Spiroplasma culicicola: SCULI_v1c00040
Help
Entry
SCULI_v1c00040 CDS
T03047
Symbol
gyrA
Name
(GenBank) DNA gyrase subunit A
KO
K02469
DNA gyrase subunit A [EC:
5.6.2.2
]
Organism
scq
Spiroplasma culicicola
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
scq00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
scq03032
]
SCULI_v1c00040 (gyrA)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
scq03400
]
SCULI_v1c00040 (gyrA)
Enzymes [BR:
scq01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.2 DNA topoisomerase (ATP-hydrolysing)
SCULI_v1c00040 (gyrA)
DNA replication proteins [BR:
scq03032
]
Prokaryotic type
DNA Topoisomerases
SCULI_v1c00040 (gyrA)
DNA repair and recombination proteins [BR:
scq03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
NHEJ (non-homologous end-joining)
SHIIR (short-homology-independent illegitimate recombination)
Facilitator
SCULI_v1c00040 (gyrA)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_topoisoIV
DNA_gyraseA_C
Retrotran_gag_2
KHA
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AHI52345
UniProt:
W6A681
LinkDB
All DBs
Position
4560..6995
Genome browser
AA seq
811 aa
AA seq
DB search
MSDNLGLGKILEIDIKNEVEKDFLEYSMSVIVSRALPDLRDGLKPVHRRIIYAMNDLKIT
SDTPHKKSARIVGEVIGKYHPHGDSSVYEAMVRMSQDFSYRYPLVEGHGNFGSIDGDGAA
AMRYTEARLSKISNMLLKDIDMDTVPYVDNYDASEQEPRYLTGYFPNLLVNGATGIAVGM
ATNIPPHNLREVISAIIAYIDNNEITIDQILEYIKGPDFPTGALMTNGRSMIEGYRTGKG
NLTIRAKIDIEDVNKKQRIVISEIPYQTNKIRIVEKIAELYKNKIITGISDIRDESNYEG
IRIVLDLTTNANAQLIIKRLYKYTSLQTNFAINMLSLNNGIPVVLNIKEIIRLYVKHQIE
MILKRSLFEKNKLNAKLHILNAIRKTLDHIDEVIKIIRESKTTEIAHQKLNETFGFDEKQ
SKAILDMRLQRLVGLEREKIEQDISNIEIRIAELEKIINSREEQNIVLKDQLTSIFEKFG
DDRRTKIIQEEQTQIDEEELIQDTQMILTLTENGYIRRLTPEEFKTQKRGGKGIIINSYP
EDNIVISKMGKTKDDILFFSNEGKVYKIKGYNITQFTRTSRGLPIINFIGINSSEEITSV
LPIKNKNKKFKYLVFITMNGVVKKVEINEFDRINNYGKIAIHLDKGDKLVSVVPSSGDNH
ILIASNKGKIIKVHENEFRAMSRSSRGVKGMTLDKDDKVMTAVSDYGNDSIATISEYGIM
KKTLISEYNTFGRGAKGVVGMKLNDKTGKFKSMLAIRDSDEILMISSQGKVIKIQVKDIN
LQSRNSTGVIGFNLEQDEYITATALEFNKGE
NT seq
2436 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctgataatttaggtctaggaaagattcttgaaatagatattaaaaatgaagttgaa
aaagattttttagaatattcaatgagtgttattgttagtcgtgcacttccagatttaaga
gatggtttaaaaccagttcacagaagaattatttatgcaatgaatgatttaaaaattact
tcagatactccacacaaaaaatctgcgcgtattgttggtgaagtaattggtaagtatcat
ccacatggtgattcatcagtttatgaagcaatggttagaatgtcacaagatttttcatat
cgttatccactagttgaaggacatggtaactttggatcaattgatggtgatggagctgct
gctatgagatatactgaagcaagattgtcaaaaatttcaaatatgctattaaaagatatt
gatatggatactgttccatatgttgataattatgatgcttctgaacaagaaccaagatat
ttaactggatattttccaaatttattagtaaatggtgcaacaggaattgctgttggtatg
gcaacaaatattccaccacacaatttacgtgaggtaatttctgcaataattgcatatatt
gataataatgaaattacaattgatcaaattttggaatatattaaaggtcctgactttcca
acaggagcattaatgacaaatggaagaagcatgattgaaggttatagaaccggaaaagga
aatcttacaatcagagcaaaaattgatattgaagatgttaataaaaaacaaagaatagtt
attagtgaaattccgtatcaaacaaacaaaattagaattgttgaaaaaattgcagagctt
tataaaaataaaattattacaggaatttctgatattcgtgatgaatcaaactatgaagga
attagaattgttttagatttaacaacaaatgcaaatgctcaattaataattaaacgtttg
tataaatatacaagcttacaaacaaattttgcaattaacatgttgtcattaaataatgga
attccagttgttttaaatattaaagaaataattcgtctttatgtaaaacatcaaattgaa
atgattttgaaaagatcattatttgaaaaaaataaattaaatgctaagttacatatttta
aatgcaattagaaaaactttagatcatattgatgaagttattaaaattattcgtgaatct
aaaactacagaaattgcacatcaaaaattaaatgaaacttttggattcgatgaaaaacaa
tctaaagcaattttagatatgagattgcaaagattggttggtcttgaaagagaaaaaatt
gaacaagatatttcaaatattgaaattagaattgcagaacttgaaaaaattattaattca
agagaagaacaaaatattgttttaaaagatcaattgacaagtatttttgaaaaatttgga
gatgacagaagaacaaaaatcattcaagaagaacaaacacaaattgatgaagaagaatta
attcaagacactcaaatgattttaactctgactgaaaatggatatattagaagattaact
ccagaggaatttaaaactcaaaaacgtggtggaaaaggaattattattaattcatatcca
gaagataatattgtaatttcaaaaatgggaaaaacaaaagatgatattttatttttttca
aatgaaggtaaagtttataaaattaaaggttataacattactcaatttacaagaacatca
agaggtttaccaattattaattttataggaattaattcttctgaagaaattacttcagtt
cttcctattaaaaataaaaataaaaaattcaaataccttgtctttattacaatgaatggt
gttgttaaaaaagttgagattaatgaatttgatagaattaacaattatggaaaaattgca
attcaccttgataaaggtgataagttagtttcagttgttccttcatcaggagataatcat
attttaattgcttctaataaaggaaaaattattaaagtacatgaaaatgaatttagagca
atgtcaagatcatctcgtggtgttaaaggtatgactttagataaagatgataaagttatg
acagctgtaagcgattatgggaatgatagtattgcaacaatttcagaatatggaattatg
aaaaaaacacttataagtgaatacaatacttttggtcgtggagctaaaggtgttgttggt
atgaaactaaatgacaagactggtaagtttaaatctatgcttgcaatccgtgattctgat
gaaattttaatgatttcatctcaagggaaagtaattaaaattcaggttaaagatatcaat
ttacaatcaagaaattcaactggtgtaattggattcaacttagaacaagacgaatatatt
acagcaacagcacttgaatttaataaaggagaataa
DBGET
integrated database retrieval system
