Streptococcus parasanguinis ATCC 15912: HMPREF0833_11438
Help
Entry
HMPREF0833_11438 CDS
T01545
Name
(GenBank) YhgE/Pip domain protein
KO
K01421
putative membrane protein
Organism
scp
Streptococcus parasanguinis ATCC 15912
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
scp00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09194 Poorly characterized
99996 General function prediction only
HMPREF0833_11438
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
ABC2_membrane_3
DUF489
T4SS_LegC2C7
Helical_needle
ABC2_membrane
SPC25_N
CCDC89
LRIM1_dimer
CEP135_TSGA10_CC
ATG14
HmpF
ODF2_C
IFT74
ODAD1_CC
EsaA_helical
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEH56469
UniProt:
F8DFK3
LinkDB
All DBs
Position
complement(1547291..1550161)
Genome browser
AA seq
956 aa
AA seq
DB search
MKISKNCIIYYIRNLDNVYKKETKNMMKEWKAVLKKPTFIIVMIGVALIPALYNIIFLSS
MWDPYGQVSDLPVAVVNKDQSATYNGQKMEIGKDMVSNLKDNDSLDFHFVDEKAAKDGLK
NGDYYMIVTLPEDLSKKASSILTNHPEQMTIDYQTSSGHSFIAGKMSDTAMTKMKQSVAE
KVTNTYTTALFSKMGSLKTGMGTVADGSAKLADGASKLEDGGQTLSTNLNTLARSSLAFS
DGATTLRTGLAAYTDGVGQLGNGLNQMAGQLPNLVSGVNQLNNGFGTFNTGLMAYATGVD
RLGNGLNQMASQTPRLASGVGQLTSGMGTLNDGLGNYTNGVRQLNSGLSNFSNGLVTYTN
GVATLSEGAGQLSSQSATLRNGVSQLESGIQTLSSQLQASTSQSAQIDQLAAGLNQLNAA
IQNASVDTSQLSSGLTSIANSAQSILASAQADRANALASVQGTAAYQAMTADQQAEINAA
ISSSPSSSETAAQGILTTIQTIQGSLNTGNSLTQLQTAANQVLPTASSTLTNLSSGLSKI
QSAVSGQLLPASQTISQGIGAYTAGVDKIANGATQLQTNSSTLTNGASQLAAGVGQLDSK
SSELLAGSNQLASGLGELNGKMPALTSGMNQLASGATQLTGKSGELVAGARKLADGVGQL
NSKTPELAGGVNKLVTGVNQLTEKSGQLVTGADKLADGANQISDGSSKLAAGGQTLTNGL
GELATGSQTLSQGLNDAKGQLNVATTEKENAKTLADPVTLSKTDRDNVPVNGVGMAPYMI
SVALFVCALSTNMIFAKLPSGRHPESRWAWFKSRFEVNGTIAVIAGVLVYGAVHLIGLSA
NHEMATLFLCVIGSVAFMSIVTALTTWQRKIGDFLSLILLLLQLASSAGTYPLALTNGFF
QAIHPFLPMSYTVSGLRQTISMTGEIGNQVAFLLMTIVLFAGLGMWFYNPKKYEED
NT seq
2871 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgaaaatttctaaaaactgtataatctattatatcagaaatttagacaatgtgtataaa
aaggagacaaaaaatatgatgaaagaatggaaggctgttcttaaaaagccaacatttatc
attgtcatgattggagttgctttgattccagctctttataatattatttttctatcttcc
atgtgggatccatatggccaggtttcggatcttcctgtagcggttgtcaataaggatcaa
tctgctacatataatggacaaaaaatggaaatcggaaaagacatggtgtccaatttgaag
gacaatgactcacttgattttcattttgtagatgagaaagctgcgaaagatggtctcaaa
aatggcgattattatatgattgtaaccctgcctgaggatctttcaaaaaaagctagctcc
atcttaaccaatcatccggaacagatgaccattgattaccaaacgtccagtggtcatagt
tttatcgcagggaaaatgagcgacactgcgatgacaaaaatgaagcagtcagtggctgaa
aaagtgaccaatacgtatacaacagctttattttccaaaatgggatcgcttaaaactggt
atggggacagtggcagatggaagtgctaaattagcagatggtgcaagtaaattggaagat
ggtggtcaaacactatctactaatttgaatacattggctcgttcaagcttagcattttca
gatggtgctactactcttcgtacaggtctagcagcctatacagatggtgttggtcaatta
ggaaatggtctcaatcaaatggctggtcaacttccaaatttggtatctggcgtcaatcaa
ttaaataatgggtttggtacttttaatacaggcttgatggcttacgctaccggagtggat
cgattaggaaatggtctcaatcaaatggcgagtcaaacccctcggttggcctcaggagtt
ggtcagttaactagtggtatggggaccctcaatgatggtcttggaaattataccaatggt
gtgcgtcaattgaattcgggtctatctaacttttcaaatggtttagtgacctatacaaat
ggagttgccactttatccgagggagcgggtcaattaagtagtcaatctgctacccttcga
aatggggtttcacaattagaatcaggtattcaaacattatcaagccagctacaagcttct
acaagccaatctgctcagattgatcaattggcagctggtttaaaccaattaaatgcggcg
attcaaaatgcttcagtagataccagtcaactttcgtctggattgacgagtattgcgaat
tcagctcaatcaatccttgcttcagcccaagcagatcgtgcaaatgcccttgcaagtgtg
caaggaacagcagcctatcaagcaatgacagctgaccaacaagcggagatcaatgcggcg
atctcatcgagcccaagctcgagtgaaacggcggctcaaggaatcttgacaacgattcaa
acgatccaaggtagtttgaatacagggaatagcttgacacaactgcaaacggcagccaat
caagttttaccgacagcttcttctaccttgacaaacttgtcaagtggcttgtctaagatc
caatccgcagttagtggacaattgttgccagctagtcaaaccatcagtcaagggatcggc
gcttatacagctggtgtcgataaaatcgctaatggagcaacccaacttcagacgaatagc
agtactttaacaaatggggctagtcagttagcagcaggtgttgggcaactagatagtaaa
tcatcagaattacttgcaggaagcaatcaattggcttctggtctaggtgagttaaatggg
aagatgcctgccttgacatcaggcatgaatcaactggcttcaggcgcgacccaattaaca
ggtaagtcgggtgaattggttgccggtgctagaaaattagctgacggtgtagggcaattg
aacagcaaaactccagagttggcaggtggtgtcaacaaacttgtcactggtgtcaatcag
ttgacagaaaaatcaggtcaattggtgactggtgctgataaactagccgacggtgcaaat
caaatctcggatgggtccagcaaattagcagcaggtggccaaacattgacaaatggttta
ggtgaattagcaacaggaagccaaaccttgagtcaaggattaaacgatgctaagggacaa
ttgaatgtggctacaactgaaaaagaaaacgctaaaaccttagcagatcctgtcactttg
tctaaaacagaccgtgacaatgtcccggtgaatggtgtcggaatggctccttatatgatc
tcggtagcactctttgtttgtgccttgtcaaccaatatgatctttgcaaaattgccatcc
ggtcgtcatcctgaaagtcgctgggcatggtttaaatctcgctttgaggtcaacggaaca
attgcggtgattgcaggagtcttggtctatggtgccgttcacttgattggtttatcagct
aatcatgagatggctactctcttcctttgtgtgattggtagtgtggccttcatgtctatc
gtgactgctttgacaacatggcaaagaaagatcggtgatttcctttccttgatcctcttg
ctcttgcaattggcttctagtgcaggaacttatcctcttgctttgacaaatggctttttc
caagccattcatccattcttgccaatgagttataccgtttctggtcttcgtcaaacgatt
tcgatgacaggagaaattggaaatcaagtggccttccttctgatgaccattgtccttttt
gcaggactaggaatgtggttctataatccaaaaaaatatgaagaggactaa
DBGET
integrated database retrieval system
