Spiroplasma culicicola: SCULI_v1c08420
Help
Entry
SCULI_v1c08420 CDS
T03047
Symbol
smc
Name
(GenBank) chromosome condensation and segregation SMC ATPase
KO
K03529
chromosome segregation protein
Organism
scq
Spiroplasma culicicola
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
scq00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
scq03036
]
SCULI_v1c08420 (smc)
Chromosome and associated proteins [BR:
scq03036
]
Prokaryotic type
Chromosome partitioning proteins
Condensin-like complex
SCULI_v1c08420 (smc)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SMC_N
SMC_hinge
AAA_23
AAA_21
AAA_29
AAA_15
ABC_tran
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AHI53182
UniProt:
W6A869
LinkDB
All DBs
Position
complement(931162..934113)
Genome browser
AA seq
983 aa
AA seq
DB search
MIFLKRIEAFGFKSFAEPTTLNYDFAMTGIVGPNGSGKSNITDAIMWALGEQSSKSLRGD
SMEDIVFSGSSDRKGLNMAEVTLVFDNSKRAFSSLDYNEVSITRKYFKITKESEYYINGA
KVRLKDIQDVALETGLTKSSLAIISQGSISTFVESSPEQRRRLFDEAAGVARYKKRKEEA
IRKLIRSQENLDRLNDIINEIERKLPSLKRQSKKALEYQTKFDELKQIEVAVLVKDIQLY
KQRINELNDEKIEMKTKISSLEKEIQTKSDEFNNINRSSFEKEKELSKLNREYTKIVDEI
GKLKVSRISLESKKSKVDIDDKEFRISDLKNKAKELEIKLNSEEQKLSKLLADKVEKRTN
LDSLSKERFDINSKLDYIRKDAAKIETSLETLNMRKNSHEGLFEGVKNILENKKVLSGII
GTVQDVINVDKEYEIAASSILQNSLQNIVANNSSDVKQAIEFLKSNKAGYATFLPLDTLK
ANFISSDMRFAIQKADGFIGFANELIKTEKKYQIVLDYLLANHIVVKKYDNAIEIAKLTN
YKFHIVTLDGERVLPHGAIVGGSRKVKNNLLNESVKISELEIQKQNLDLLEKELIEKVAQ
LSDKIEIHREEIQEIQIAIGASKQSTEIIERETAEVREEYRILTGKELNGSEQGFQSVDE
QIIEIIEQISKQESLKEEIQQQINVLRSIKDKSNDRQNTLNSVIDEDRIMLSALKDQYSK
ITTDGLLMFEKQSSAQERLAQNYNLTYEAALELESTSIEDEQTTRDRINKLRNEIKSLGN
VNLDSIEEYEEENQRYETYVSQTNDVLESINNLKEAINDMDEQMIVQFKKIIKDVNNALP
NTFATLFGGGSANLIYTNPDDILNSGIDIKISPPGKKISNLNLLSGGEKSMVALSVLFSI
LKVKPIPLVILDEVEAPLDIANVERFAKYIKTFTTGTQFMIVTHRIGTMENCDILFGATM
QQKGITKLVQIKLVEAKQMSNSN
NT seq
2952 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatatttttaaaacgtattgaagcgtttggttttaagtcttttgctgaaccaaccact
ttaaactatgattttgctatgacagggattgttggtcctaatggttcgggtaaatcaaat
attactgatgcaattatgtgagctttaggagaacaatcttctaaatcacttcgtggagat
tcaatggaagacattgttttttctggaagtagtgatcgcaaaggcttaaatatggcagaa
gtcactcttgtttttgacaatagtaaacgagcatttagctctttagattataatgaagta
tcaattacacgtaagtattttaaaataacaaaagaatctgaatattatattaatggtgcc
aaagttagattaaaagatattcaagatgttgctcttgaaactggtttaactaagtcaagt
ttggcaattatttcacaaggttcaatttcaacatttgttgaatcaagtccagaacaaaga
agaagactatttgacgaagctgctggagttgcaagatacaaaaaaagaaaagaagaagca
attcgtaaattaattagaagtcaagaaaacttggatcgcttaaatgacattattaatgaa
attgaaagaaaattaccaagtttaaagagacaatctaaaaaggctttagaatatcaaaca
aagtttgatgaactaaagcaaattgaagttgcagttttagttaaagatattcaattatat
aaacaaagaattaatgaattaaatgatgaaaaaattgaaatgaaaacaaaaatttcttca
ttagaaaaagaaattcaaacaaagtcagatgaatttaataatatcaatagatcaagtttt
gaaaaagaaaaagaactttcaaaattaaaccgtgaatatacaaaaattgttgatgaaatt
ggaaaacttaaagtttcaagaattagtttagaatcaaaaaaatcaaaagttgatattgat
gataaagaatttagaattagtgatttaaaaaataaagcaaaagagcttgaaattaaactt
aattcagaagagcaaaaattatcaaaattacttgcagataaagtagaaaaaagaactaat
cttgatagtttaagtaaagaaagatttgatatcaattcaaaattagactacataagaaaa
gatgcagcaaaaattgaaacaagtttagaaacattaaatatgagaaaaaattctcatgaa
ggtttatttgaaggtgttaaaaatattttagaaaataaaaaagtgctttctggaattatt
ggaacagttcaagatgtaattaatgttgataaagaatatgaaattgcagcttcaagtatt
ttacaaaactcattacaaaatattgttgccaacaattcttctgatgtaaaacaagcaatt
gaatttttaaaatcaaataaagcaggttatgcaacattcttaccacttgatacattaaaa
gcaaattttatttcaagtgatatgcgttttgcaattcaaaaagcagatggttttattggt
tttgcaaatgaattgatcaaaacagaaaaaaaatatcaaatagttttagattatttactg
gcaaatcatattgttgtaaaaaaatatgataatgcaattgaaattgcaaaattgacaaat
tacaaattccacattgtgactttagatggtgaaagagttttaccacatggagcaattgtt
gggggaagtcgtaaagttaaaaataatttattaaatgaatctgtaaaaatttctgaatta
gaaattcaaaaacaaaatttagatttattagaaaaagaattaattgaaaaagttgcgcag
ttaagtgacaaaattgaaattcatcgtgaagaaattcaagaaattcaaattgcaattggt
gcttcaaaacaatcaactgaaattattgaacgtgaaactgcagaagttagagaagaatat
cgtattttaactggaaaagaattaaatggttctgaacaaggtttccaatcagttgatgaa
caaattattgaaatcattgaacaaatttcaaaacaagaaagcttaaaagaagaaattcaa
caacaaattaatgttctacgttctattaaagataaatcaaatgatagacaaaatacatta
aactctgtgatcgatgaagatagaataatgctttctgctttaaaagaccaatattcaaaa
attacaactgatggtttattaatgtttgaaaaacaatcatcagctcaagagagattggct
caaaattataatttaacttatgaggcagctcttgaattagaatcaacaagtattgaagat
gaacaaacaacaagagatcgtattaataaattaagaaatgaaattaagtctcttggaaat
gttaatcttgattcaatcgaagaatatgaagaagaaaatcaaagatatgaaacatatgtt
tcacaaacaaatgatgttcttgaatcaattaataatttaaaagaagcaattaatgatatg
gatgaacaaatgattgttcaattcaaaaaaattattaaagatgttaataatgctcttcca
aatacatttgcaacattatttgggggaggaagtgcaaacttaatttatacaaatccagat
gatattttaaattctggaattgatattaaaatctcaccacctggtaaaaaaattagtaat
ttaaatttattatctgggggagaaaaatcaatggtagcactttctgttctattttcaatc
ttaaaagtaaaaccaataccgttagtaattttagatgaggtagaagccccattagatatt
gccaacgttgaacgttttgcaaaatatattaaaacatttacaacaggaactcaatttatg
atcgtaactcatagaattggaacaatggaaaattgtgacatcctatttggagcaacaatg
caacaaaaaggaattacaaagcttgtacaaattaaattagtagaagcaaaacaaatgagt
aattcaaattag
DBGET
integrated database retrieval system
