctcaccgtgatgaagacaagtttgtcggtgggtataag
gaacagcgtatgcgtaatggcgattttatgctgtcttggactccggatgataacaatact
gttgatttggaggtaagtcgcagtttgcaaaaccgcaatggtaaggtgggcaaaactatt
gatactgcaccacgcaggggaaagaaaccaactgatgactacactttgtatgatcgcaat
cagtacagtgtgacccatcgtggctattatgagaatattgatacgcagtcatatttacag
cgagaggaaaataataatccttctcgtgacatgcatgagaaaaatacgattttcaatact
caaactcagtttagcttgaataagcatacgctgagtgtcggcgggcggtggcagcgagaa
gagctaaatgattcgggtaatcagcttacgattaatggtcggcggttgagccatctggaa
cgagattcttgggctatttttgggcaggatgaatggcgtattgtgccaacttttgcgttg
actggtgcgatgcggctggatcatgatgaaaattatggttctgaattaacgccaaaacta
tatggtgtatggactccgaataaacaatggacaattaagggaggatattcacgtggttat
aaagcacccgctttacgggcagcttcagatggatgggggcaggttactggtggtggttat
tcaaatggtattattgtgggtaattcaaatctgaaaccggaaaaatcggataattttgaa
attggcttaaactgggataataatcgtaatttatctgctgggctaactacttattataca
aaatttaaaaataagataacggaagtacgcacttgtcagggtaaggccggttcgaatgcc
tgctcatggcgtaatgagtattttgattttatcagccagcgtgaaaatgtggataaggcg
gtattacgtggtgtagaagcaacgtttggctggaaaataacgccgaaaattgattggtct
gccaattatacttatacgcatagtgaacagaaaagtggccagtttagtggtaagccacta
aatgagatgccaaaaaatatgtttaatacgacgctgagctggaatgccaatgaaaagttc
tccagctgggcaagatggaatttccgtagcagaacttcggattatctgtcacggacatca
atggcgattggtaagccgtcgtatggttttgtagatacggggctggtattcaagccgaag
aaagatgtgattgtcagtggtggtatttataatatttttgataagcgggttgatcagaag
gattatggccgtactctggatggtcgccgttataatatcagtgcacaggttaacttctag
DBGET
integrated database retrieval system