Spiroplasma corruscae: SCORR_v1c03870
Help
Entry
SCORR_v1c03870 CDS
T05302
Symbol
recD
Name
(GenBank) exodeoxyribonuclease V subunit alpha
KO
K03581
exodeoxyribonuclease V alpha subunit [EC:
3.1.11.5
]
Organism
scou
Spiroplasma corruscae
Pathway
scou03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
scou00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03440 Homologous recombination
SCORR_v1c03870 (recD)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
scou03400
]
SCORR_v1c03870 (recD)
Enzymes [BR:
scou01000
]
3. Hydrolases
3.1 Acting on ester bonds
3.1.11 Exodeoxyribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
3.1.11.5 exodeoxyribonuclease V
SCORR_v1c03870 (recD)
DNA repair and recombination proteins [BR:
scou03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
RecBC pathway proteins
SCORR_v1c03870 (recD)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
AAA_19
AAA_30
Viral_helicase1
UvrD_C_2
SH3_13
AAA_11
HHH_RecD2
SLFN-g3_helicase
UvrD_C
UvrD-helicase
AAA_22
nSTAND3
AAA_12
NPHP3_N
ABC_tran
T2SSE
AAA_29
AAA_28
cobW
NTPase_1
PIF1
AAA
AAA_16
OB_YrrC
RsgA_GTPase
NACHT
IstB_IS21
AAA_14
DEAD
AAA_18
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ASP28161
UniProt:
A0A222EP36
LinkDB
All DBs
Position
448086..450305
Genome browser
AA seq
739 aa
AA seq
DB search
MKKFKGKIYKYIFSSESGFGVALFSLFENPKKIIKIIGDISHMKKDYLYEISVQQFNDSS
RNEVNFKVINIITVKDFENDPDSLIKYLSSSLFPTIGKGLATNLVNHFKTDVINKILLNK
DSLIDIDGMNSVKAKILYDTLFELKNSFIDLFIEKNLKLDFFYKLNKNFNNYKDIEMVLK
NDFYKFAYENNLTPFSEVDKVALAFGEELLSEKRISWLVHSVVKNMLFNSGDTYTDIEKI
KSVLYKENLLDYTVPFQEIINKLVYAKNETILYFKDQKIYTKDSYEEEQCISEKLINILK
LKKDNEFDEDYVLDKIKIIEDEFKIIKKIDNFKFNKEQLNSLLSFVNNNILIITGGPGTG
KTTLIHAIVRLYEILYNKNKNDYSILAPTGRAASRIKEDSNSLYTSTIHRYLKYTGNNMF
DVNEGNPIYTNLIVIDESSILGNQLFSKLLKGVKGIEKLVLIGDINQLPSVEYGNLYEDL
IKSKKFKTEYLVANNRQSSENDIPVFANSVWNGVEDLSLKGYKNVIFDYDEDENKLLEKL
KDYYIKYCPDKLEDSITGIQVIAPMYKNNLGINNLNNYIQSFKNNSSGVKVKKGNSQFKN
NDKVIFNENNIKLMLFNGDVGYIKSITKVEEKINISLDFCLRDINVSVDLIKNLDLSYAC
SIHKTQGSEYDNVILVLDASNWSTLSFVDKRMIYTAITRAKKNLVILSNEKTFIKCASFL
RESRKTTLIEYINYKLENF
NT seq
2220 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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DBGET
integrated database retrieval system
