Spiroplasma corruscae: SCORR_v1c03500
Help
Entry
SCORR_v1c03500 CDS
T05302
Symbol
secDF
Name
(GenBank) bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF
KO
K12257
SecD/SecF fusion protein
Organism
scou
Spiroplasma corruscae
Pathway
scou02024
Quorum sensing
scou03060
Protein export
scou03070
Bacterial secretion system
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
scou00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03060 Protein export
SCORR_v1c03500 (secDF)
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
03070 Bacterial secretion system
SCORR_v1c03500 (secDF)
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
SCORR_v1c03500 (secDF)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02044 Secretion system [BR:
scou02044
]
SCORR_v1c03500 (secDF)
Secretion system [BR:
scou02044
]
Sec (secretion) system
Prokaryotic Sec-SRP core components
SCORR_v1c03500 (secDF)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SecD_SecF_C
Cep57_CLD_2
Rx_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ASP28124
UniProt:
A0A222EP87
LinkDB
All DBs
Position
397490..401194
Genome browser
AA seq
1234 aa
AA seq
DB search
MINVNNNNKKKNFKKSTIFKFFTLFIILSSLILSIFFSSLFFSEKYKLGSDFKGYYSALV
SVNNINSDNTTDNQPNGDAKEAAKVLNDRLNPMGSNQIIIETAGKNFLKVMSPIDIYDSE
TVFENQIQRNGGIVLLNSDNKDLQISGEDDKVTRKGITDYFSSASSTTITARSAKEPAIS
YDLNGDNFTSLFPSDETNATPLNLKIMIDADGFFNDIRNYYKLVSGEMKDRVSNFFDIII
TPLRDAYKTADDDTKAILYDLFYGRWRTTTSGGVNDYSYDSIISNDSITKDVFLNDIVDS
FTYESDTSKYVYDANAKTEDFTNDDGKYKNPIKIYKANQGHNLIDFKRIDKSFSLLSTSL
INFYNNNKETILNKNKKYYNNMESYFLFNGSILKSGNELNEGYIKDNKLYTKVDTDSKAR
IGASLFNASGKGFVFKVNSMAVNTASVTNIMLIIGLVFIAIVTLSLLIYMCFFYRILGLF
AMVITLAIIGVTLLIITLWFGLTIGPETIIAGFIIAAISVELFSMIFENMKESYFLKQRG
IKTSFNISIKENISLMLDILVAILIPAISMFWLTSNTIQSFAIILTIGSLVTVLFGIIVG
LILFKVFLSTNIINKWPSMFALNTVAPNYNVSKLLINIKINSLKNKISKNNKNGKESLND
PLNTKLDILIKKLEEYEVKKQAKLNKTNDRYIKKLNSKLDKYNAFIQKLDKDKNAYRYQK
VEFKIRDIKYLLGNDAQQVDDEILLTSTKEKLRIKSTEKIIYTGLKTIPFISMFLIMLSI
ILGFFVGVRYDNTFGGRTEYTLWGDRIGTVYDQMNNLDDEAPTHLLDKVQALQKEFDDYN
NYNHSQTEIDFKKTEIVKEFISYSFLNIDVVNNIAHAPTNKSYKSTPFTITDGNSFSYND
TNSTLENDINWITLSVSTTDNSQSAIVKRYFANLYVSKEDESTYDSGFITKRISPSTMLD
LTIQLAYSVLALILALIIYIIIRFKWTYYVAIALSIIITPLVLSAIIIAFQVPFGNLIIV
GITTSIIFAITTAFAIFGKVRSTIASRNEKSLVTYFNKEVDYAYEIKDKKRKINHEIFLE
KQAIKIKLSERKHSREELRQYNLDFNKFVYDKKAEYKQFAKENKSLIYKVAKENNYLSEV
LAKTFKFGIKRFILMSVLFFALSLLLIIAINPIVYFGISIILGVLISNLVVLFISLPVFI
YLEKVRIRNNLARKRFINKLVVSNEEQIIEGLND
NT seq
3705 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgattaacgtgaataacaataataagaaaaaaaactttaaaaaatctacaatattcaag
ttttttactttatttataattttatcttcattaattctttcgatttttttctcttctcta
ttcttttcagaaaaatataaattaggttctgattttaaagggtattactcggctttagta
agtgtcaataatattaatagtgataataccactgataatcaacctaacggagatgcaaaa
gaagctgctaaagttcttaatgatcgtttaaatccaatgggaagtaaccaaattattatt
gaaacagctggtaaaaacttcttgaaagtaatgtctccaattgatatttatgatagtgaa
actgtttttgaaaaccaaattcaaagaaacggtggaatagtactacttaacagcgataat
aaagatctacaaatatctggtgaagatgataaagtaacaagaaaaggtattactgattat
ttttcttcagcatcatctacaacaattactgcaaggtctgcaaaagagcccgcaatttca
tatgatttaaatggagataatttcacatctttatttccatcagacgaaacaaatgcaact
cctttaaatctaaaaattatgattgatgcagatggttttttcaatgatattcgaaactat
tacaaacttgtatctggtgaaatgaaagatagagtttcaaacttttttgatataattatt
acacctttaagagacgcttataaaactgcagatgatgacacaaaggcaattttatatgat
ttgttttatggaagatggagaacaactacttcaggtggtgttaatgactatagttatgat
tctattataagcaatgattctattactaaagatgtatttttaaacgatattgttgattca
tttacttatgaatctgatacttctaaatatgtttatgatgctaatgcaaaaacagaagat
tttactaatgatgatggtaaatataaaaacccaataaaaatttataaagccaatcaaggt
cataaccttatcgactttaaacgaattgataagagtttctcattattaagcacaagttta
ataaatttctataataataataaagaaacaattttaaataaaaataaaaaatattataac
aacatggaaagttatttcttatttaatggttcaatacttaaatcaggaaatgaactaaac
gaaggttatatcaaagataataagctttacactaaagttgatacagattcaaaagcgaga
attggtgcttcattatttaatgcatctggtaaagggtttgtatttaaagtaaatagtatg
gcagtaaatacagcctctgttacaaatataatgttgataataggtttagtttttatagcg
attgttacactatcgttactaatctatatgtgtttcttctatagaattcttggattattt
gcaatggttattaccttggcaataataggagtgactttactaataattacattatgattt
ggattaactattggtcctgaaactataattgcaggtttcataatcgcggcaataagtgtt
gaactattctcgatgatctttgagaacatgaaggaaagttacttcctaaaacaaagaggt
attaaaacaagttttaatatttctattaaggaaaatatatctttaatgcttgatatttta
gtagctatattaatacctgctattagtatgttttgattaacttctaacactattcaatca
tttgcaattatattaaccataggtagtttagtgacagtattattcggtatcattgtgggt
ctaatattatttaaagtatttttatcaacaaacataataaataagtgaccaagcatgttt
gctttaaacacagtagcgccaaattataatgtttcaaaattgcttataaatattaaaata
aatagtttaaaaaataaaatttcaaaaaataataaaaatggtaaagaatcattaaacgat
cctttaaacactaaattagatatactaataaaaaaacttgaagaatatgaagttaagaaa
caagctaaattaaataaaacaaacgatagatacattaaaaaactaaattcaaaacttgat
aaatataatgcatttattcaaaaacttgataaggataaaaatgcttatcgttatcagaaa
gtagagtttaaaattagagatataaaatacttacttggtaatgatgcgcaacaagttgat
gatgaaattttactaacttcaactaaagaaaaattaagaattaaatcaacagaaaaaatt
atttacacaggattaaaaactattccatttatctcaatgtttttaattatgttatcaatt
attttagggttctttgttggtgttagatatgataatacatttggtggtagaaccgagtac
acattatgaggagatagaataggtactgtttatgatcaaatgaacaaccttgatgatgaa
gctccaactcatttgttagataaagttcaagctttacaaaaagagtttgatgattataac
aattataatcattctcaaacagagatagattttaagaaaacagaaattgtaaaagaattt
attagttactcttttttaaatattgatgttgtaaataatattgcacatgcacctactaat
aaatcttataaatcaactccatttactataactgatggaaattcattctcttataatgat
acaaattcaacattagaaaatgatattaattgaataactttaagcgtatcaactactgat
aattctcaatctgcgattgttaaaagatattttgctaatttatatgtttctaaagaagat
gaatctacatacgattcaggatttattacaaaacgtattagtccttcaacaatgcttgat
ttaacaattcaacttgcttatagtgttttagcacttatattagctctaattatttatata
ataattagatttaagtgaacatattacgttgctattgcattgtcaataattattactcct
ttagttttaagtgcaataataatagcattccaagttcctttcggaaacttgataattgtt
ggtattacaacttcaatcatatttgcaattactacagcatttgctatttttggtaaggtt
cgtagcacaattgcatcaagaaatgaaaaatcacttgtcacttactttaataaagaagtg
gattatgcatatgaaattaaagacaaaaaacgtaaaataaatcatgaaattttcttagaa
aaacaagctattaaaattaaattaagcgaaagaaaacactcgcgtgaagaattaagacaa
tataatcttgactttaataagtttgtttatgataaaaaagcagaatacaaacagtttgca
aaagagaataaatcattgatttataaagtggctaaagaaaataactacctttcagaagta
ttggcaaaaacatttaaatttggtattaaaagattcatattaatgtcagttctattcttt
gccctatctttattattgatcattgcaattaatccaatagtttattttggaatttcaata
atattaggtgtattaatttcaaacttagttgttttatttatatcattacctgtatttata
tatcttgaaaaagttagaataagaaataatttagctagaaaaagatttattaataaatta
gttgtatcaaatgaagagcaaataatagaaggattaaacgactaa
DBGET
integrated database retrieval system