Spiroplasma culicicola: SCULI_v1c00990
Help
Entry
SCULI_v1c00990 CDS
T03047
Name
(GenBank) ribose/galactose ABC transporter permease
KO
K23535
general nucleoside transport system permease protein
Organism
scq
Spiroplasma culicicola
Pathway
scq02010
ABC transporters
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
scq00001
]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
SCULI_v1c00990
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
scq02000
]
SCULI_v1c00990
Transporters [BR:
scq02000
]
ABC transporters, prokaryotic type
Saccharide, polyol, and lipid transporters
General nucleoside transporter
SCULI_v1c00990
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
BPD_transp_2
KshA_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AHI52440
UniProt:
W6A6F8
LinkDB
All DBs
Position
103994..106306
Genome browser
AA seq
770 aa
AA seq
DB search
MKFKLKTWVRNMKLNAQLNSPEIKKTASFFKTSVISILVGTILTMLLIAGLGANPIAFFI
KSFDVVFTRDVNLQNAFSWFAVYGLFAIGLAIGFKVGLFNMSGSGQAILSMGITGLMLIS
LFGNTQVEINKAGSWVIILIFIVMVTMSMLLSSITGILKVFFNIHEVATSILLNWTVWYL
MKWAFGLEGFISSSPRIPTEWIALAGIKWLIPIILMTLVFVATWFILTFTTLGYKFKLVG
TQKDAAHYVGINYKKYIISATAIQGFCIGIGSFVYWCAIKGQYSLGNDIIPTIGFDAIAI
SLIAFNNILGILPISFLWAILTVGMPVAVTSFNELGREIAPLIFGFIVYASTFASLFARL
QPMKWIRFSIYYFRDIPTQIEIKNINKQIKDIKQEIKNINRRNFENHLQLKALVSEIEKN
IEDIKDLKFELNNTNKLDPTNESKIKELKDNFSKLVETNKRLSEQFEHSKKEIIIVLNRH
IKQLKGDIQYLKDSGSEKYFKSSYYSIKSSFKFKTKRNAWDLLNPAVKDLNAIEEEKINI
LLEIKRYKKAKFNSELKFIKEVKAKYKLDLKQLKTEYQLNIKKIANEIKSIKKEELENKD
AQLEVLRLKIVELTSEYNQKIDSLSNDLNQKLVISDNQRIKFAKQDEIDRENKIVRLAQL
HKDFEVWKEKEQVLNQKWAVKIANLKETNVQLMKKKEENWILAKTELISLENNIKVSIEN
TNNQIKMNLENETNEQRILDLKLENKEFIVNQKAMRYEKILELGEKYGCN
NT seq
2313 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaatttaaactaaaaacatgagttagaaatatgaagttgaatgctcaattaaattcc
ccagaaattaaaaagactgcttcattttttaaaacaagtgtaatttcaattcttgttgga
acaattttaacaatgcttttaattgcgggacttggagctaatccaattgctttctttata
aaatcatttgatgttgtatttacaagagatgttaacttacaaaatgcattttcatgattt
gcagtctatggattatttgcaattggtcttgcaattggttttaaagttggactatttaat
atgtctggttctggacaagcaattctttctatgggtattactggattaatgttaatttca
ttatttggaaatactcaagtggaaattaataaagctggaagttgagtaataattttgatt
tttattgttatggtaacaatgtcaatgttgctttcatcaattactggaatattgaaagta
tttttcaatatccatgaagttgcaacttcaattttattaaactgaacagtttgatattta
atgaaatgagcctttggtttagaaggatttatttcttctagtccaagaataccaactgag
tgaatagcacttgcgggtattaaatgattaataccgattatattaatgacattagtattt
gttgctacatgatttattctaacatttacaactttaggttataaatttaaactagttgga
acacaaaaagatgcagcgcactatgttggtattaattacaaaaaatatataattagtgca
actgctatacagggattttgtataggaattggttcatttgtgtattgatgtgcaatcaaa
gggcaatatagtttaggtaatgatattattcctacaattggatttgatgcaattgcaatt
agtttaattgcttttaataatattttaggaatattaccaatttcattcttatgagcaatt
ttaactgtaggaatgcctgttgctgtaacttcatttaatgaattaggaagagaaattgca
ccattaatttttggtttcatagtatatgcttcaacatttgcttcattatttgcaagattg
caaccaatgaaatgaataagatttagcatatattactttagagatattcctactcaaatt
gaaattaaaaatattaacaaacaaattaaggatataaaacaagaaattaaaaatattaat
agacgtaattttgaaaatcatttacaattaaaagcattggtatctgaaattgaaaaaaat
attgaagatatcaaagacttaaaatttgaattaaataatactaataaacttgatccaact
aacgaatcaaagatcaaagagcttaaagataatttcagtaaacttgttgaaacaaataaa
agattgagtgaacaatttgaacattctaaaaaagaaattattattgttttaaatagacat
ataaaacaattaaaaggagatattcaatatcttaaagattcaggatctgaaaaatacttt
aaatcaagttattattcaataaaatcttcatttaaatttaaaacaaaaagaaatgcgtga
gatctattaaatcctgcagttaaagatttaaatgcaattgaagaagaaaaaattaatata
ctacttgaaataaaaagatataaaaaagcaaaattcaattcggaattaaaatttattaaa
gaagtaaaagcaaaatataaattagatttaaaacaattaaaaacagaatatcaattaaat
attaaaaaaatagcaaatgaaataaaaagtattaaaaaagaagaattagaaaataaagat
gcacaacttgaagttcttagattaaaaatagttgaattaactagtgaatataatcaaaaa
atagattcactaagtaatgacttaaatcaaaaattagtaatttctgataatcaaagaatt
aaatttgcaaaacaagatgaaattgatagagaaaataaaattgttagacttgcacaattg
cataaagattttgaagtttgaaaagaaaaagaacaagttttaaatcaaaaatgagctgtc
aaaattgctaatttaaaagaaacaaatgttcaattaatgaagaaaaaagaagaaaattga
attttagcaaaaacagaattaatttcattagaaaataatattaaagtatcgattgaaaat
actaataatcaaattaaaatgaatttagaaaatgaaacaaatgagcaaagaattttagac
ttaaaacttgaaaacaaagaatttattgtcaatcaaaaggcaatgagatatgaaaaaatc
ttagaattgggtgagaaatatggatgtaattag
DBGET
integrated database retrieval system