Spiroplasma culicicola: SCULI_v1c09320
Help
Entry
SCULI_v1c09320 CDS
T03047
Name
(GenBank) ABC transporter permease
KO
K02004
putative ABC transport system permease protein
Organism
scq
Spiroplasma culicicola
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
scq00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
scq02000
]
SCULI_v1c09320
Transporters [BR:
scq02000
]
ABC transporters, prokaryotic type
ABC-2 type and other transporters
Putative ABC transporter
SCULI_v1c09320
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
FtsX
MacB_PCD
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AHI53272
UniProt:
W6A8E4
LinkDB
All DBs
Position
complement(1031248..1035477)
Genome browser
AA seq
1409 aa
AA seq
DB search
MKGIRLLLKNAFRSAGRNKSQIIGLSLLVMLVSLVISLLSATTTRIIEAYKDLNTKSNLR
DVVMEVNPNDRIKLEDENNEKNWYMDFDESALANNQELYQQYLMNQLSFEYGFDWSRTEG
RTLASTTINNNDLKIKALAKTNGTSNAVDSLVISKGRNIENKNEIIVGESFAKKHNIELG
SIVRVQEDKFGNSFLVNQSSDTEMVKEIEGLKIKEILDIGKYANMVWFEVVGYGSSADFA
TPLLDQTSVITNIASEVIVYLDPTMFGLEIAPYEFSDKVTKGIYNRNMYTYVIANSPIVV
TSESDKESYYSIKFRDGYDQNLIDTINNKYKAYASIGVSTNYFFDNNDEAYTFSGRIKTF
ETVIIAYNTTSIILLVTIISIASLTILLITKKQIDQQRRQIGCLKALGYKKREVINNFIA
APLIVSVIGSLLGYVISIFLEYVVVNSFSLYFNVSFYDFQFNVFSFLSGLLLVWILLTVL
SFIIGYSVIKTSALTLLKGGDDKAISKFGTKMKLITAKGSFNTRLRTALTITSLGKLAGV
SATMLLGTTLMTTTIVAPKVMKDNMTATFNGMNYENLVEYEQPLANNPLSFYKTYNPNKV
DGWGFDINDSSNKKIDMNYDSTTAKLPSWTGLPVTTDGNFIDYDKMFDDLYKGKIDNSFY
AFDVTESNSYSWSKMSYLNWKNLSTDFLRVLDRIVPDSYQSLAIGTLLSQWPDHSKLLEF
VGVHDAKTYLLNMLWFYNKYTQGLKIEYNPITVKDNISIDVTLAQKQLDKKFTKKEMKVF
WTPEVTPEFKIDQNAYSADFVPIESNYFNSIHDITEDTIDKMLNDNKNEELLQINYLLTI
WFGATFGNRMSTAILETTYSRAPYFVQEYIKNSWEENKNYNIAFNLNPFDYDTEEMGTML
NTQFKNRNSENETLKVYGVNKNTNLVSLQDKKGLDLKNNLFALNSNTTPIIINQTTAIKS
GLKNGDKINLKVFKELLSKDGEAIEFDGTKNKEEINLGFESENTYYKTQSVSGYFSTKNK
TFADTTKIGILPPIPSSVASGSYSSYKLTGDSATVSTNQTQIHKAYSDGNIAIQSYDDNY
EFEIVGIQNGYGQPQAWISNDVANEVMGYDLIEKFNFEQWFSKEYLNIPEFYNSNFLGKN
GQELENIFNETIGKYEEFKELLNSEDEEISFAANKINELFKKLYPIYNYKYSPNPEILDL
IKGFSTSQKFGDFSSQGLNGNFEFKKVDPECNDQETNCEMEVDPTKFVEGFGIGSLKTMM
PMEQTRQILGQITDLVNMIIIMFMVIALIVSTTIILLTTSLIIYENKQFIATMKTLGYSN
GYVVKQILSTYIWAVLAMFTIGFIVGWYLFEYAALFLALNTSWVLPVQFAWYLPVGVLGV
LSGICLLTFGVGWSNIQKINPVVALSIKD
NT seq
4230 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaggaataaggcttcttttaaagaatgcttttaggtctgcaggaagaaataaatca
caaattattggtttatctcttttagttatgcttgtttctcttgtaatttcacttttaagt
gctacaactacaagaattattgaagcatataaagacttaaatactaaatctaatttaaga
gatgttgttatggaagtaaatccaaatgacagaattaaacttgaagatgaaaataatgaa
aaaaattgatacatggattttgatgaatcagcattagcaaataatcaagagttgtatcaa
caatacttaatgaatcaattaagttttgaatatggttttgattgaagtagaactgaagga
agaactcttgcttcaactactatcaataataatgatttaaaaattaaagctttagcaaaa
acaaatggaacatcaaatgctgttgattcattagttatttcaaaaggaagaaatattgaa
aataaaaatgaaattatagttggtgaatcttttgctaaaaaacataacattgaacttggt
tcaattgtaagagttcaagaagataaatttggtaattcattcttagtaaatcagagttca
gatactgaaatggttaaagagattgaaggactaaaaattaaggaaattttagatattggt
aaatatgctaatatggtttgatttgaagttgtaggttatgggtcatcagctgactttgcc
acacctttacttgatcaaacttcagttataacaaatatcgcatcagaagttattgtttat
ctagatccaacaatgtttggattagaaattgcaccatatgaatttagtgataaagtaact
aaaggaatttataatagaaatatgtatacatatgttattgcaaattcaccaatagttgta
acttctgaatcagataaagaatcatattattcaataaaatttagagatggttatgatcaa
aatttaattgatacaattaataacaaatataaagcatatgcatcaattggtgtttcgaca
aattatttctttgataataatgatgaagcatatactttttcaggaagaataaagactttt
gaaacagtaattattgcatacaatacaacttcaattattttattagtaacaattatttcg
attgcatcattgacaatcttattaattactaaaaaacaaattgatcaacaaagaagacaa
atcggatgtttaaaagcattaggatacaaaaaaagagaagttattaataactttattgca
gcgccattaattgtttctgtaattggttctcttttaggatatgtaatttcgattttctta
gaatatgttgttgtaaatagtttttcactatactttaacgtatcattctatgattttcaa
tttaatgtgttttcattcttaagtggacttttattagtttgaattttattaacagttcta
tcatttatcattggatattctgtaattaaaacatctgcattaactttattaaaaggtgga
gatgataaagcaatttcaaaatttggaactaaaatgaaattgattacagctaaaggaagt
tttaatacaagattaagaactgctttaactattacttcgttaggtaaacttgcaggagta
agtgcaacaatgttattgggaacaactttaatgacaacaacaatagttgctccaaaggtt
atgaaagataatatgactgcaacatttaatggaatgaactatgaaaacttagttgaatat
gaacaaccattagcaaataatcctttaagtttttataaaacttataatccaaataaagtc
gatggatgaggatttgatattaatgattcatcaaataagaaaatagatatgaactatgat
tcaacaacagcaaaattaccttcttgaactggattgccagttacaaccgatggaaatttt
attgattatgataaaatgtttgatgatttatataaaggaaagattgataattcattttat
gcatttgatgtaactgaatcaaatagttattcttgatcaaaaatgagttatttaaattga
aaaaatttatctacagattttttaagagtattagatagaattgttccagatagttatcaa
agtcttgcaataggaacactattatcacaatggccagatcattcaaaacttttagaattt
gtaggagttcatgatgcaaaaacatatttattaaatatgttgtgattttataataaatat
actcaaggtttaaaaattgaatataatccaattacagtgaaagataatatttcaattgat
gtaactttggcacaaaaacaattggataaaaaatttacaaagaaagaaatgaaagtattt
tgaacacctgaagtaacacctgaatttaaaattgatcagaatgcttatagtgctgatttt
gtaccaattgaatcaaattattttaattcaatacatgatattactgaagataccattgat
aaaatgttaaatgataataagaatgaagaattacttcaaattaactatttgttaactatt
tgatttggtgcaacttttggtaataggatgtcaacagcaatactggaaacaacttattca
agagcaccatattttgttcaagaatatattaaaaatagttgagaagaaaataaaaattat
aatattgcttttaatctaaatccatttgattatgatactgaagagatgggaactatgtta
aacactcaatttaagaatcgtaatagtgaaaatgaaactttaaaagtttatggagttaat
aaaaatacaaatcttgtatcactacaagataaaaaaggtttagatttaaaaaataattta
tttgctttaaatagtaacacaacaccaattataattaatcagacaacagcaattaaatca
ggtttaaaaaatggtgataaaataaatctaaaggtatttaaagaattactttcaaaagat
ggagaagctattgaatttgatggaacaaaaaataaagaggaaattaatttaggttttgaa
tctgaaaatacatactataaaactcaatctgtttcgggttatttttcaacaaaaaataaa
acttttgctgatactactaagattggaattttacctcctattccaagttctgtagcttct
ggttcatatagttcatataaattaactggagatagtgcaacagtttcaacaaatcaaaca
caaattcataaagcatattcagatggaaatatagctattcaaagttatgatgataattac
gaatttgaaattgtgggtatacaaaatggatatggtcaacctcaagcatgaatttcaaat
gatgttgcaaatgaagtaatgggctatgatctaatagaaaaatttaattttgaacaatga
tttagtaaagaatatttaaatattcctgaattttataattcaaatttcttaggaaaaaat
ggacaggaattagaaaatatttttaatgaaactattggaaaatatgaagaatttaaagaa
ttattaaatagtgaagatgaagaaatatcttttgctgcaaataaaattaatgaattattt
aaaaaattatatccgatttataattataaatattctccaaatccagaaattttagattta
attaaaggattttcaacttcacaaaaatttggagatttcagttcgcaaggattaaatggt
aactttgaatttaaaaaagttgatccagaatgtaacgaccaggaaactaattgtgagatg
gaagttgatccaacaaaatttgtggaaggatttggtattggttcattaaaaacaatgatg
ccaatggaacaaactagacagattcttgggcaaattactgacttagttaacatgattatt
attatgtttatggtaattgcattaatagtttctacaacaattattttattaacaacaagt
ttaattatttatgaaaataaacaatttatagcaacaatgaaaacattaggatattcaaat
ggatatgttgtaaagcaaattctttcaacttatatttgagccgttcttgcaatgtttaca
attggatttattgttggttgatatttatttgaatatgcagcgttattcctggctttaaat
acaagttgggtcttacctgtacaatttgcatgatatcttccagtaggagtgttaggagtc
ctttcaggtatatgtttattaacatttggagtaggatgatcaaatattcaaaaaattaat
ccagtagttgctttaagtattaaagattaa
DBGET
integrated database retrieval system
